<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>
<!DOCTYPE root>
<article xmlns:mml="http://www.w3.org/1998/Math/MathML" xmlns:xlink="http://www.w3.org/1999/xlink" xmlns:xsi="http://www.w3.org/2001/XMLSchema-instance" xmlns:ali="http://www.niso.org/schemas/ali/1.0/" article-type="other" dtd-version="1.2" xml:lang="en"><front><journal-meta><journal-id journal-id-type="publisher-id">Herald of the Russian Academy of Sciences</journal-id><journal-title-group><journal-title xml:lang="en">Herald of the Russian Academy of Sciences</journal-title><trans-title-group xml:lang="ru"><trans-title>Вестник Российской академии наук</trans-title></trans-title-group></journal-title-group><issn publication-format="print">0869-5873</issn><issn publication-format="electronic">3034-5200</issn><publisher><publisher-name xml:lang="en">The Russian Academy of Sciences</publisher-name></publisher></journal-meta><article-meta><article-id pub-id-type="publisher-id">659725</article-id><article-id pub-id-type="doi">10.31857/S0869587323110026</article-id><article-id pub-id-type="edn">CMMRZI</article-id><article-categories><subj-group subj-group-type="toc-heading"><subject>ИЗ РАБОЧЕЙ ТЕТРАДИ ИССЛЕДОВАТЕЛЯ</subject></subj-group><subj-group subj-group-type="article-type"><subject>Unknown</subject></subj-group></article-categories><title-group><article-title xml:lang="en">NATIVE STRAINS OF HUMAN INTESTINAL BIFIDOBACTERIA: INDIGENEITY THROUGH THE PRISM OF PERSISTENCE</article-title><trans-title-group xml:lang="ru"><trans-title>Коренные Штаммы Бифидобактерий Кишечника Человека: Индигенность Через Призму Персистенции</trans-title></trans-title-group></title-group><contrib-group><contrib contrib-type="author"><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Bukharin</surname><given-names>O. V.</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Бухарин</surname><given-names>О. В.</given-names></name></name-alternatives><email>ofrc@list.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff1"/></contrib><contrib contrib-type="author"><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Ivanova</surname><given-names>E. V.</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Иванова</surname><given-names>Е. В.</given-names></name></name-alternatives><email>walerewna13@gmail.com</email><xref ref-type="aff" rid="aff1"/></contrib><contrib contrib-type="author"><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Perunova</surname><given-names>N. B.</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Перунова</surname><given-names>Н. Б.</given-names></name></name-alternatives><email>perunovanb@gmail.com</email><xref ref-type="aff" rid="aff1"/></contrib></contrib-group><aff-alternatives id="aff1"><aff><institution xml:lang="en">Institute for Cellular and Intracellular Symbiosis, Ural Branch of the Russian Academy of Sciences</institution></aff><aff><institution xml:lang="ru">Институт клеточного и внутриклеточного симбиоза УрО РАН</institution></aff></aff-alternatives><pub-date date-type="pub" iso-8601-date="2023-11-01" publication-format="electronic"><day>01</day><month>11</month><year>2023</year></pub-date><volume>93</volume><issue>11</issue><fpage>1071</fpage><lpage>1080</lpage><history><date date-type="received" iso-8601-date="2025-02-20"><day>20</day><month>02</month><year>2025</year></date></history><permissions><copyright-statement xml:lang="en">Copyright ©; 2023, О.В. Бухарин, Е.В. Иванова, Н.Б. Перунова</copyright-statement><copyright-statement xml:lang="ru">Copyright ©; 2023, О.В. Бухарин, Е.В. Иванова, Н.Б. Перунова</copyright-statement><copyright-year>2023</copyright-year><copyright-holder xml:lang="en">О.В. Бухарин, Е.В. Иванова, Н.Б. Перунова</copyright-holder><copyright-holder xml:lang="ru">О.В. Бухарин, Е.В. Иванова, Н.