Impact of gut microbiota on interindividual variability in response to antidepressant therapy: a question of pharmacokinetics or pharmacodynamics?

Cover Page


Cite item

Full Text

Open Access Open Access
Restricted Access Access granted
Restricted Access Subscription or Fee Access

Abstract

Depression represents a global medical and social challenge, necessitating improvements in treatment effectiveness. One of the key therapeutic challenges is the pronounced interindividual variability in response to antidepressants. This narrative review summarizes current evidence on the role of the gut microbiota in shaping interindividual differences in antidepressant treatment effectiveness. A comparative analysis of pharmacokinetic mechanisms (effects on drug absorption, metabolism, bioaccumulation, and blood–brain barrier permeability) and pharmacodynamic mechanisms (modulation of neurotransmitter systems, neuroplasticity, and neuroinflammation) is presented. Bidirectional interactions between antidepressants and the gut microbial community are also discussed. The available data indicate that although the microbiota functions as an active pharmacokinetic filter, its influence on pharmacodynamics appears to play a decisive role in determining variability in therapeutic response. Even when adequate drug delivery is achieved, intestinal dysbiosis may create an unfavorable pathophysiological milieu that impairs the functional state of central nervous system targets, primarily through suppression of neuroplasticity and induction of inflammation. This conclusion shifts the focus of future research from identifying pharmacokinetic predictors of response to investigating the microbiota-induced pharmacodynamic context. The development of personalized microbiome-modulating adjunctive interventions based on assessment of the functional state of the gut–brain axis appears to be a promising strategy for improving the effectiveness of antidepressant therapy.

Full Text

ВВЕДЕНИЕ

Депрессия относится к числу наиболее распространённых заболеваний и затрагивает все возрастные группы [1–3]. Согласно прогнозам, к 2030 году по числу дней нетрудоспособности она выйдет на первое место в мире среди всех болезней [4]. Высокая распространённость и социальная значимость депрессии диктуют необходимость повышения эффективности её лечения. Один из серьёзных вызовов на этом пути связан с выраженными межиндивидуальными различиями в эффективности антидепрессивной терапии [5].

Проблема усугубляется отсутствием надёжных инструментов прогнозирования терапевтического ответа. На сегодняшний день не существует клинически валидированных биомаркеров или других предикторов, которые позволили бы врачу заранее определить оптимальный препарат для конкретного пациента. Несмотря на большие надежды, возлагаемые на фармакогенетические и фармакогеномные исследования, с их помощью пока не удаётся добиться ощутимого прогресса в персонализации терапии [6, 7]. Отсутствие объективных предикторов эффективности зачастую вынуждает клиницистов прибегать к последовательному перебору антидепрессантов, что затягивает наступление ремиссии, увеличивает риск развития побочных эффектов и снижает приверженность лечению.

В поиске новых путей решения проблемы в фокусе внимания всё чаще оказывается ось «кишечник–мозг», представляющая собой двунаправленную систему коммуникации между желудочно-кишечным трактом (ЖКТ) и центральной нервной системой (ЦНС) [8–10]. Ключевым модулятором этой оси выступает кишечная микробиота — уникальная и чрезвычайно сложная экосистема, насчитывающая триллионы микроорганизмов и играющая важную роль в регуляции пищеварения, метаболизма, иммунной функции и, что особенно важно, деятельности ЦНС [11, 12]. По имеющимся данным, микробиом — совокупность всех элементов экосистемы (микроорганизмов, их генов и метаболитов) — вносит существенный вклад как в патогенез депрессии [13–15], так и в формирование ответа на терапию [16–18]. Установлена связь терапевтического ответа на антидепрессанты с микробным разнообразием (альфа-разнообразием) [19, 20] и с относительной долей определённых таксонов [21, 22]. Показано, что назначение пробиотиков потенцирует действие антидепрессантов [23, 24], тогда как кишечный дисбиоз (нарушение состава микробиоты), напротив — снижает антидепрессивный эффект [25].

Однако несмотря на растущий интерес к влиянию кишечной микробиоты на формирование терапевтического ответа [18, 20, 26], за рамками научного дискурса остаётся вопрос о том, какие именно механизмы — фармакокинетические (воздействие на биодоступность и концентрацию препарата в организме) или фармакодинамические (воздействие на мишени препарата) — в большей степени определяют это влияние. Между тем ответ на этот вопрос имеет не только теоретическое, но и практическое значение, поскольку во многом определяет потенциальные стратегии персонализации антидепрессивной терапии и поиска надёжных предикторов её эффективности.

Если ведущая роль принадлежит фармакокинетике, то ключ к персонализации — в управлении дозой и лекарственной формой (титрация, путь введения, разработка новых способов доставки). В этом случае поиск биомаркеров эффективности терапии среди особенностей микробиома может быть не столь эффективен. Если же основное значение имеют фармакодинамические механизмы, то это обосновывает поиск предикторов ответа среди показателей, связанных с самой микробиотой и сопутствующими патофизиологическими процессами (профилем микробных метаболитов, уровнем маркеров воспаления). При этом перспективной стратегией повышения эффективности лечения становится разработка методов коррекции микробного фона.

В обзоре обобщены современные научные данные о фармакокинетических и фармакодинамических механизмах влияния кишечной микробиоты на эффективность антидепрессантов, а также оценить их потенциальный вклад в межиндивидуальную вариабельность терапевтического ответа.

МЕТОДЫ

Стратегия поиска и источники информации

Для подготовки нарративного обзора осуществлён поиск публикаций в электронных базах данных MEDLINE (доступ через PubMed), Scopus, eLIBRARY.RU и КиберЛенинка.

Использовали следующие ключевые слова и их комбинации: “gut microbiota”, “microbiome”, “gut-brain axis”, “microbiota-gut-brain axis”, “antidepressants”, “SSRI”, “SNRI”, “tricyclic antidepressants”, “pharmacokinetics”, “pharmacodynamics”, “pharmacomicrobiomics”, “psychobiotics”, “depression”, “major depressive disorder”, “microbial diversity”, “antimicrobial activity”, “short chain fatty acids”, “vagus nerve”, “serotonin”, “tryptophan metabolism”, а также их русскоязычные эквиваленты. Поисковые запросы формулировали с использованием логических операторов, например: [(antidepressants OR SSRI) AND (gut-brain axis OR microbiome OR gut microbiota)] или [(depression OR major depressive disorder) AND (short chain fatty acids OR SCFA)].

Критерии соответствия и процесс отбора публикаций

Для отбора статей использовали следующие критерии.

Критерии включения:

  • клинические исследования и исследования на животных моделях, сфокусированные на взаимодействии антидепрессантов с осью «кишечник–мозг»;
  • исследования in vitro, в которых изучали взаимодействие антидепрессантов с микроорганизмами;
  • релевантные систематические обзоры, метаанализы и нарративные обзоры;
  • статьи, опубликованные на английском или русском языках.

Критерии невключения:

  • отдельные описания случаев и серий случаев;
  • публикации без рецензирования или тезисы конференций (из-за невозможности адекватно оценить методологию и полноту данных).

Процесс отбора публикаций состоял из нескольких этапов:

  1. первоначальный поиск и удаление дубликатов;
  2. скрининг по названиям и аннотациям для исключения заведомо нерелевантных работ;
  3. анализ полнотекстовых статей с оценкой их соответствия установленным критериям;
  4. поиск вручную по спискам литературы отобранных статей (метод «снежного кома») для идентификации дополнительных публикаций.

Для обеспечения актуальности данных приоритет отдавали исследованиям последних пяти лет — с сентября 2020 года по август 2025 года. При этом допускалось включение ключевых работ, опубликованных ранее.

Анализ и синтез данных

Результаты отобранных исследований разделили на две категории: фармакокинетические и фармакодинамические факторы влияния микробиоты на терапевтический ответ. Особое внимание уделяли механизмам взаимодействия между антидепрессантами, микробиотой и макроорганизмом, включая:

  • влияние микробиоты на компоненты фармакокинетики антидепрессантов;
  • влияние микробиоты на первичные мишени действия антидепрессантов (нейротрансмиттерные системы);
  • влияние микробиоты на нейропластичность;
  • роль микробиоты в развитии системного воспаления и нейровоспаления;
  • влияние антидепрессантов на микробное сообщество и передачу сигналов по оси «кишечник–мозг».

Результаты структурировали в соответствии с основными тематическими блоками для представления в отдельных разделах обзора. Учитывая его нарративный характер, формальный качественный или количественный синтез данных не проводили. Полученные данные интегрировали с фокусом на сравнительную оценку вклада фармакокинетических и фармакодинамических эффектов микробиоты в вариабельность терапевтического ответа. При обобщении результатов учитывали их согласованность, потенциальную клиническую значимость, наличие методологических ограничений и пробелов в текущих знаниях с целью определения перспективных направлений для дальнейших исследований.

ФАРМАКОКИНЕТИЧЕСКИЕ ЭФФЕКТЫ — МИКРОБИОТА КАК МЕТАБОЛИЗИРУЮЩИЙ БАРЬЕР

В соответствии с положениями классической фармакологии компонентами фармакокинетики являются всасывание, распределение, метаболизм и выведение лекарственных средств [27]. Микробиота способна в той или иной степени воздействовать на разные компоненты фармакокинетики антидепрессантов.

Влияние на всасывание и проницаемость кишечного барьера

На сегодняшний день о влиянии кишечной микробиоты на всасывание антидепрессантов известно немного, нам удалось обнаружить лишь отдельные косвенные данные. Например, добавление пробиотиков значимо повышает концентрацию перорально вводимых лекарственных препаратов в плазме крови у лабораторных животных [28–30], что указывает на возможное влияние микробиоты на всасывание.

Хорошо известно о существовании связи между депрессией и кишечным дисбиозом [31, 32]. Дисбиоз ассоциирован с повышенной проницаемостью кишечного барьера и изменением интестинального транспорта лекарственных веществ [33]. Одним из возможных механизмов нарушения барьерной функции служит снижение ферментативной активности кишечных бактерий. В результате уменьшается содержание короткоцепочечных жирных кислот (КЦЖК) — ацетата, пропионата, бутирата, которые являются основными продуктами ферментации пищевых волокон и необходимы для поддержания барьерной функции кишечника [34]. Другой механизм связан с выработкой бактериями фермента триптофаназы, расщепляющего триптофан на метаболиты, включая индол, который также регулирует проницаемость кишечного барьера [35]. Оба механизма могут оказывать влияние на всасывание антидепрессантов в ЖКТ.

Метаболизм антидепрессантов микробиотой

Представители микробиоты способны синтезировать ферменты, участвующие в метаболизме лекарств, в том числе антидепрессантов [36]. Исследование взаимодействия препаратов различных классов, включая 16 антидепрессантов (флуоксетин, флувоксамин, сертралин, пароксетин, циталопрам, венлафаксин, десвенлафаксинφ, милнаципран, дулоксетин, миансерин, тразодон, нефазодонφ, вилазодонφ, доксепинφ, тримипраминφ, бупропион), с основными таксонами микробиоты in vitro показало значимое снижение концентрации большинства препаратов по крайней мере одним из штаммов, тогда как в серии контрольных экспериментов (без бактерий) концентрации лекарственных средств практически не изменялись [37].

Интересно, что группировка препаратов на основе полученных данных об их метаболизме бактериями во многом отражала структурные особенности соединений, что указывает на возможность существования химических структур-мишеней для метаболических модификаций микробиотой. Анализ функциональных групп подтвердил, что определённые химические субструктуры определяют степень чувствительности соединения к микробному метаболизму. Кроме того, были идентифицированы ферменты, закодированные в метагеноме (совокупном геноме микробного сообщества), которые могут напрямую влиять на биотрансформацию препаратов в кишечнике [37].

Показано, что некоторые представители кишечной микробиоты способны осуществлять деметилирование антидепрессантов, в частности имипрамина, изменяя тем самым его концентрацию в плазме крови [38]. Кроме того, кишечные микроорганизмы воздействуют на энтерогепатическую циркуляцию антидепрессантов путём модуляции желчных кислот и активности β-глюкуронидазы, что, в свою очередь, влияет на реабсорбцию препаратов [39].

