Molekulyarnaya Meditsina (Molecular medicine)Molekulyarnaya Meditsina (Molecular medicine)Молекулярная медицина1728-29182499-9490Russkiy Vrach Publishing House71723210.29296/24999490-2026-04-06bellohOriginal researchОригинальные исследованияResearch ArticleSNCA long 3’UTR transcripts in patients with synucleinopathyДоля длинных 3’UTR транскриптов SNCA у больных синуклеинопатиямиhttps://orcid.org/0000-0002-5927-460XKaranLyudmila S.КараньЛюдмила Станиславовна
Russian Federation

Researcher, Molecular Genetics Laboratory, 5th Neurological Department, Institute of Clinical and Preventive Neurology

научный сотрудник молекулярно-генетической лаборатории 5-го неврологического отделения Института клинической и профилактической неврологии

lskaran@mail.ruhttps://orcid.org/0000-0001-9419-1159AbramychevaNatalia Yu.АбрамычеваНаталья Юрьевна
Russian Federation

Head of the Molecular Genetics Laboratory, 5th Neurological Department, Institute of Clinical and Preventive Neurology; Candidate of Biological Sciences

ведущий научный сотрудник, заведующая молекулярно-генетической лабораторией 5-го неврологического отделения Института клинической и профилактической неврологии; Кандидат биологических наук

abramicheva@neurology.ruhttps://orcid.org/0000-0003-0728-8708MinaevIvan V.МинаевИван Вячеславович
Russian Federation

Neurologist of the 5th Neurological Department, Institute of Clinical and Preventive Neurology

врач-невролог 5-го неврологического отделения Института клинической и профилактической неврологии

minaev@neurology.ruKrutyakovaTatyana A.КрутяковаТатьяна Алексеевна
Russian Federation

2nd year master’s degree student at the Faculty of Biology

студентка II курса магистратуры биологического факультета

tanyapankratova_1997@mail.ruhttps://orcid.org/0000-0002-2798-0331ProtopopovaAnna O.ПротопоповаАнна Олеговна
Russian Federation

Junior Researcher, Molecular Genetics Laboratory, 5th Neurological Department, Institute of Clinical and Preventive Neurology

младший научный сотрудник молекулярно-генетической лаборатории 5-го неврологического отделения Института клинической и профилактической неврологии

anna.pro@mail.ruhttps://orcid.org/0009-0000-5290-5045ProtsenkoArina R.ПроценкоАрина Романовна
Russian Federation

Junior Researcher, Molecular Genetics Laboratory, 5th Neurological Department, Institute of Clinical and Preventive Neurology

младший научный сотрудник молекулярно-генетической лаборатории 5-го неврологического отделения Института клинической и профилактической неврологии

proсenko.a.r@neurology.ruhttps://orcid.org/0009-0001-8707-180XBerdalinaIrina A.БердалинаИрина Александровна
Russian Federation

Statistician, Department of Higher Qualification Training, Institute of Medical Education and Professional Development

статистик отдела подготовки кадров высшей квалификации Института медицинского образования и профессионального развития

berdalina@neurology.ruhttps://orcid.org/0000-0001-8070-7644FedotovaEkaterina Yu.ФедотоваЕкатерина Юрьевна
Russian Federation

Head of the 5th Neurological Department, Institute of Clinical and Preventive Neurology; Doctor of Medical Sciences

ведущий научный сотрудник, руководитель 5-го неврологического отделения Института клинической и профилактической неврологии; Доктор медицинских наук

fedotova@neurology.ruhttps://orcid.org/0000-0002-2704-6282IllarioshkinSergey N.ИллариошкинСергей Николаевич
Russian Federation

Director of the Brain Institute, Deputy Director; Doctor of Medical Sciences, Professor, Academician of the Russian Academy of Sciences

директор Института мозга, заместитель директора по научной работе; Доктор медицинских наук, профессор, академик РАН

snillario@gmail.comRussian Center of Neurology and NeuroscienceФГБНУ «Российский центр неврологии и нейронаук»Lomonosov Moscow State UniversityФГБОУ ВО «Московский государственный университет им. М.В. Ломоносова»1308202624436431208202612082026Copyright ©; 2026, Russkiy Vrach Publishing HouseCopyright ©; 2026, ИД "Русский врач"2026Russkiy Vrach Publishing HouseИД "Русский врач"https://journals.eco-vector.com/1728-2918/article/view/717232

Introduction. Post-transcriptional and post-translational modifications of the alpha-synuclein protein are considered important links in the pathogenesis of Parkinson’s disease (PD) and multiple system atrophy (MSA). Regulation of mRNA stability and translational activity is primarily provided by the 3’untranslated region (3’UTR). The proportion of long 3’UTRs (3’UTR-L) is currently considered as a risk factor for PD.

Aim of the study. To assess the proportion of 3’UTR-L SNCA transcripts with in patients with PD and MSA, and the influence of single nucleotide polymorphisms (SNPs) in this gene on the 3’UTR-L/total SNCA mRNA ratio.

