<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>
<!DOCTYPE root>
<article xmlns:mml="http://www.w3.org/1998/Math/MathML" xmlns:xlink="http://www.w3.org/1999/xlink" xmlns:xsi="http://www.w3.org/2001/XMLSchema-instance" xmlns:ali="http://www.niso.org/schemas/ali/1.0/" article-type="research-article" dtd-version="1.2" xml:lang="en"><front><journal-meta><journal-id journal-id-type="publisher-id">Advances in Chemical Physics</journal-id><journal-title-group><journal-title xml:lang="en">Advances in Chemical Physics</journal-title><trans-title-group xml:lang="ru"><trans-title>Физиология растений</trans-title></trans-title-group></journal-title-group><issn publication-format="print">0015-3303</issn><issn publication-format="electronic">3034-6126</issn><publisher><publisher-name xml:lang="en">The Russian Academy of Sciences</publisher-name></publisher></journal-meta><article-meta><article-id pub-id-type="publisher-id">648225</article-id><article-id pub-id-type="doi">10.31857/S0015330324020086</article-id><article-id pub-id-type="edn">OAXKXV</article-id><article-categories><subj-group subj-group-type="toc-heading"><subject>ЭКСПЕРИМЕНТАЛЬНЫЕ СТАТЬИ</subject></subj-group><subj-group subj-group-type="article-type"><subject>Research Article</subject></subj-group></article-categories><title-group><article-title xml:lang="en">Метаболизм каллозы в волокнах льна при гравиответе: анализ экспрессии генов</article-title><trans-title-group xml:lang="ru"><trans-title>Метаболизм каллозы в волокнах льна при гравиответе: анализ экспрессии генов</trans-title></trans-title-group></title-group><contrib-group><contrib contrib-type="author"><name><surname>Ибрагимова</surname><given-names>Н. Н.</given-names></name><address><country country="RU">Russian Federation</country></address><email>nibra@yandex.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff1"/></contrib><contrib contrib-type="author"><name><surname>Мокшина</surname><given-names>Н. Е.</given-names></name><address><country country="RU">Russian Federation</country></address><email>nibra@yandex.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff1"/></contrib></contrib-group><aff id="aff1"><institution>Казанский институт биохимии и биофизики – обособленное структурное подразделение Федерального государственного бюджетного учреждения науки Федерального исследовательского центра “Казанский научный центр Российской академии наук”</institution></aff><pub-date date-type="pub" iso-8601-date="2024-08-16" publication-format="electronic"><day>16</day><month>08</month><year>2024</year></pub-date><volume>71</volume><issue>2</issue><fpage>216</fpage><lpage>227</lpage><history><date date-type="received" iso-8601-date="2025-01-28"><day>28</day><month>01</month><year>2025</year></date></history><permissions><copyright-statement xml:lang="en">Copyright ©; 2024, Russian Academy of Sciences</copyright-statement><copyright-statement xml:lang="ru">Copyright ©; 2024, Российская академия наук</copyright-statement><copyright-year>2024</copyright-year><copyright-holder xml:lang="en">Russian Academy of Sciences</copyright-holder><copyright-holder xml:lang="ru">Российская академия наук</copyright-holder></permissions><self-uri xlink:href="https://journals.eco-vector.com/0015-3303/article/view/648225">https://journals.eco-vector.com/0015-3303/article/view/648225</self-uri><abstract xml:lang="en"><p>Двигательные реакции растений, относящиеся к тропизмам, обычно осуществляются с использованием механизмов роста растяжением. Однако в данном исследовании изучался гравитропизм на уровне клеток (первичные флоэмные волокна), закончивших свой рост и формирующих утолщенную третичную клеточную стенку. Проведены инвентаризация и анализ экспрессии генов ферментов, ответственных за метаболизм каллозы, на разных стадиях развития флоэмных волокон льна (<italic>Linum usitatissimum</italic> L.) и при гравиответе. Выявлены гены предполагаемых β-1,3-глюкансинтаз (GSLs) и β-1,3-глюканаз (BGs), имеющие дифференциальный характер экспрессии в исследуемых клетках, среди которых отмечены гены с максимальным уровнем экспрессии на определенной стадии развития. В основном при гравитропизме экспрессия генов β-1,3-глюкансинтаз была понижена, тогда как для генов β-1,3-глюканаз были характерны различные профили экспрессии, среди которых выявлены гены с повышенным уровнем экспрессии только при гравиответе (<italic>LusBG1 </italic>и<italic> LusBG3</italic>). Полученные данные позволили предположить наличие активного метаболизма каллозы в клеточной стенке исследуемых волокон на разных стадиях развития и доминирование деградации каллозы в ходе гравиответа. Результаты работы закладывают основу для дальнейших исследований функции каллозы в развитии волокон и реализации двигательной реакции растений.