Транскриптомика плацентарной ткани как инструмент для идентификации молекулярных механизмов больших акушерских синдромов
Dublin Core | PKP метаданные | Метаданные этого документа | |
1. | Название | Название документа | Транскриптомика плацентарной ткани как инструмент для идентификации молекулярных механизмов больших акушерских синдромов |
2. | Создатель | Автор, учреждение, страна | Е. А. Трифонова; Научно-исследовательский институт медицинской генетики Томского национального исследовательского центра; Сибирский государственный медицинский университет; Россия |
2. | Создатель | Автор, учреждение, страна | А. В. Марков; Научно-исследовательский институт медицинской генетики Томского национального исследовательского центра; Россия |
2. | Создатель | Автор, учреждение, страна | А. А. Зарубин; Научно-исследовательский институт медицинской генетики Томского национального исследовательского центра; Россия |
2. | Создатель | Автор, учреждение, страна | А. А. Бабовская; Научно-исследовательский институт медицинской генетики Томского национального исследовательского центра; Россия |
2. | Создатель | Автор, учреждение, страна | М. М. Гавриленко; Научно-исследовательский институт медицинской генетики Томского национального исследовательского центра; Россия |
2. | Создатель | Автор, учреждение, страна | Т. В. Габидулина; Сибирский государственный медицинский университет; Россия |
2. | Создатель | Автор, учреждение, страна | В. А. Степанов; Научно-исследовательский институт медицинской генетики Томского национального исследовательского центра; Россия |
3. | Предмет | Дисциплины | |
3. | Предмет | Ключевые слова | транскриптом; плацента; дифференциально экспрессирующиеся гены; большие акушерские синдромы; преэклампсия; задержка роста плода |
4. | Описание | Аннотация | Многочисленными гистологическими исследованиями продемонстрировано, что ключевые патогенетические механизмы больших акушерских синдромов (БАС) связаны с нарушением процессов плацентации. Тем не менее молекулярная основа данного открытия все еще не установлена. Цель нашей работы заключалась в выяснении молекулярных механизмов и поиске новых генетических маркеров этих гестационных осложнений на основе интегративного анализа данных, полученных при полногеномном экспрессионном профилировании плацентарной ткани женщин с преэклампсией, задержкой роста плода, преждевременными родами и физиологической беременностью. Показана значимая роль окислительного стресса, ферроптоза и нарушения межклеточных взаимодействий в плацентарной ткани как общих механизмов патогенетики БАС. Выявлено 64 гена, транскрипционная активность которых статистически значимо изменяется как минимум при двух из рассматриваемых гестационных осложнений. Наиболее значимыми клеточными популяциями, обогащенными данными генами, выступили материнские эндотелиальные клетки и клетки синцитиотрофобласта. Биоинформатический анализ и оценка топологии сети белок–белковых взаимодействий позволили идентифицировать в качестве центральных генов SOD1, ACTG1, TXNRD1, TKT, GCLM, GOT1, ACO1 и UBB, а также выделить ключевые регуляторы, запускающие каскад реакций с вовлечением дифференциально экспрессирующихся генов, – MAPK3, MID1, LCMT1, DUSP10, TOPORS, SOX10, EGFR, TFAP2A, GLIS1, NR2F1, NR2F2, PAX5, HSF1, BCL6, которые сверхпредставлены в сигнальном пути митоген-активируемых протеинкиназ и в процессах, опосредованных интерфероном-гамма. Указанные гены и их продукты являются наиболее перспективными биомаркерами для разработки подходов к оценке факторов риска и таргетной терапии БАС. Дальнейшие исследования должны быть направлены на уточнение функционального и диагностического значения этих генов при развитии патологических состояний беременности. |
5. | Издатель | Организатор, город | The Russian Academy of Sciences |
6. | Контрибьютор | Спонсоры |
|
7. | Дата | (ДД-ММ-ГГГГ) | 03.06.2025 |
8. | Тип | Тип исследования или жанр | Отрецензированная статья |
8. | Тип | Тип | Научная статья |
9. | Формат | Формат файла | |
10. | Идентификатор | Универсальный идентификатор, URI | https://journals.eco-vector.com/0026-8984/article/view/682877 |
10. | Идентификатор | Digital Object Identifier (DOI) | 10.31857/S0026898425020048 |
10. | Идентификатор | eLIBRARY Document Number (EDN) | GGNMXK |
11. | Источник | Журнал/конференция, том., №. (год) | Молекулярная биология; Том 59, № 2 (2025) |
12. | Язык | Russian=ru, English=en | ru |
13. | Связь | Дополнительные файлы |
Рис. 1. Дизайн исследования. ФБ – физиологическая беременность; ПЭ – преэклампсия; ПР – преждевременные роды; ЗРП – задержка роста плода; БАС– большие акушерские синдромы; ДЭГ – дифференциально экспрессирующиеся гены. (1MB) Рис. 2. Кластеризация образцов, включенных в интегративный анализ. Приведены идентификационные номера набора данных согласно базе данных GEO. Наборы данных, полученные в результате собственных исследований в русской и якутской популяционных выборках, обозначены “OUR_Y” и “OUR_R” соответственно. (297KB) Рис. 3. Диаграмма Венна, демонстрирующая общность и специфичность ДЭГ, выявленных при проведении интегративного анализа. ПЭ – преэклампсия, ЗРП – задержка развития плода, ПР – преждевременные роды. (355KB) Рис. 4. Белок-белковые взаимодействия продуктов генов, ассоциированных с БАС, по данным анализа транскриптома. (540KB) Рис. 5. Анализ топологии генной сети с использованием плагина cytoHubba. Красным цветом выделены центральные гены сети с максимальным коэффициентом связи (ранг). (148KB) Рис. 6. Основные сигнальные пути, ассоциированные с мастер-регуляторами. (186KB) Рис. 7. Теплокарта, отражающая вариабельность уровня экспрессии ряда генов, ассоциированных с БАС, в клеточных популяциях, идентифицированных в плаценте при анализе данных, полученных ранее Vento-Tormo R. и соавт. [75]. (461KB) Рис. 8. Основные клеточные популяции, обогащенные генами, ассоциированными с БАС. Специфичность генов для определенного типа клеток идентифицирована на основе проведенного ранее секвенирования единичных клеток. а – Vento-Tormo R. и соавт. [75]; б – Suryawanshi и соавт. [76]. Показатель Fold change отражает изменение кратности обогащения клеток специфичными транскриптами относительно фонового набора генов (подробнее см. [74]). (161KB) |
14. | Покрытие | Пространственно-временной охват, методика исследования | |
15. | Права | Права и разрешения |
© Российская академия наук, 2025 |