Биоаккумуляция антидепрессантов

Установлена способность кишечных бактерий биоаккумулировать антидепрессант дулоксетин и тем самым уменьшать его влияние на поведение лабораторных животных [40]. Биоаккумуляция — процесс, при котором бактерии поглощают и удерживают ксенобиотики, не метаболизируя их. При этом лекарственные вещества связываются с клеточными стенками, мембранами или внутриклеточными компонентами бактерий, что препятствует их всасыванию организмом-хозяином. Биоаккумуляция снижает концентрацию антидепрессантов в плазме крови и уменьшает их терапевтическую эффективность. Однако при гибели бактерий накопленные препараты высвобождаются в просвет кишечника и, попадая в системный кровоток, теоретически, способны вызывать токсические эффекты [39].

Влияние на биотрансформацию в печени

Помимо биоаккумуляции и прямого метаболизма в просвете кишечника, микробиота может оказывать дистанционное влияние на метаболизм ксенобиотиков, в первую очередь через регуляцию экспрессии и активности ферментов системы цитохрома P450 [41]. Показано, что у лабораторных животных-гнотобионтов (выращенных в течение нескольких поколений в стерильных условиях и практически лишённых микробиоты) значительно изменён профиль экспрессии изоформ цитохрома P450 в печени по сравнению с контрольными животными [42, 43]. Влияние микробиоты на ферменты системы цитохрома Р450 опосредовано микробными метаболитами, которые действуют как лиганды ядерных рецепторов, таких как PXR (Pregnane X Receptor) и FXR (Farnesoid X Receptor), регулирующих транскрипцию соответствующих генов [44]. Например, индол-3-пропионовая кислота — продукт метаболизма триптофана кишечными бактериями — способна ингибировать активность CYP1A2 (Cytochrome P450 1A2) и CYP2C9 (Cytochrome P450 2C9) [45]. Поскольку антидепрессанты являются субстратами ферментов цитохрома, межиндивидуальные различия микробиома могут влиять на скорость их метаболизма в печени.

Потенциальное влияние на распределение и экскрецию

Данные о влиянии микробиоты на распределение и выведение лекарственных препаратов крайне ограничены. Теоретически, опосредованное микробиотой системное воспаление и изменение уровня эндогенных метаболитов могут влиять на связывание препаратов с белками плазмы и функцию почечных транспортеров. Однако этот аспект влияния микробиоты на фармакокинетику антидепрессантов пока мало исследован.

Влияние на проницаемость гематоэнцефалического барьера

Важнейшим компонентом процесса распределения психофармакологических препаратов в организме является проникновение через гематоэнцефалический барьер (ГЭБ), определяющее доступ к мишеням в ЦНС. Состав и функциональная активность кишечной микробиоты существенно влияют на целостность и проницаемость ГЭБ [46]. Продуцируемые кишечной микробиотой КЦЖК стимулируют синтез белков плотных контактов — клаудина-5, окклюдина и зонулина-1 — необходимых для нормального функционирования гистогематических барьеров [47]. В условиях дисбиоза дефицит КЦЖК приводит к повышению проницаемости ГЭБ [48, 49]. С одной стороны, это облегчает доставку антидепрессантов к мишеням, но с другой — утрата защитной функции ГЭБ нарушает гомеостаз ЦНС и усугубляет текущие патофизиологические процессы [50].

Таким образом, совокупность имеющихся данных демонстрирует, что кишечная микробиота способна выступать в роли активного модулятора фармакокинетики антидепрессантов, влияя на их всасывание, метаболизм и распределение, включая проникновение через ГЭБ. Для оценки клинической значимости этих эффектов необходимо изучение фармакокинетических параметров на фоне дисбиоза. Однако несмотря на большое внимание к вопросам взаимодействия антидепрессантов и микробиоты [51–53], подобных исследований практически не проводится. Следует также учитывать, что индуцированные микробиотой изменения (например, повышение проницаемости барьеров) влекут за собой неизбежные патофизиологические последствия, что не позволяет оценивать их исключительно с позиций фармакокинетики, а требует обязательного учёта влияния на фармакодинамику.

ФАРМАКОДИНАМИЧЕСКИЕ ЭФФЕКТЫ — МИКРОБИОТА КАК МОДУЛЯТОР МИШЕНЕЙ В ЦЕНТРАЛЬНОЙ НЕРВНОЙ СИСТЕМЕ

Влияние микробиоты кишечника на фармакодинамику антидепрессантов заключается в изменении функционального состояния их центральных мишеней. Это многоуровневое влияние реализуется через несколько взаимосвязанных механизмов: модуляцию нейротрансмиттерных систем, регуляцию нейропластичности и индукцию системного воспаления.

Микробиота-зависимая модуляция нейротрансмиттерных систем — первичных мишеней антидепрессантов

Кишечная микробиота способна влиять на центральные нейротрансмиттерные системы, являющиеся основными молекулярными мишенями антидепрессантов. Конкретные пути этого влияния включают синтез нейроактивных метаболитов, изменение доступности предшественников для синтеза нейромедиаторов, а также модуляцию воспалительных процессов.

Серотонинергическая система. Большинство антидепрессантов, в том числе селективные ингибиторы обратного захвата серотонина (СИОЗС), ингибиторы обратного захвата серотонина и норадреналина (ИОЗСН) и трициклические антидепрессанты (ТЦА), изменяют функциональную активность серотонинергической передачи сигнала [54]. Согласно имеющимся данным, микробиота способна модулировать серотонинергическую систему.

Во-первых, определённые виды кишечных бактерий сами способны синтезировать серотонин [55], который, хотя и не проникает через ГЭБ, модулирует передачу сигналов в ЦНС, в частности по блуждающему нерву (подробнее см. ниже).

Во-вторых, кишечная микробиота играет существенную роль в метаболизме предшественника серотонина — триптофана [56]. Дисбиоз нарушает метаболизм триптофана, усиливая его катаболизм по кинурениновому пути [57]. С одной стороны, это приводит к образованию провоспалительных и нейротоксичных молекул, таких как хинолиновая кислота [58], а с другой — снижает доступность триптофана для синтеза серотонина [57]. Важность последнего механизма подтверждают результаты экспериментальных исследований, в которых трансплантация микробиоты от «депрессивных» мышей, подвергшихся хроническому стрессу, снижает у мышей-реципиентов уровень триптофана в плазме и серотонина в гиппокампе, подавляет экспрессию генов, отвечающих за синтез (TPH2) и обратный захват (SERT) серотонина, а также повышает активность генов, связанных с его распадом (MAOA) [25]. Введение на этом фоне флуоксетина не увеличивает уровень серотонина в гиппокампе, не улучшает нейрогенез и не купирует депрессивно-подобное поведение. В то же время, сочетанное введение флуоксетина и предшественника серотонина — 5-гидрокситриптофана — восстанавливает эффективность антидепрессанта [25].

Другие нейрохимические системы. Микробиом способен модулировать и другие нейротрансмиттерные системы, значимые для патогенеза депрессии и действия антидепрессантов. Показано, что накопление кинурениновой кислоты в ЦНС влияет на дофаминергическую передачу сигнала [59], что может вносить вклад в нарушение функционирования эндогенной системы вознаграждения и развитие ангедонии. Связь между кишечным дисбиозом и этим ключевым симптомом депрессии подтверждена результатами экспериментальных и клинических исследований [60–62].

Отдельные виды кишечных микроорганизмов способны продуцировать дофамин, норадреналин, гамма-аминомасляную кислоту (ГАМК), глутамат, а также влиять на их метаболизм [55, 63]. Как и серотонин, эти молекулы практически не проникают через ГЭБ, но могут изменять передачу сигналов из ЖКТ в ЦНС. В экспериментальных исследованиях продемонстрирована способность пробиотических штаммов (в частности, Lactobacillus rhamnosus) модулировать ГАМК-ергическую передачу нервного импульса через изменение экспрессии ГАМК-рецепторов в мозге [64]. Изменение ГАМК-ергической передачи, опосредованное микробиотой, может потенциально влиять на эффективность антидепрессантов. Хотя первичными нейрохимическими мишенями антидепрессантов являются моноаминовые системы, их результирующее фармакологическое действие может включать и ГАМК-ергические механизмы [65]. Дополнительный интерес вызывает потенциальное влияние микробиоты на глутаматергическую систему, поскольку в свете современных представлений она играет важную роль в патогенезе депрессии и быстром терапевтическом ответе на кетамин — антагонист NMDA-рецепторов [66].

Некоторые из продуцируемых микробиотой метаболитов могут проникать через ГЭБ. В частности, КЦЖК напрямую воздействуют на нейроны путём активации сопряжённых с G-белком рецепторов [67]. Кроме того, они уменьшают иммуновоспалительный ответ, воздействуя на микроглию [68]. Соответственно, дефицит КЦЖК, возникающий в условиях дисбиоза, способствует формированию провоспалительного статуса.

Таким образом, совокупность опосредованных дисбиозом нарушений нейрохимического гомеостаза, включая нейротрансмиттерные дисфункции, метаболический дисбаланс и активацию воспаления, создаёт неблагоприятный «фармакодинамический фон», который изменяет функциональное состояние первичных молекулярных мишеней антидепрессантов и негативно сказывается на формировании терапевтического ответа.

Влияние микробиоты на нейропластичность — центральное звено эффективности антидепрессантов

Современная парадигма действия антидепрессантов выходит далеко за рамки простого восполнения гипотетического дефицита моноаминов. Всё больше данных указывает на то, что в основе терапевтического эффекта этих препаратов лежит способность стимулировать нейропластичность — свойство мозга изменять свою структурно-функциональную организацию в ответ на те или иные воздействия [69–71]. Установлено, что кишечная микробиота способна влиять на ключевые процессы нейропластичности: нейрогенез (образование новых нейронов) и синаптическую пластичность (изменение эффективности существующих синапсов).

Регуляция мозгового нейротрофического фактора (BDNF). Одним из ведущих факторов нейропластичности является BDNF (Brain-Derived Neurotrophic Factor). Снижение его уровня в гиппокампе и префронтальной коре считается ключевым патогенетическим механизмом депрессии, а его восстановление — универсальным эффектом различных классов антидепрессантов, напрямую связанным с их терапевтической активностью [72–74].

Микробиом способен регулировать уровень экспрессии BDNF [75]. У мышей-гнотобионтов отмечено значимое снижение экспрессии BDNF в гиппокампе [76]. Показано также, что введение пробиотиков повышает уровень BDNF [77, 78]. Важнейшими посредниками здесь опять же выступают продуцируемые бактериями КЦЖК, особенно бутират, который ингибирует гистондеацетилазы, приводя тем самым к эпигенетическим изменениям, способствующим усилению экспрессии BDNF [79, 80]. Соответственно, наблюдаемый при дисбиозе дефицит КЦЖК, может блокировать универсальный механизм действия антидепрессантов — способность повышать уровень BDNF.

Нарушение нейрогенеза. Гиппокамп — область головного мозга, где нейрогенез продолжается во взрослом возрасте [81]. Снижение пролиферации и выживаемости новых нейронов в зубчатой извилине гиппокампа ассоциировано с депрессией, а стимуляция нейрогенеза рассматривается как необходимый компонент антидепрессивного эффекта [82, 83].

Данные экспериментальных исследований убедительно демонстрируют неблагоприятное влияние кишечного дисбиоза на нейрогенез. Показано, что трансплантация микробиоты от мышей, подвергавшихся хроническому непредсказуемому лёгкому стрессу, вызывает у мышей-реципиентов депрессивно-подобное поведение и подавляет нейрогенез в гиппокампе [84]. Пересадка крысам-гнотобионтам фекальной микробиоты пациентов с болезнью Альцгеймера также нарушает нейрогенез, в отличие от микробиоты здоровых доноров [85]. Введение комбинации пробиотических штаммов (Bacillus subtilis TO-A, Enterococcus faecium T-110 и Clostridium butyricum TO-A) восстанавливает нейрогенез у мышей-гнотобионтов, а также усиливает пролиферацию нейронов гиппокампа у здоровых мышей взрослого возраста [86]. Приведённые данные подтверждают, что микробиота является одним из важных факторов, влияющих на реализацию ключевого фармакодинамического эффекта антидепрессантов — стимуляцию нейрогенеза.

