<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>
<!DOCTYPE root>
<article xmlns:mml="http://www.w3.org/1998/Math/MathML" xmlns:xlink="http://www.w3.org/1999/xlink" xmlns:xsi="http://www.w3.org/2001/XMLSchema-instance" xmlns:ali="http://www.niso.org/schemas/ali/1.0/" article-type="research-article" dtd-version="1.2" xml:lang="en"><front><journal-meta><journal-id journal-id-type="publisher-id">Molekulyarnaya Meditsina (Molecular medicine)</journal-id><journal-title-group><journal-title xml:lang="en">Molekulyarnaya Meditsina (Molecular medicine)</journal-title><trans-title-group xml:lang="ru"><trans-title>Молекулярная медицина</trans-title></trans-title-group></journal-title-group><issn publication-format="print">1728-2918</issn><issn publication-format="electronic">2499-9490</issn><publisher><publisher-name xml:lang="en">Russkiy Vrach Publishing House</publisher-name></publisher></journal-meta><article-meta><article-id pub-id-type="publisher-id">113344</article-id><article-id pub-id-type="doi">10.29296/24999490-2020-06-05</article-id><article-categories><subj-group subj-group-type="toc-heading" xml:lang="en"><subject>Articles</subject></subj-group><subj-group subj-group-type="toc-heading" xml:lang="ru"><subject>Статьи</subject></subj-group><subj-group subj-group-type="article-type"><subject>Research Article</subject></subj-group></article-categories><title-group><article-title xml:lang="en">Standardization of the method of multi-target single-nucleotide elongation for molecular genetic study of cytological material in thyroid neoplasm</article-title><trans-title-group xml:lang="ru"><trans-title>Стандартизация метода мультитаргетной однонуклеотидной элонгации для молекулярно-генетического исследования цитологического материала при новообразованиях щитовидной железы</trans-title></trans-title-group></title-group><contrib-group><contrib contrib-type="author"><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Fedorova</surname><given-names>P. A</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Федорова</surname><given-names>П. А</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="en"><p>Researcher of Laboratory for Diagnosis of Autoimmune Diseases</p></bio><bio xml:lang="ru"><p>научный сотрудник лаборатории диагностики аутоиммунных заболеваний научно-методического центра по молекулярной медицине</p></bio><email>fedorova97@gmail.com</email><xref ref-type="aff" rid="aff1"/></contrib><contrib contrib-type="author"><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Nazarov</surname><given-names>V. D</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Назаров</surname><given-names>В. Д</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="en"><p>Junior Researcher of Laboratory for Diagnosis of Autoimmune Diseases of Pavlov First Saint Petersburg State Medical University, Russian Federation, PhD.</p></bio><bio xml:lang="ru"><p>младший научный сотрудник лаборатории диагностики аутоиммунных заболеваний научно-методического центра по молекулярной медицине ФГБОУ ВО «Первый Санкт-Петербургский государственный медицинский университет им. акад. И.П. Павлова» Министерства здравоохранения Российской Федерации, кандидат медицинских наук</p></bio><email>nazarov19932@mail.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff1"/></contrib><contrib contrib-type="author"><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Musaelyan</surname><given-names>A. A</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Мусаелян</surname><given-names>А. А</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="en"><p>a 1st year resident of Pavlov First Saint Petersburg State Medical University, Russian Federation, Researcher of Laboratory for Diagnosis of Autoimmune Diseases</p></bio><bio xml:lang="ru"><p>ординатор I года ФГБОУ ВО «Первый Санкт-Петербургский государственный медицинский университет им. акад. И.П. Павлова», научный сотрудник лаборатории диагностики аутоиммунных заболеваний научно-методического центра по молекулярной медицине</p></bio><email>a.musaelyan8@gmail.com</email><xref ref-type="aff" rid="aff1"/></contrib><contrib contrib-type="author"><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Lapin</surname><given-names>S. V</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Лапин</surname><given-names>С. В</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="en"><p>Head of Laboratory for Diagnosis of Autoimmune Diseases of Pavlov First Saint Petersburg State Medical University, Russian Federation, PhD.