Email this article Fecal microbiota transplantation in the treatment of astrovirus infection in a recipient of an allogeneic hematopoietic stem cell transplant: a clinical case
- Authors: Bespyatykh J.A.1,2,3, Gospodarik A.V.1, Zhuravel E.A.4, Seregin G.Z.4, Komarova A.V.1,3, Esiev S.S.1, Bronin G.O.4, Shansky Y.D.1
-
Affiliations:
- Lopukhin Federal Research and Clinical Center of Physical-Chemical Medicine
- N.A. Semashko National Research Institute of Public Health
- Mendeleev University of Chemical Technology of Russia
- Morozov Children's Municipal Clinical Hospital
- Issue: Vol 14, No 1 (2023)
- Pages: 115-122
- Section: Case reports
- URL: https://journals.eco-vector.com/clinpractice/article/view/275406
- DOI: https://doi.org/10.17816/clinpract275406
- ID: 275406
Cite item
Full Text
Abstract
Background: Secondary immunodeficiency in recipients after allogeneic hematopoietic stem cell transplantation (allo-HSCT) in the pediatric practice is often accompanied by bacterial and viral infections of the gastrointestinal tract (GIT), resistant to conventional therapy. Fecal microbiota transplantation (FMT) promotes intestinal recolonization and eradication of gastrointestinal symptoms.
Clinical case description: A 2.5-year-old patient underwent allo-HSCT from a haploidentical related donor (father) as a part of the treatment of acute myeloid leukemia. A month after the last procedure, diarrhea (up to 10 times a day) and abdominal pain appeared. The astrovirus RNA and Clostridium difficile toxin A were detected in the feces. The FMT was prescribed. After two FMT procedures, the intestinal syndrome leveled out, and the tests for the astrovirus RNA and clostridial toxins were negative. The content of cholic and, in particular, deoxycholic acids, as well as their conjugates with glycine and taurine, in the feces increased; the acetic acid content increased with a simultaneous decrease in the level of propionic acid, which indicates the restoration of the intestinal microbiota’s functional potential.
Conclusion: FMT contributes to the restoration of the normal intestinal microflora, the elimination of clostridial toxins, enteroinvasive E. coli and astrovirus infection in allo-HSCT recipients, as evidenced by the indicators of the intestinal microbiota activity, and can be used in allo-HSCT recipients with infections refractory to conventional therapy.
Full Text
ОБОСНОВАНИЕ
Инфекционные поражения желудочно-кишечного тракта часто встречаются в педиатрической практике: например, острый гастроэнтерит является причиной диареи у детей в возрасте до 5 лет в 1,7 млрд случаев [1]. Около 30% случаев приходится на бактериальные инфекции: хорошо изученным примером является широко распространенная внутрибольничная клостридиальная инфекция, связанная с применением антибиотиков и вызываемая действием токсинов А и В Clostridioides (ранее Clostridium) difficile [2]. В 70% случаев гастроэнтерит имеет вирусную этиологию и вызывается представителями Norovirus, Rotavirus, Adenovirus, Sapovirus и Astrovirus [3], в том числе при иммуносупрессивных состояниях, например у реципиентов аллогенной трансплантации гемопоэтических стволовых клеток (алло-ТГСК). Вирусная этиология диареи у пациентов после алло-ТГСК составляет 20% от всех эпизодов ТГСК-ассоциированной диареи [4], однако только 4,2% случаев острого гастроэнтерита у детей ассоциировано с инфицированием Astrovirus [5], что затрудняет поиск оптимальной схемы терапии вирусных заболеваний желудочно-кишечного тракта.
Трансплантация фекальной микробиоты (ТФМ) является одним из эффективных методов реколонизации кишечника, уменьшает антибиотикорезистентность патогенной микробиоты, что делает ее подходящим методом профилактики и лечения жизнеугрожающих осложнений у иммунокомпрометированных пациентов [4, 6]. Ранее была показана эффективность ТФМ при кишечных инфекциях, вызываемых C. difficile [7], в то время как при вирусных заболеваниях она изучена недостаточно.
КЛИНИЧЕСКИЙ ПРИМЕР
О пациенте
Пациентке Э., 2,5 года, на основании морфоцитохимического, иммунологического, молекулярно-генетического методов исследования клеток костного мозга установлен диагноз: «Острый миелоидный лейкоз, М1 морфологический вариант, t(8;21) (RUNX1-RUNX1T1)».
Лабораторная и инструментальная диагностика
В кале пациентки на всех этапах, как до проведения ТФМ, так и после трансплантации, методом полимеразной цепной реакции (ПЦР) оценивали наличие патогенной кишечной флоры (Shigella spp., Salmonella spp., Campylobacter spp.); вирусов (Adenovirus F, Norovirus 2-й генотип, Rotavirus A, Astrovirus); токсинов A и B C. difficile. Проводили также бактериологический анализ кала (табл. 1) с определением чувствительности к антибиотикам. Кроме того, в кале пациентки оценивали качественный и количественный состав короткоцепочечных жирных кислот (КЦЖК) и желчных кислот как индикаторов состояния микробиоты кишечника. Анализ желчных кислот проводили методом высокоэффективной жидкостной хроматографии с тандемным масс-спектрометрическим детектированием, КЦЖК — методом газожидкостной хроматографии с пламенно-ионизационным детектированием [8].
