<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>
<!DOCTYPE root>
<article xmlns:mml="http://www.w3.org/1998/Math/MathML" xmlns:xlink="http://www.w3.org/1999/xlink" xmlns:xsi="http://www.w3.org/2001/XMLSchema-instance" xmlns:ali="http://www.niso.org/schemas/ali/1.0/" article-type="research-article" dtd-version="1.2" xml:lang="en"><front><journal-meta><journal-id journal-id-type="publisher-id">Epidemiоlоgy and infectious diseases. Сurrent items</journal-id><journal-title-group><journal-title xml:lang="en">Epidemiоlоgy and infectious diseases. Сurrent items</journal-title><trans-title-group xml:lang="ru"><trans-title>Эпидемиология и инфекционные болезни. Актуальные вопросы</trans-title></trans-title-group></journal-title-group><issn publication-format="print">2226-6976</issn><issn publication-format="electronic">2414-9640</issn><publisher><publisher-name xml:lang="en">Bionika Media</publisher-name></publisher></journal-meta><article-meta><article-id pub-id-type="publisher-id">716219</article-id><article-id pub-id-type="doi">10.18565/epidem.2026.16.2.38-43</article-id><article-categories><subj-group subj-group-type="toc-heading" xml:lang="en"><subject>Original Investigations</subject></subj-group><subj-group subj-group-type="toc-heading" xml:lang="ru"><subject>Оригинальные исследования</subject></subj-group><subj-group subj-group-type="article-type"><subject>Research Article</subject></subj-group></article-categories><title-group><article-title xml:lang="en">The impact of metabolic syndrome on the taxonomic composition of the respiratory tract microbiome in patients with pneumococcal pneumonia</article-title><trans-title-group xml:lang="ru"><trans-title>Влияние метаболического синдрома на таксономический состав микробиома дыхательных путей у пациентов с пневмококковой пневмонией</trans-title></trans-title-group></title-group><contrib-group><contrib contrib-type="author"><contrib-id contrib-id-type="orcid">https://orcid.org/0009-0006-5483-1784</contrib-id><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Starikova</surname><given-names>Valeria A.</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Старикова</surname><given-names>Валерия Андреевна</given-names></name></name-alternatives><address><country country="RU">Russian Federation</country></address><bio xml:lang="en"><p>Assistant Professor, Department of Infectious Diseases and Epidemiology</p>
<p> </p></bio><bio xml:lang="ru"><p>ассистент кафедры инфекционных болезней и эпидемиологии</p>
<p> </p></bio><email>v.a.starikova@samsmu.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff1"/></contrib><contrib contrib-type="author"><contrib-id contrib-id-type="orcid">https://orcid.org/0000-0002-6177-8487</contrib-id><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Konstantinov</surname><given-names>Dmitry Yu.</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Константинов</surname><given-names>Дмитрий Юрьевич</given-names></name></name-alternatives><address><country country="RU">Russian Federation</country></address><bio xml:lang="en"><p>MD, Head, Department of Infectious Diseases and Epidemiology</p>
<p> </p></bio><bio xml:lang="ru"><p>д.м.н., заведующий кафедрой инфекционных болезней и эпидемиологии</p>
