ОБНАРУЖЕНИЕ РАКА ПРЕДСТАТЕЛЬНОЙ ЖЕЛЕЗЬІ МАСС-СПЕКТРОМЕТРИЧЕСКИМ ПРОФИЛИРОВАНИЕМ НИЗКОМОЛЕКУЛЯРНОГО ПРОТЕОМА ПЛАЗМЬІ КРОВИ


Цитировать

Полный текст

Открытый доступ Открытый доступ
Доступ закрыт Доступ предоставлен
Доступ закрыт Доступ платный или только для подписчиков

Аннотация

В настоящее время отсутствуют надежные биомаркеры плазми крови для раннего обнаружения рака предстательной желези (РПЖ) — одной из наиболее распространенних злокачественних опухолей у мужчин. В данном исследовании разработана, унифицирована и апробирована новая методология поиска биомаркеров РПЖ — профилирование низкомолекулярного протеома плазми крови (1—17кДа). Данний подход включил три основних компонента: предварительную подготовку образцов, времяпролетную масс-спектрометрию с активированной матрицей лазерной десорбцией/ ионизацией ALDI-TOF-MS, обработку данних с помощью биоинформационного пакета программ. Продемонстрировани возможности и перспективность разработанного подхода к обнаружению потенциальних маркеров РПЖ. Проведен скрининг 46 образцов плазми крови больных РПЖ и 26 контрольних образцов. В результате проведенного исследования обнаружени пептиди/полипептиди, которие могут в перспективе использоваться в качестве детектирования этого заболевания.

Полный текст

Доступ закрыт

Об авторах

В. Е. Шевченко

ФГБУ “РОНЦ им. Н. Н. Блохина” РАМН

Email: vshev@nm.ru
д-р биол. наук, проф., зав. лабораторией онкопротеомики НИИ канцерогенеза

В. А. Черняев

ФПДО Московский государственный медико-стоматологический университет

кафедра онкологии

Н. Е. Арноцкая

ФГБУ “РОНЦ им. Н. Н. Блохина” РАМН

Лаборатория онкопротеомики НИИ канцерогенеза

В. Б. Матвеев

ФГБУ “РОНЦ им. Н. Н. Блохина”

