Лекарственная устойчивость ВИЧ-1 среди пациентов без опыта антиретровирусной терапии в Северо-Кавказском Федеральном округе

Обложка

Цитировать

Полный текст

Открытый доступ Открытый доступ
Доступ закрыт Доступ предоставлен
Доступ закрыт Доступ платный или только для подписчиков

Аннотация

Цель исследования. Изучение структуры и уровня распространенности лекарственной устойчивости (ЛУ) ВИЧ-1 среди пациентов без опыта антиретровирусной терапии (АРТ), проживающих на территории Северо-Кавказского федерального округа (СКФО).

Материалы и методы. Проанализированы нуклеотидные последовательности ВИЧ-1 и сопутствующая клинико-эпидемиологическая информация от 122 ВИЧ-инфицированных пациентов без опыта АРТ, проживающих на территории СКФО, полученные в период с 2010 по 2024 г. Определены мутации резистентности и прогностическая ЛУ ВИЧ-1 с использованием базы данных Стэнфордского университета HIVdb (v. 9.6). Выявлены молекулярные кластеры ВИЧ-1 с порогом генетической дистанции менее 2,0% с помощью инструмента MicrobeTrace.

Результаты. ЛУ ВИЧ-1 была обнаружена у 27,9% пациентов, наиболее часто к препаратам класса ненуклеозидных ингибиторов обратной транскриптазы (ННИОТ) – невирапину (NVP) (23,0%) и эфавирензу (EFV) (21,3%). Распространенность мутаций, значимых для надзора, составила 22,1%. В результате анализа молекулярных кластеров было установлено, что высокая распространенность ЛУ ВИЧ-1 в исследуемой выборке обусловлена передачей вариантов ВИЧ-1, содержащих мутации K103N/S, что указывает на проблему передаваемой ЛУ ВИЧ-1 в округе. При этом в результате оценки ЛУ ВИЧ-1 у эпидемиологически несвязанных лиц было показано, что распространенность первичной ЛУ ВИЧ-1 и мутаций, значимых для надзора, составила 16,5 и 9,4% соответственно.

Заключение. Продемонстрирован высокий риск распространения первичной резистентности ВИЧ-1 к ННИОТ 1-го поколения в СКФО, что требует принятия мер по предупреждению возникновения и дальнейшего распространения ЛУ-вариантов ВИЧ-1.

Полный текст

Доступ закрыт

Об авторах

Алина Алексеевна Кириченко

Центральный НИИ эпидемиологии

Автор, ответственный за переписку.
Email: kirichenko@cmd.su
ORCID iD: 0000-0002-7116-0138

кандидат медицинских наук, старший научный сотрудник

Россия, Москва

Дмитрий Евгеньевич Киреев

Центральный НИИ эпидемиологии

Email: dmitry.kireev@pcr.ms
ORCID iD: 0000-0002-7896-2379

кандидат биологических наук, заведующий лабораторией

Россия, Москва

Илья Андреевич Лаповок

Центральный НИИ эпидемиологии

Email: lapovok@cmd.su
ORCID iD: 0000-0002-6328-1415

кандидат биологических наук , старший научный сотрудник

Россия, Москва

Дмитрий Сергеевич Колпаков

Ростовский НИИ микробиологии и паразитологии

Email: dimakolpakov@mail.ru
ORCID iD: 0009-0007-7604-4631

заведующий лабораторией

Россия, Ростов-на-Дону

Александр Георгиевич Суладзе

Ростовский НИИ микробиологии и паразитологии

Email: sualrostov@mail.ru
ORCID iD: 0000-0002-9051-1220

кандидат медицинских наук, ВРИО директора

Россия, Ростов-на-Дону

Луиза Курейшевна Бекмурзиева

Республиканский центр по профилактике и борьбе со СПИДом и другими инфекционными заболеваниями

Email: luizabays@mail.ru
ORCID iD: 0009-0000-0163-7933

главный врач

Россия, Назрань, Республика Ингушетия

Ибрагим Исаевич Гандалоев

Республиканский центр по профилактике и борьбе со СПИДом и другими инфекционными заболеваниями