Модуляция синаптической пластичности. Помимо нейрогенеза, микробиота влияет на синаптическую пластичность — способность синапсов усиливать или ослаблять передачу сигнала в зависимости от функциональной активности нейронов (долговременная потенциация и долговременная депрессия). Показано, что у мышей с индуцированным антибиотиками истощением микробиоты, острый стресс изменяет синаптическую пластичность в гиппокампе. При этом КЦЖК не только восстанавливают активность синапсов, но и усиливают долгосрочную потенциацию независимо от наличия стресса [87]. Соответственно, снижение уровня КЦЖК при дисбиозе может нарушать синаптическую передачу и процессы, лежащие в основе формирования новых связей, в ключевых нейрональных цепях, регулирующих настроение (в частности, в гиппокампе), делая их менее восприимчивыми к действию антидепрессантов.

Таким образом, способность микробиоты кишечника модулировать нейропластичность опосредует влияние дисбиоза на фармакодинамику антидепрессивных средств. Терапевтическая активность антидепрессантов, чьим конечным эффектом является усиление экспрессии BDNF, нейрогенеза и синаптической пластичности, может оказаться под угрозой в условиях, когда критически нарушена основа для этих процессов — структурно-функциональное состояние микробиоты. Следовательно, индивидуальные особенности микробиома, определяющие потенциал нейропластичности, — это один из существенных факторов, влияющих на терапевтический ответ.

Дисбиоз — триггер системного воспаления и нейровоспаления

Наряду с воздействием на нейрохимические системы и пластичность мозга, ещё одним механизмом, опосредующим влияние микробиоты на фармакодинамику антидепрессантов, является индукция системного иммуновоспалительного ответа. Хроническое системное воспаление низкой интенсивности (low-grade systemic inflammation) рассматривается как одно из патогенетических звеньев депрессии [88, 89]. Кишечный дисбиоз является одним из мощных факторов инициации воспаления. Установлено, что депрессия ассоциирована с увеличением в кишечнике количества провоспалительных таксонов и уменьшением — противовоспалительных, продуцирующих КЦЖК [90].

Нарушение барьерной функции и транслокация бактериальных продуктов. Одним из последствий дисбиоза является повышение проницаемости кишечного барьера («синдром дырявого кишечника»), связанное с нарушением экспрессии белков плотных контактов, в том числе вследствие дефицита КЦЖК [91, 92]. Это приводит к транслокации в системный кровоток бактериальных продуктов, прежде всего липополисахарида (ЛПС) — компонента микробной стенки грамотрицательных бактерий. ЛПС связывается с Toll-подобными рецепторами на иммунных клетках и запускает каскад провоспалительных реакций с высвобождением цитокинов, таких как фактор некроза опухоли-α (Tumor Necrosis Factor-α, TNF-α) и интерлейкин-6 (IL-6) [93]. Циркулирующий ЛПС не проникает через ГЭБ, но усугубляет нарушение его барьерной функции, тем самым усиливая перемещение иммунных клеток и цитокинов в ЦНС [94].

Активация инфламмасомного пути. Дисбиоз и повышенная проницаемость кишечного барьера приводят к избыточному поступлению в системный кровоток и к тканям не только различных микробных компонентов (таких как ЛПС и пептидогликан), но и эндогенных молекул, высвобождающихся при повреждении клеток: АТФ, кристаллов мочевой кислоты и пр. Все эти вещества способны активировать инфламмасомы, в частности комплекс NLRP3 (NLR family pyrin domain containing 3) [95]. Активация инфламмасом в иммунных клетках (макрофагах и моноцитах) запускает каскад реакций, завершающийся созреванием и секрецией провоспалительных цитокинов — IL-1β и IL-18. Их высвобождение, в отличие от TNF-α или IL-6, зависит именно от инфламмасомного пути [96]. IL-1β является одним из наиболее мощных супрессоров синаптической пластичности и нейрогенеза в гиппокампе. В экспериментальных моделях на животных блокирование сигнального пути IL-1β оказывает эффект, аналогичный действию антидепрессантов [97]. Таким образом, активация инфламмасомного пути под влиянием дисбиоза опосредует формирование специфического провоспалительного фона, потенциально препятствующего адекватному терапевтическому ответу.

Нейровоспаление. Провоспалительные цитокины, преодолевая ГЭБ, активируют резидентные иммунные клетки (микроглию и астроциты) и инициируют развитие нейровоспаления [10, 98]. Показано, что пересадка мышам микробиоты от животных, подвергавшихся хроническому непредсказуемому лёгкому стрессу, индуцирует праймирование микроглии, которая становится более чувствительной к воздействию ЛПС и хронического стресса [84].

Нейровоспаление оказывает негативное влияние на фармакодинамические эффекты антидепрессантов. Провоспалительные цитокины активируют фермент индоламин-2,3-диоксигеназу, который перенаправляет метаболизм триптофана с пути синтеза серотонина на кинурениновый путь [99]. Как отмечалось выше, в результате снижается доступность серотонина — необходимого субстрата фармакодинамической активности большинства антидепрессантов. К тому же накопление метаболитов кинуренина, в частности хинолиновой кислоты, являющейся агонистом NMDA-рецепторов и усиливающей глутаматергическую эксайтотоксичность, приводит к подавлению нейропластичности и способствует нейродегенерации [57, 58]. Кроме того, провоспалительные цитокины, такие как TNF-α и IL-1β, напрямую ингибируют синаптическую пластичность и нейрогенез в гиппокампе, подавляя экспрессию BDNF и активируя внутриклеточные сигнальные пути, ведущие к апоптозу нейронов [100].

Противовоспалительная активность антидепрессантов. Воспалительный фон создаёт потенциал для реализации противовоспалительных эффектов, присущих антидепрессантам. Известно несколько механизмов воздействия антидепрессантов на воспаление:

  • прямое влияние на продукцию провоспалительных цитокинов — антидепрессанты способны ингибировать активацию факторов транскрипции и тем самым подавлять продукцию провоспалительных цитокинов иммунными клетками [101];
  • иммуномодуляция, опосредованная влиянием на уровень моноаминов — антидепрессанты повышают уровень серотонина и норадреналина, которые, взаимодействуя с рецепторами иммунных клеток, модулируют их функцию, еще больше подавляя высвобождение цитокинов [102];
  • восстановление чувствительности гипоталамо-гипофизарно-надпочечниковой оси к кортизолу — с депрессией часто ассоциированы гиперактивация этой оси и снижение чувствительности рецепторов к кортизолу (глюкокортикоидная резистентность), что может способствовать воспалению [103];
  • антиоксидантное действие — окислительный стресс тесно связан с воспалением, при этом некоторые антидепрессанты обладают выраженной антиоксидантной активностью — снижают уровень маркеров окислительного повреждения и повышают активность эндогенных антиоксидантных ферментов [104, 105];
  • FIASMA-эффект — некоторые представители СИОЗС и ТЦА обладают дополнительным противовоспалительным потенциалом, связанным с ингибированием кислой сфингомиелиназы, — так называемой FIASMA-активностью (Functional Inhibitor of Acid Sphingomyelinase) [106]; такие препараты снижают уровень провоспалительного церамида, который, помимо прочих эффектов, активирует инфламмасомы в клетках микроглии [107].

Таким образом, связанные с дисбиозом системное воспаление и нейровоспаление принимают непосредственное участие в формировании неблагоприятного фармакодинамического контекста, препятствующего реализации фармакологических эффектов антидепрессантов как на уровне первичных нейрохимических мишеней, так и нейропластичности. Противовоспалительные свойства самих антидепрессантов позволяют частично противодействовать этому фону, однако в условиях выраженного дисбиоза их действие может быть недостаточным.

ФАРМАКОДИНАМИЧЕСКАЯ РОЛЬ АНТИДЕПРЕССАНТ-ИНДУЦИРОВАННЫХ ИЗМЕНЕНИЙ МИКРОБИОТЫ

Рассматривая влияние микробиоты на фармакодинамику антидепрессантов, важно учитывать двунаправленный характер взаимодействия препаратов с осью «кишечник–мозг». Известно, что сами антидепрессанты способны изменять состав и функциональную активность кишечной микробиоты [108].

Антимикробное действие in vitro

Многие антидепрессанты обладают антимикробными свойствами и in vitro ингибируют рост как комменсалов, так и потенциальных патобионтов [109, 110]. Интересно, что представители различных классов антидепрессантов демонстрируют дифференцированную антимикробную активность (табл. 1), что позволяет предположить различия в механизмах их действия на микроорганизмы [52, 53]. Хотя эти механизмы до конца не изучены, они, вероятно, включают воздействие на бактериальные мембраны, системы эффлюкса и активность ДНК-гираз [109, 111]. Вместе с тем различия в антимикробной активности могут быть также связаны и с методологической неоднородностью исследований. При всей условности переноса данных in vitro на живой организм эти наблюдения, тем не менее, демонстрируют, что антидепрессанты способны напрямую взаимодействовать с микробным сообществом.

 

Таблица 1. Результаты исследований антимикробной активности антидепрессантов in vitro

Table 1. Results of in vitro studies on the antimicrobial activity of antidepressants

Класс антидепрессантов

Препарат

Эффекты в отношении кишечной микробиоты

Трициклические антидепрессанты

Амитриптилин

  • В различных дозах подавляет рост 185 из 254 бактериальных штаммов, в наибольшей степени Staphylococcus spp., Bacillus spp. и Vibrio cholerae;
  • Подавление роста Cryptococcus spp. и Candida albicans

Кломипрамин

Цитотоксические эффекты в отношении простейших Leishmania donovani и Leishmania major

Дезипраминφ

Антимикробная активность в отношении Plasmodium falciparum

Имипрамин

  • Цитотоксические эффекты в отношении простейших-паразитов человека Leishmania donovani и Leishmania major;
  • Подавление роста E. Coli, Yersinia enterocolitica и Giardia lamblia

Селективные ингибиторы обратного захвата серотонина

Флуоксетин

Выраженная дозозависимая антимикробная активность в отношении L. rhamnosus и E. coli

Эсциталопрам

Антимикробная активность в отношении E. coli

Сертралин

  • Выраженная антимикробная активность в отношении E. coli;
  • Подавление роста S. aureus, E. coli и P. aeruginosa; синергизм в комбинации с антибиотиками;
  • Выраженная противогрибковая активность в отношении Cryptococcus neoformans, Coccidioides immitis и Candida spp.;
  • В дозе 30 мг/л оказывает цитотоксическое действие в отношении 97,5% промастигот Leishmania donovani, в концентрации 3 мг/л значимо снижает жизнеспособность промастигот (61%)

Ингибиторы обратного захвата серотонина и норадреналина

Венлафаксин

  • Незначительная антимикробная активность;
  • Усиление антибактериального действия антибиотиков по отношению к резистентным штаммам

Другие

Бупропион⌀

Минимальная антимикробная активность

Кетамин

  • Антимикробная активность в отношении S. aureus, S. epidermidis, E. faecalis, S. pyogenes, P. aeruginosa и E. coli (в наибольшей степени — S. Aureus и S. pyogenes);
  • Устойчивая дозозависимая антимикробная активность в отношении микроорганизмов в пропофоле, который является мощным фактором роста

Примечание. Таблица адаптирована с изменениями из [52]. © Cussotto S. и соавт., 2019; распространяется на условиях лицензии CC-BY 4.0; φ лекарственное средство не зарегистрировано на территории РФ; ⌀ лекарственное средство в РФ аннулировано, то есть исключено из официального Регистра лекарственных средств.

 

Влияние на микробиоту in vivo

Более весомыми являются результаты исследований in vivo, подтверждающие способность антидепрессантов влиять на состав кишечной микробиоты (табл. 2). Важные данные получены в лонгитюдных исследованиях, в которых оценивали изменения микробиоты в ходе антидепрессивной терапии. Одной из наиболее воспроизводимых находок является то, что у пациентов с депрессией курсовой приём антидепрессантов нормализует состав микробного сообщества, приближая его к микробному профилю здоровых лиц [18, 112, 113].