<p> </p></bio><email>d.u.konstantinov@samsmu.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff1"/></contrib><contrib contrib-type="author"><contrib-id contrib-id-type="orcid">https://orcid.org/0000-0003-2425-6732</contrib-id><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Konnova</surname><given-names>Tatyana V.</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Коннова</surname><given-names>Татьяна Витальевна</given-names></name></name-alternatives><address><country country="RU">Russian Federation</country></address><bio xml:lang="en"><p>Cand. Med. Sci., Associate Professor, Department of Infectious Diseases and Epidemiology</p>
<p> </p></bio><bio xml:lang="ru"><p>к.м.н., доцент кафедры инфекционных болезней и эпидемиологии</p>
<p> </p></bio><email>t.v.konnova@samsmu.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff1"/></contrib></contrib-group><aff-alternatives id="aff1"><aff><institution xml:lang="en">Samara State Medical University</institution></aff><aff><institution xml:lang="ru">Самарский государственный медицинский университет Минздрава России</institution></aff></aff-alternatives><pub-date date-type="pub" iso-8601-date="2026-07-10" publication-format="electronic"><day>10</day><month>07</month><year>2026</year></pub-date><volume>16</volume><issue>2</issue><issue-title xml:lang="en"/><issue-title xml:lang="ru"/><fpage>38</fpage><lpage>43</lpage><history><date date-type="received" iso-8601-date="2026-07-08"><day>08</day><month>07</month><year>2026</year></date><date date-type="accepted" iso-8601-date="2026-07-08"><day>08</day><month>07</month><year>2026</year></date></history><permissions><copyright-statement xml:lang="en">Copyright ©; 2026, Bionika Media</copyright-statement><copyright-statement xml:lang="ru">Copyright ©; 2026, ООО «Бионика Медиа»</copyright-statement><copyright-year>2026</copyright-year><copyright-holder xml:lang="en">Bionika Media</copyright-holder><copyright-holder xml:lang="ru">ООО «Бионика Медиа»</copyright-holder><license><ali:license_ref xmlns:ali="http://www.niso.org/schemas/ali/1.0/">https://journals.eco-vector.com/2226-6976/about/editorialPolicies#purchaseIssue</ali:license_ref></license></permissions><self-uri xlink:href="https://journals.eco-vector.com/2226-6976/article/view/716219">https://journals.eco-vector.com/2226-6976/article/view/716219</self-uri><abstract xml:lang="en"><p><bold>Objective. </bold>Evaluation of the composition of the sputum microbiome in patients with pneumococcal pneumonia depending on the prevalence of metabolic syndrome components.</p> <p><bold>Materials and methods.</bold> A total of 38 patients with pneumococcal pneumonia were examined, stratified into three groups according to the International Diabetes Federation (IDF) metabolic syndrome criteria: Group A (<italic>n</italic> = 17): abdominal obesity + type 2 diabetes mellitus + arterial hypertension + hypertriglyceridemia; Group B (<italic>n</italic> = 12): abdominal obesity + type 2 diabetes mellitus + low high-density lipoprotein levels; Group C (<italic>n</italic> = 9): abdominal obesity + arterial hypertension + hypertriglyceridemia. <italic>Streptococcus pneumoniae</italic> was identified by culture and MALDI-TOF MS; taxonomic analysis was performed by 16S rRNA sequencing.</p> <p><bold>Results. </bold>The highest bacterial load of S. pneumoniae and the slowest elimination during therapy were observed in Group A (7.2 × 10⁶ CFU/ml) and Group B (5.8 × 10⁶ CFU/ml). The microbiota of patients in Groups A and B was characterized by pronounced dysbiosis with a predominance of <italic>Streptococcus</italic> (49.1 ± 2.4%) and a combined increase in opportunistic pathogens (<italic>Haemophilus</italic>, <italic>Klebsiella</italic>), while in Group C, commensal taxa (<italic>Prevotella</italic>, <italic>Veillonella</italic>) predominated. The dysbiosis index was highest in Group A (3,8 ± 0.3) and lowest in Group C (0,6 ± 0,1) (p &lt; 0.001).