урологическое отделение НИИ клинической онкологии

Список литературы

  1. Damber J.E., Aus G. Prostate cancer. Lancet 2008;371 (9625): 1710—1721.
  2. Freedland S.J., Partin A.W. Prostate-specific antigen: update 2006. Urology 2006;67(3):458—460.
  3. Thompson I.M., Ankerst D.P., Chi C. et.al. Operating characteristics of prostate-specific antigen in men with an initial PSA level of 3.0 ng/ml or lower. JAMA 2005;294(1):66—70.
  4. Schroder F.H., van der Cruijsen-Koeter I., de Koning H.J. et.al. Prostate cancer detection at low prostate specific antigen. J Urol 2000;163(3):806—812.
  5. Tirumalai R.S., Chan K.C., Prieto D.A. et al. Characterization of the low molecular weight human serum proteome. Mol Cell Proteomics 2003;2(10):1096—1103.
  6. Anderson N.L., Anderson N.G. The human plasma proteome: history, character, and diagnostic prospects. Mol Cell Proteomics 2002;1(11):845—867.
  7. Al-Ruwaili J.A., Larkin S.E., Zeidan B.A. et al. Discovery of serum protein biomarkers for prostate cancer progression by proteomic analysis. Cancer Genomics Proteomics 2010;7(2):93—103.
  8. Qu Y., Adam B.L., Yasui Y. et al. Boosted decision tree analysis of surface-enhanced laser desorption/ionization mass spectral serum profiles discriminates prostate cancer from noncancer patients. Clin Chem 2002;48(10):1835—1843.
  9. Petricoin E.F., 3rd, Ornstein D.K., Paweletz C.P. et al. Serum proteomic patterns for detection of prostate cancer. J Natl Cancer Inst 2002;94(20):1576—1578.
  10. Banez L.L., Prasanna P., Sun L. et al. Diagnostic potential of serum proteomic patterns in prostate cancer. J Urol 2003;170(2 Pt 1): 442—446.
  11. Adam B.L., Qu Y., Davis J.W et al. Serum protein fingerprinting coupled with a pattern-matching algorithm distinguishes prostate cancer from benign prostate hyperplasia and healthy men. Cancer Res 2002;62(13):3609—3614.
  12. Lawrie L.C., Curran S., McLeod H.L. et al. Application of laser capture microdissection and proteomics in colon cancer. Mol Pathol 2001;54(4):253—258.
  13. Vlahou A., Schellhammer P.F., Mendrinos S. et al. Development of a novel proteomic approach for the detection of transitional cell carcinoma of the bladder in urine. Am J Pathol 2001; 158(4):1491—1502.
  14. Ketterlinus R., Hsieh S.Y., Teng S.H. et al. Fishing for biomarkers: analyzing mass spectrometry data with the new ClinProTools software. Biotechniques 2005;Suppl:37—40.
  15. Petricoin E.F., Ardekani A.M., Hitt B.A. et al. Use of proteomic patterns in serum to identify ovarian cancer. Lancet 2002; 359(9306):572—577.
  16. Rai A.J., Zhang Z., Rosenzweig J. et al. Proteomic approaches to tumor marker discovery. Arch Pathol Lab Med 2002; 126(12):1518—1526.
  17. Villanueva J., Philip J., Entenberg D. et al. Serum peptide profiling by magnetic particle-assisted, automated sample processing and MALDI-TOF mass spectrometry. Anal Chem 2004; 76(6):1560—1570.
  18. Шевченко В.Е., Арноцкая Н.Е., Трифонова О.П. и др. Профилирование низкомолекулярного протеома плазмы крови для обнаружения потенциальних маркеров рака легкого. Масс-спектрометрия 2007; 4(4): 245—254.
  19. Shevchenko V.E., Arnotskaya N.E., Zaridze D.G. Detection of lung cancer using plasma protein profiling by matrix-assisted laser desorption/ionization mass spectrometry. Eur J Mass Spectrom 2010;16(4):539—49.
  20. Pyatnitskiy M.A., Lisitsa A.V., Moshkovskii S.A. et al. Identification of differential signs of squamous cell lung carcinoma by means of the mass spectrometry profiling of blood plasma. Journal of Analytical Chemistry 2011; 66 (14):1369—1375.
  21. Шевченко В.Е., Мадина Х., Поддубная И.В. и др. Масс-спектрометрическое профилирование низкомолекулярного протеома плазми крови для обнаружения потенциальних маркеров рака молочной желези. Вестник РОНЦ им. Н.Н. Блохина РАМН. 2011;22 (3):27—33.
  22. Ornstein D.K., Rayford W., Fusaro V.A. et al. Serum proteomic profiling can discriminate prostate cancer from benign prostates in men with total prostate specific antigen levels between 2.5 and 15.0 ng/ml. J Urol 2004;172(4 Pt 1):1302—1305.
  23. Kohli M., Siegel E., Bhattacharya S. et al. Surface-enhanced laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry (SELDI-TOF MS) for determining prognosis in advanced stage hormone relapsing prostate cancer. Cancer Biomark 2006;2(6):249—258.
  24. Baggerly K.A., Morris J.S., Coombes K.R. Reproducibility of SELDI-TOF protein patterns in serum: comparing datasets from different experiments. Bioinformatics 2004;20(5):777—785.
  25. Petricoin E.F., Ornstein D.K., Liotta L.A. Clinical proteomics: Applications for prostate cancer biomarker discovery and detection. Urol Oncol 2004;22(4):322—328.
  26. M'Koma A.E., Blum D.L., Norris J.L. et al. Detection of preneoplastic and neoplastic prostate disease by MALDI profiling of urine. Biochem Biophys Res Commun 2007;353(3):829—834.

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML
Скачать

© ООО «Бионика Медиа», 2013

Данный сайт использует cookie-файлы

Продолжая использовать наш сайт, вы даете согласие на обработку файлов cookie, которые обеспечивают правильную работу сайта.

О куки-файлах