 

Таблица 2. Результаты исследований влияния антидепрессантов на состав кишечной микробиоты in vivo

Table 2. Results of in vivo studies on the effects of antidepressants on gut microbiota composition

Класс антидепрессантов

Препарат

Основные эффекты

Трициклические антидепрессанты

Амитриптилин

Увеличение альфа-разнообразия у лабораторных животных

Селективные ингибиторы обратного захвата серотонина

Флуоксетин

Противоречивые данные о влиянии на уровень Bacteroidetes и альфа-разнообразие у лабораторных животных (от снижения до повышения)

Циталопрам / Эсциталопрам

  • Уменьшение альфа-разнообразия у лабораторных животных;
  • Нормализация состава микробиоты у пациентов с большим депрессивным расстройством

Пароксетин

Уменьшение альфа-разнообразия у лабораторных животных

Ингибиторы обратного захвата серотонина и норадреналина

Венлафаксин

  • Уменьшение альфа-разнообразия у лабораторных животных;
  • Увеличение альфа-разнообразия у пациентов с большим депрессивным расстройством

Дулоксетин

  • Уменьшение альфа-разнообразия у лабораторных животных;
  • Отсутствие влияния у пациентов с большим депрессивным расстройством и коморбидным синдромом раздражённого кишечника

Другие

Вортиоксетин

Нормализация состава кишечной микробиоты у пациентов с большим депрессивным расстройством

Кетамин

Противоречивые данные о влиянии на альфа-разнообразие у лабораторных животных (от отсутствия влияния до повышения)

Примечание. Таблица адаптирована с изменениями из [51]. © Brown L.C. и соавт., 2023; распространяется на условиях лицензии CC-BY 4.0.

 

Механизмы влияния антидепрессантов на микробиоту не сводятся исключительно к антимикробной активности. Безусловно, способность ингибировать рост определённых таксонов может частично объяснять изменения их представленности в составе микробиоты. Однако антидепрессанты влияют на микробиоту ещё и через организм хозяина, модифицируя среду обитания микроорганизмов. Один из механизмов — модуляция моторной функции кишечника. Так, СИОЗС повышают уровень серотонина (ключевого регулятора моторики ЖКТ) в кишечной стенке и тем самым оказывают прокинетическое действие, тогда как ТЦА благодаря своей антихолинергической активности, напротив, ослабляют перистальтику [114]. Это влияет на время транзита, доступность субстратов и, следовательно, на состав и метаболическую активность микробиоты. Другой механизм связан с уменьшением системного и локального воспаления. Противовоспалительное действие антидепрессантов способствует нормализации кишечного барьера и формированию в ЖКТ менее воспалительной среды, что благоприятствует росту полезных комменсалов [33]. Наконец, действие препаратов in vivo включает влияние на функциональную активность микробного сообщества, что изменяет профиль вырабатываемых метаболитов (таких как КЦЖК, нейротрансмиттеры и витамины) [16, 40] и выступает мощным фактором селекции.

Изменение микробного профиля как компонент фармакодинамики

Способность антидепрессантов изменять состав микробного сообщества ставит вопрос, являются ли эти изменения значимым компонентом фармакодинамики препаратов или просто дополнительным «бонусом»?

Результаты экспериментальных исследований показывают, что воздействие на микробиоту может вносить вклад в реализацию антидепрессивного эффекта. Установлено, что введение дулоксетина купирует у мышей депрессивно-подобное поведение и изменяет состав кишечной микробиоты, в частности уменьшает представленность бактерий Ruminococcus flavefaciens. При этом искусственная инверсия этих изменений путём введения данного бактериального штамма совместно с дулоксетином блокирует действие антидепрессанта [115]. Это доказывает, что определённые сдвиги в составе микробиоты необходимы для реализации эффектов антидепрессанта в экспериментальных моделях. Если бы изменение микробного профиля было лишь эпифеноменом, его инверсия не влияла бы на действие препарата. Приведённые данные позволяют рассматривать воздействие на микробиоту в качестве значимого компонента фармакодинамики антидепрессантов.

Влияние на коммуникацию по оси «кишечник–мозг»

Согласно существующим представлениям о функционировании оси «кишечник–мозг», антидепрессант-индуцированные изменения микробиома приводят к мультимодальной перестройке передачи сигналов по всем «каналам связи» между ЖКТ и ЦНС: метаболическому — изменение профиля КЦЖК и других нейроактивных метаболитов, иммунному — модуляция цитокинового профиля, нейроэндокринному — влияние на гипоталамо-гипофизарно-надпочечниковую ось и вагусному — изменение афферентных сигналов [38, 116]. Отдельного внимания заслуживает прямая модуляция афферентных сигналов блуждающего нерва, которая может реализовываться независимо от изменений в составе микробиоты. Как известно, основным местом синтеза серотонина в организме является ЖКТ. Блокада клеточного захвата серотонина большинством антидепрессантов (СИОЗС, ИОЗСН, ТЦА) существенно повышает его локальную концентрацию [117]. Стимулируя афферентные волокна блуждающего нерва, серотонин модулирует передачу сигнала из ЖКТ в ЦНС. Доказательства значимости подобного механизма получены в исследованиях на лабораторных животных, показавших, что ваготомия блокирует действие СИОЗС, но не влияет на эффективность бупропиона⊗ [118, 119]. Эти данные указывают на вероятный вклад периферического серотонинергического эффекта в антидепрессивную активность и демонстрируют способность антидепрессантов изменять передачу сигналов по блуждающему нерву не только опосредованно — через микробиоту, но и напрямую. При этом рассмотренный выше метаболизм триптофана, зависимый от микробиома, является важным фактором, определяющим уровень серотонина в ЖКТ и, следовательно, потенциал для реализации периферического фармакодинамического эффекта антидепрессантов.

Таким образом, экспериментальные и клинические данные свидетельствуют о способности антидепрессантов оказывать благоприятное влияние на таксономический состав и функциональную активность кишечной микробиоты. Это влияние реализуется как за счёт прямых эффектов (антимикробная активность), так и через изменение физиологической среды (моторика кишечника, воспаление). Нормализуя состояние микробного сообщества, антидепрессанты могут опосредованно усиливать нейропластичность и подавлять воспаление, тем самым улучшая фармакодинамический контекст, необходимый для их собственной эффективности. Соответственно, индивидуальный ответ на антидепрессанты будет зависеть от результирующего взаимодействия комплекса фармакодинамических эффектов, включая модулирующее влияние на микробиоту и коммуникацию по оси «кишечник–мозг».

ОБСУЖДЕНИЕ

Результаты проведённого нарративного обзора подтверждают роль кишечной микробиоты как значимого фактора, влияющего на эффективность антидепрессивной терапии. Обсуждение направлено на сравнительную оценку вклада фармакокинетических и фармакодинамических механизмов этого влияния в межиндивидуальную вариабельность терапевтического ответа.

Анализ имеющихся данных позволяет утверждать, что микробиота функционирует как активный фармакокинетический «фильтр», способный влиять на концентрацию препарата, поступающего в системный кровоток и достигающего мишеней в ЦНС. Данные о прямом микробном метаболизме и биоаккумуляции препаратов, а также о модуляции активности печёночных ферментов, убедительно это доказывают. Современные методы машинного обучения позволяют прогнозировать лекарственно-микробные взаимодействия, включая метаболизм и биоаккумуляцию препаратов кишечной микробиотой [120]. Однако вклад фармакокинетических эффектов микробиоты в межиндивидуальную вариабельность терапевтического ответа, по-видимому, не имеет первостепенного клинического значения. Во-первых, влияние микробиоты на фармакокинетические параметры может быть компенсировано титрацией дозы. Во-вторых, отсутствие для большинства антидепрессантов надёжных зависимостей «доза–эффект» и «концентрация–эффект» [121, 122] указывает на то, что вариабельность ответа в большей степени определяется факторами, связанными с мишенями терапии, то есть с фармакодинамикой.

Яркой иллюстрацией служит влияние микробиоты на проницаемость защитных барьеров — кишечного и ГЭБ. С одной стороны, индуцированное дисбиозом повышение проницаемости может рассматриваться как фармакокинетический фактор, потенциально увеличивающий доставку препарата в системный кровоток и далее в мозг — к его первичным нейрохимическим мишеням. С другой стороны, повышенная проницаемость барьеров является важным патофизиологическим механизмом, ассоциированным с системным и нейровоспалением, нарушением гомеостаза ЦНС, повреждением нейронов и нейрональных сетей [48, 50]. Тем самым, потенциальный «выигрыш» в доставке препарата может нивелироваться ухудшением «почвы», на которую этот препарат призван воздействовать. Это наглядно демонстрирует, что оценка изолированных фармакокинетических эффектов микробиоты без учёта формируемого ею же патофизиологического контекста (фармакодинамического фона) не имеет смысла.

Проведённый анализ литературы позволяет сделать вывод, что именно влияние микробиоты на фармакодинамику играет решающую роль в вариабельности терапевтического ответа. Основной тезис заключается в том, что даже при адекватной доставке препарата в ЦНС терапевтический ответ может отсутствовать, если первичные или конечные мишени функционально или структурно изменены вследствие дисбиоза. Иными словами, приоритетная значимость фармакодинамических факторов подтверждается их способностью объяснять вариабельность ответа на антидепрессант даже при сравнимых концентрациях препарата в крови и в ЦНС, тогда как фармакокинетические различия потенциально могут быть компенсированы (табл. 3).

 

Таблица 3. Сравнительная характеристика фармакокинетического и фармакодинамического влияния микробиоты на вариабельность терапевтического ответа

Table 3. Comparative characteristics of pharmacokinetic and pharmacodynamic effects of the microbiota on variability in therapeutic response

Аспект

Фармакокинетическое влияние

Фармакодинамическое влияние

Основной механизм

Изменение концентрации препарата в системном кровотоке и центральной нервной системе

Изменение функционального состояния и чувствительности мишеней препарата

Пути реализации

Метаболизм препарата бактериями, биоаккумуляция, модуляция ферментов системы цитохрома P450

Дисрегуляция нейротрансмиттерных систем, подавление нейропластичности, индукция нейровоспаления

Клиническая значимость

Объясняет вариабельность концентраций препарата в организме

Объясняет вариабельность эффекта при одинаковых концентрациях

Потенциал для коррекции

Изменение дозы и/или пути введения

Целенаправленная модуляция микробиома

 

Наиболее убедительные доказательства приоритета фармакодинамических механизмов получены в экспериментальных исследованиях, где трансплантация «депрессивной» микробиоты снижала уровень серотонина в гиппокампе, изменяла экспрессию генов серотонинергической системы, включая SERT, а также блокировала действие флуоксетина [25]. Особую важность имеет тот факт, что действие антидепрессанта восстанавливалось введением предшественника серотонина — 5-гидрокситриптофана [25]. Это доказывает, что влияние дисбиоза реализуется именно на фармакодинамическом уровне. Если бы причина заключалась в фармакокинетике (например, в разрушении флуоксетина микробиотой или снижении его биодоступности), то введение 5-гидрокситриптофана не могло бы восстановить эффективность антидепрессанта. Иными словами, дисбиоз способен создавать такой патофизиологический фон — с дефицитом субстрата (серотонина) и изменением экспрессии молекулярной мишени (серотонинового транспортера), — при котором первичная нейрохимическая мишень становится нерелевантной, независимо от концентрации препарата в ЦНС.

Существенный вклад в межиндивидуальные различия терапевтического ответа может вносить влияние микробиоты на нейропластичность. Именно нейропластичность является конечной мишенью действия антидепрессантов, поскольку согласно современным представлениям их терапевтический эффект связан со способностью повышать уровень BDNF, стимулировать нейрогенез и синаптическую пластичность [71, 74, 82]. Кишечный микробиом выступает регулятором этих процессов [75, 84, 87]. Дисбиоз, сопровождающийся снижением выработки КЦЖК, подавляет экспрессию BDNF и нейрогенез в гиппокампе, тем самым лишая антидепрессанты их конечной точки приложения. Соответственно, индивидуальные особенности микробиома, определяющие его способность поддерживать нейропластичность, напрямую влияют на терапевтический ответ.

