Структура возбудителей внебольничных инфекций мочевыводящих путей в Российской Федерации в 2022–2024 гг.: данные исследования RESOURCE-2

Обложка

Цитировать

Полный текст

Открытый доступ Открытый доступ
Доступ закрыт Доступ предоставлен
Доступ закрыт Доступ платный или только для подписчиков

Аннотация

Цель. Анализ данных структуры возбудителей внебольничных инфекций мочевыводящих путей (ИМП) в Российской Федерации в 2022–2024 гг.

Материалы и методы. Проанализированы результаты 566 122 микробиологических исследований мочи жителей 834 городов в 83 субъектах Российской Федерации с 2022 по 2024 г. включительно. Исследование проводилось с использованием технологии анализа данных реальной клинической практики (ДРКП) с использованием соответствующих фрагментов лабораторных баз данных лаборатории ИнВитро. Проанализированы отдельные виды ИМП у беременных, детей, мужчин и женщин разных возрастных групп.

Результаты. Наиболее частым возбудителем ИМП в России является E. coli, которая выделяется у 40,7% мужчин, 69,5% женщин и 61,2% детей с внебольничными ИМП. При этом доля E.coli максимальна у женщин в возрасте 38–55 лет, у мужчин – в возрасте 20–50 лет. На втором месте находится K. pneumoniae (12,8%), отмечается рост частоты выделения этой бактерии, начиная с возрастного диапазона 38–40 лет. Из других представителей порядка Enterobacterales реже выделяли P. mirabilis – 3,4%. Из числа грам(+) бактерий наиболее часто выявляли E. faecalis (5,7%), S. saprophyticus (1,5%) и S. agalactiae (1,8%). Выявлено значительное повышение частоты выявления S. agalactiae у беременных (6–19%) по сравнению с небеременными женщинами (2–5%) аналогичного возрастного диапазона.

Выводы. ДРКП является простым, недорогим инструментом изучения структуры возбудителей внебольничных ИМП, дополняющим существующие микробиологические подходы, а также позволяет получить сведения по структуре возбудителей инфекций, недоступные другим методам сбора микробиологической информации: в частности, сведения о частотах выделения относительно редких возбудителей, подробные данные по возрастным особенностям структуры возбудителей.

Полный текст

Доступ закрыт

Об авторах

Екатерина Михайловна Андреева

ФГАОУ ВО «БФУ им. И. Канта»

Email: v.rafalskiy@mail.ru
SPIN-код: 2252-2526

к.м.н., врач - клинический фармаколог, Центр клинических исследований

Россия, Калининград

Алла Витальевна Захарова

Институт микробиологии, антимикробной терапии и эпидемиологии ФГБУ «НМИЦ АГП им. В.И. Кулакова» Минздрава России

Email: v.rafalskiy@mail.ru

к.м.н., врач клинический фармаколог отделения клинической фармакологии антимикробных и иммунобиологических препаратов

Россия, Москва

Алина Андреевна Изотова

ФГАОУ ВО «БФУ им. И. Канта»

Email: alina.tsapkova@inbox.ru
ORCID iD: 0000-0002-2701-9719
SPIN-код: 9641-9319

врач — клинический фармаколог Центра клинических исследований, аспирант по специальности «Фармакология, клиническая фармакология»

Россия, Калининград

Надежда Олеговна Крюкова

ФГАОУ ВО «БФУ им. И. Канта»

Email: krukovano@yandex.ru
ORCID iD: 0000-0002-2379-6764
SPIN-код: 3938-2027

к.м.н., доцент кафедры общей и клинической фармакологии ОНК «Институт медицины и наук о жизни» (МЕДБИО)

Россия, Калининград

Лариса Викторовна Михайлова

ФГАОУ ВО «БФУ им. И. Канта»

Email: mihalysa@mail.ru
ORCID iD: 0000-0001-5070-5955
SPIN-код: 4991-9875

к.м.н., доцент, заведующая кафедрой терапии ОНК «Институт медицины и наук о жизни» (МЕДБИО)