Email: gandaloev93@bk.ru
ORCID iD: 0009-0007-8566-5763

заведующий лабораторией

Россия, Назрань, Республика Ингушетия

Ихсан Зелбухарович Сулейманов

Республиканский клинический центр инфекционных болезней, профилактики и борьбы со СПИД

Email: ihsansuleymanov@gmail.com
ORCID iD: 0009-0007-3595-3329

заместитель главного врача

Россия, Грозный, Чеченская Республика

Хамзат Хусейнович Муртазалиев

Республиканский клинический центр инфекционных болезней, профилактики и борьбы со СПИД

Email: hiv-chr@mail.ru
ORCID iD: 0009-0003-4524-5730

главный внештатный специалист, главный врач

Россия, Грозный, Чеченская Республика

Марха Казбековна Дальцаева

Республиканский клинический центр инфекционных болезней, профилактики и борьбы со СПИД

Email: marha-epid@yandex.ru
ORCID iD: 0009-0000-9746-4861

заместитель главного врача

Россия, Грозный, Чеченская Республика

Людмила Викторовна Ртищева

Карачаево-Черкесская республиканская инфекционная клиническая больница и Центр по профилактике и борьбе со СПИДом

Email: infekcia73@mail.ru
ORCID iD: 0009-0001-7399-3977

главный врач

Россия, Черкесск, Карачаево-Черкесская Республика

Оксана Александровна Шунгарова

Карачаево-Черкесская республиканская инфекционная клиническая больница и Центр по профилактике и борьбе со СПИДом