Еще одним механизмом, опосредующим вариабельность ответа, является провоспалительный статус, тесно ассоциированный с кишечным дисбиозом. Системное воспаление выступает в роли интегративного патогенетического пути, индуцирующего или усугубляющего нарушения сразу нескольких ключевых мишеней антидепрессантов, включая моноаминергическую передачу сигнала, синаптическую пластичность и нейрогенез. Это объясняет, почему у пациентов с дисбиозом и воспалительным фенотипом стандартная терапия может быть недостаточно эффективной [88, 89]. Клинические и экспериментальные данные подтверждают эту связь: у пациентов с недостаточным ответом на антидепрессивную терапию часто выявляется повышенный уровень маркеров воспаления [123], а в экспериментальных моделях провоспалительный статус, например индуцированный введением ЛПС, блокирует поведенческие эффекты антидепрессантов [124]. Следовательно, межиндивидуальные различия в выраженности воспаления, ассоциированного с дисбиозом, являются значимым фактором фармакодинамической вариабельности.

Важная роль во влиянии микробиоты на фармакодинамику антидепрессантов принадлежит петле положительной обратной связи, образующейся в результате воздействия препаратов на микробный профиль. Нормализующее влияние антидепрессантов на состав микробного сообщества [18, 112, 113] является компонентом фармакодинамического механизма, необходимым для полноценного терапевтического ответа. Доказательством этому служат рассмотренные в предыдущем разделе экспериментальные данные: «принудительное» поддержание исходного дисбиотического состояния путём введения определённых штаммов бактерий полностью блокирует антидепрессивное действие [115]. Существуют и другие, независимые линии доказательств. Во-первых, потенциальная антидепрессивная активность пробиотиков и антимикробных средств [125–127] демонстрирует, что модуляция микробиоты сама по себе способна влиять на состояние ЦНС, создавая благоприятный фармакодинамический фон. Во-вторых, экспериментальные исследования с ваготомией, блокирующей эффекты антидепрессантов [118, 119], подтверждают, что передача сигналов из ЖКТ в ЦНС критически важна для реализации терапевтического действия. Совокупность этих данных позволяет предположить, что межиндивидуальные различия в структуре микробиоты и её потенциале к целенаправленным антидепрессант-индуцированным изменениям определяют способность препарата запустить терапевтическую петлю обратной связи, что может вносить значимый вклад в вариабельность конечного терапевтического ответа.

Помимо «традиционных» путей коммуникации между ЖКТ и ЦНС — метаболического, нейроэндокринного, иммунного, вагусного — в качестве потенциально значимого, хотя и менее изученного «канала связи» можно рассмотреть малые внеклеточные везикулы, выделяемые как кишечными бактериями, так и клетками организма-хозяина. Эти мембранные пузырьки, содержащие белки, липиды, нуклеиновые кислоты (микроРНК) и другие вещества, способны преодолевать биологические барьеры, попадать в системный кровоток и достигать всех органов и тканей [128]. Индивидуальные особенности внеклеточных везикул, определяемые составом микробиоты и состоянием макроорганизма, могут создавать ещё один уровень межиндивидуальной вариабельности. С одной стороны, доставляя биологически активные молекулы в ЦНС, внеклеточные везикулы могут напрямую модулировать нейрональную функцию и нейропластичность. Так, показана противовоспалительная активность внеклеточных везикул, продуцируемых определёнными кишечными бактериями [129], что позволяет им непосредственно влиять на фармакодинамический фон. С другой стороны, взаимодействуя с клетками печени, содержимое внеклеточных везикул, теоретически, может регулировать экспрессию ферментов системы цитохрома P450 [130] и изменять метаболизм антидепрессантов. Следовательно, один и тот же механизм, связанный с микробиотой, потенциально может вносить вклад в вариабельность терапевтического ответа, одновременно воздействуя на оба компонента — фармакокинетику и фармакодинамику.

Таким образом, для адекватного описания сложных взаимодействий между антидепрессантами, кишечной микробиотой и организмом-хозяином классическая фармакологическая парадигма, строго разделяющая «то, что организм делает с лекарством» (фармакокинетика) и «то, что лекарство делает с организмом» (фармакодинамика), оказывается недостаточной. Проведённый анализ, хотя и выявляет приоритет фармакодинамических влияний в формировании вариабельности терапевтического ответа, одновременно демонстрирует их глубинную взаимосвязь с фармакокинетическими процессами. Ограниченность классической дихотомической парадигмы требует иного методологического подхода, который предлагает новая научная дисциплина — фармакомикробиомика [51, 131]. Эта дисциплина не противопоставляет фармакокинетику и фармакодинамику, а рассматривает их в рамках взаимозависимых отношений внутри единой системы «лекарство–микробиом–макроорганизм». Такой холистический подход не отменяет выявленного приоритета фармакодинамических эффектов микробиоты, а напротив, подчёркивает, что таргетные воздействия для повышения эффективности терапии должны быть направлены прежде всего на коррекцию фармакодинамического фона.

Ограничения

Несмотря на стремление к комплексному анализу проблемы, настоящий обзор имеет ряд неизбежных ограничений, которые важно учитывать при интерпретации его результатов и выводов.

Отбор исследований. Поскольку обзор является нарративным, а не систематическим, подбор литературы мог быть подвержен субъективному влиянию, хотя авторы и стремились максимально полно осветить тему. Для более однозначных выводов и количественной оценки эффектов в будущем необходимы систематические обзоры и метаанализы, проведение которых станет возможным, как только накопится достаточное количество однородных данных.

Гетерогенность дизайна и методов. Существенная неоднородность исследований, а именно различия в дизайне, выборках и методах анализа микробиома, затрудняет прямое сравнение их результатов и формирование единой, непротиворечивой картины, а следовательно ограничивает возможности интерпретации полученных данных.

Преобладание экспериментальных данных. Подавляющее большинство доказательных данных, особенно касающихся причинно-следственных связей, получено в исследованиях на лабораторных животных. Экстраполяция выводов с экспериментальных моделей на человека требует крайней осторожности, что затрудняет формулировку конкретных практических рекомендаций.

Фокус на общих закономерностях. Обзор сосредоточен на самых общих патогенетических путях, таких как воспаление и нейропластичность. В его задачи не входил анализ возможных различий во влиянии микробиоты на фармакокинетику и фармакодинамику отдельных антидепрессантов или их классов. Однако эти различия, обусловленные особенностями метаболизма и механизмов действия препаратов, могут быть значимыми и требуют отдельного изучения.

Учёт перечисленных ограничений позволяет более объективно оценить представленные выводы и обозначить направления для будущих исследований, призванных восполнить имеющиеся пробелы в научных знаниях.

Перспективные направления для будущих исследований

Несмотря на стремительное развитие обсуждаемой области, многие вопросы пока остаются открытыми.

Недостаток клинических исследований. Обращает на себя внимание явный дефицит лонгитюдных исследований с всесторонней и динамической оценкой микробиома, фармакокинетических параметров антидепрессантов, маркеров воспаления и нейропластичности, а также терапевтического ответа.

Проблема стандартизации. Требуется разработка стандартизированных протоколов для сбора образцов, метагеномного анализа и функциональной характеристики микробиома, чтобы сделать результаты разных исследований сопоставимыми.

Сложность двунаправленных взаимодействий. Не до конца изучены механизмы, с помощью которых антидепрессанты изменяют состав микробиоты, и как именно эти изменения опосредуют их терапевтический эффект. Перспективным направлением представляется изучение роли вагусной афферентации, индуцированной периферическим серотонином, в реализации терапевтической активности антидепрессантов.

Терапевтические интервенции. Будущие исследования должны быть направлены на определение конкретных таксонов бактерий или их метаболитов (постбиотиков), которые являются критически важными для обеспечения ответа на антидепрессанты. Это откроет путь к созданию целевых интервенций — от специфических психобиотиков до методов микробного инжиниринга.

Риски модуляции микробиома. Крайне важна оценка безопасности таргетных воздействий на микробиом. Микробное сообщество представляет собой сложную экосистему, находящуюся в динамическом равновесии с организмом-хозяином, и попытки вмешательства могут приводить к непредсказуемым системным сдвигам. В связи с этим будущие исследования должны быть направлены не только на оценку эффективности, но и на всестороннее изучение отдалённых последствий модуляции микробиома для здоровья, что является одним из серьёзных пробелов в современных знаниях.

ЗАКЛЮЧЕНИЕ

Анализ актуальных научных данных, представленных в обзоре, позволяет заключить, что кишечная микробиота способна влиять на эффективность антидепрессантов как через фармакокинетические, так и фармакодинамические механизмы. При этом решающий вклад в межиндивидуальную вариабельность терапевтического ответа вносит её влияние на фармакодинамику. Микробиота выступает не столько в роли «фильтра», изменяющего концентрацию препарата, сколько в качестве модулятора патофизиологических процессов, формирующего индивидуальный фармакодинамический контекст. Именно этот контекст, подверженный влиянию микробиоты через модуляцию нейровоспаления, нейротрансмиттерных систем и, самое главное, нейропластичности, определяет, сможет ли препарат реализовать свой терапевтический потенциал. Этот вывод имеет важное значение для дальнейших исследований, поскольку смещает фокус с поиска фармакокинетических предикторов ответа на изучение биомаркеров функционального состояния оси «кишечник–мозг», а также с концепции «неподходящего препарата» на концепцию «неподходящего фармакодинамического фона», который поддаётся целенаправленной коррекции. Для клиницистов это означает более пристальное внимание к состоянию ЖКТ и маркерам воспаления у пациентов с недостаточным ответом на лечение, а также обоснованное рассмотрение потенциальных адъювантных вмешательств (диетотерапии, назначения пробиотиков), направленных на модуляцию оси «кишечник–мозг». Интеграция принципов фармакомикробиомики в исследовательскую и клиническую практику представляется перспективным путём к повышению эффективности антидепрессивной терапии и разработке «сверхперсонализированных» стратегий, учитывающих уникальность не только генома пациента, но и его метагенома.

ДОПОЛНИТЕЛЬНАЯ ИНФОРМАЦИЯ

Вклад авторов. М.Ю. Попов — разработка общей концепции, работа с данными, написание черновик рукописи, пересмотр и редактирование рукописи; О.В. Лепик — работа с данными, написание черновика рукописи. Все авторы одобрили рукопись (версию для публикации), а также согласились нести ответственность за все аспекты настоящей работы, гарантируют надлежащее рассмотрение и решение вопросов, связанных с точностью и добросовестностью любой её части.

Источники финансирования. Отсутствуют.

Раскрытие интересов. Авторы заявляют об отсутствии отношений, деятельности и интересов за последние три года, связанных с третьими лицами (коммерческими и некоммерческими организациями), интересы которых могут быть затронуты содержанием статьи.

Оригинальность. При проведении исследования и создании настоящей статьи авторы не использовали ранее опубликованные сведения (текст, иллюстрации, данные).

Доступ к данным. Неприменимо, новые данные не собирали и не создавали.

Генеративный искусственный интеллект. При создании настоящей статьи технологии генеративного искусственного интеллекта не использовали.

Рассмотрение и рецензирование. Настоящая работа подана в журнал в инициативном порядке и рассмотрена по обычной процедуре. В рецензировании участвовали два внешних рецензента, член редакционной коллегии и научный редактор издания.

ADDITIONAL INFORMATION

Author contributions: M.Yu. Popov: conceptualization, data curation, writing—original draft, writing—review & editing; O.V. Lepik: data curation, writing—original draft. All the authors approved the version of the manuscript to be published and agreed to be accountable for all aspects of the work, ensuring that questions related to the accuracy or integrity of any part of the work are appropriately investigated and resolved.

Funding sources: No funding.

Disclosure of interests: The authors have no relationships, activities, or interests for the last three years related to for-profit or not-for-profit third parties whose interests may be affected by the content of the article.

Statement of originality: No previously obtained or published material (text, images, or data) was used in this study.