Россия, Калининград

Татьяна Валерьевна Припутневич

Институт микробиологии, антимикробной терапии и эпидемиологии ФГБУ «НМИЦ АГП им. В.И. Кулакова» Минздрава России; ФГБОУ ДПО «РМАНПО» Минздрава России

Email: v.rafalskiy@mail.ru
SPIN-код: 8383-7023

чл.-корр. РАН, д.м.н., профессор, директор института микробиологии, антимикробной терапии и эпидемиологии ФГБУ «НМИЦ АГП им. В.И. Кулакова» Минздрава России; заведующая кафедрой медицинской микробиологии им. акад. З.В. Ермольевой ФГБОУ ДПО «РМАНПО» Минздрава России

Россия, Москва; Москва

Владимир Витальевич Рафальский

ФГАОУ ВО «БФУ им. И. Канта»

Автор, ответственный за переписку.
Email: v.rafalskiy@mail.ru
ORCID iD: 0000-0002-2503-9580
SPIN-код: 9424-2840

 д.м.н., профессор, заведующий кафедрой общей и клинической фармакологии, директор Центра клинических исследований «Институт медицины и наук о жизни» (МЕДБИО)

Россия, Калининград

Александр Польевич Ройтман

ФГБОУ ДПО «РМАНПО» Минздрава России

Email: v.rafalskiy@mail.ru
ORCID iD: 0000-0003-2592-6857
SPIN-код: 5400-7815

д.м.н., профессор, медико-диагностический факультет, кафедра клинической лабораторной диагностики с курсом лабораторной иммунологии

Россия, Москва

Наталья Евгеньевна Шабанова

Институт микробиологии, антимикробной терапии и эпидемиологии ФГБУ «НМИЦ АГП им. В.И. Кулакова» Минздрава России

Email: v.rafalskiy@mail.ru
ORCID iD: 0000-0001-6838-3616

к.м.н., доцент, заведующая отделением клинической фармакологии антимикробных и иммунобиологических препаратов

Россия, Москва

Сергей Владимирович Яковлев

ФГАОУ ВО «Первый МГМУ им. И.М. Сеченова» (Сеченовский университет) Минздрава России

Email: v.rafalskiy@mail.ru
SPIN-код: 9313-1453

д.м.н., Институт клинической медицины им. Н.В. Склифосовского, кафедра госпитальной терапии № 2

