Комбинация протеомного и транскриптомного подходов для определения риска малигниза-ции неоплазий шейки матки при папилломавирусной инфекции


Цитировать

Полный текст

Открытый доступ Открытый доступ
Доступ закрыт Доступ предоставлен
Доступ закрыт Доступ платный или только для подписчиков

Аннотация

Цель исследования. Изучить протеомный состав цервиковагинальной жидкости (ЦВЖ) у пациенток репродуктивного возраста для определения риска малигнизации неоплазий шейки матки при папилломавирусной инфекции Материал и методы. Клинические, молекулярно-генетические методы исследования, цитологическое исследование, расширенная кольпоскопия, полимеразная цепная реакция, протеомное исследование цервиковагинальной жидкости. Результаты. Обследовано 30 женщин, сформировано 4 группы: 7 пациенток (23%) - NILM (I группа - контрольная), 23 (77%) - вирус папилломы человека (ВПЧ)-позитивные, разделены на 3 группы: IIгруппа - 11 (49%) с ASCUS, IIIгруппа - 7(30%) с LSIL, IVгруппа - 5 (21%) с HSIL. ВПЧ высокого онкогенногориска выявлен в 90,9% случаев в группе ASCUSи в 100% - в группахLSIL и HSIL. Наиболее распространенным типами были ВПЧ 16(34,8%), 31 (17,4%), 52, 58, 56(13%), 18, 35(8,7%), остальные типы встречались менее чем в 5% случаев. У 69% пациенток вирусная нагрузка была более 5,2hg (в среднем - 5,6log) без существенных различий между группами. Нормальная кольпоскопическая картина наблюдалась у 7(23%) пациенток, ненормальная - у 23 (87%). По полуколичественному анализу протеомного состава ЦВЖ было выявлено достоверное разделение контрольных образцов (NILM) и групп ASCUS, LSIL, HSIL. Концентрация белков теплового шока S100-A9, S100-P, S100-A11, HSPA8, а также ацетил-CoA-связывающего белка и аннексинов A1 и A2 в группах с неоплазией на порядок выше, чем в контрольной группе. Многофакторный анализ протеомных и транскриптомных данных пациентов был выполнен методом PLS. В результате достигнуто достоверное разделение группы с низким риском развития и прогрессии цервикальной дисплазии и группы высокого риска. Заключение. Выявлены белки ЦВЖ, внесшие важный вклад в дифференциацию групп с нормальным эпителием шейки матки от групп с неоплазией различной степени тяжести.

Полный текст

Доступ закрыт

Об авторах

Наталия Леонидовна Стародубцева

ФГБУ НЦАГиП им. академика В.И. Кулакова Минздрава России

Email: n_starodubtseva@oparina4.ru
к.б.н., зав. лабораторией протеомики репродукции человека

Нисо Мирзоевна Назарова

ФГБУ НЦАГиП им. академика В.И. Кулакова Минздрава России

Email: grab2@yandex.ru
д.м.н., в.н.с

Мака Джемаловна Зардиашвили

ФГБУ НЦАГиП им. академика В.И. Кулакова Минздрава России

Email: z-m-d@mail.ru
аспирант

Ольга Владимировна Бурменская

ФГБУ НЦАГиП им. академика В.И. Кулакова Минздрава России

Email: o_bourmenskaya@oparina4.ru
д.б.н., научный сотрудник лаборатории молекулярно-генетических методов

Анна Евгеньевна Бугрова

ФГБУ НЦАГиП им. академика В.И. Кулакова Минздрава России

Email: a_bugrova@oparina4.ru
к.б.н., с.н.с. лаборатории протеомики репродукции человека

Виталий Викторович Чаговец

ФГБУ НЦАГиП им. академика В.И. Кулакова Минздрава России

Email: vvchagovets@gmail.com
к.ф.-м.н., с.н.с. лаборатории протеомики метаболомики репродукции человека

Алексей Сергеевич Кононихин

ФГБУ НЦАГиП им. академика В.И. Кулакова Минздрава России

Email: konoleha@yandex.ru
к.ф.-м.н., научный сотрудник лаборатории протеомики репродукции человека

Дмитрий Юрьевич Трофимов

ФГБУ НЦАГиП им. академика В.И. Кулакова Минздрава России

Email: d.trofimov@dna-tech.ru
д.б.н., зав. лабораторией молекулярно-генетических методов

Владимир Евгеньевич Франкевич

ФГБУ НЦАГиП им. академика В.И. Кулакова Минздрава России

Email: v_frankevich@oparina4.ru
к.ф-м.н., руководитель отдела системной биологии в репродукции

Геннадий Тихонович Сухих

ФГБУ НЦАГиП им. академика В.И. Кулакова Минздрава России

Email: g_sukhikh@oparina4.ru
академик РАН, доктор медицинских наук, профессор, директор

