ВЛАГАЛИЩНЫЕ ЛАКТОБАКТЕРИИ - СОВРЕМЕННЫЕ ПОДХОДЫ К ВИДОВОЙ ИДЕНТИФИКАЦИИ И ИЗУЧЕНИЮ ИХ РОЛИ В МИКРОБНОМ СООБЩЕСТВЕ


Цитировать

Полный текст

Открытый доступ Открытый доступ
Доступ закрыт Доступ предоставлен
Доступ закрыт Доступ платный или только для подписчиков

Аннотация

Развитие инновационных технологий в медицине способствует широкому внедрению новых лабораторных методов диагностики дисбиотических состояний и фармакологической коррекции дисбаланса взаимоотношений в экологической системе «человек — микроорганизм». Одним из таких направлений является внедрение принципиально нового метода время-пролетной масс-спектрометрии. Изучение с помощью MALDI-TOF масс-спектрометрии видового спектра лактобактерий влагалища у женщин репродуктивного возраста показало, что оно отличается широким разнообразием и представлено 21 видом, лидирующими из которых являются L. crispatus, L. iners, L. jensenii и L. gasseri. Дальнейшее изучение видовых и штаммовых различий лактобактерий в норме и патологии станет основой для отбора штаммов, наиболее перспективных в качестве пробиотических препаратов. Реализация геномно-протеомного типирования с привлечением протеомных исследований и изучение новых молекулярных механизмов с учетом данных бактериологического тестирования и метагеномного анализа, возможно, откроют новые знания в вопросе колонизационных механизмов формирования микробиоценозов.

Полный текст

Доступ закрыт

Об авторах

Алина Рантиковна МЕЛКУМЯН

ФГБУ Научный центр акушерства, гинекологии и перинатологии им. академика В.И. Кулакова Минздрава России

Email: a_melkumyan@oparina4.ru
научный сотрудник лаборатории микробиологии отдела микробиологии и клинической фармакологии 117997, Россия, Москва, ул. Академика Опарина, д. 4

Татьяна Валерьевна ПРИПУТНЕВИЧ

ФГБУ Научный центр акушерства, гинекологии и перинатологии им. академика В.И. Кулакова Минздрава России

Email: t_priputnevich@oparina4.ru
кандидат медицинских наук, главный научный сотрудник лаборатории микробиологии отдела микробиологии и клинической фармакологии 117997, Россия, Москва, ул. Академика Опарина, д. 4