</p> <p><bold>Conclusion. </bold>Severe respiratory dysbiosis was recorded in patients with metabolic syndrome, an essential component of which was type 2 diabetes mellitus.</p> <p> </p></abstract><trans-abstract xml:lang="ru"><p><bold>Цель исследования.</bold> Изучение состава микробиома мокроты у пациентов с пневмококковой пневмонией в зависимости от представленности компонентов метаболического синдрома.</p> <p><bold>Материалы и методы.</bold> Обследовано 38 пациентов с пневмококковой пневмонией, стратифицированных на 3 группы в соответствии с критериями метаболического синдрома Международной федерации диабета (International Diabetes Federation, IDF): группа A (<italic>n</italic> = 17): абдоминальное ожирение + сахарный диабет 2-го типа + артериальная гипертензия + гипертриглицеридемия; группа B (<italic>n</italic> = 12): абдоминальное ожирение + сахарный диабет 2-го типа + сниженный уровень липопротеинов высокой плотности; группа C (<italic>n</italic> = 9): абдоминальное ожирение + артериальная гипертензия + гипертриглицеридемия. Идентификацию <italic>Streptococcus pneumoniae</italic> осуществляли культуральным методом и MALDI-TOF MS; таксономический анализ – секвенированием 16S рРНК.</p> <p><bold>Результаты. </bold>Наибольшая бактериальная нагрузка <italic>S. pneumoniae</italic> и наиболее медленная ее элиминация на фоне терапии наблюдались в группе А (7,2 × 10⁶ КОЕ/мл) и группе B (5,8 × 10⁶ КОЕ/мл). Микробиота пациентов групп А и B характеризовалась выраженным дисбиозом с доминированием <italic>Streptococcus</italic> (49,1 ± 2,4%) и сочетанным повышением условно-патогенных родов (<italic>Haemophilus</italic>, <italic>Klebsiella</italic>), тогда как в группе C преобладали комменсальные таксоны (<italic>Prevotella</italic>, <italic>Veillonella</italic>). Индекс дисбиоза был максимальным в группе A (3,8 ± 0,3) и минимальным в группе C (0,6 ± 0,1) (p &lt; 0,001).</p> <p><bold>Заключение.</bold> Выраженный дисбиоз дыхательных путей регистрировали у пациентов с метаболическим синдромом, обязательным компонентом которого был сахарный диабет 2 типа.</p> <p> </p></trans-abstract><kwd-group xml:lang="en"><kwd>pneumococcal pneumonia</kwd><kwd>metabolic syndrome</kwd><kwd>respiratory microbiome</kwd></kwd-group><kwd-group xml:lang="ru"><kwd>пневмококковая пневмония</kwd><kwd>метаболический синдром</kwd><kwd>микробиом дыхательных путей</kwd></kwd-group><funding-group/></article-meta></front><body></body><back><ref-list><ref id="B1"><label>1.</label><mixed-citation>GBD 2019 LRI Collaborators. Age-sex differences in the global burden of lower respiratory infections and risk factors, 1990―2019: results from the Global Burden of Disease Study 2019. Lancet Infect. Dis. 2022; 22(11): 1626=1647. DOI: 10.1016/S1473-3099(22)00510-2</mixed-citation></ref><ref id="B2"><label>2.</label><mixed-citation>Torres A., Cilloniz C., Niederman M.S., Menéndez R., Chalmers J.D., Wunderink R.G. et al. Pneumonia. Nat. Rev. Dis. Primers. 2021; 7(1): 25. DOI: 10.1038/s41572-021-00259-0</mixed-citation></ref><ref id="B3"><label>3.</label><mixed-citation>Брико Н.И., Коршунов В.А., Ломоносов К.С. Пневмококковая инфекция в Российской Федерации: состояние проблемы. Вестник РАМН 2021; 76(1): 28–42. [Briko N.I., Korshunov V.A., Lomonosov K.S. Pneumococcal infection in the Russian Federation: state of the problem. Annals of the Russian Academy of Medical Sciences 2021; 76(1): 28–42. (In Russ.)]