Россия, Москва

Список литературы

  1. Foxman B. The epidemiology of urinary tract infection. Nature Reviews Urology. 2010;7(12):653–660.
  2. Kranz J., Bartoletti R., Bruyère F. et al. European Association of Urology Guidelines on Urological Infections: Summary of the 2024 Guidelines. European Urology. 2024. Article in Press. doi: 10.1016/j.eururo.2024.03.035.
  3. Colgan R., Williams M. Diagnosis and treatment of acute uncomplicated cystitis. American Family Physician. 2011;84(7):771–776. PMID: 22010614.
  4. Tandogdu Z., Wagenlehner F. M. Global epidemiology of urinary tract infections. Current Opinion in Infectious Diseases. 2016;29(1):73–79.
  5. Loran O.B. Epidemiological aspects of urinary tract infections. In: Proceedings of the International Symposium “Urinary Tract Infections in Outpatients.” Moscow; 1999. p. 5–8. Russian (Лоран О.Б. Эпидемиологические аспекты инфекций мочевыводящих путей. Материалы международного симпозиума «Инфекции мочевыводящих путей у амбулаторных больных». М., 1999. С. 5–8).
  6. Rafalsky V., Khodnevich L. Prevalence and risk factors of uncomplicated UTI: multicentre study sonar. European Urology Supplements. 2008;7(3):267. doi: 10.1016/S1569-9056(08)60620-8
  7. Foxman B. Epidemiology of urinary tract infections: incidence, morbidity, and economic costs. The American Journal of Medicine. 2002;113(1):5–13. doi: 10.1016/s0002-9343(01)01054-9
  8. Gupta K., Hooton T.M., Naber K.G. et al. International clinical practice guidelines for the treatment of acute uncomplicated cystitis and pyelonephritis in women: a 2010 update by the Infectious Diseases Society of America and the European Society for Microbiology and Infectious Diseases. Clinical Infectious Diseases. 2011;52(5):e103-e120. doi: 10.1093/cid/ciq257
  9. Bonkat G., Pickard R., Bartoletti R. et al. Urological Infections. Arnhem: European Association of Urology, 2018. 112 p.
  10. Rafalskiy V.V. Antimicrobial resistance of uropathogens causing uncomplicated urinary tract infections in the Russian Federation. Urology Herald. 2018;3:50–56. doi: 10.29188/2222-8543-2018-10-3-50-56. Russian (Рафальский В.В. Антибиотикорезистентность возбудителей неосложненных инфекций мочевых путей в Российской Федерации. Вестник урологии. 2018;3:50–56. doi: 10.29188/2222-8543-2018-10-3-50-56).
  11. Rafalskiy V.V., Tsapkova A.A., Mikhailova L.V., Korenev S.V. Software for transforming laboratory datasets containing data on pathogen resistance to antimicrobial agents. Certificate of state registration of computer program No. 2025664394 RF. Filed Apr 3, 2025; published Jun 4, 2025. Russian (Свидетельство о государственной регистрации программы для ЭВМ № 2025664394 РФ. Программа для преобразования дата-сетов лабораторных данных, содержащих информацию по резистентности возбудителей к антимикробным препаратам / В.В. Рафальский, А.А. Цапкова, Л.В. Михайлова, С.В. Коренев. Заявл. 03.04.2025; опубл. 04.06.2025).
  12. Bacteriological urine analysis: Clinical guidelines. Moscow: Federation of Laboratory Medicine; 2014. 33 p. Available from: https://fedlab.ru/upload/medialibrary/d6f/kochetov-ag.-klin.-rek.-kld.-2014-bakteriologicheskiy-analiz-mochi.pdf. Russian (Бактериологический анализ мочи: клинические рекомендации. М.: Федерация лабораторной медицины, 2014. 33 с. URL: https://fedlab.ru/upload/medialibrary/d6f/kochetov-ag.-klin.-rek._-kld.-2014_-bakteriologicheskiy-analiz-mochi.pdf).
  13. Modern clinical guidelines for uncomplicated urinary tract infection. Effective Pharmacotherapy. 2023;19(18):32–37. Russian (Современные клинические рекомендации по неосложненной инфекции мочевых путей. Эффективная фармакотерапия. 2023;19(18):32–37).
  14. Antimicrobial resistance: treating today – looking into the future. Effective Pharmacotherapy. 2023;19(36):12–18. Russian (Антибиотикорезистентность: лечим сейчас – смотрим в будущее. Эффективная фармакотерапия. 2023;19(36):12–18).
  15. Ku J.H., Bruxvoort K.J., Salas S.B. et al. Multidrug Resistance of Escherichia coli From Outpatient Uncomplicated Urinary Tract Infections in a Large United States Integrated Healthcare Organization. Open Forum Infectious Diseases. 2023;10(7). Art. ofad287. doi: 10.1093/ofid/ofad287
  16. Mareș C., Petca R.C., Popescu R.I. et al. Update on Urinary Tract Infection Antibiotic Resistance – A Retrospective Study in Females in Conjunction with Clinical Data. Life. 2024;14(1). Art. 106. doi: 10.3390/life14010106
  17. Gevorkyan A.R., Orlova O.E. Study of the spectrum of uropathogens causing uncomplicated lower urinary tract infections and their susceptibility to antibiotics in outpatient clinics of the Western and Northwestern districts of Moscow. RMJ. 2023;8:24–30. doi: 10.32364/2587-6821-2023-9-8-24-30. Russian (Геворкян А.Р., Орлова О.Е. Изучение спектра возбудителей неосложненных инфекций нижних мочевыводящих путей и их чувствительности к антибактериальным препаратам в поликлиниках Западного и Северо-Западного округов г. Москвы. РМЖ. 2023;8:24–30. doi: 10.32364/2587-6821-2023-9-8-24-30).