Список литературы

  1. Gill S.R., Pop M., Deboy R.T., Eckburg P.B., Turnbaugh P.J., Samuel B.S. et al. Metagenomic analysis of the human distal gut microbiome. Science. 2006; 312(5778): 1355—9.
  2. Коршунов В.М., Володин Н.Н., Ефимов Б.А. и др. Микроэкология влагалища. Коррекция микрофлоры при вагинальных дисбактериозах: Учебное пособие. М.: ВУНМЦ Минздрава РФ; 1999. 80с.
  3. Муравьева В.В. Микробиологическая диагностика бактериального вагиноза у женщин репродуктивного возраста: Автореф. дис.. канд. биол. наук. М.; 1997. 23с.
  4. Анкирская А.С., Муравьева В.В. Опыт диагностики оппортунистических инфекций влагалища. Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. 2001; 3(2): 190—4.
  5. Шендеров Б.А. Медицинская микробная экология и функциональное питание. т.1: Микрофлора человека и животных и ее функции. М.: Гранть; 1998. 288с.
  6. Land M.H., Rouster-Stevens K., Woods C.R., Cannon M.L., Cnota J., Shetty A.K. Lactobacillus sepsis associated wit probiotic therapy. Pediatrics. 2005; 115(1): 178—81.
  7. Salminen M., Rautelin H., Tynkkynen S., Poussa T., Saxelin M., Valtonen V., Järvinen A. Lactobacillus bacteremia, clinical significance, and patient outcome, with special focus on probiotic L. rhamnosus GG. Clin. Infect. Dis. 2004; 38(1): 62—9.
  8. Ботина С.Г., Ивашкина Н.Ю., Маев И.В. Молекулярногенетическая характеристика и пробиотический потенциал бактерий рода Lactobacillus. Молекулярная медицина. 2011; 1: 53—7.
  9. Vitali B., Pugliese C., Biagi E., Candela M., Turroni S., Bellen G. et al. Dynamics of vaginal bacterial communities in women developing bacterial vaginosis, candidiasis, or no infection, analyzed by PCR-denaturing gradient gel electrophoresis and real-time PCR. Appl. Environ. Microbiol. 2007; 73: 5731—41.
  10. Grice E.A., Kong H.H., Conlan S., Deming C.B., Davis J., Young A.C. et al. Topographical and temporal diversity of the human skin microbiome. Science. 2009; 324: 1190—2.
  11. Meyer M., Stenzel U., Hofreiter M. Parallel tagged sequencing on the 454 platform. Nat. Protoc. 2008; 3(2): 267—78.
  12. Du Plessis E.M., Dicks L.M.T. Evaluation of random amplified polymorphic DNA (RAPD)-PCR as a method to differentiate Lactobacillus acidophilus, Lactobacillus crispatus, Lactobacillus amylovorus, Lactobacillus gallinarum, Lactobacillus gasseri, and Lactobacillus johnsonii. Curr. Microbiol. 1995; 31: 114—8.
  13. Ventura M., O’Flaherty S., laesson M.J., Turroni F., Klaenhammer T.R., van Sinderen D., O’Toole P.W. Genomescale analyses of health-promoting bacteria: probiogenomics. Nat. Rev. Microbiol. 2009; 7(1): 61—71.
  14. Makarova K., Slesarev A., Wolf Y., Sorokin A., Mirkin B., Koonin E. et al. Comparative genomics of the lactic acid bacteria. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 2006; 103(42): 15611—6.
  15. Macklaim J.M., Gloor G.B., Anukam K.C., Cribby S., Reid G. At the crossroads of vaginal health and disease, the genome sequence of Lactobacillus iners AB-1. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 2011; 108(Suppl.1): 4688—95.
  16. Gasser F., Mandel M., Rogosa M. Lactobacillus jensenii sp. nov., a new representative of the subgenus Thermobacterium. J. Gen. Microbiol. 1970; 62(2): 219—22.
  17. Точилина А.Г., Новикова Н.А., Соколова К.Я., Соловьева И.В., Белова И.В., Иванова Т.П. Индикация и идентификация бактерий рода Lactobacillus с использованием полимеразной цепной реакции. Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. 2008; 3: 69—73.
  18. Schwebke J.R. Gynecologic consequences of bacterial vaginosis. Obstet. Gynecol. Clin. North Am. 2003; 30: 685—94.
  19. Sobel J.D., Funaro D., Kaplan E.L. Recurrent group A streptococcal vulvovaginitis in adult women: family epidemiology. Clin. Infect. Dis. 2007; 44: 43—5.
  20. Verstraelen H., Verhelst R., Roelens K., Claeys G., Weyers S., De Backer E. et al. Modified classification of Gram-stained vaginal smears to predict spontaneous preterm birth: a prospective cohort study. Am. J. Obstet. Gynecol. 2007; 196(6): 528; e1—6.