Б. Перунова</copyright-holder></permissions><self-uri xlink:href="https://journals.eco-vector.com/0869-5873/article/view/659725">https://journals.eco-vector.com/0869-5873/article/view/659725</self-uri><abstract xml:lang="en"><p id="idm45257551785104">The indigenous human microbiota is a natural storehouse of bifidobacteria strains, the key to our health. To determine the indigeneity of symbiont microorganisms, it is proposed to evaluate their adaptive potential (lysozyme resistance and biofilm formation), since adaptation is characteristic of all living systems, and in the human body the main adaptation strategy for bacteria is persistence. One of the mechanisms of persistence of indigenous bifidoflora is resistance to the action of host lysozyme, realized through the modification of peptidoglycan – O-acetylation (a wide range of O-cetylate determinants and a family of σ-factors). An important function of indigenous bifidobacteria in the functioning of the human digestive tract is their ability to participate in microbial recognition of “friend or foe”. The results obtained made it possible to open access to a source of beneficial indigenous microorganisms and use them in the selection of cultures for the creation of modern biological products.</p></abstract><trans-abstract xml:lang="ru"><p id="idm45257551784352">Индигенная микробиота человека – это природная кладовая штаммов бифидобактерий, залог нашего здоровья. Для определения индигенности симбионтных микроорганизмов предлагается оценивать их адаптивный потенциал (лизоцимрезистентность и биоплёнкообразование), поскольку адаптация свойственна всем живым системам, а в организме человека основной стратегией адаптации бактерий служит персистенция. Одним из механизмов персистенции индигенной бифидофлоры выступает устойчивость к действию лизоцима хозяина, реализуемая через модификацию пептидогликана – O-ацетилирование (широкий набор детерминант О-цетилата и семейство σ-факторов). Важная функция индигенных бифидобактерий в работе пищеварительного тракта человека – их способность участвовать в микробном распознавании “свой–чужой”. Полученные результаты позволили открыть доступ к источнику полезных индигенных микроорганизмов и использовать их при отборе культур для создания современных биопрепаратов.</p></trans-abstract><kwd-group xml:lang="en"><kwd>indigeneity</kwd><kwd>indigeneity</kwd><kwd>persistence</kwd><kwd>adaptation</kwd><kwd>bifidobacteria</kwd><kwd>lysozyme resistance</kwd><kwd>microbial recognition of “self–non-self”.</kwd></kwd-group><kwd-group xml:lang="ru"><kwd>индигенность</kwd><kwd>персистенция</kwd><kwd>адаптация</kwd><kwd>бифидобактерии</kwd><kwd>лизоцимрезистентность</kwd><kwd>микробное распознавание “свой–чужой”.</kwd></kwd-group><funding-group/></article-meta></front><body></body><back><ref-list><ref id="B1"><label>1.</label><mixed-citation>Бухарин О.В., Иванова Е.В. Особенности персистенции индигенных штаммов бифидобактерий кишечника человека // Вестник РАН. 2023. № 6. С. 549–556.</mixed-citation></ref><ref id="B2"><label>2.</label><mixed-citation>Дворецкий И.Х. Латинско-русский словарь. М.: Русский язык, 1986.</mixed-citation></ref><ref id="B3"><label>3.</label><mixed-citation>Бухарин О.В., Перунова Н.Б., Иванова Е.В. Бифидофлора при ассоциативном симбиозе человека. Екатеринбург: УрО РАН, 2014.</mixed-citation></ref><ref id="B4"><label>4.</label><mixed-citation>Бухарин О.В. Персистенция патогенных бактерий. М.: Медицина, 1999.</mixed-citation></ref><ref id="B5"><label>5.</label><mixed-citation>Duranti S., Longhi G., Ventura M. et al. Exploring the eco-logy of Bifidobacteria and their genetic adaptation to the mammalian gut // Microorganisms. 2020. V. 9 (1). P. 8.</mixed-citation></ref><ref id="B6"><label>6.</label><mixed-citation>Sun Z., Zhang W., Guo C. et al. Comparative Genomic Analysis of 45 Type Strains of the Genus Bifidobacterium: A Snapshot of Its Genetic Diversity and Evolution // PLOS ONE. 2015. V. 10 (2). e0117912.</mixed-citation></ref><ref id="B7"><label>7.</label><mixed-citation>Turroni F., Duranti S., Bottacini F. et al. Bifidobacterium bifidum as an example of a specialized human gut commensal // Front. in microbiol. 2014. V. 5. P. 437.</mixed-citation></ref><ref id="B8"><label>8.</label><mixed-citation>Russell J.T., Roesch L.F.W., Ordberg M. et al. Genetic Risk for Autoimmunity is Associated with Distinct Changes in the Human Gut Microbiome // Nat. Commun. 2019. № 10. P. 3621.</mixed-citation></ref><ref id="B9"><label>9.</label><mixed-citation>Lin C., Lin Y., Zhang H. et al. Intestinal ‘Infant-Type’ Bifidobacteria Mediate Immune System Development in the First 1000 Days of Life // Nutrients. 2022. № 14. P. 1498.</mixed-citation></ref><ref id="B10"><label>10.