  18. Kozlov R.S., Palagin I.S., Ivanchik N.V., et al. National monitoring of antimicrobial resistance of community-acquired urinary tract infection pathogens in Russia: results of the multicenter epidemiological study “DARMIS-2023.” Clinical Microbiology and Antimicrobial Chemotherapy. 2024;26(3):328–337. doi: 10.36488/cmac.2024.3.328-337. Russian (Козлов Р.С., Палагин И.С., Иванчик Н.В. и др. Национальный мониторинг антибиотикорезистентности возбудителей внебольничных инфекций мочевых путей в России: результаты многоцентрового эпидемиологического исследования «ДАРМИС-2023». Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. 2024;26(3):328–337. doi: 10.36488/cmac.2024.3.328-337).
  19. Dataset: DARMIS-2023. Available from: https://app.amrcloud.net/rus/?id=darmis&public=T. Russian (Набор данных: DARMIS-2023. URL: https://app.amrcloud.net/rus/?id=darmis&public=T).
  20. Nicolle L.E. Urinary Tract Infections in the Older Adult. Clinics in Geriatric Medicine. 2016;32(3):523–538. doi: 10.1016/j.cger.2016.03.002
  21. Mohapatra S., Panigrahy R., Tak V. et al. Prevalence and resistance pattern of uropathogens from community settings of different regions: an experience from India. Access Microbiology. 2022;4(2). Art. 000321. doi: 10.1099/acmi.0.000321
  22. Zhan Z.S., Shi J., Zheng Z.S. et al. Epidemiological insights into seasonal, sex-specific and age-related distribution of bacterial pathogens in urinary tract infections. Experimental and Therapeutic Medicine. 2024;27(4). Art. 140. doi: 10.3892/etm.2024.12428
  23. Krawczyk B., Wysocka M., Michalik M., Gołębiewska J. Urinary Tract Infections Caused by K. pneumoniae in Kidney Transplant Recipients - Epidemiology, Virulence and Antibiotic Resistance. Frontiers in Cellular and Infection Microbiology. 2022;12. Art. 861374. doi: 10.3389/fcimb.2022.861374
  24. Chebotar I.V., Bocharova Yu.A., Podoprigora I.V., Shagin D.A. Why Klebsiella pneumoniae is becoming a leading opportunistic pathogen. Clinical Microbiology and Antimicrobial Chemotherapy. 2020;22(1):4–19. doi: 10.36488/cmac.2020.1.4-19. Russian (Чеботарь И.В., Бочарова Ю.А., Подопригора И.В., Шагин Д.А. Почему Klebsiella pneumoniae становится лидирующим оппортунистическим патогеном. Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. 2020;22(1):4–19. doi: 10.36488/cmac.2020.1.4-19).
  25. Baranov A.A., Kozlov R.S., Namazova-Baranova L.S., et al. Modern recommendations for managing patients with urinary tract infections. Pediatric Pharmacology. 2025;22(1):79–97. doi: 10.15690/pf.v22i1.2852. Russian (Баранов А.А., Козлов Р.С., Намазова-Баранова Л.С. и др. Современные рекомендации по ведению пациентов с инфекцией мочевых путей. Педиатрическая фармакология. 2025;22(1):79–97. doi: 10.15690/pf.v22i1.2852).
  26. Raabe V.N., Shane A.L. Group B Streptococcus (Streptococcus agalactiae). Microbiology Spectrum. 2019;7(2). doi: 10.1128/microbiolspec.GPP3-0007-2018
  27. Pashchenko A.A., Dzhokhadze L.S., Dobrokhotova Yu.E., et al. Practical recommendations for counseling pregnant women with group B Streptococcus carriage. RMJ. Mother and Child. 2022;5(1):51–57. doi: 10.32364/2618-8430-2022-5-1-51-57. Russian (Пащенко А.А., Джохадзе Л.С., Доброхотова Ю.Э. и др. Практические рекомендации по консультированию беременных с носительством стрептококка группы B. РМЖ. Мать и дитя. 2022;5(1):51–57. doi: 10.32364/2618-8430-2022-5-1-51-57).
  28. Grigoryan I.E., Priputnevich T.V., Dolgushina N.V., et al. Pathway to developing an effective system for preventing infections caused by group B Streptococcus in obstetrics and neonatology. Obstetrics and Gynecology. 2023;12:59–67. doi: 10.18565/aig.2023.216. Russian (Григорян И.Э., Припутневич Т.В., Долгушина Н.В. и др. Путь создания эффективной системы профилактики инфекций, вызванных стрептококком группы В в акушерстве и неонатологии. Акушерство и гинекология. 2023;12:59–67 https://dx.doi.org/10.18565/aig.2023.216).
  29. Nikitina I.V., Krog-Jensen O.A., Budina A.Yu., et al. Group B Streptococcus infection in pregnant women and newborns: a clinical case and current state of the problem. Obstetrics and Gynecology. 2023;9:180–190. doi: 10.18565/aig.2023.136. Russian (Никитина И.В., Крог-Йенсен О.А., Будина А.Ю., и др. Инфекция, вызванная стрептококком группы В у беременных и новорожденных: клиническое наблюдение и современное состояние проблемы. Акушерство и гинекология. 2023;9:180–190. https://dx.doi.org/10.18565/aig.2023.136).
  30. Shabanova N.E. Urinary tract infections in pregnant women. Obstetrics and Gynecology. 2024;8:153–158. doi: 10.18565/aig.2024.175. Russian (Шабанова Н.Е. Инфекции мочевыводящих путей у беременных. Акушерство и гинекология. 2024;8:153–158 https://dx.doi.org/10.18565/aig.2024.175).
  31. Prevention of Group B Streptococcal Early-Onset Disease in Newborns: ACOG Committee Opinion, Number 797. Obstetrics & Gynecology. 2020;135(2):e51-e72. doi: 10.1097/AOG.0000000000003668
  32. 16. Clinical Guidelines: Normal Pregnancy. Moscow; 2023. Available from: https://cr.minzdrav.gov.ru/. Russian (Клинические рекомендации, Нормальная беременность. Москва, 2023. https://cr.minzdrav.gov.ru/).