Data availability statement: Not applicable; no new data was collected or created.

Generative AI: No generative artificial intelligence technologies were used to prepare this article.

Provenance and peer-review: This article was submitted unsolicited and reviewed following the standard procedure. The peer-review process involved two external reviewers, a member of the Editorial Board, and the in-house science editor.

 

φ Лекарственное средство не зарегистрировано в РФ.

Лекарственное средство в РФ аннулировано, то есть исключено из официального Регистра лекарственных средств.

×

About the authors

Mikhail Yu. Popov

V.M. Bekhterev National Medical Research Centre for Psychiatry and Neurology

Author for correspondence.
Email: popovmikhail@mail.ru
ORCID iD: 0000-0002-7905-4583
SPIN-code: 6916-8907

MD, Dr. Sci. (Medicine)

Russian Federation, Saint Petersburg

Olga V. Lepik

V.M. Bekhterev National Medical Research Centre for Psychiatry and Neurology

Email: ovlepik@gmail.com
ORCID iD: 0000-0001-9516-4427
SPIN-code: 5859-3236
Russian Federation, Saint Petersburg

References

  1. Gutiérrez-Rojas L, Porras-Segovia A, Dunne H, et al. Prevalence and correlates of major depressive disorder: a systematic review. Braz J Psychiatry. 2020;42(6):657–672. doi: 10.1590/1516-4446-2020-0650 EDN: LOCPKI
  2. Abdoli N, Salari N, Darvishi N, et al. The global prevalence of major depressive disorder (MDD) among the elderly: A systematic review and meta-analysis. Neurosci Biobehav Rev. 2022;132:1067–1073. doi: 10.1016/j.neubiorev.2021.10.041 EDN: JRHQBZ
  3. Lu B, Lin L, Su X. Global burden of depression or depressive symptoms in children and adolescents: A systematic review and meta-analysis. J Affect Disord. 2024;354:553–562. doi: 10.1016/j.jad.2024.03.074 EDN: BUOWGX
  4. Zhang Y, Jia X, Yang Y, et al. Change in the global burden of depression from 1990-2019 and its prediction for 2030. J Psychiatr Res. 2024;178:16–22. doi: 10.1016/j.jpsychires.2024.07.054 EDN: JBIBGX
  5. Munkholm K, Winkelbeiner S, Homan P. Individual response to antidepressants for depression in adults-a meta-analysis and simulation study. PLoS One. 2020;15(8):e0237950. doi: 10.1371/journal.pone.0237950 EDN: FIIYJF
  6. Smith TL, Nemeroff CB. Pharmacogenomic testing and antidepressant response: problems and promises. Braz J Psychiatry. 2020;42(2):116–117. doi: 10.1590/1516-4446-2019-0799 EDN: ZXZFGG
  7. Frye MA, Nemeroff CB. Pharmacogenomic testing for antidepressant treatment selection: lessons learned and roadmap forward. Neuropsychopharmacology. 2024;49(1):282–284. doi: 10.1038/s41386-023-01667-4 EDN: QYEJEY
  8. Zhu F, Tu H, Chen T. The microbiota-gut-brain axis in depression: The potential pathophysiological mechanisms and microbiota combined antidepression effect. Nutrients. 2022;14(10):2081. doi: 10.3390/nu14102081 EDN: ZSRIBI
  9. Mayer EA, Nance K, Chen S. The gut-brain axis. Annu Rev Med. 2022;73:439–453. doi: 10.1146/annurev-med-042320-014032 EDN: MERWBL
  10. Reyes-Martínez S, Segura-Real L, Gómez-García AP, et al. Neuroinflammation, microbiota-gut-brain axis, and depression: The vicious circle. J Integr Neurosci. 2023;22(3):65. doi: 10.31083/j.jin2203065 EDN: JZBPLE
  11. Cryan JF, O'Riordan KJ, Cowan CSM, et al. The microbiota-gut-brain axis. Physiol Rev. 2019;99(4):1877–2013. doi: 10.1152/physrev.00018.2018 EDN: TDLZAT
  12. Bhatia NY, Jalgaonkar MP, Hargude AB, et al. Gut-brain axis and neurological disorders-how microbiomes affect our mental health. CNS Neurol Disord Drug Targets. 2023;22(7):1008–1030. doi: 10.2174/1871527321666220822172039 EDN: EXKUVC
  13. Chang L, Wei Y, Hashimoto K. Brain-gut-microbiota axis in depression: A historical overview and future directions. Brain Res Bull. 2022;182:44–56. doi: 10.1016/j.brainresbull.2022.02.004 EDN: RWKRJH
  14. Yao H, Zhang D, Yu H, et al. The microbiota-gut-brain axis in pathogenesis of depression: A narrative review. Physiol Behav. 2023;260:114056. doi: 10.1016/j.physbeh.2022.114056 EDN: HPFELL
  15. Mohan A, Godugu S, Joshi SS, et al. Gut-brain axis: altered microbiome and depression – review. Ann Med Surg (Lond). 2023;85(5):1784–1789. doi: 10.1097/MS9.0000000000000573 EDN: JLIGZC
  16. Rukavishnikov GV, Leonova LV, Kaysanov ED, et al. The antidepressants effects on microbiota: unobvious possibilities. V.M. Bekhterev Review of Psychiatry and Medical Psychology. 2021;55(4):8–14. doi: 10.31363/2313-7053-2021-57-4-8-14 EDN: IYMVFX
  17. Chen Y, Liu Y, Pu J, et al. Treatment response of venlafaxine induced alterations of gut microbiota and metabolites in a mouse model of depression. Metab Brain Dis. 2024;39(8):1505–1521. doi: 10.1007/s11011-024-01403-x EDN: UHJYXD
  18. Borgiani G, Possidente C, Fabbri C, et al. The bidirectional interaction between antidepressants and the gut microbiota: are there implications for treatment response? Int Clin Psychopharmacol. 2025;40(1):3–26. doi: 10.1097/YIC.0000000000000533 EDN: YCHOXC
  19. Minichino A, Preston T, Fanshawe JB, et al. Psycho-pharmacomicrobiomics: A systematic review and meta-analysis. Biol Psychiatry. 2024;95(7):611–628. doi: 10.1016/j.biopsych.2023.07.019 EDN: FEVESC
  20. Wang Y, Zhou J, Ye J, et al. Multi-omics reveal microbial determinants impacting the treatment outcome of antidepressants in major depressive disorder. Microbiome. 2023;11(1):195. doi: 10.1186/s40168-023-01635-6 EDN: DNZCKG
  21. Fontana A, Manchia M, Panebianco C, et al. Exploring the role of gut microbiota in major depressive disorder and in treatment resistance to antidepressants. Biomedicines. 2020;8(9):311. doi: 10.3390/biomedicines8090311 EDN: GHVOSP
  22. Dong Z, Shen X, Hao Y, et al. Gut microbiome: A potential indicator for predicting treatment outcomes in major depressive disorder. Front Neurosci. 2022;16:813075. doi: 10.3389/fnins.2022.813075 EDN: WHSLZJ
  23. Nikolova VL, Cleare AJ, Young AH, Stone JM. Acceptability, tolerability, and estimates of putative treatment effects of probiotics as adjunctive treatment in patients with depression: A randomized clinical trial. JAMA Psychiatry. 2023;80(8):842–847. doi: 10.1001/jamapsychiatry.2023.1817 EDN: YVHMJJ
  24. Elahinejad V, Khorasanian AS, Tehrani-Doost M, et al. Effects of probiotics as adjunctive therapy to fluoxetine on depression severity and serum brain-derived neurotrophic factor, cortisol, and adrenocorticotropic hormone in patients with major depressive disorder: A randomized, double-blind, placebo-controlled trial. Food Sci Nutr. 2025;13(4):e4698. doi: 10.1002/fsn3.4698
  25. Siopi E, Chevalier G, Katsimpardi L, et al. Changes in gut microbiota by chronic stress impair the efficacy of fluoxetine. Cell Rep. 2020;30(11):3682–3690.e6. doi: 10.1016/j.celrep.2020.02.099 EDN: BAPPOY
  26. Gao M, Tu H, Liu P, et al. Association analysis of gut microbiota and efficacy of SSRIs antidepressants in patients with major depressive disorder. J Affect Disord. 2023;330:40–47. doi: 10.1016/j.jad.2023.02.143 EDN: PNEFQP
  27. Arundel PA. A multi-compartmental model generally applicable to physiologically-based pharmacokinetics. IFAC Proceedings. 1997;30(2):129–133. doi: 10.1016/S1474-6670(17)44557-5
  28. Matuskova Z, Anzenbacherova E, Vecera R, et al. Administration of a probiotic can change drug pharmacokinetics: effect of E. coli Nissle 1917 on amiodarone absorption in rats. PLoS One. 2014;9(2):e87150. doi: 10.1371/journal.pone.0087150 EDN: UPYBCH
  29. Kim JK, Choi MS, Jeong JJ, et al. Effect of probiotics on pharmacokinetics of orally administered acetaminophen in mice. Drug Metab Dispos. 2018;46(2):122–130. doi: 10.1124/dmd.117.077222
  30. Ciont C, Mesaros A, Cocean AM, et al. Bioconversion of Fe3O4 nanoparticles by probiotics. Pharmaceuticals (Basel). 2025;18(4):542. doi: 10.3390/ph18040542
  31. Barandouzi ZA, Starkweather AR, Henderson WA, et al. Altered composition of gut microbiota in depression: A systematic review. Front Psychiatry. 2020;11:541. doi: 10.3389/fpsyt.2020.00541 EDN: WGPPMB
  32. Alli SR, Gorbovskaya I, Liu JCW, et al. The gut microbiome in depression and potential benefit of prebiotics, probiotics and synbiotics: A systematic review of clinical trials and observational studies. Int J Mol Sci. 2022;23(9):4494. doi: 10.3390/ijms23094494 EDN: QYVWOJ
  33. Varesi A, Campagnoli LIM, Chirumbolo S, et al. The brain-gut-microbiota interplay in depression: A key to design innovative therapeutic approaches. Pharmacol Res. 2023;192:106799. doi: 10.1016/j.phrs.2023.106799 EDN: HSQNQB
  34. Bruun CF, Haldor Hansen T, Vinberg M, et al. Associations between short-chain fatty acid levels and mood disorder symptoms: a systematic review. Nutr Neurosci. 2024;27(8):899–912. doi: 10.1080/1028415X.2023.2277970
  35. Trzeciak P, Herbet M. Role of the intestinal microbiome, intestinal barrier and psychobiotics in depression. Nutrients. 2021;13(3):927. doi: 10.3390/nu13030927 EDN: ZHIIAG
  36. Pant A, Maiti TK, Mahajan D, Das B. Human gut microbiota and drug metabolism. Microb Ecol. 2023;86(1):97–111. doi: 10.1007/s00248-022-02081-x EDN: NKHZJR
  37. Zimmermann M, Zimmermann-Kogadeeva M, Wegmann R, Goodman AL. Mapping human microbiome drug metabolism by gut bacteria and their genes. Nature. 2019;570(7762):462–467. doi: 10.1038/s41586-019-1291-3
  38. Xu F, Xie Q, Kuang W, Dong Z. Interactions between antidepressants and intestinal microbiota. Neurotherapeutics. 2023;20(2):359–371. doi: 10.1007/s13311-023-01362-8 EDN: PPPHJJ
  39. Wang S, Ju D, Zeng X. Mechanisms and clinical implications of human gut microbiota-drug interactions in the precision medicine era. Biomedicines. 2024;12(1):194. doi: 10.3390/biomedicines12010194 EDN: MMZDAX
  40. Klünemann M, Andrejev S, Blasche S, et al. Bioaccumulation of therapeutic drugs by human gut bacteria. Nature. 2021;597(7877):533–538. doi: 10.1038/s41586-021-03891-8 EDN: UCBXXE
