<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>
<!DOCTYPE root>
<article xmlns:mml="http://www.w3.org/1998/Math/MathML" xmlns:xlink="http://www.w3.org/1999/xlink" xmlns:xsi="http://www.w3.org/2001/XMLSchema-instance" xmlns:ali="http://www.niso.org/schemas/ali/1.0/" article-type="research-article" dtd-version="1.2" xml:lang="en"><front><journal-meta><journal-id journal-id-type="publisher-id">Urologiia</journal-id><journal-title-group><journal-title xml:lang="en">Urologiia</journal-title><trans-title-group xml:lang="ru"><trans-title>Урология</trans-title></trans-title-group></journal-title-group><issn publication-format="print">1728-2985</issn><issn publication-format="electronic">2414-9020</issn><publisher><publisher-name xml:lang="en">Bionika Media</publisher-name></publisher></journal-meta><article-meta><article-id pub-id-type="publisher-id">696330</article-id><article-id pub-id-type="doi">10.18565/urology.2025.5.18-23</article-id><article-categories><subj-group subj-group-type="toc-heading" xml:lang="en"><subject>Original Articles</subject></subj-group><subj-group subj-group-type="toc-heading" xml:lang="ru"><subject>Оригинальные статьи</subject></subj-group><subj-group subj-group-type="article-type"><subject>Research Article</subject></subj-group></article-categories><title-group><article-title xml:lang="en">Antibiotic resistance of the main uropathogens in patients with acute secondary pyelonephritis</article-title><trans-title-group xml:lang="ru"><trans-title>Антибиотикорезистентность основных уропатогенов у пациентов с острым вторичным пиелонефритом</trans-title></trans-title-group></title-group><contrib-group><contrib contrib-type="author"><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Antonov</surname><given-names>Alexander G.</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Антонов</surname><given-names>Александр Геннадьевич</given-names></name></name-alternatives><address><country country="RU">Russian Federation</country></address><bio xml:lang="en"><p>Dr.Sc. professor. Head of the Department of Urology and Nephrology</p></bio><bio xml:lang="ru"><p>д.м.н., профессор, заведующий кафедрой урологии и нефрологии</p></bio><email>antonovs@rambler.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff1"/></contrib><contrib contrib-type="author"><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Mikhailichenko</surname><given-names>Alexander O.</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Михайличенко</surname><given-names>Александр Олегович</given-names></name></name-alternatives><address><country country="RU">Russian Federation</country></address><bio xml:lang="en"><p>Assistant Professor, Department of Urology and Nephrology</p></bio><bio xml:lang="ru"><p>ассистент кафедры урологии и нефрологии</p></bio><email>mao4212@mail.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff1"/></contrib><contrib contrib-type="author"><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Svishcheva</surname><given-names>Ekaterina V.</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Свищёва</surname><given-names>Екатерина Викторовна</given-names></name></name-alternatives><address><country country="RU">Russian Federation</country></address><bio xml:lang="en"><p>Head of Bacteriological Laboratory</p></bio><bio xml:lang="ru"><p>заведующая бактериологической лабораторией</p></bio><email>e.svishcheva@mail.cardiokhv.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff2"/></contrib><contrib contrib-type="author"><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Taran</surname><given-names>Ekaterina K.</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Таран</surname><given-names>Екатерина Константиновна</given-names></name></name-alternatives><address><country country="RU">Russian Federation</country></address><bio xml:lang="en"><p>Head of Bacteriological Laboratory</p></bio><bio xml:lang="ru"><p>заведующая бактериологической лабораторией</p></bio><email>direct@kkb1.medkhv.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff3"/></contrib></contrib-group><aff-alternatives id="aff1"><aff><institution xml:lang="en">FSBEI HE «Far Eastern State Medical University» of the Ministry of Health of Russia</institution></aff><aff><institution xml:lang="ru">ФГБОУ ВО «Дальневосточный государственный медицинский университет» Минздрава России</institution></aff></aff-alternatives><aff-alternatives id="aff2"><aff><institution xml:lang="en">Federal Center for Cardiovascular Surgery of the Ministry of Health of Russia</institution></aff><aff><institution xml:lang="ru">ФГБУ «Федеральный центр сердечно-сосудистой хирургии» Минздрава России</institution></aff></aff-alternatives><aff-alternatives id="aff3"><aff><institution xml:lang="en">Regional Clinical Hospital named after Professor S.I. Sergeev of the Ministry of Health of the Khabarovsk Territory</institution></aff><aff><institution xml:lang="ru">КГБУЗ «Краевая клиническая больница» им. проф. С.