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML
Скачать
2. Рис. 1. Распределение значений микробного числа при выделении из мочи наиболее частых возбудителей внебольничных ИМП. n=131101

Скачать (229KB)
Метаданные
3. Рис. 2. Распределение частот выделения двух возбудителей в диагностическом титре мочи пациентов с внебольничными ИМП. Серым цветом выделена предельная ошибка выборочной для соответствующих частот. Общее число положительных образцов мочи - 135786, число образцов с выделенными двумя возбудителями — 6122

Скачать (131KB)
Метаданные
4. Рис. З. Распределение частот выделения Е. coli у взрослых пациентов с внебольничными ИМП в зависимости от пола и возраста. Серым цветом выделена предельная ошибка выборочной для соответствующих частот. Общее число проанализированных штаммов: женщины — n=79341, мужчины — n=11152

Скачать (169KB)
Метаданные
5. Рис. 4. Распределение частот выделения Е. coli у детей с внебольничными ИМП в зависимости от пола и возраста. Серым цветом выделена предельная ошибка выборочной для соответствующих частот. Общее число проанализированных штаммов: девочки — n=6599, мужчины — n=1824

Скачать (121KB)
Метаданные
6. Рис. 5. Распределение частот выделения грам(-) «не-Е. cоli» возбудителей у пациентов с внебольничными ИМП в зависимости от возраста. Серым цветом выделена предельная ошибка выборочной для соответствующих частот. Число исследованных штаммов K. pneumoniае — 17000, P. mirabilis — 4518

Скачать (217KB)
Метаданные
7. Рис. 6. Распределение частот выделения грам(+) возбудителей у пациентов с внебольничными ИМП в зависимости от возраста. Серым цветом выделена предельная ошибка выборочной для соответствующих частот. Число исследованных штаммов: Е. faecalis — 9049, S. saprophyticus — 2109

Скачать (169KB)
Метаданные
8. Рис. 7. Распределение частот выделения S. agalactiae у пациентов с внебольничными ИМП в зависимости от пола, возраста и гравидарного статуса. Общее число проанализированных штаммов 2985, небеременные женщины — 2803, мужчины — 182, беременные ченщины — 318

Скачать (178KB)
Метаданные

© ООО «Бионика Медиа», 2025