  41. Spanogiannopoulos P, Bess EN, Carmody RN, Turnbaugh PJ. The microbial pharmacists within us: a metagenomic view of xenobiotic metabolism. Nat Rev Microbiol. 2016;14(5):273–287. doi: 10.1038/nrmicro.2016.17 EDN: YWJYPZ
  42. Toda T, Saito N, Ikarashi N, et al. Intestinal flora induces the expression of Cyp3a in the mouse liver. Xenobiotica. 2009; 39(4):323–334. doi: 10.1080/00498250802651984
  43. Li CY, Lee S, Cade S, et al. Novel interactions between gut microbiome and host drug-processing genes modify the hepatic metabolism of the environmental chemicals polybrominated diphenyl ethers. Drug Metab Dispos. 2017;45(11):1197–1214. doi: 10.1124/dmd.117.077024
  44. Zhang J, Zhang J, Wang R. Gut microbiota modulates drug pharmacokinetics. Drug Metab Rev. 2018;50(3):357–368. doi: 10.1080/03602532.2018.1497647
  45. Jourova L, Anzenbacher P, Anzenbacherova E. Human gut microbiota plays a role in the metabolism of drugs. Biomed Pap Med Fac Univ Palacky Olomouc Czech Repub. 2016;160(3):317–326. doi: 10.5507/bp.2016.039 EDN: XUGCKD
  46. Braniste V, Al-Asmakh M, Kowal C, et al. The gut microbiota influences blood-brain barrier permeability in mice. Sci Transl Med. 2014;6(263):263ra158. doi: 10.1126/scitranslmed.3009759
  47. Fock E, Parnova R. Mechanisms of blood-brain barrier protection by microbiota-derived short-chain fatty acids. Cells. 2023;12(4):657. doi: 10.3390/cells12040657 EDN: POQOYC
  48. Tang CF, Wang CY, Wang JH, et al. Short-chain fatty acids ameliorate depressive-like behaviors of high fructose-fed mice by rescuing hippocampal neurogenesis decline and blood-brain barrier damage. Nutrients. 2022;14(9):1882. doi: 10.3390/nu14091882 EDN: CBNUFB
  49. Chenghan M, Wanxin L, Bangcheng Z, et al. Short-chain fatty acids mediate gut microbiota-brain communication and protect the blood-brain barrier integrity. Ann N Y Acad Sci. 2025;1545(1):116–131. doi: 10.1111/nyas.15299 EDN: WISOZC
  50. Anand N, Gorantla VR, Chidambaram SB. The role of gut dysbiosis in the pathophysiology of neuropsychiatric disorders. Cells. 2022;12(1):54. doi: 10.3390/cells12010054 EDN: YGYITC
  51. Brown LC, Bobo WV, Gall CA, et al. Pharmacomicrobiomics of antidepressants in depression: A systematic review. J Pers Med. 2023;13(7):1086. doi: 10.3390/jpm13071086 EDN: GJARLP
  52. Cussotto S, Clarke G, Dinan TG, Cryan JF. Psychotropics and the microbiome: A chamber of secrets…. Psychopharmacology (Berl). 2019;236(5):1411–1432. doi: 10.1007/s00213-019-5185-8 EDN: PVHGAG
  53. Ait Chait Y, Mottawea W, Tompkins TA, Hammami R. Unravelling the antimicrobial action of antidepressants on gut commensal microbes. Sci Rep. 2020;10(1):17878. doi: 10.1038/s41598-020-74934-9 EDN: PPFHGD
  54. Stahl SM. Stahl's essential psychopharmacology: Neuroscientific basis and practical applications. 5th ed. Cambridge University Press; 2021. doi: 10.1017/9781108975292
  55. Shanenko EF, Nikolaev YuA, Ganina VI, et al. Synthesis of biogenic amines by lactic acid bacteria on media of plant and animal origin. Microbiology. 2022;91(4):378–394. doi: 10.1134/S0026261722300208 EDN: EOYKYJ
  56. Gupta SK, Vyavahare S, Duchesne Blanes IL, et al. Microbiota-derived tryptophan metabolism: Impacts on health, aging, and disease. Exp Gerontol. 2023;183:112319. doi: 10.1016/j.exger.2023.112319 EDN: XMXPMA
  57. Roth W, Zadeh K, Vekariya R, et al. Tryptophan metabolism and gut-brain homeostasis. Int J Mol Sci. 2021;22(6):2973. doi: 10.3390/ijms22062973 EDN: HQQJSF
  58. Réus GZ, Jansen K, Titus S, et al. Kynurenine pathway dysfunction in the pathophysiology and treatment of depression: Evidences from animal and human studies. J Psychiatr Res. 2015;68:316–328. doi: 10.1016/j.jpsychires.2015.05.007
  59. Wu HQ, Rassoulpour A, Schwarcz R. Kynurenic acid leads, dopamine follows: a new case of volume transmission in the brain? J Neural Transm (Vienna). 2007;114(1):33–41. doi: 10.1007/s00702-006-0562-y EDN: CDUZTB
  60. Minichino A, Jackson MA, Francesconi M, et al. Endocannabinoid system mediates the association between gut-microbial diversity and anhedonia/amotivation in a general population cohort. Mol Psychiatry. 2021;26(11):6269–6276. doi: 10.1038/s41380-021-01147-5 EDN: IJHPDK
  61. Hassan AM, Mancano G, Kashofer K, et al. Anhedonia induced by high-fat diet in mice depends on gut microbiota and leptin. Nutr Neurosci. 2022;25(2):299–312. doi: 10.1080/1028415X.2020.1751508 EDN: TURQWL
  62. Lee J, Kim EJ, Park GS, et al. Lactobacillus reuteri ATG-F4 alleviates chronic stress-induced anhedonia by modulating the prefrontal serotonergic system. Exp Neurobiol. 2023;32(5):313–327. doi: 10.5607/en23028 EDN: VHJFQT
  63. Dicks LMT. Gut bacteria and neurotransmitters. Microorganisms. 2022;10(9):1838. doi: 10.3390/microorganisms10091838 EDN: TTUBHV
  64. Bravo JA, Forsythe P, Chew MV, et al. Ingestion of Lactobacillus strain regulates emotional behavior and central GABA receptor expression in a mouse via the vagus nerve. Proc Natl Acad Sci U S A. 2011;108(38):16050–16055. doi: 10.1073/pnas.1102999108
  65. Della Vecchia A, Arone A, Piccinni A, et al. GABA system in depression: Impact on pathophysiology and psychopharmacology. Curr Med Chem. 2022;29(36):5710–5730. doi: 10.2174/0929867328666211115124149 EDN: ALZYAU
  66. Wilkowska A, Szałach ŁP, Cubała WJ. Gut microbiota in depression: A focus on ketamine. Front Behav Neurosci. 2021;15:693362. doi: 10.3389/fnbeh.2021.693362 EDN: VZACAU
  67. Dalile B, Van Oudenhove L, Vervliet B, Verbeke K. The role of short-chain fatty acids in microbiota-gut-brain communication. Nat Rev Gastroenterol Hepatol. 2019;16(8):461–478. doi: 10.1038/s41575-019-0157-3 EDN: SGKOUW
  68. Wenzel TJ, Gates EJ, Ranger AL, Klegeris A. Short-chain fatty acids (SCFAs) alone or in combination regulate select immune functions of microglia-like cells. Mol Cell Neurosci. 2020;105:103493. doi: 10.1016/j.mcn.2020.103493 EDN: JEUNIY
  69. Liu W, Ge T, Leng Y, et al. The role of neural plasticity in depression: From hippocampus to prefrontal cortex. Neural Plast. 2017;2017:6871089. doi: 10.1155/2017/6871089
  70. Tartt AN, Mariani MB, Hen R, et al. Dysregulation of adult hippocampal neuroplasticity in major depression: pathogenesis and therapeutic implications. Mol Psychiatry. 2022;27(6):2689–2699. doi: 10.1038/s41380-022-01520-y EDN: SDBRND
  71. Brown KA, Gould TD. Targeting metaplasticity mechanisms to promote sustained antidepressant actions. Mol Psychiatry. 2024;29(4):1114–1127. doi: 10.1038/s41380-023-02397-1 EDN: PESMBK
  72. Björkholm C, Monteggia LM. BDNF – a key transducer of antidepressant effects. Neuropharmacology. 2016;102:72–79. doi: 10.1016/j.neuropharm.2015.10.034
  73. Castrén E, Monteggia LM. Brain-derived neurotrophic factor signaling in depression and antidepressant action. Biol Psychiatry. 2021;90(2):128–136. doi: 10.1016/j.biopsych.2021.05.008 EDN: YFMPBK
  74. Duman RS, Deyama S, Fogaça MV. Role of BDNF in the pathophysiology and treatment of depression: Activity-dependent effects distinguish rapid-acting antidepressants. Eur J Neurosci. 2021;53(1):126–139. doi: 10.1111/ejn.14630
  75. Maqsood R, Stone TW. The gut-brain axis, BDNF, NMDA and CNS disorders. Neurochem Res. 2016;41(11):2819–2835. doi: 10.1007/s11064-016-2039-1 EDN: XUOROL
  76. Sudo N, Chida Y, Aiba Y, et al. Postnatal microbial colonization programs the hypothalamic-pituitary-adrenal system for stress response in mice. J Physiol. 2004;558(Pt 1):263–275. doi: 10.1113/jphysiol.2004.063388
  77. Mohammed SK, Magdy YM, El-Waseef DAA, et al. Modulation of hippocampal TLR4/BDNF signal pathway using probiotics is a step closer towards treating cognitive impairment in NASH model. Physiol Behav. 2020;214:112762. doi: 10.1016/j.physbeh.2019.112762 EDN: LVTYJD
  78. Zhang Y, Pu F, Cheng R, et al. Effect of heat-inactivated Lactobacillus paracasei N1115 on microbiota and gut-brain axis related molecules. Biosci Microbiota Food Health. 2020;39(3):89–99. doi: 10.12938/bmfh.2019-025 EDN: TPHPVU
  79. Schroeder FA, Lin CL, Crusio WE, Akbarian S. Antidepressant-like effects of the histone deacetylase inhibitor, sodium butyrate, in the mouse. Biol Psychiatry. 2007;62(1):55–64. doi: 10.1016/j.biopsych.2006.06.036
  80. Kumar V, Kundu S, Singh A, Singh S. Understanding the Role of Histone Deacetylase and their Inhibitors in Neurodegenerative Disorders: Current Targets and Future Perspective. Curr Neuropharmacol. 2022;20(1):158–178. doi: 10.2174/1570159X19666210609160017 EDN: JIFLIH
  81. Kempermann G, Song H, Gage FH. Adult neurogenesis in the hippocampus. Hippocampus. 2023;33(4):269–270. doi: 10.1002/hipo.23525 EDN: NODHAY
  82. Perera TD, Dwork AJ, Keegan KA, et al. Necessity of hippocampal neurogenesis for the therapeutic action of antidepressants in adult nonhuman primates. PLoS One. 2011;6(4):e17600. doi: 10.1371/journal.pone.0017600
  83. Pérez-Domper P, Palomo V, Gradari S, et al. The GSK-3-inhibitor VP2.51 produces antidepressant effects associated with adult hippocampal neurogenesis. Neuropharmacology. 2017;116:174–187. doi: 10.1016/j.neuropharm.2016.12.019
  84. He H, He H, Mo L, et al. Priming of microglia with dysfunctional gut microbiota impairs hippocampal neurogenesis and fosters stress vulnerability of mice. Brain Behav Immun. 2024;115:280–294. doi: 10.1016/j.bbi.2023.10.031 EDN: ROVWZV
  85. Grabrucker S, Marizzoni M, Silajdžić E, et al. Microbiota from Alzheimer's patients induce deficits in cognition and hippocampal neurogenesis. Brain. 2023;146(12):4916–4934. doi: 10.1093/brain/awad303 EDN: CAJMOM
  86. Namihira M, Inoue N, Watanabe Y, et al. Combination of 3 probiotics restores attenuated adult neurogenesis in germ-free mice. Stem Cells. 2025;43(2):sxae077. doi: 10.1093/stmcls/sxae077 EDN: HTCACI
  87. Rosell-Cardona C, Collins MK, O'Riordan KJ, et al. Acute stress enhances synaptic plasticity in male mice via a microbiota-dependent mechanism. Neuropharmacology. 2025;273:110434. doi: 10.1016/j.neuropharm.2025.110434