Email: aminova@mail.ru
ORCID iD: 0009-0007-6094-6091

Инфекционист

Россия, Черкесск, Карачаево-Черкесская Республика

Вячеслав Геннадьевич Бобков

НИИ вакцин и сывороток им. И.И. Мечникова

Email: vbobkov@gmail.com
ORCID iD: 0000-0003-0869-6594

инженер IT

Россия, Москва

Марина Ридовна Бобкова

НИИ вакцин и сывороток им. И.И. Мечникова

Email: mrbobkova@mail.ru
ORCID iD: 0000-0001-5481-8957

главный специалист

Россия, Москва

Василий Геннадьевич Акимкин

Центральный НИИ эпидемиологии

Email: crie@pcr.ru
ORCID iD: 0000-0003-4228-9044

академик РАН, доктор медицинских наук, профессор, директор

Россия, Москва

Список литературы

  1. Bertagnolio S., Hermans L., Jordan M.R., Avila-Rios S., Iwuji C., Derache A. et al. Clinical Impact of Pretreatment Human Immunodeficiency Virus Drug Resistance in People Initiating Nonnucleoside Reverse Transcriptase Inhibitor–Containing Antiretroviral Therapy: A Systematic Review and Meta-analysis. J. Infect. Dis. 2021; 224(3): 377–388. doi: 10.1093/infdis/jiaa683
  2. Cambiano V., Bertagnolio S., Jordan M.R., Lundgren J.D., Phillips A. Transmission of drug resistant HIV and its potential impact on mortality and treatment outcomes in resource-limited settings. J. Infect. Dis. 2013; 207(Suppl 2): 557–562. doi: 10.1093/infdis/jit111
  3. Kireev D., Kirichenko A., Lebedev A., Bobkova M. Alarming Rise of Primary HIV Drug Resistance in Major Regions of Russia. Curr. HIV Res. 2023; 21(6): 347–353. doi: 10.2174/011570162X271430231201075335
  4. Kirichenko A., Kireev D., Lapovok I., Shlykova A., Lopatukhin A., Pokrovskaya A. et al. HIV-1 Drug Resistance among Treatment-Naïve Patients in Russia: Analysis of the National Database, 2006-2022. Viruses 2023; 15(4): 991. doi: 10.3390/v15040991
  5. Wertheim J.O., Kosakovsky Pond S.L., Forgione L.A., Mehta S.R., Murrell B., Shah S. et al. Social and Genetic Networks of HIV-1 Transmission in New York City. PLoS Pathog. 2017; 13(1): e1006000. doi: 10.1371/journal.ppat.1006000
  6. Melikian G.L., Rhee S.Y., Varghese V., Porter D., White K., Taylor J. et al. Non-nucleoside reverse transcriptase inhibitor (NNRTI) cross-resistance: implications for preclinical evaluation of novel NNRTIs and clinical genotypic resistance testing. J. Antimicrob. Chemother. 2014; 69(1): 12–20. doi: 10.1093/jac/dkt316
  7. Xu H.-T., Colby-Germinario S.P., Asahchop E.L., Oliveira M., McCallum M., Schader S.M. et al. Effect of Mutations at Position E138 in HIV-1 Reverse Transcriptase and Their Interactions with the M184I Mutation on Defining Patterns of Resistance to Nonnucleoside Reverse Transcriptase Inhibitors Rilpivirine and Etravirine. Antimicrob. Agents Chemother. 2013; 57(7): 3100–3109. doi: 10.1128/AAC.00344-13/
  8. Porter D.P., Toma J., Tan Y., Solberg O., Cai S., Kulkarni R. et al. Clinical Outcomes of Virologically-Suppressed Patients with Pre-existing HIV-1 Drug Resistance Mutations Switching to Rilpivirine/Emtricitabine/Tenofovir Disoproxil Fumarate in the SPIRIT Study. HIV Clin. Trials. 2016; 17(1): 29–37. doi: 10.1080/15284336.2015.1115585
  9. Kuznetsova A., Lebedev A., Gromov K., Kazennova E., Zazzi M., Incardona F. et al. Pre‐existing singleton E138A mutations in the reverse transcriptase gene do not affect the efficacy of first‐line antiretroviral therapy regimens using rilpivirine in human immunodeficiency virus‐infected patients. Clin. Case Rep. 2022; 10(2): e05373. doi: 10.1002/ccr3.5373
  10. Reuman E.C., Rhee S.Y., Holmes S.P., Shafer R.W. Constrained patterns of covariation and clustering of HIV-1 non-nucleoside reverse transcriptase inhibitor resistance mutations. J. Antimicrob. Chemother. 2010; 65(7): 1477–1485. doi: 10.1093/jac/dkq140
  11. Hance A.J, Lemiale V., Izopet J., Lecossier D., Joly V., Massip P. et al. Changes in human immunodeficiency virus type 1 populations after treatment interruption in patients failing antiretroviral therapy. J. Virol. 2001; 75: 6410–6417. doi: 10.1128/jvi.75.14.6410-6417.2001
  12. Rhee S.Y., Tzou P.L., Shafer R.W. Temporal Trends in HIV-1 Mutations Used for the Surveillance of Transmitted Drug Resistance. Viruses 2021; 13(5): 879. doi: 10.3390/v13050879
  13. Kühnert D., Kouyos R., Shirreff G., Pečerska J., Scherrer A.U., Böni J. et al. Quantifying the fitness cost of HIV-1 drug resistance mutations through phylodynamics. PLoS Pathog. 2018; 14(2): e1006895. doi: 10.1371/journal.ppat.1006895
  14. Wertheim J.O., Oster A.M., Johnson J.A., Switzer W.M., Saduvala N., Hernandez A.L. et al. Transmission fitness of drug-resistant HIV revealed in a surveillance system transmission network. Virus Evol. 2017; 3(1): vex008. doi: 10.1093/ve/vex008

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML
Скачать
2. Рис. 1. Распространенность ЛУ (а) и мутаций ВИЧ-1 (б) * Мутации, значимые для надзора (SDRMs)

Скачать (198KB)
Метаданные
3. Рис. 2. Молекулярные кластеры ВИЧ Серым квадратом обозначены НП ВИЧ-1, не содержащие мутации резистентности, белым квадратом - НП ВИЧ-1 с мутациями резистентности (внутри квадрата)

Скачать (155KB)
Метаданные

© ООО «Бионика Медиа», 2025