</p></abstract><trans-abstract xml:lang="ru"><p>Двигательные реакции растений, относящиеся к тропизмам, обычно осуществляются с использованием механизмов роста растяжением. Однако в данном исследовании изучался гравитропизм на уровне клеток (первичные флоэмные волокна), закончивших свой рост и формирующих утолщенную третичную клеточную стенку. Проведены инвентаризация и анализ экспрессии генов ферментов, ответственных за метаболизм каллозы, на разных стадиях развития флоэмных волокон льна (<italic>Linum usitatissimum</italic> L.) и при гравиответе. Выявлены гены предполагаемых β-1,3-глюкансинтаз (GSLs) и β-1,3-глюканаз (BGs), имеющие дифференциальный характер экспрессии в исследуемых клетках, среди которых отмечены гены с максимальным уровнем экспрессии на определенной стадии развития. В основном при гравитропизме экспрессия генов β-1,3-глюкансинтаз была понижена, тогда как для генов β-1,3-глюканаз были характерны различные профили экспрессии, среди которых выявлены гены с повышенным уровнем экспрессии только при гравиответе (<italic>LusBG1 </italic>и<italic> LusBG3</italic>). Полученные данные позволили предположить наличие активного метаболизма каллозы в клеточной стенке исследуемых волокон на разных стадиях развития и доминирование деградации каллозы в ходе гравиответа. Результаты работы закладывают основу для дальнейших исследований функции каллозы в развитии волокон и реализации двигательной реакции растений.</p></trans-abstract><kwd-group xml:lang="ru"><kwd>гравитропизм</kwd><kwd>волокно</kwd><kwd>третичная клеточная стенка</kwd><kwd>каллоза</kwd><kwd>β-1</kwd><kwd>3-глюкансинтазы (каллозосинтазы)</kwd><kwd>β-1</kwd><kwd>3-глюканазы</kwd><kwd>экспрессия генов</kwd></kwd-group><funding-group><award-group><funding-source><institution-wrap><institution xml:lang="ru">Российский научный фонд</institution></institution-wrap><institution-wrap><institution xml:lang="en">Russian Science Foundation</institution></institution-wrap></funding-source><award-id>23-24-00612</award-id></award-group></funding-group></article-meta></front><body></body><back><ref-list><ref id="B1"><label>1.</label><mixed-citation>Moulia B., Fournier M. The power and control of gravitropic movements in plants: a biomechanical and systems biology view // J. Exp. Bot. 2009. V. 60. P. 461. https://doi.org/10.1093/jxb/ern341</mixed-citation></ref><ref id="B2"><label>2.</label><mixed-citation>Gorshkova T., Chernova T., Mokshina N., Ageeva M., Mikshina P. Plant “muscles”: fibers with a tertiary cell wall // New Phytol. 2018. V. 218. P. 66. https://doi.org/10.1111/nph.14997</mixed-citation></ref><ref id="B3"><label>3.</label><mixed-citation>Almeras T., Derycke M., Jaouen G., Beauchene J., Fournier M. Functional diversity in gravitropic reaction among tropical seedlings in relation to ecological and developmental traits // J. Exp. Bot. 2009. V. 60. P. 4397. https://doi.org/10.1093/jxb/erp276</mixed-citation></ref><ref id="B4"><label>4.</label><mixed-citation>Kojima M., Becker V.K., Altaner C.M. An unusual form of reaction wood in Koromiko [Hebe salicifolia G. Forst. (Pennell)], a southern hemisphere angiosperm // Planta. 2012. V. 235. P. 289. https://doi.org/10.1007/s00425-011-1503-z</mixed-citation></ref><ref id="B5"><label>5.</label><mixed-citation>Fisher J.B. Anatomy of axis contraction in seedlings from a fire prone habitat // Am. J. Bot. 2008. V. 95. P. 1337. https://doi.org/10.3732/ajb.0800083</mixed-citation></ref><ref id="B6"><label>6.