  88. Miller AH, Raison CL. The role of inflammation in depression: from evolutionary imperative to modern treatment target. Nat Rev Immunol. 2016;16(1):22–34. doi: 10.1038/nri.2015.5 EDN: WSJTIN
  89. Bernier V, Alsaleh G, Point C, et al. Low-grade inflammation associated with major depression subtypes: a cross-sectional study. Brain Sci. 2024;14(9):850. doi: 10.3390/brainsci14090850 EDN: IAWANZ
  90. Cao Y, Cheng Y, Pan W, et al. Gut microbiota variations in depression and anxiety: a systematic review. BMC Psychiatry. 2025;25(1):443. doi: 10.1186/s12888-025-06871-8 EDN: LKANEJ
  91. van de Wouw M, Boehme M, Lyte JM, et al. Short-chain fatty acids: microbial metabolites that alleviate stress-induced brain-gut axis alterations. J Physiol. 2018;596(20):4923–4944. doi: 10.1113/JP276431 EDN: WCDKRO
  92. Di Vincenzo F, Del Gaudio A, Petito V, et al. Gut microbiota, intestinal permeability, and systemic inflammation: a narrative review. Intern Emerg Med. 2024;19(2):275–293. doi: 10.1007/s11739-023-03374-w EDN: SRRILJ
  93. Hoogland IC, Houbolt C, van Westerloo DJ, et al. Systemic inflammation and microglial activation: systematic review of animal experiments. J Neuroinflammation. 2015;12:114. doi: 10.1186/s12974-015-0332-6 EDN: FUFJIJ
  94. Lawrence JH, Patel A, King MW, et al. Microglia drive diurnal variation in susceptibility to inflammatory blood-brain barrier breakdown. JCI Insight. 2024;9(21):e180081. doi: 10.1172/jci.insight.180081 EDN: OQYIYS
  95. Krakauer T. Inflammasomes, autophagy, and cell death: The trinity of innate host defense against intracellular bacteria. Mediators Inflamm. 2019;2019:2471215. doi: 10.1155/2019/2471215 EDN: WZQYOG
  96. Schroder K, Tschopp J. The inflammasomes. Cell. 2010;140(6):821–832. doi: 10.1016/j.cell.2010.01.040 EDN: YBRHHD
  97. Zhang Y, Liu L, Liu YZ, et al. NLRP3 inflammasome mediates chronic mild stress-induced depression in mice via neuroinflammation. Int J Neuropsychopharmacol. 2015;18(8):pyv006. doi: 10.1093/ijnp/pyv006 EDN: USIHZV
  98. D'Mello C, Swain MG. Immune-to-brain communication pathways in inflammation-associated sickness and depression. Curr Top Behav Neurosci. 2017;31:73–94. doi: 10.1007/7854_2016_37
  99. Shilov YE, Bezrukov MV. Kynurenines in pathogenesis of endogenous psychiatric disorders. Annals of the Russian academy of medical sciences. 2013;68(1):35–41. doi: 10.15690/vramn.v68i1.535 EDN: PWDRYX
  100. Yirmiya R, Rimmerman N, Reshef R. Depression as a microglial disease. Trends Neurosci. 2015;38(10):637–658. doi: 10.1016/j.tins.2015.08.001
  101. Kubera M, Lin AH, Kenis G, et al. Anti-inflammatory effects of antidepressants through suppression of the interferon-gamma/interleukin-10 production ratio. J Clin Psychopharmacol. 2001;21(2):199–206. doi: 10.1097/00004714-200104000-00012 EDN: LSFOUB
  102. Nazimek K, Strobel S, Bryniarski P, et al. The role of macrophages in anti-inflammatory activity of antidepressant drugs. Immunobiology. 2017;222(6):823–830. doi: 10.1016/j.imbio.2016.07.001
  103. Pariante CM. Why are depressed patients inflamed? A reflection on 20 years of research on depression, glucocorticoid resistance and inflammation. Eur Neuropsychopharmacol. 2017;27(6):554–559. doi: 10.1016/j.euroneuro.2017.04.001
  104. Eren I, Naziroğlu M, Demirdaş A. Protective effects of lamotrigine, aripiprazole and escitalopram on depression-induced oxidative stress in rat brain. Neurochem Res. 2007;32(7):1188–1195. doi: 10.1007/s11064-007-9289-x EDN: LPLUWV
  105. Hassanein EHM, Althagafy HS, Baraka MA, et al. Pharmacological update of mirtazapine: a narrative literature review. Naunyn Schmiedebergs Arch Pharmacol. 2024;397(5):2603–2619. doi: 10.1007/s00210-023-02818-6 EDN: KQHUET
  106. Gulbins E, Palmada M, Reichel M, et al. Acid sphingomyelinase-ceramide system mediates effects of antidepressant drugs. Nat Med. 2013;19(7):934–938. doi: 10.1038/nm.3214
  107. Scheiblich H, Schlütter A, Golenbock DT, et al. Activation of the NLRP3 inflammasome in microglia: the role of ceramide. J Neurochem. 2017;143(5):534–550. doi: 10.1111/jnc.14225
  108. Cussotto S, Strain CR, Fouhy F, et al. Differential effects of psychotropic drugs on microbiome composition and gastrointestinal function. Psychopharmacology (Berl). 2019;236(5):1671–1685. doi: 10.1007/s00213-018-5006-5 EDN: TNPOOK
  109. Munoz-Bellido JL, Munoz-Criado S, Garcìa-Rodrìguez JA. Antimicrobial activity of psychotropic drugs: selective serotonin reuptake inhibitors. Int J Antimicrob Agents. 2000;14(3):177–180. doi: 10.1016/s0924-8579(99)00154-5
  110. Rukavishnikov G, Leonova L, Kasyanov E, et al. Antimicrobial activity of antidepressants on normal gut microbiota: Results of the in vitro study. Front Behav Neurosci. 2023;17:1132127. doi: 10.3389/fnbeh.2023.1132127 EDN: BHLNBC
  111. Macedo D, Filho AJMC, Soares de Sousa CN, et al. Antidepressants, antimicrobials or both? Gut microbiota dysbiosis in depression and possible implications of the antimicrobial effects of antidepressant drugs for antidepressant effectiveness. J Affect Disord. 2017;208:22–32. doi: 10.1016/j.jad.2016.09.012 EDN: XTLUNX
  112. Ye X, Wang D, Zhu H, et al. Gut microbiota changes in patients with major depressive disorder treated with vortioxetine. Front Psychiatry. 2021;12:641491. doi: 10.3389/fpsyt.2021.641491 EDN: KBOQMF
  113. Shen Y, Yang X, Li G, et al. The change of gut microbiota in MDD patients under SSRIs treatment. Sci Rep. 2021;11(1):14918. doi: 10.1038/s41598-021-94481-1 EDN: ZPQBGE
  114. Camilleri M. Management options for irritable bowel syndrome. Mayo Clin Proc. 2018;93(12):1858–1872. doi: 10.1016/j.mayocp.2018.04.032
  115. Lukić I, Getselter D, Ziv O, et al. Antidepressants affect gut microbiota and Ruminococcus flavefaciens is able to abolish their effects on depressive-like behavior. Transl Psychiatry. 2019;9(1):133. doi: 10.1038/s41398-019-0466-x EDN: YKNYQJ
  116. Bi C, Guo S, Hu S, et al. The microbiota-gut-brain axis and its modulation in the therapy of depression: Comparison of efficacy of conventional drugs and traditional Chinese medicine approaches. Pharmacol Res. 2022;183:106372. doi: 10.1016/j.phrs.2022.106372 EDN: WSNSAJ
  117. Galligan JJ. 5-HT secretion by enterochromaffin cells is a very touching story. J Physiol. 2017;595(1):3. doi: 10.1113/JP273041
  118. McVey Neufeld KA, Bienenstock J, Bharwani A, et al. Oral selective serotonin reuptake inhibitors activate vagus nerve dependent gut-brain signalling. Sci Rep. 2019;9(1):14290. doi: 10.1038/s41598-019-50807-8
  119. Hung LY, Alves ND, Del Colle A, et al. Intestinal epithelial serotonin as a novel target for treating disorders of gut-brain interaction and mood. Gastroenterology. 2025;168(4):754–768. doi: 10.1053/j.gastro.2024.11.012 EDN: IGOQFH
  120. McCoubrey LE, Thomaidou S, Elbadawi M, et al. Machine learning predicts drug metabolism and bioaccumulation by intestinal microbiota. Pharmaceutics. 2021;13(12):2001. doi: 10.3390/pharmaceutics13122001 EDN: IXJRAF
  121. Antonuccio DO, Danton WG, DeNelsky GY, et al. Raising questions about antidepressants. Psychother Psychosom. 1999;68(1):3–14. doi: 10.1159/000012304
  122. De Donatis D, Verrastro M, Fanelli G, et al. Mirtazapine blood levels and antidepressant response. Int J Psychiatry Clin Pract. 2024;28(2):102–106. doi: 10.1080/13651501.2024.2409654
  123. Yoshimura R, Hori H, Ikenouchi-Sugita A, et al. Higher plasma interleukin-6 (IL-6) level is associated with SSRI- or SNRI-refractory depression. Prog Neuropsychopharmacol Biol Psychiatry. 2009;33(4):722–726. doi: 10.1016/j.pnpbp.2009.12.003
  124. Walker FR, Nilsson M, Jones K. Acute and chronic stress-induced disturbances of microglial plasticity, density and phagocytosis. Curr Drug Targets. 2013;14(11):1262–1276. doi: 10.3389/fnins.2013.00139 EDN: SOPCHN
  125. Zhang Q, Chen B, Zhang J, et al. Effect of prebiotics, probiotics, synbiotics on depression: results from a meta-analysis. BMC Psychiatry. 2023;23(1):477. doi: 10.1186/s12888-023-04963-x EDN: BBUAKS
  126. Shamim MA, Manna S, Dwivedi P, et al. Minocycline in depression not responding to first-line therapy: A systematic review and meta-analysis. Medicine (Baltimore). 2023;102(45):e35937. doi: 10.1097/MD.0000000000035937 EDN: PSLGLI
  127. Asad A, Kirk M, Zhu S, et al. Effects of prebiotics and probiotics on symptoms of depression and anxiety in clinically diagnosed samples: Systematic review and meta-analysis of randomized controlled trials. Nutr Rev. 2025;83(7):e1504–e1520. doi: 10.1093/nutrit/nuae177 EDN: GTCYYO
  128. Díaz-Garrido N, Badia J, Baldomà L. Microbiota-derived extracellular vesicles in interkingdom communication in the gut. J Extracell Vesicles. 2021;10(13):e12161. doi: 10.1002/jev2.12161 EDN: VGMMOS
  129. Han HS, Hwang S, Choi SY, et al. Roseburia intestinalis-derived extracellular vesicles ameliorate colitis by modulating intestinal barrier, microbiome, and inflammatory responses. J Extracell Vesicles. 2024;13(8):e12487. doi: 10.1002/jev2.12487
  130. Wang G, Li J, Bojmar L, et al. Tumour extracellular vesicles and particles induce liver metabolic dysfunction. Nature. 2023;618(7964):374–382. doi: 10.1038/s41586-023-06114-4 EDN: FPEZHR
  131. Sharma A, Buschmann MM, Gilbert JA. Pharmacomicrobiomics: The holy grail to variability in drug response? Clin Pharmacol Ther. 2019;106(2):317–328. doi: 10.1002/cpt.1437 EDN: HMGCCH

Supplementary files

Supplementary Files
Action
1. JATS XML

Copyright (c) 2025 Eco-Vector

Creative Commons License
This work is licensed under a Creative Commons Attribution-NonCommercial-NoDerivatives 4.0 International License.

СМИ зарегистрировано Федеральной службой по надзору в сфере связи, информационных технологий и массовых коммуникаций (Роскомнадзор).
Регистрационный номер и дата принятия решения о регистрации СМИ: ПИ № ФС 77 - 84654 от 01.02.2023 г