</p></bio><bio xml:lang="ru"><p>заведующий лабораторией диагностики аутоиммунных заболеваний научно-методического центра по молекулярной медицине ФГБОУ ВО «Первый Санкт-Петербургский государственный медицинский университет им. акад. И.П. Павлова» Министерства здравоохранения Российской Федерации, кандидат медицинских наук</p></bio><email>svlapin@mail.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff1"/></contrib><contrib contrib-type="author"><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Boriskova</surname><given-names>M. E</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Борискова</surname><given-names>М. Е</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="en"><p>Docent, Head of Division of Endocrine Surgery of Pavlov First Saint Petersburg State Medical University, Russian Federation, PhD.</p></bio><bio xml:lang="ru"><p>доцент, заведующая отделением эндокринной хирургии, ассистент кафедры общей хирургии ГБОУ ВПО «Первый Санкт-Петербургский государственный медицинский университет имени акад. И.П. Павлова» Министерства здравоохранения Российской Федерации, доктор медицинских наук</p></bio><email>boriskovam@gmail.com</email><xref ref-type="aff" rid="aff1"/></contrib><contrib contrib-type="author"><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Farafonova</surname><given-names>U. V</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Фарафонова</surname><given-names>У. В</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="en"><p>Surgeon of Division of Endocrine Surgery of Pavlov First Saint Petersburg State Medical University, Russian Federation, PhD.</p></bio><bio xml:lang="ru"><p>врач-хирург отделения эндокринной хирургии ГБОУ ВПО «Первый Санкт-Петербургский государственный медицинский университет имени акад. И.П. Павлова» Министерства здравоохранения Российской Федерации, кандидат медицинских наук</p></bio><email>medici@yandex.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff1"/></contrib><contrib contrib-type="author"><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Emanuel</surname><given-names>V. L</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Эмануэль</surname><given-names>В. Л</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="en"><p>Professor, Head of Department of Clinical Laboratory Diagnostics with Molecular Medicine Course of Pavlov First Saint Petersburg State Medical University, Russian Federation, PhD</p></bio><bio xml:lang="ru"><p>заведующий кафедрой клинической лабораторной диагностики с курсом молекулярной медицины ФГБОУ ВО «Первый Санкт-Петербургский государственный медицинский университет им. акад. И.П. Павлова» Министерства здравоохранения Российской Федерации, доктор медицинских наук, профессор.</p></bio><email>vladimirem1@gmail.com</email><xref ref-type="aff" rid="aff1"/></contrib></contrib-group><aff-alternatives id="aff1"><aff><institution xml:lang="en">Pavlov First Saint-Petersburg State Medical University</institution></aff><aff><institution xml:lang="ru">ФГБОУ ВО «Первый Санкт-Петербургский государственный медицинский университет им. акад. И.П. Павлова» Министерства здравоохранения Российской Федерации</institution></aff></aff-alternatives><pub-date date-type="pub" iso-8601-date="2020-06-15" publication-format="electronic"><day>15</day><month>06</month><year>2020</year></pub-date><volume>18</volume><issue>6</issue><issue-title xml:lang="en">VOL 18, NO6 (2020)</issue-title><issue-title xml:lang="ru">ТОМ 18, №6 (2020)</issue-title><fpage>31</fpage><lpage>37</lpage><history><date date-type="received" iso-8601-date="2022-11-18"><day>18</day><month>11</month><year>2022</year></date></history><permissions><copyright-statement xml:lang="en">Copyright ©; 2020, Russkiy Vrach Publishing House</copyright-statement><copyright-statement xml:lang="ru">Copyright ©; 2020, ИД "Русский врач"</copyright-statement><copyright-year>2020</copyright-year><copyright-holder xml:lang="en">Russkiy Vrach Publishing House</copyright-holder><copyright-holder xml:lang="ru">ИД "Русский врач"</copyright-holder><ali:free_to_read