</label><mixed-citation>Henrick B.M., Rodriguez L., Lakshmikanth T. et al. Bifidobacteria-Mediated Immune System Imprinting Early in Life // Cell. 2021. V. 184 (15). P. 3884–3898.</mixed-citation></ref><ref id="B11"><label>11.</label><mixed-citation>Yao Y., Cai X., Ye Y. et al. The Role of Microbiota in Infant Health: From Early Life to Adulthood // Front. Immunol. 2021. № 12. P. 708472.</mixed-citation></ref><ref id="B12"><label>12.</label><mixed-citation>Беляева Е.А., Червинец Ю.В., Червинец В.М. и др. Характеристика пробиотических свойств штаммов рода Bifidobacterium, выделенных из желудочно-кишечного тракта жителей Центрального региона России // Клиническая лабораторная диагностика. 2015. № 2. С. 53–58.</mixed-citation></ref><ref id="B13"><label>13.</label><mixed-citation>Hidalgo-Cantabrana C., Delgado S., Ruiz L. et al. Bifidobacteria and their health-promoting effects // Microbiol. Spectr. 2017. № 5. P. 3.</mixed-citation></ref><ref id="B14"><label>14.</label><mixed-citation>Бухарин О.В., Валышев А.В., Гильмутдинова Ф.Г. и др. Экология микроорганизмов человека / Отв. ред. О.В. Бухарин. Екатеринбург: УрО РАН, 2006.</mixed-citation></ref><ref id="B15"><label>15.</label><mixed-citation>Эль-Регистан Г.И., Николаев Ю.А., Мулюкин А.Л. и др. Явление персистенции – формы и механизмы выживаемости популяций // Медицинский алфавит. Эпидемиология и гигиена. 2014. № 2. С. 49–54.</mixed-citation></ref><ref id="B16"><label>16.</label><mixed-citation>Андрюков Б.Г., Ляпун И.Н. Молекулярные механизмы персистенции бактерий // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. 2020. № 3. С. 271–279.</mixed-citation></ref><ref id="B17"><label>17.</label><mixed-citation>Бухарин О.В., Гинцбург А.Л., Романова Ю.М., ЭльРегистан Г.И. Механизмы выживания бактерий. М.: Медицина, 2005.</mixed-citation></ref><ref id="B18"><label>18.</label><mixed-citation>Бухарин О.В., Лобакова Е.С., Немцева Н.В., Черкасов С.В. Ассоциативный симбиоз. Екатеринбург: УрО РАН, 2007.</mixed-citation></ref><ref id="B19"><label>19.</label><mixed-citation>Бухарин О.В., Андрющенко С.В., Перунова Н.Б., Иванова Е.В. Механизм персистенции индигенных бифидобактерий под действием ацетата в кишечном биотопе человека // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. 2021. № 3. С. 276–282.</mixed-citation></ref><ref id="B20"><label>20.</label><mixed-citation>Kaus G.M., Snyder L.F., Müh U. et al. Lysozyme Resistance in Clostridioides difficile is Dependent on Two Peptidoglycan Deacetylases // J. Bacteriol. 2020. V. 202 (22). e00421-20.</mixed-citation></ref><ref id="B21"><label>21.</label><mixed-citation>Бухарин О.В., Перунова Н.Б. Микросимбиоценоз. Екатеринбург: УрО РАН, 2014.</mixed-citation></ref><ref id="B22"><label>22.</label><mixed-citation>Wenren L.M., Sullivan N.L., Cardarelli L. et al. Two independent pathways for self-recognition in Proteus mirabilis are linked by type VI-dependent export // mBio. 2013. V. 4 (4). e00374-13.</mixed-citation></ref><ref id="B23"><label>23.</label><mixed-citation>Shank A.E., Kolter R. New developments in microbial interspecies signaling // Curr. Opin. Microbiol. 2009. V. 12 (2). P. 205–214.</mixed-citation></ref><ref id="B24"><label>24.</label><mixed-citation>Бухарин О.В., Перунова Н.Б., Иванова Е.В., Андрющенко С.В. Межмикробное распознавание “свой–чужой” в паре “доминант–ассоциант” пробиотических штаммов Escherichia coli M-17 и Escherichia coli ЛЭГM-18 // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. 2016. № 3. С. 3–9.</mixed-citation></ref><ref id="B25"><label>25.</label><mixed-citation>Бухарин О.В., Иванова Е.В., Перунова Н.Б., Чайникова И.Н. Роль бифидобактерий в формировании иммунного гомеостаза человека // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. 2015. № 67. С. 98–104.</mixed-citation></ref><ref id="B26"><label>26.</label><mixed-citation>Бухарин О.В., Иванова Е.В., Перунова Н.Б. и др. Иммунорегуляторные свойства метаболитов бифидобактерий при эубиозе и дисбиозе толстого кишечника человека // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. 2015. № 4. С. 89–96.</mixed-citation></ref><ref id="B27"><label>27.</label><mixed-citation>Teng M.W., Bowman E.P., McElwee J.J. et al. IL-12 and IL-23 cytokines: from discovery to targeted therapies for immune-mediated inflammatory diseases // Nat. Med. 2015. V. 21 (7). P. 719–729.</mixed-citation></ref></ref-list></back></article>