</label><mixed-citation>Schreiber N., Gierlinger N., Putz N., Fratz P., Neinhuis C., Burgert I. G-fibres in storage roots of Trifolium pratense (Fabaceae): tensile stress generators for contraction // Plant J. 2010. V. 61. P. 854. https://doi.org/10.1111/j.1365-313X.2009. 04115.x</mixed-citation></ref><ref id="B7"><label>7.</label><mixed-citation>Ibragimova N.N., Ageeva M.V., Gorshkova T.A. Development of gravitropic response: unusual behavior of ﬂax phloem G-ﬁbers // Protoplasma. 2017. V. 254. P. 749. https://doi.org/10.1007/s00709-016-0985-8</mixed-citation></ref><ref id="B8"><label>8.</label><mixed-citation>Waterkeyn L., Caeymaex S., Decamps E. Callose in compression wood tracheids of Pinus and Larix // Bull. Soc. Roy. Bot. Belg. 1982. V. 115. P. 149.</mixed-citation></ref><ref id="B9"><label>9.</label><mixed-citation>Chen X.-Y., Kim J.-Y. Callose synthesis in higher plants // Plant Signal. Behav. 2009. V. 4. P. 489. https://doi.org/10.4161/psb.4.6.8359</mixed-citation></ref><ref id="B10"><label>10.</label><mixed-citation>Usak D., Haluška S., Pleskot R. Callose synthesis at the center point of plant development – an evolutionary insight // Plant Physiol. 2023. V. 193. P. 54. https://doi.org/10.1093/plphys/kiad274</mixed-citation></ref><ref id="B11"><label>11.</label><mixed-citation>Pirselova B., Matusikova I. Callose: the plant cell wall polysaccharide with multiple biological functions // Acta Physiol. Plant. 2013. V. 35. P. 635. https://doi.org/10.1007/s11738-012-1103-y</mixed-citation></ref><ref id="B12"><label>12.</label><mixed-citation>Richmond T.A., Somerville C.R. The cellulose synthase superfamily // Plant Physiol. 2000. V. 124. P. 495. https://doi.org/10.1104/pp.124.2.495</mixed-citation></ref><ref id="B13"><label>13.</label><mixed-citation>Verma D.P.S, Hong Z. Plant callose synthase complexes // Plant Mol. Biol. 2001. V. 47. P. 693. https://doi.org/10.1023/A:1013679111111</mixed-citation></ref><ref id="B14"><label>14.</label><mixed-citation>Lombard V., Ramulu H.G., Drula E., Coutinho P.M., Henrissat B. The carbohydrate-active enzymes database (CAZy) in 2013 // Nucleic Acids Res. 2014. V. 42. P. D490. https://doi.org/10.1093/nar/gkt1178</mixed-citation></ref><ref id="B15"><label>15.</label><mixed-citation>Perrot T., Pauly M., Ramírez V. Emerging roles of β-glucanases in plant development and adaptative responses // Plants. 2022. V. 11. P. 1119. https://doi.org/10.3390/plants11091119</mixed-citation></ref><ref id="B16"><label>16.</label><mixed-citation>Snegireva A.V., Ageeva M.V., Amenitskii S.I., Chernova T.E., Ebskamp M., Gorshkova T.A. Intrusive growth of sclerenchyma fibers // Russ. J. Plant Physiol. 2010. V. 57. P. 342. https://doi.org/10.1134/S1021443710030052</mixed-citation></ref><ref id="B17"><label>17.</label><mixed-citation>Gorshkova T., Chernova T., Mokshina N., Gorshkov V., Kozlova L., Gorshkov O. Transcriptome analysis of intrusively growing flax fibers isolated by laser microdissection // Sci. Rep. 2018. V. 8. P. 14570. https://doi.org/10.1038/s41598-018-32869-2</mixed-citation></ref><ref id="B18"><label>18.</label><mixed-citation>Mokshina N., Gorshkov O., Takasaki H., Onodera H., Sakamoto S., Gorshkova T., Mitsuda N. FIBexDB: a new online transcriptome platform to analyze development of plant cellulosic fibers // New Phytol. 2021. V. 231. P. 512. https://doi.org/10.1111/nph.17405</mixed-citation></ref><ref id="B19"><label>19.</label><mixed-citation>Cui W., Lee J.-Y. Arabidopsis callose synthases CalS1/8 regulate plasmodesmal permeability during stress // Nat. Plants. 2016. V. 2. P. 16034. https://doi.org/10.1038/nplants.2016.34</mixed-citation></ref><ref id="B20"><label>20.</label><mixed-citation>Teea E.E., Johnstona M.G., Papp D., Faulknera C.A. PDLP-NHL3 complex integrates plasmodesmal immune signaling cascades // PNAS. 2023. V. 120. e2216397120. https://doi.org/10.1073/pnas.2216397120</mixed-citation></ref><ref id="B21"><label>21.</label><mixed-citation>Sevilem I., Miyashima S., Helariutta Y. Cell-to-cell communication via plasmodesmata in vascular plants // Cell Adh. Migr. 2013. V. 7. P. 27. https://doi.org/10.4161/cam.22126</mixed-citation></ref><ref id="B22"><label>22.