Список литературы

  1. Zur Hausen H. Papillomaviruses causing cancer: evasion from host-cell control in early events in carcinogenesis. J. Natl. Cancer Inst. 2000; 92(9): 690-8.
  2. http : //www. cdc. gov/hpv
  3. Good D.M., Thongboonkerd V., Novak J., Bascands J.L., Schanstra J.P., Coon J.J. et al. Body fluid proteomics for biomarker discovery: lessons from the past hold the key to success in the future. J. Proteome Res. 2007; 6(12): 4549-55.
  4. Van Raemdonck G.A., Tjalma W.A., Coen E.P., Depuydt C.E., Van Ostade X.W.M. Identification of protein biomarkers for cervical cancer using human cervicovaginal fluid. PLoS One. 2014; 9(9): e106488.
  5. Zegels G., Van Raemdonck G.A., Tjalma W.A., Van Ostade X.W. Use of cervicovaginal fluid for the identification of biomarkers for pathologies of the female genital tract. Proteome Sci. 2010; 8: 63.
  6. Solomon D., Nayar R., eds. The Bethesda system for reporting cervical cytology: definitions, criteria and explanatory notes. 2nd ed. New York, NY: Springer; 2004: 169-75.
  7. Стародубцева Н.Л., Бугрова А.Е., Кононихин А.С., Вавина О.В., Широкова В.А., Наумов В.А., Гаранина И.А., Лагутин В.В., Попов И.А., Логинова Н.С., Ходжаева З.С., Франкевич В.Е., Николаев Е.Н., Сухих Г.Т. Возможность прогнозирования и диагностики преэклампсии по пептидному профилю мочи. Акушерство и гинекология. 2015; 6: 46-52. [Starodubtseva N.L., Bugrova A.E., Kononikhin A.S., Vavina O.V., Shirokova V.A., Naumov V.A., Garanina I.A., Lagutin V.V., Popov I.A., Loginova N.S., Khodzhaeva Z.S., Frankevich V.E., Nikolaev E.N., Sukhikh G.T. Possibility for the prediction and early diagnosis of preeclampsia from the urinary peptide profile. Akusherstvo i Ginekologiya/Obstetrics and Gynecology. 2015; 6: 46-52. (in Russian)]
  8. Starodubtseva N.L., Kononikhin A.S., Bugrova A.E., Chagovets V., Indeykina M., Krokhina K.N., Nikitina I.V., Kostyukevich Y.I., Popov I.A., Larina I.M., Timofeeva L.A., Frankevich V.E., Ionov O.V., Degtyarev D.N., Nikolaev E.N., Sukhikh G.T. Investigation of urine proteome of preterm newborns with respiratory pathologies. J. Proteomics. 2016; 149: 31-7. doi: 10.1016/j.jprot.2016.06.012.
  9. Бурменская О.В., Назарова Н.М., Прилепская В.Н., Мзарелуа Г.М., Бестаева Н.В, Трофимов Д.Ю., Сухих Г.Т. Прогнозирование риска развития и прогрессирования цервикальных интраэпителиальных неоплазий, ассоциированных с папилломавирусной инфекцией. Акушерство и гинекология. 2016; 2: 92-98. http://dx.doi.org/10.18565/aig.2016.2.92-98
  10. Serce N.B., Boesl A., Klaman I., von Serényi S., Noetzel E., Press M.F. et al. Overexpression of SERBP1 (Plasminogen activator inhibitor 1 RNA binding protein) in human breast cancer is correlated with favourable prognosis. BMC Cancer. 2012; 12: 597. doi: 10.1186/1471-2407-12-597.
  11. Preston-Martin S., Pike M.C., Ross R.K., Jones P.A., Henderson B.E. Increased cell division as a cause of human cancer. Cancer Res. 1990; 50(23): 7415-21.
  12. Klug A. The discovery of zinc fingers and their applications in gene regulation and genome manipulation. Annu. Rev. Biochem. 2010; 79: 213-31. doi: 10.1146/ annurev-biochem-010909-095056.
  13. Wicki R., Marenholz I., Mischke D., Schafer B.W., Heizmann C.W. Characterization of the human S100A12 (calgranulin C, p6, CAAF1, CGRP) gene, a new member of the S100 gene cluster on chromosome 1q21. Cell Calcium. 1997; 20(6): 459-64. doi: 10.1016/S0143-4160(96)90087-1.
  14. Ahrens T.D., Timme S., Ostendorp J., Bogatyreva L., Hoeppner J., Hopt U.T. et al. Response of esophageal cancer cells to epigenetic inhibitors is mediated via altered thioredoxin activity. Lab. Invest. 2016; 96(3): 307-16. doi: 10.1038/ labinvest.2015.148.
  15. Huber M., Siegenthaler G., Mirancea N., Marenholz I., Nizetic D., Breitkreutz D. et al. Isolation and characterization of human repetin, a member of the fused gene family of the epidermal differentiation complex. J. Invest. Dermatol. 2005; 124(5): 998-1007.
  16. Zhang H., Zhang Y., Zhao H., Niyaz H., Liu P., Zhang L. et al. HPV infection and prognostic factors of tongue squamous cell carcinoma in different ethnic groups from geographically closed cohort in Xinjiang, China. Biochem. Res. Int. 2016; 2016: 7498706. doi: 10.1155/2016/7498706.
  17. Wang C., Zhang Y., Guo K., Wang N., Jin H., Liu Y., Qin W. Heat shock proteins in hepatocellular carcinoma: Molecular mechanism and therapeutic potential. Int. J. Cancer. 2016; 138(8): 1824-34. doi: 10.1002/ ijc.29723.
  18. Tokunaga M., Baron B., Kitagawa T., Tokuda K., Kuramitsu Y. Active hexose-correlated compound down-regulates heat shock factor 1, a transcription factor for HSP27, in gemcitabine-resistant human pancreatic cancer cells. Anticancer Res. 2015; 35(11): 6063-7.
  19. Lin Z., Xiong L., Zhou J., Wang J., Li Z., Hu H., Lin Q. 1y-Glutamylcyclotransferase knockdown inhibits growth of lung cancer cells through G0/G1 phase arrest. Cancer Biother. Radiopharm. 2015; 30(5): 211-6. doi: 10.1089/ cbr.2014.1807.

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML
Скачать

Данный сайт использует cookie-файлы

Продолжая использовать наш сайт, вы даете согласие на обработку файлов cookie, которые обеспечивают правильную работу сайта.

О куки-файлах