Material and methods. The concentration of SNCA and 3’UTR-L mRNAs was determined in blood leukocytes of 84 patients (Russian population) with PD, 50 patients with MSA, and 49 healthy volunteers, by quantitative RT-PCR. The proportion of 3’UTR-L was expressed as a percentage of the total SNCA mRNA. SNP was determined by Sanger sequencing.

Results. Overall, the proportion of 3’UTR-L did not differ significantly between the PD, MSA, and control groups: in PD, the median proportion of 3’UTR-L was 30.9%, in MSA – 28.5%, in the control group – 29.8%, p = 0.21. A decrease in the proportion of 3’UTR-L by 15–21% relative to the median value for the group was detected in PD patients in association with the «risk» genotype GG at rs356168, rs356165, and rs3756063; in the MSA patient group, a decrease of 13–15% was also noted in relationship with the GG genotype at rs356168, rs356165, and the CC genotype at rs2737029. An increase in the proportion of 3’UTR-L by 17% was noted only in the PD group for “protective” genotype AA at rs356168 and rs356165.

Введение. Посттранскрипционные и посттрансляционные изменения белка альфа-синуклеина рассматриваются как важные звенья в патогенезе болезни Паркинсона (БП) и мультисистемной атрофии (МСА). Регуляция стабильности мРНК и трансляционной активности в основном обеспечивается 3-нетранслируемой областью (3’UTR) гена. Доля длинных 3’UTR (3’UTR-L) в настоящее время рассматривается как фактор риска при БП.

Цель исследования. Оценить долю SNCA транскриптов с 3’UTR-L у больных с БП, МСА и влияние однонуклеотидных полиморфизмов (ОНП) в данном гене на соотношение 3’UTR-L/тотальная мРНК SNCA.

Материал и методы. В исследование были включены 84 пациента российской популяции с БП, 50 пациентов с МСА и 49 здоровых добровольцев. Концентрация мРНК SNCA и 3’UTR-L определялась в лейкоцитах крови методом количественной полимеразной цепной реакции с обратной транскрипцией. Доля 3’UTR-L выражалась в проценте от суммарной мРНК SNCA. Определение ОНП проводили методом секвенирования.

Результаты. В целом доля 3’UTR-L значимо не отличалась в группах с БП, МСА и контрольной группе: при БП медиана доли 3’UTR-L составила 30,9%, при МСА – 28,5%, в контрольной группе – 29,8%, p = 0,21. Снижение доли 3’UTR-L на 15–21% относительно медианного значения для группы было выявлено у пациентов с БП в ассоциации с генотипом «риска» GG в rs356168, rs356165 и rs3756063; в группе пациентов с МСА снижение на 13–15% отмечалось также в связи c генотипом GG в rs356168, rs356165 и генотипом СС в rs2737029. Повышение доли 3’UTR-L на 17% отмечалось только в группе БП у носителей «протективного» генотипа AA в rs356168 и rs356165.

Заключение. Обнаружение ассоциации 3’UTR-L с ОНП в регуляторных областях SNCA указывает на потенциальную роль данных ОНП в регуляции трансляции альфа-синуклеина посредством синтеза транскриптов с разной трансляционной активностью.