И. Сергеева Министерства здравоохранения Хабаровского края</institution></aff></aff-alternatives><pub-date date-type="pub" iso-8601-date="2025-11-18" publication-format="electronic"><day>18</day><month>11</month><year>2025</year></pub-date><issue>5</issue><issue-title xml:lang="en"/><issue-title xml:lang="ru"/><fpage>18</fpage><lpage>23</lpage><history><date date-type="received" iso-8601-date="2025-11-16"><day>16</day><month>11</month><year>2025</year></date><date date-type="accepted" iso-8601-date="2025-11-16"><day>16</day><month>11</month><year>2025</year></date></history><permissions><copyright-statement xml:lang="en">Copyright ©; 2025, Bionika Media</copyright-statement><copyright-statement xml:lang="ru">Copyright ©; 2025, ООО «Бионика Медиа»</copyright-statement><copyright-year>2025</copyright-year><copyright-holder xml:lang="en">Bionika Media</copyright-holder><copyright-holder xml:lang="ru">ООО «Бионика Медиа»</copyright-holder></permissions><self-uri xlink:href="https://journals.eco-vector.com/1728-2985/article/view/696330">https://journals.eco-vector.com/1728-2985/article/view/696330</self-uri><abstract xml:lang="en"><p>Relevance. Pyelonephritis is an infectious and inflammatory disease of the kidneys with predominant damage to the mucous membrane of the pelvis and calyces and/or interstitial tissue. In complicated acute pyelonephritis, the frequency of E. coli isolation is 63,3%. Less common pathogens are Proteus mirabilis (6,1%), Pseudomonas aeruginosa (1,3%), Klebsiella pneumoniae (13,5%). Enterobacteriaceae are characterized by high levels of resistance to many antimicrobial drugs (AMPs). Today, the greatest clinical significance is the increase in resistance of enterobacteria strains to modern cephalosporins and carbapenems.</p> <p>Purpose of the study. To study the level of resistance of pyelonephritis pathogens to antibacterial drugs of various groups, to identify producers of extended spectrum beta-lactamases and carbapenemases among the causative agents of acute secondary pyelonephritis.</p> <p>Materials and methods. The medical histories of 305 medical histories of patients who were undergoing inpatient treatment at the uronephrological center of the Regional Clinical Hospital named after Professor S.I. Sergeev, Khabarovsk with an established diagnosis: acute secondary pyelonephritis. The material for laboratory research was the average portion of freely released urine obtained after toileting the genital organs, or urine collected by a catheter using a generally accepted method. Identification of microorganisms was carried out using automatic bacteriological analyzers. Antimicrobial susceptibility was tested using the disk diffusion method. Molecular genetic analysis was carried out using the PCR method.</p> <p>Results and discussion. The resistance of microorganisms that cause acute secondary pyelonephritis to antibacterial drugs of various groups was assessed. The mechanisms of antibiotic resistance of enterobacteriaceae have been studied. A high prevalence of extended spectrum beta-lactamase producers was revealed. In E. coli isolates. genes of the bla CTX-M-1 cluster predominated (34%). Carbopenemase production was detected in 24% of the analyzed E.coli strains. The vast majority of K. pneumoniae strains produced extended-spectrum beta-lactamases of the bla SHV cluster (87.5%). The frequency of carbapenemase production among K. pneumoniae isolates was 68.7%.</p> <p>Conclusion. If acute secondary pyelonephritis is suspected and empirical therapy is prescribed, assessment of the local resistance phenotype of the leading pathogens is necessary to exclude from the selection of antibacterial agents to which there is a high level of resistance.</p></abstract><trans-abstract xml:lang="ru"><p>Актуальность. Пиелонефрит – это инфекционно-воспалительное заболевание почек с преимущественным поражением слизистой лоханки и чашечек и/или интерстициальной ткани. При осложненном остром пиелонефрите частота выделения E. сoli составляет 63,3%. Реже встречаются такие возбудители, как Proteus mirabilis (6,1%), Pseudomonas aeruginosa (1,3%), Klebsiella pneumoniae (13,5%). Энтеробактерии характеризуются высоким уровнем устойчивости ко многим антимикробным препаратам (АМП). На сегодняшний день наибольшее клиническое значение имеет рост резистентности штаммов энтеробактерий к современным цефалоспоринам и карбапенемам.