. DOI: 10.15690/vramn1404</mixed-citation></ref><ref id="B4"><label>4.</label><mixed-citation>Kahraman H., Yıldız P., Yılmaz, Ş., Durmaz G., Bilgin M., Çağlayan M. Impact of invasive and noninvasive pneumococcal diseases on adult populations: risk factors and vaccination status. BMC Infect. Dis. 2025; 25: 172. DOI: 10.1186/s12879-025-10579-1</mixed-citation></ref><ref id="B5"><label>5.</label><mixed-citation>Saklayen M.G. The Global Epidemic of the Metabolic Syndrome. Curr. Hypertens Rep. 2018; 20(2): 12. DOI: 10.1007/s11906-018-0812-z</mixed-citation></ref><ref id="B6"><label>6.</label><mixed-citation>Fahed G., Aoun L., Bou Zerdan M., Allam S., Bou Zerdan M., Bouferraa Y. et al. Metabolic Syndrome: Updates on Pathophysiology and Management in 2021. Int. J. Mol. Sci. 2022; 23(2): 786. DOI: 10.3390/ijms23020786</mixed-citation></ref><ref id="B7"><label>7.</label><mixed-citation>Баланова Ю.А., Имаева А.Э., Куценко В.А., Капустина А.В., Муромцева Г.А., Евстифеева С.Е. и др. Метаболический синдром и его ассоциации с социально-демографическими и поведенческими факторами риска в российской популяции 25–64 лет. Кардиоваскулярная терапия и профилактика 2020; 19(4) :2600. [Balanova Yu.A., Imaeva A.E., Kutsenko V.A., Kapustina A.V., Muromtseva G.A., Evstifeeva S.E. et al. Metabolic syndrome and its associations with socio-demographic and behavioral risk factors in the Russian population aged 25-64 years. Cardiovascular Therapy and Preventio 2020; 19(4): 2600. (In Russ.)]. DOI: 10.15829/1728-8800-2020-2600</mixed-citation></ref><ref id="B8"><label>8.</label><mixed-citation>Hotamisligil G.S. Inflammation, metaflammation and immunometabolic disorders. Nature 2017; 542(7640): 177–185. DOI: 10.1038/nature21363</mixed-citation></ref><ref id="B9"><label>9.</label><mixed-citation>Hamooya B.M., Siame L., Muchaili L., Masenga S.K., Kirabo A. Metabolic syndrome: epidemiology, mechanisms, and current therapeutic approaches. Front Nutr. 2025; 12: 1661603. DOI: 10.3389/fnut.2025.1661603</mixed-citation></ref><ref id="B10"><label>10.</label><mixed-citation>Юдаева А.Д., Стафеев Ю.С., Мичурина С.С., Меньшиков М.Ю., Шестакова М.В., Парфенова Е.В.. Взаимодействие воспаления и инсулиновой резистентности: молекулярные механизмы в инсулинопродуцирующих и инсулинозависимых тканях. Сахарный диабет 2023; 26(1): 75–81. [Yudaeva A.D., Stafeev I.S., Michurina S.S., Menshikov M Yu., Shestakova M.V., Parfyonova Y.V. The interactions between inflammation and insulin resistance: molecular mechanisms in insulin-producing and insulin-dependent tissues. Diabetes mellitus 2023; 26(1): 75–81. (In Russ.)]. DOI: 10.14341/DM12981</mixed-citation></ref><ref id="B11"><label>11.</label><mixed-citation>Honce R., Schultz-Cherry S. Impact of Obesity on Influenza A Virus Pathogenesis, Immune Response, and Evolution. Front. Immunol. 2019; (10): 1071. DOI: 10.3389/fimmu.2019.01071</mixed-citation></ref><ref id="B12"><label>12.</label><mixed-citation>Özçam M., Lynch S.V. The gut-airway microbiome axis in health and respiratory diseases. Nat. Rev. Microbiol. 2024; (8): 492–506. DOI: 10.1038/s41579-024-01048-8</mixed-citation></ref><ref id="B13"><label>13.</label><mixed-citation>Natalini J.G., Singh S., Segal L.N. The dynamic lung microbiome in health and disease. Nat. Rev. Microbiol. 2023; (4): 222–235. DOI: 10.1038/s41579-022-00821-x</mixed-citation></ref><ref id="B14"><label>14.