Parkinson’s diseasemultiple system atrophySNCA3’-untranslated regionsingle nucleotide polymorphismsalternative polyadenylationболезнь Паркинсонамультисистемная атрофияSNCA3’-нетранслируемая областьоднонуклеотидные полиморфизмыальтернативное полиаденилированиеThe study was carried out within the framework of the Russian Science Foundation grant No. 24-25-00478 “Implementation of genetic and epigenetic predisposition to synucleinopathies”.Исследование выполнено в рамках гранта РНФ №24-25-00478 «Реализация генетической и эпигенетической предрасположенности к синуклеинопатиям».Junn E., Lee K.W., Jeong B.S., Chan T.W., Im J.Y., Mouradian M.M. Repression of alpha-synuclein expression and toxicity by microRNA-7. Proc Natl Acad Sci USA. 2009; 106 (31): 13052–7. DOI: 10.1073/pnas.0906277106.Doxakis E. Post-transcriptional regulation of alpha-synuclein expression by mir-7 and mir-153. J. Biol. Chem. 2010; 285 (17): 12726–34. DOI: 10.1074/jbc.M109.086827.Uwatoko H., Hama Y., Iwata I.T., Shirai S., Matsushima M., Yabe I., Utsumi J., Sasaki H. Identification of plasma microRNA expression changes in multiple system atrophy and Parkinson’s disease. Mol. Brain. 2019; 12 (1): 49. DOI: 10.1186/s13041-019-0471-2.Soldner F., Stelzer Y., Shivalila C.S., Abraham B.J., Latourelle J.C., Barrasa M.I., Goldmann J., Myers R.H., Young R.A., Jaenisch R. Parkinson-associated risk variant in distal enhancer of α-synuclein modulates target gene expression. Nature. 2016; 533 (7601): 95–9. DOI: 10.1038/nature17939.Marchese D., Botta-Orfila T., Cirillo D., Rodriguez J.A., Livi C.M., Fernández-Santiago R., Ezquerra M., Marti M.J., Bechara E., Tartaglia G.G. Catalan M.S.A. Registry (CMSAR). Discovering the 3’ UTR-mediated regulation of alpha-synuclein. Nucleic Acids Res. 2017; 45 (22): 12888–903. DOI: 10.1093/nar/gkx1048.Rhinn H., Qiang L., Yamashita T., Rhee D., Zolin A., Vanti W., Abeliovich A. Alternative α-synuclein transcript usage as a convergent mechanism in Parkinson’s disease pathology. Nat Commun. 2012; 3: 1084. DOI: 10.1038/ncomms2032.Sotiriou S., Gibney G., Baxevanis A.D., Nussbaum R.L. A single nucleotide polymorphism in the 3’UTR of the SNCA gene encoding alpha-synuclein is a new potential susceptibility locus for Parkinson disease. Neurosci Lett. 2009; 461 (2): 196–201. DOI: 10.1016/j.neulet.2009.06.034.Bae B., Miura P. Emerging Roles for 3’ UTRs in Neurons. Int. J. Mol. Sci. 2020; 21 (10): 3413. DOI: 10.3390/ijms21103413Blažeković A., Jerčić K.G., Borovečki F. SNCA 3’ UTR Genetic Variants in Patients with Parkinson’s Disease. Biomolecules. 2021; 11 (12): 1799. DOI: 10.3390/biom11121799.Satake W., Nakabayashi Y., Mizuta I. et al. Genome-wide association study identifies common variants at four loci as genetic risk factors for Parkinson’s disease. Nature genetics. 2009; 41: 1303–7. DOI: 10.1038/ng.485Simon-Sanchez J., Schulte C., Bras J.M. Genome-wide association study reveals genetic risk underlying Parkinson’s disease. Nature genetics. 2009; 41: 1308–12. DOI: 10.1038/ng.487Nalls N.A., Plagnol V., Hernandez D.G. International Parkinson Disease Genomics Consortium. Imputation of sequence variants for identification of genetic risks for Parkinson’s disease: a meta-analysis of genome-wide association studies. Lancet. 2011; 377 (9766): 641–9. DOI: 10.1016/S0140-6736(10)62345-8Szwedo A.A., Pedersen C.C., Anastasia Ushakova A et al. Association of SNCA Parkinson’s Disease Risk Polymorphisms With Disease Progression in Newly Diagnosed Patients. Frontiers in Neurology. 2021; 11: 620585. DOI: 10.3389/fneur.2020.620585Zhang Y., Shu L., Qiying Sun O. et al. A Comprehensive Analysis of the Association Between SNCA Polymorphisms and the Risk of Parkinson’s Disease. Front Mol. Neurosci. 2018; 11: 391. DOI: 10.3389/fnmol.2018.00391Абрамычева Н.Ю., Карань Л.С., Протопопова А.О., Минаев И.В., Бердалина И.А., Федотова Е.Ю., Иллариошкин С.Н. Полиморфные варианты гена SNCA и риск развития синуклеинопатий. Анналы клинической и экспериментальной неврологии. 2025; 19 (1): 43–52. DOI: 10.17816/ACEN.1220. [Abramycheva N., Karan L., Protopopova A., Minaev I., Berdalina I., Fedotova E., Illarioshkin S. Polymorphisms in the SNCA gene and the risk of synucleopathy. Annals of Clinical and Experimental Neurology. 2025; 19 (1): 43–52. DOI: 10.17816/ACEN.1220Soldner F., Stelzer Y., Shivalila C.S., Abraham B.J., Latourelle J.C., Barrasa M.I., Goldmann J., Myers R.H., Young R.A., Jaenisch R. Parkinson-associated risk variant in distal enhancer of α-synuclein modulates target gene expression. Nature. 2016; 533 (7601): 95–9. DOI: 10.1038/nature17939.Locascio J.J., Eberly S., Liao Z., Liu G., Hoesing A.N., Duong K., Trisini-Lipsanopoulos A., Dhima K., Hung A.Y., Flaherty A.W., Schwarzschild M.A., Hayes M.T., Wills A.M., Shivraj Sohur U., Mejia N.I., Selkoe D.J., Oakes D., Shoulson I., Dong X., Marek K., Zheng B., Ivinson A., Hyman B.T., Growdon J.H., Sudarsky L.R., Schlossmacher M.G., Ravina B., Scherzer C.R. Association between α-synuclein blood transcripts and early, neuroimaging-supported Parkinson’s disease. Brain. 2015; 138 (9): 2659–71. DOI: 10.1093/brain/awv202.Pihlstrøm L., Berge V., Rengmark A., Toft M. Parkinson’s disease correlates with promoter methylation in the α-synuclein gene. Mov Disord. 2015; 30 (4): 577–80. DOI: 10.1002/mds.26073.Wei Y., Yang N., Xu Q., Sun Q., Guo J., Li K., Liu Z., Yan X., Zhu X., Tang B. The rs3756063 polymorphism is associated with SNCA methylation in the Chinese Han population. J. Neurol Sci. 2016; 367: 11–4. DOI: 10.1016/j.jns.2016.05.037.