</p> <p>Цель исследования. Изучение уровня устойчивости возбудителей пиелонефрита к антибактериальным препаратам различных групп и выявление продуцентов бета-лактамаз расширенного спектра и карбапенемаз среди возбудителей острого вторичного пиелонефрита.</p> <p>Материалы и методы. Проанализированы истории болезни 305 пациентов, находившихся на стационарном лечении уронефрологическом центре ККБ им. проф. С.И. Сергеева г. Хабаровска с установленным диагнозом: острый вторичный пиелонефрит. Материалом для лабораторного исследования являлась средняя порция свободно выпущенной мочи, полученная после туалета наружных половых органов, либо моча, собранная катетером по общепринятой методике. Идентификацию микроорганизмов осуществляли с использованием автоматических бактериологических анализаторов. Чувствительность к антимикробным препаратам тестировалась диско-диффузионным методом. Молекулярно-генетический анализ проводили методом ПЦР.</p> <p>Результаты и обсуждение. Оценена устойчивость микроорганизмов — возбудителей острого вторичного пиелонефрита к антибактериальным препаратам различных групп. Изучены механизмы антибиотикорезистентности энтеробактерий. Выявлена высокая распространенность продуцентов бета-лактамаз расширенного спектра. У изолятов E. coli преобладали гены кластера bla CTX-M-1 (34%). У 24% проанализированных штаммов E.coli выявлена продукция карбопенемаз. Подавляющее большинство штаммов K. pneumoniae продуцировали бета-лактамазы расширенного спектра кластера bla SHV (87,5%). Частота продукции карбапенемаз среди изолятов K. pneumoniae составила 68,7%.</p> <p>Заключение. При подозрении на острый вторичный пиелонефрит и назначении эмпирической терапии оценка локального фенотипа резистентности ведущих патогенов необходима для исключения из препаратов выбора антибактериальных средств, к которым отмечается высокий уровень резистентности.</p></trans-abstract><kwd-group xml:lang="en"><kwd>urinary tract infection</kwd><kwd>acute secondary pyelonephritis</kwd><kwd>antibacterial therapy</kwd><kwd>antibiotic resistance</kwd><kwd>betalactamase genes</kwd></kwd-group><kwd-group xml:lang="ru"><kwd>urinary tract infection</kwd><kwd>acute secondary pyelonephritis</kwd><kwd>antibacterial therapy</kwd><kwd>antibiotic resistance</kwd><kwd>betalactamase genes</kwd></kwd-group><funding-group/></article-meta></front><body></body><back><ref-list><ref id="B1"><label>1.</label><mixed-citation>Perepanova T.S., Kozlov R.S., Rudnov V.A., Sinyakova L.A., Palagin I.S. Federal Clinical Guidelines «Antimicrobial Therapy and Prevention of Infections of the Kidneys, Urinary Tract, and Male Genital Organs. Uromedia Publishing House, Moscow, 2022, 126 p. Russian (Перепанова Т.С., Козлов Р.С., Руднов В.А., Синякова Л.А., Палагин И.С. Федеральные клинические рекомендации «Антимикробная терапия и профилактика инфекций почек, мочевыводящих путей и мужских половых органов. Издательский дом «Уромедиа», М., 2022, 126 с.)</mixed-citation></ref><ref id="B2"><label>2.</label><mixed-citation>Bonkat G., Bartoletti R., Bruyere F., Cai T., Geerlings S.E., Köves B. et al. EAU Urological Infections Guidelines. Edn. Presented at the EAU Annual Congress Milan Italy. 2021 ISBN 978-94-92671-13-4.</mixed-citation></ref><ref id="B3"><label>3.</label><mixed-citation>Bochkarev A.B, Kostuykov S.V., Shamatrina E.I., Merinov D.S. Antibiotic resistance in urological patients with inflammatory diseases of the upper urinary tract. Experimental and Clinical Urology. 2019;2:106–110. https://doi.org/ 10.29188/2222-8543-2019-11-2-106-110. Russian (Бочкарев А.Ю., Костюков С.В., Шаматрина Е.И., Меринов Д.С. Антибиотикорезистентность у урологических пациентов с воспалительными заболеваниями верхних мочевыводящих путей. Экспериментальная и клиническая урология. 2019;2:106–110).</mixed-citation></ref><ref id="B4"><label>4.</label><mixed-citation>Kozlov R.S., Palagin I.S., Ivanchik N.V., Trushin I.V., Dekhnich A.V., Eidelstein M.V., Perepanova T.S, and «DARMIS-2023» Study Group. National monitoring of antibiotic resistance of pathogens causingcommunity-acquired urinary tract infections in Russia: results of the multicenter epidemiological study «DARMIS-2023». Klinicheskaya mikrobiologiya i antimikrobnaya himioterapiya = Clinical Microbiology and Antimicrobial Chemotherapy 2024;26(3):328-337. https://doi.org/ 10.36488/cmac.2024.3.328-337. Russian (Козлов Р.