xmlns:ali="http://www.niso.org/schemas/ali/1.0/" start_date="2025-06-15"/></permissions><self-uri xlink:href="https://journals.eco-vector.com/1728-2918/article/view/113344">https://journals.eco-vector.com/1728-2918/article/view/113344</self-uri><abstract xml:lang="en"><p>Thyroid cancer (TC) is the most prevalent cancer among malignant neoplasms of the organs of the endocrine system. Cytological categories Bethesda III-V of TC are considered to be the most difficult for making a diagnosis. Molecular genetic tests can be a tool to complement routine cytopathological studies. The aim of the study. To develop a panel for detecting point mutations in the cytological material of thyroid tumors using the multi-target single-nucleotide elongation (MSE) method. Materials and methods. The studied group of patients included 52 cases with thyroid neoplasm. Patients were divided into subgroups under Bethesda category IV, V and VI. The first, second, and third subgroup consisted of 24, 7, and 21 patients correspondingly. Cytological material was obtained by fine-needle aspiration biopsy. Genetic testing was carried out using the MSE approach. There were created 3 panels included the most common mutations in thyroid cancer: mutations in the BRAF, KRAS, NRAS, HRAS genes. The obtained results of a postoperative histological examination included II samples of papillary thyroid cancer, 9 samples of the follicular variant of papillary cancer and 5 - follicular adenoma. Results. 39% of cytological samples showed mutations. The BRAFV600E mutation was revealed in 29% out of founding aberration, NRASQ6IR mutation in I0% of those. To verify the method, there were used positive and negative control samples confirmed by PCR. In all control samples, the results were completely consistent with the molecular genetic study by the MSE method. Conclusion. MSE is a highly sensitive and promising method for the detection of mutations in cytological samples in TC patients.</p></abstract><trans-abstract xml:lang="ru"><p>Рак щитовидной железы (РЩЖ) занимает первое место по распространенности среди злокачественных новообразований органов эндокринной системы. Группу наиболее сложных для диагностики случаев составляют новообразования с цитологическими категориями Bethesda III-V. Молекулярно-генетическое тестирование может стать инструментом, дополняющим рутинные цитопатологические исследования и оптимизировать диагностику РЩЖ. Цель исследования. Разработка панели для обнаружения точечных мутаций в цитологическом материале новообразования щитовидной железы с помощью метода МОЭ. Материалы и методы. В исследование были включены 52 пациента с новообразованием щитовидной железы. Пациенты были разделены на группы по принадлежности к IV-VI категории по классификации Bethesda. Первую группу составляли 24 человека, вторую - 7, третью - 21 человек. Цитологический материал представлен смывом с иглы тонкоигольной аспирационной биопсии. Генетическое тестирование проводилось с помощью технологии мультитаргетной однонуклеотидной элонгации (МОЭ). Было создано 3 панели с наиболее распространенными мутациями при РЩЖ: мутации в генах BRAF, KRAS, NRAS, HRAS. Для 25 пациентов получены результаты постоперационного гистологического исследования: 11 образцов папиллярного РЩЖ, 9 образцов фолликулярного варианта папиллярного рака и 5 - фолликулярной аденомы. Результаты. С помощью метода МОЭ удалось детектировать мутации в цитологическом материале, их доля составила 39%, из них BRAFV600Eобнаружена в 29% образцов, а мутация NRASQ6IR - в 10%. Для верификации метода были использованы положительные и отрицательные контрольные образцы, подтвержденные методом ПЦР. Во всех пробах наблюдалось полное соответствие полученных результатов при молекулярно-генетическом исследовании методом МОЭ. Заключение. МОЭ является высокочувствительным методом, позволяющим в относительно короткие сроки осуществить комплексный подход к поиску мутаций, что особенно важно при диагностике РЩЖ.</p></trans-abstract><kwd-group xml:lang="en"><kwd>multi-target single-base elongation (MSE)</kwd><kwd>thyroid cancer</kwd><kwd>somatic mutation</kwd></kwd-group><kwd-group xml:lang="ru"><kwd>мультитаргетная однонуклеотидная элонгация (МОЭ)</kwd><kwd>рак щитовидной железы</kwd><kwd>соматические мутации</kwd></kwd-group></article-meta></front><body></body><back><ref-list><ref id="B1"><label>1.