</label><mixed-citation>Yu J., Li P., Yu Y.. Ma Y., Zuo S., Chen H. A comprehensive insight of complex interplay of microbiota in pulmonary diseases. Discov. Med. 2024; 1: 48. DOI: 10.1007/s44337-024-00063-1</mixed-citation></ref><ref id="B15"><label>15.</label><mixed-citation>Yu X., Yu X., Wang Y., Guo X., Wang C. Wang F. Respiratory diseases and the gut microbiota: an updated review. Front. Cell. Infect. Microbiol. 2025; 15: 1629005. DOI: 10.3389/fcimb.2025.1629005</mixed-citation></ref><ref id="B16"><label>16.</label><mixed-citation>Беляев В.С., Червинец В.М., Червинец Ю.В. Ось кишечник–легкие. Пульмонология 2023; 33(5): 663–669. [Belyaev V.S., Chervinets V.M., Chervinets Yu.V. Gut–lung axis. Pulmonologiya 2023; 33(5): 663–669. (In Russ.)]. DOI: 10.18093/0869-0189-2022-3053</mixed-citation></ref><ref id="B17"><label>17.</label><mixed-citation>Червинец В.М., Червинец Ю.В., Ганзя Д.В., Беляев В.С., Зайцева В.С. Влияние кишечной микробиоты на развитие сахарного диабета. Экспериментальная и клиническая гастроэнтерология 2023; 220(12): 77–85. [Chervinets V. M., Chervinets Yu. V., Ganzya D.V., Zaitseva V.S., Belyaev V.S The effect of the intestinal microbiota on the development of diabetes mellitus. Experimental and Clinical Gastroenterology 2023; 220(12): 77–85. (In Russ.)].. DOI: 10.31146/1682-8658-ecg-220-12-77-85</mixed-citation></ref><ref id="B18"><label>18.</label><mixed-citation>Wang P. Impact of Hyperglycemia on Streptococcus pneumoniae Virulence: Insights into Capsular Dynamics and Clinical Implications. J. Physiol. Investig. 2025; 68(4): 185–201. DOI: 10.4103/ejpi.EJPI-D-24-00112</mixed-citation></ref><ref id="B19"><label>19.</label><mixed-citation>Abdelqader E.M., Mahmoud W.S., Gebreel H.M., Kamel M.M., Abu-Elghait M. Correlation between gut microbiota dysbiosis, metabolic syndrome and breast cancer. Sci. Rep. 2025; 15(1): 6652. DOI: 10.1038/s41598-025-89801-8</mixed-citation></ref><ref id="B20"><label>20.</label><mixed-citation>Lee S.H., Kim J.H., Park H.J. Haemophilus influenzae augments Streptococcus pneumoniae-induced pathogenesis in the rat lung. Microb. Pathog. 2023; 179: 106089. DOI: 10.1016/j.micpath.2023.106089</mixed-citation></ref><ref id="B21"><label>21.</label><mixed-citation>Smith J.M., Jones A.R., Brown K.L. Haemophilus influenzae potentiates Streptococcus pneumoniae-induced inflammation and bacterial load in a murine co-infection model. Infect. Immun. 2022; 90(5): e00415–22. DOI: 10.1128/iai.00415-22</mixed-citation></ref><ref id="B22"><label>22.</label><mixed-citation>Ильина Т.С., Романова Ю.М. Бактериальные биопленки: роль в хронических инфекционных процессах и поиск средств борьбы с ними. Молекулярная генетика, микробиология и вирусология 2021; 39(2): 14–24. [Ilyina T.S., Romanova Yu.M. Bacterial biofilms: their role in chronical infection processes and the means to combat them. Molecular Genetics, Microbiology and Virology 2021; 39(2): 14–24. (In Russ.)]. DOI: 10.17116/molgen20213902114</mixed-citation></ref><ref id="B23"><label>23.</label><mixed-citation>Скрябина А.А., Голенок Е.С., Собх М.М. Инфекционные заболевания у пациентов с сахарным диабетом: обзор литературы. Медицина 2024; 12(1): 37–52. [Skryabina A.A., Golenok E.S., Sobkh M.M. Infektsionnye zabolevaniya u patsientov s sakharnym diabetom: obzor literatury. Meditsina 2024; 12(1): 37–52. (In Russ.)]. DOI: 10.29234/2308-9113-2024-12-1-37-52</mixed-citation></ref><ref id="B24"><label>24.</label><mixed-citation>Hotamisligil G.S. Inflammation, metaflammation and immunometabolic disorders. Nature 2017; 542(7640): 177–185. DOI: 10.1038/nature21363</mixed-citation></ref></ref-list></back></article>