С., Палагин И.С., Иванчик Н.В., Трушин И.В., Дехнич А.В., Эйдельштейн М.В., Перепанова Т.С. и исследовательская группа «ДАРМИС-2023». Национальный мониторинг антибиотикорезистентности возбудителей внебольничных инфекций мочевых путей в России: результаты многоцентрового эпидемиологического исследования «ДАРМИС-2023». Клин. микробиология антимикробная химиотерапия. – 2024. – Т. 26. – № 3. С.328– 337).</mixed-citation></ref><ref id="B5"><label>5.</label><mixed-citation>Wagenlehner F.M.E. Neue Antibiotika in der Behandlung von Harnwegsinfektionen [New antibiotics for the treatment of urinary tract infections]. Urologie. 2023;62(7):705–710. https://doi.org/10.1007/s00120-023-02121-5.</mixed-citation></ref><ref id="B6"><label>6.</label><mixed-citation>Murray C.J.L. et al. Global burden of bacterial antimicrobial resistance in 2019: a systematic analysis. The Lancet 2022;399(10325):629–655. https://doi.org/10.1016/S0140-6736(21)02724-0.</mixed-citation></ref><ref id="B7"><label>7.</label><mixed-citation>Medina-Polo J., Naber K.G., Bjerklund Johansen T.E. Healthcareassociated urinary tract infections in urology. GMS Infect Dis. 2021;9. ID Doc05. https://doi.org/10.3205/id000074.</mixed-citation></ref><ref id="B8"><label>8.</label><mixed-citation>Sukhorukova M.V., Edelstein M.V., Ivanchik N.V., Skleenova E.Yu., Shajdullina E.R., Azyzov I.S. et al. Antimicrobial resistance of nosocomial Enterobacterales isolates in Russia: results of multicenter epidemiological study «MARATHON 2015–2016». 2019;21(2):147–159. https://doi.org/10.36488/cmac.2019.2.147-159. Russian (Сухорукова М.В., Эйдельштейн М.В., Иванчик Н.В., Склеенова Е.Ю., Шайдуллина Э.Р., Азизов И.С. и соавт. Антибиотикорезистентность нозокомиальных штаммов Enterobacteriaceae в стационарах России: результаты многоцентрового эпидемиологического исследования МАРАФОН в 2015–2016 гг. Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. 2019;21(2):147-159).</mixed-citation></ref><ref id="B9"><label>9.</label><mixed-citation>Palagin I.S. Sukhorukova M.V., Dekhnich A.V., Edelstein M.V., Shevelev A.V., Grinev A.V., Perepanova T.S., Kozlov R.S., DARMIS Study Group. Current state of antibiotic resistance of pathogens causing community-aquired urinary tract infections in Russia: «DARMIS» Study (2010–2011). KMAKH 2012;14(4):280–302. Russian (Палагин И.С., Сухорукова М.В., Дехнич А.В., Эйдельштейн М.В., Шевелев А.Н., Гринев А.В., Перепанова Т.С., Козлов Р.С. Исследовательская группа «ДАРМИС». Современное состояние антибиотикорезистентности возбудителей внебольничных инфекций мочевых путей в России: результаты исследования «ДАРМИС» (2010–2011). Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. 2012;14(4):280–302).</mixed-citation></ref><ref id="B10"><label>10.</label><mixed-citation>Tilahun M., Kassa Y., Gedefie A., Ashagire M. Emerging Carbapenem-Resistant Enterobacteriaceae Infection, Its Epidemiology and Novel Treatment Options: A Review. Infect Drug Resist. 2021 Oct 21;14:4363-4374. https://doi.org/10.2147/IDR.S337611.</mixed-citation></ref><ref id="B11"><label>11.</label><mixed-citation>Sinyakova L.A., Kosova I.V., Nezovibatko Y.I. Treatment of lower urinary tract infections in women. Meditsinsky Sovet. 2018;21:184–191. https://doi.org/10.21518/2079-701X-2018-21-184-191. Russian (Синякова Л.А., Косова И.В., Незовибатько Я.И. Лечение инфекций нижних мочевых путей у женщин. Медицинский совет. 2018;21:184–191).</mixed-citation></ref><ref id="B12"><label>12.</label><mixed-citation>Vinogradova A.G., Kuzmenkov A.Yu. Practical application of AMRmap: elements of the «from General to particular» approach on the example of Klebsiella pneumoniae. Klinicheskaya mikrobiologiya i antimikrobnaya himioterapiya = Clinical Microbiology and Antimicrobial Chemotherapy 2019;21(2):181–186. https://doi.org/10.36488/cmac.2019.2.181-186. Russian (Виноградова А.Г., Кузьменков А.Ю. Практическое применение AMRmap: элементы подхода «от общего к частному» на примере Klebsiella pneumoniae. Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. 2019;21(2):181–186).</mixed-citation></ref><ref id="B13"><label>13.</label><mixed-citation>Leski T.A., Bangura U., Jimmy D.H., Ansumana R., Lizewski S.E., Li R.W., Stenger D.A., Taitt C.R., Vora G.J. Identification of blaOXA-₅₁-like, blaOXA-₅₈, blaDIM-₁, and blaVIM carbapenemase genes in hospital Enterobacteriaceae isolates from Sierra Leone. J Clin Microbiol. 2013;51(7):2435–38. https://doi.org/10.1128/JCM.00832-13.</mixed-citation></ref></ref-list></back></article>