  21. Kiss H., Kögler B., Petricevic L., Sauerzapf I., Klayraung S., Domig K. et al. Vaginal Lactobacillus microbiota of healthy women in the late first trimester of pregnancy. Br. J. Obstet. Gynaecol. 2007; 114(11): 1402—7.
  22. Tamrakar R., Yamada T., Furuta I., Cho K., Morikawa M., Yamada H. et al. Association between Lactobacillus species and bacterial vaginosis — related bacteria, and bacterial vaginosis scores in pregnant Japanese women. BMC Infect. Dis. 2007; 7: 128.
  23. Hernández-Rodríguez C., Romero-González R., Albani-Campanario M., Figueroa-Damián R., Meraz-Cruz N., Hernández-Guerrero C. Vaginal microbiota of healthy pregnant Mexican women is constituted by four Lactobacillus species and several vaginosis-associated bacteria. Infect. Dis. Obstet. Gynecol. 2011; 2011: 851485.
  24. Spear G.T., Sikaroodi M., Zariffard M.R., Landay A.L., French A.L., Gillevet P.M. Comparison of the diversity of the vaginal microbiota in HIV-infected and HIV-uninfected women with or without bacterial vaginosis. J. Infect. Dis. 2008; 198(8): 1131—40.
  25. Rave J., Gajer P., Abdo Z., Schneider G.M., Koenig S.S., McCulle S.L. et al. Vaginal microbiome of reproductive-age women. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 2011; 108(Suppl.1): 4680—7.
  26. Spiegel C.A., Amsel R., Holmes K.K. Diagnosis of bacterial vaginosis by direct gram stain of vaginal fluid. J. Clin. Microbiol. 1983; 18: 170—7.
  27. Witkin S.S. Bacterial flora of the female genital tract: function and immune regulation. Best Pract. Res. Clin. Obstet. Gynecol. 2007; 21(3): 347—54.
  28. Ison C.A., Hay P.E. Validation of a simplified grading of Gram stained vaginal smears for use in genitourinary medicine clinics. Sex. Transm. Infect. 2002; 78: 413—5.
  29. Jakobsson T., Forsum U. Lactobacillus iners: a marker of changes in the vaginal flora? J. Clin. Microbiol. 2007; 45(9): 3145.
  30. Анкирская А.С., Муравьева В.В. Интегральная оценка состояния микробиоты влагалища. Диагностика оппортунистических вагинитов. (Медицинская технология). М.; 2011: 10—3.
  31. Fredricks D.N., Fiedler T.L., Marrazzo J.M. Molecular identification of bacteria associated with bacterial vaginosis. N. Engl. J. Med. 2005; 353: 1899—911.
  32. Brolazo E.M., Leite D.S., Tiba M.R., Villarroel M., Marconi C., Simoes J.A. Correlation between API 50 CH and multiplex polymerase chain reaction for the identification of vaginal lactobacilli in isolates. Braz. J. Microbiol. 2011: 42(1): 225—32.
  33. Kalra A., Palcu C.T., Sobel J.D., Akins R.A. Bacterial vaginosis: culture- and PCR-based characterizations of a complex polymicrobial disease’s pathobiology. Curr. Infect. Dis. Rep. 2007; 9: 485—500.
  34. Ворошилина Е.С., Кротова А.А., Хаютин Л.В. Количественная оценка биоценоза влагалища у беременных женщин методом ПЦР в реальном времени. В кн.: Материалы IV съезда акушеров-гинекологов России. Москва, 30 сентяря — 2 октября 2008 г. М.; 2008: 45—6.
  35. Липова Е.В., Болдырева М.Н., Трофимов Д.Ю., Витвицкая Ю.Г. Урогенитальные инфекции, обусловленные условно-патогенной биотой у женщин репродуктивного возраста (Клинико-лабораторная диагностика): Пособие для врачей. М.; 2009. 30с.
  36. Верещагин В.А., Ильина Е.Н., Зубков М.М., Припутневич Т.В., Кубанова А.А., Говорун В.М. Использование масс-спектрометрии MALDI-TОF для выявления в генах gyrA и parC Neisseria gonorrhoeae однонуклеотидных замен, определяющих формирование устойчивости к фторхинолонам. Молекулярная биология. 2005; 39(6): 923—32.
  37. Ильина Е.Н., Говорун В.М. Масс-спектрометрия нуклеиновых кислот в молекулярной медицине. Биоорганическая химия. 2009; 35(2): 149 — 64.
  38. Припутневич Т.В., Мелкумян А.Р., Анкирская А.С., Трофимов Д.Ю., Муравьева В.В., Завьялова М.Г. Использование современных лабораторных технологий в видовой идентификации лактобактерий при оценке состояния микробиоты влагалища у женщин репродуктивного возраста. Акушерство и гинекология. 2013; 1: 76—80.

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML
Скачать

© ООО «Бионика Медиа», 2013

Данный сайт использует cookie-файлы

Продолжая использовать наш сайт, вы даете согласие на обработку файлов cookie, которые обеспечивают правильную работу сайта.

О куки-файлах