</label><mixed-citation>Saatian B., Kohalmi S.E., Cui Y. Localization of Arabidopsis Glucan Synthase-Like 5, 8, and 12 to plasmodesmata and the GSL8-dependent role of PDLP5 in regulating plasmodesmal permeability // Plant Signal. Behav. 2023. V. 18. P. 2164670. https://doi.org/10.1080/15592324.2022.2164670</mixed-citation></ref><ref id="B23"><label>23.</label><mixed-citation>Xie B., Wang X., Zhu M., Zhang Z., Hong Z. Cals7 encodes a callose synthase responsible for callose deposition in the phloem: a phloemspecific callose synthase // Plant J. 2011. V. 65. P. 1. https://doi.org/10. 1111/j.1365-313X.2010.04399</mixed-citation></ref><ref id="B24"><label>24.</label><mixed-citation>Gorshkov O., Mokshina N., Ibragimova N., Ageeva M., Gogoleva N., Gorshkova T. Phloem fibres as motors of gravitropic behaviour of flax plants: level of transcriptome // Funct. Plant Biol. 2018. V. 45. P. 203. https://doi.org/10.1071/FP16348</mixed-citation></ref><ref id="B25"><label>25.</label><mixed-citation>Ellinger D., Naumann M., Falter C., Zwikowics C., Jamrow T., Manisseri C., Somerville S.C., Voigt C.A. Elevated early callose deposition results in complete penetration resistance to powdery mildew in Arabidopsis // Plant Physiol. 2013. V. 161. P. 1433. https://doi.org/10.1104/pp.112.211011</mixed-citation></ref><ref id="B26"><label>26.</label><mixed-citation>Naumann M., Somerville S., Voigt C. Differences in early callose deposition during adapted and non-adapted powdery mildewinfection of resistant Arabidopsis lines // Plant Signal. Behav. 2013. V. 8. e24408. https://doi.org/10.4161/psb.24408</mixed-citation></ref><ref id="B27"><label>27.</label><mixed-citation>Enns L.C., Kanaoka M.M., Torii K.U., Comai L., Okada K., Cleland R.E. Two callose synthases, GSL1 and GSL5, play an essential and redundant role in plant and pollen development and in fertility // Plant Mol. Biol. 2005. V. 58. P. 333. https://doi.org/10.1007/s11103-005-4526-7</mixed-citation></ref><ref id="B28"><label>28.</label><mixed-citation>Zhou C., Yin Y., Dam P., Xu Y. Identification of novel proteins involved in plant cell-wall synthesis based on protein-protein interaction data // J. Proteome Res. 2010. V. 9. P. 5025. https://doi.org/10.1021/pr100249c</mixed-citation></ref><ref id="B29"><label>29.</label><mixed-citation>Sakuma Y., Maruyama K., Osakabe Y., Qin F., Seki M., Shinozaki K., Yamaguchi-Shinozaki K. Functional analysis of an Arabidopsis transcription factor, DREB2A, involved in drought-responsive gene expression // Plant Cell. 2006. V. 18. P. 1292. https://doi.org/10.1105/tpc.105.035881</mixed-citation></ref><ref id="B30"><label>30.</label><mixed-citation>Levy A., Erlanger M., Rosenthal M., Epel B.L. A plasmodesmata-associated beta-1,3-glucanase in Arabidopsis // Plant J. 2007. V. 49. P. 669. https://doi.org/10.1111/j.1365-313X.2006.02986.x</mixed-citation></ref><ref id="B31"><label>31.</label><mixed-citation>Ho L.H., Giraud E., Uggalla V., Lister R., Clifton R., Glen A., Thirkettle-Watts D., Van Aken O., Whelan J. Identification of regulatory pathways controlling gene expression of stress-responsive mitochondrial proteins in Arabidopsis // Plant Physiol. 2008. V. 147. P. 1858. https://doi.org/10.1104/pp.108.121384</mixed-citation></ref><ref id="B32"><label>32.</label><mixed-citation>Borner G.H., Lilley K.S., Stevens T.J., Dupree P. Identification of glycosylphosphatidylinositol-anchored proteins in Arabidopsis. A proteomic and genomic analysis // Plant Physiol. 2003. V. 132. P. 568. https://doi.org/10.1104/pp.103.021170</mixed-citation></ref><ref id="B33"><label>33.</label><mixed-citation>Ko J.H., Yang S.H., Park A.H., Lerouxel O., Han K.H. ANAC012, a member of the plant-specific NAC transcription factor family, negatively regulates xylary fiber development in Arabidopsis thaliana // Plant J. 2007. V. 50. P. 1035. https://doi.org/10.1111/j.1365-313X.2007.03109.x</mixed-citation></ref><ref id="B34"><label>34.</label><mixed-citation>Zavaliev R., Levy A., Gera A., Epel B.L. Subcellular dynamics and role of Arabidopsis β-1,3-glucanases in cell-to-cell movement of tobamoviruses // Mol. Plant Microbe Interact. 2013. V. 26. P. 1016. https://doi.org/10.1094/MPMI-03-13-0062-R</mixed-citation></ref></ref-list></back></article>