</label><mixed-citation>Hay I.D., Thompson G.B., Grant C.S., Bergstralh E.J., Dvorak C.E., Gorman C.A. et al. Papillary thyroid carcinoma managed at the Mayo Clinic during six decades (19401999): Temporal trends in initial therapy and long-term outcome in 2444 consecutively treated patients. World J. Surg. 2002; 26 (8): 879-85. https://doi.org/10.1007/s00268-002-6612-1</mixed-citation></ref><ref id="B2"><label>2.</label><mixed-citation>Saiselet M., Floor S., Tarabichi M., Dom G., H brant A., van Staveren W.C.G. et al. Thyroid cancer cell lines: An overview. Front Endocrinol (Lausanne). 2012; 3: 1-9. https://doi.org/10.3389/fendo.2012.00133</mixed-citation></ref><ref id="B3"><label>3.</label><mixed-citation>Haugen B.R., Alexander E.K., Bible K.C., Doherty G.M., Mandel S.J., Nikiforov YE. et al. 2015 American Thyroid Association Management Guidelines for Adult Patients with Thyroid Nodules and Differentiated Thyroid Cancer: The American Thyroid Association Guidelines Task Force on Thyroid Nodules and Differentiated Thyroid Cancer. Thyroid (Internet). 2016;1-133. https://doi.org/10.1089/ thy.2015.0020</mixed-citation></ref><ref id="B4"><label>4.</label><mixed-citation>Xing M. Clinical utility of RAS mutations in thyroid cancer: A blurred picture now emerging clearer. BMC Medicine. 2016. https://doi.org/10.1089/thy2015.0020</mixed-citation></ref><ref id="B5"><label>5.</label><mixed-citation>Fernandez-Ramirez F., Hurtado-Lopez L.M., Lopez M.A., Martinez-Penafiel E., Herrera-Gonzalez N.E., Kameyama L. et al. BRAF 1799T&gt;A Mutation Frequency in Mexican Mestizo Patients with Papillary Thyroid Cancer. Biomed Res Int. 2018; 2018. https:// doi.org/10.1155/2018/2582179</mixed-citation></ref><ref id="B6"><label>6.</label><mixed-citation>Ferrari S.M., Fallahi P., Ruffilli I., Elia G., Ragusa F, Paparo S.R. et al. Molecular testing in the diagnosis of differentiated thyroid carcinomas. Gland Surg. 2018;19-29. https://doi.org/10.21037/ gs.2017.11.07</mixed-citation></ref><ref id="B7"><label>7.</label><mixed-citation>Kim W.W., Ha T.K., Bae S.K. Clinical implications of the BRAF mutation in papillary thyroid carcinoma and chronic lymphocytic thyroiditis. J. Otolaryngol - Head Neck Surg. 2018; 47 (1): 1-6. https://doi.org/10.1186/ s40463-017-0247-6</mixed-citation></ref><ref id="B8"><label>8.</label><mixed-citation>Абросимов А.Ю. Инкапсулированные фолликулярные опухоли щитовидной железы неопределенного злокачественного потенциала в новой международной гистологической классификации. Клиническая и экспериментальная тиреоидология, 2018; 13 (4): 9-15. https:// doi.org/10.14341/ket9481</mixed-citation></ref><ref id="B9"><label>9.</label><mixed-citation>Мусаелян А.А., Чистяков И.В., Назаров В.Д., Лапин С.В., Согоян М.В., Хальчицкий С.Е., Эмануэль В.Л., Лобачевская Т.В. Акопов А.Л. Оптимизация метода мультитаргетной однонуклеотидной элонгации для определния соматических мутаций при злокачественных ноовобразованиях. Молекулярная медицина. 2019; 2 (17). https://doi.org/10.29296/24999490-2019-02-06</mixed-citation></ref><ref id="B10"><label>10.</label><mixed-citation>Под ред. Каприна А.Д., Старинского В.В., Петровой Г.В. Злокачественные новообразования в россии в 2017 году (заболеваемость и смертность). 2018</mixed-citation></ref><ref id="B11"><label>11.</label><mixed-citation>Xie H., Wei B., Shen H., Gao Y, Wang L., Liu H. BRAF mutation in papillary thyroid carcinoma (PTC) and its association with clinicopathological features and systemic inflammation response index (SIRI). Am. J. Transl Res. 2018; 10 (8): 2726-36.</mixed-citation></ref><ref id="B12"><label>12.</label><mixed-citation>Nikiforov Y.E. Role of Molecular Markers in Thyroid Nodule Management: Then and Now. Endocr Pract (Internet). 2017; (aop): EP171805.RA. https://doi.org/10.4158/ EP171805.RA</mixed-citation></ref><ref id="B13"><label>13.</label><mixed-citation>Strickland K.C., Eszlinger M., Paschke R., Angell T.E., Alexander E.K., Marqusee E. et al. Molecular Testing of Nodules with a Suspicious or Malignant Cytologic Diagnosis in the Setting of Non-Invasive Follicular Thyroid Neoplasm with Papillary-Like Nuclear Features (NIFTP). Endocr Pathol. 2018; 29 (1): 68-74. https://doi.org/10.1007/s12022-018-9515-x</mixed-citation></ref></ref-list></back></article>