Таблица 1. Результаты анализа кала на наличие инфекционных агентов (бактериальных и вирусных) / Table 1. Results of the fecal analysis for the presence of infectious agents (bacterial and viral)
Показатель | До трансплантации фекальной микробиоты | После трансплантации фекальной микробиоты |
Clostridioide difficile токсин А | Обнаружено | Не обнаружено |
Clostridioide difficile токсин В | Не обнаружено | Не обнаружено |
Вирусные инфекции | ||
Rotavirus | Не обнаружено | Не обнаружено |
Norovirus | Не обнаружено | Не обнаружено |
Adenovirus | Не обнаружено | Не обнаружено |
Astrovirus | Обнаружено | Не обнаружено |
Бактериальные инфекции | ||
Shigella spp. | Не обнаружено | Не обнаружено |
Salmonella spp. | Не обнаружено | Не обнаружено |
Campylobacter spp. | Не обнаружено | Не обнаружено |
Энтероинвазивные Escherichia coli | Обнаружено | Не обнаружено |
Escherichia coli | Обнаружено (IV степень обсемененности) | Обнаружено (IV степень обсемененности) |
Klebsiella pneumoniae | Обнаружено (II степень обсемененности) | Обнаружено (IV степень обсемененности) |
Candida albicans | Обнаружено (III степень обсемененности) | Не обнаружено |
Staphylococcus epidermidis | Обнаружено (III степень обсемененности) | Обнаружено (IV степень обсемененности) |
Streptococcus mitis | Не обнаружено | Обнаружено (IV степень обсемененности) |
Streptococcus oralis | Не обнаружено | Обнаружено (IV степень обсемененности) |
В работе оценивали следующие показатели: концентрации свободных и конъюгированных желчных кислот, общую и индивидуальную концентрацию КЦЖК в кале. Концентрации 13 желчных кислот — таурохолевой (taurocholic acid, TCA), гликоурсодезоксихолевой (glycoursodeoxycholic acid, GUDCA), таурохенодезоксихолевой (taurochenodeoxycholic acid, TCDCA), гликохолевой (glycocholic acid, GCA), тауроурсодезоксихолевой (tauroursodeoxycholic acid, TUDCА), гликохенодезоксихолевой (glycochenodeoxycholic acid, GCDCA), холевой (cholic acid, СА), хенодезоксихолевой (chenodeoxycholic acid, CDCA), тауродезоксихолевой (taurodesoxycholic acid, TDCA), дезоксихолевой (desoxycholic acid, DCA), урсодезоксихолевой (ursodeoxycholic acid, UDCA), тауролитохолевой (taurolitocholic acid, TLCA) и литохолевой (litocholic acid, LCA) — приведены в табл. 2.
Таблица 2. Концентрация желчных кислот в кале реципиента / Table 2. Concentration of bile acids in the recipient’s feces
Желчная кислота | Содержание, мкг/г | |
До трансплантации фекальной микробиоты | После трансплантации фекальной микробиоты | |
Таурохолевая | - | 0,11 |
Гликоурсодезоксихолевая | 0 | 0,27 |
Таурохенодезоксихолевая | - | - |
Гликохолевая | - | - |
Тауроурсодезоксихолевая | - | 0,15 |
Гликохенодезоксихолевая | 0 | - |
Холевая | - | 0,27 |
Хенодезоксихолевая | - | - |
Тауродезоксихолевая | - | - |
Дезоксихолевая | 0 | 1,56 |
Урсодезоксихолевая | - | - |
Литохолевая | - | - |
Тауролитохолевая | - | - |
Концентрации КЦЖК — уксусной (С2), пропионовой (С3), масляной (С4), изомасляной (изоС4), валериановой (С5), изовалериановой (изоС5), капроновой (С6), а также их общее содержание, анаэробный индекс (АИ) и соотношение изомеров и гомологов КЦЖК (изоCn/Cn) приведены в табл. 3.
Таблица 3. Концентрация короткоцепочечных жирных кислот и связанных с ними параметров в кале реципиента / Table 3. Concentrations of short-chain fatty acids in the recipient’s feces and related parameters
Анализируемый параметр | Содержание, мкг/г | |
До трансплантации фекальной микробиоты | После трансплантации фекальной микробиоты | |
Уксусная кислота | 1,599 | 4,508 |
Пропионовая кислота | 0,421 | 0,258 |
Изомасляная кислота | 0,032 | 0,036 |
Масляная кислота | 0,158 | 0,183 |
Изовалериановая кислота | 0,056 | 0,041 |
Валериановая кислота | 0,063 | 0,031 |
Капроновая кислота | 0,044 | 0,054 |
Общее содержание | 2,373 | 5,110 |
Отношение суммарного содержания кислот с разветвленной цепью к кислотам с неразветвленной цепью, изоCn/Cn | 0,039 | 0,015 |
Анаэробный индекс | 0,362 | 0,098 |
Лечение и динамика состояния
После получения информированного согласия родителей проводилась полихимиотерапия по протоколу ALL-BFM-2004. После 1-го курса полихимиотерапии достигнута клинико-гематологическая ремиссия, однако при исследовании минимальной остаточной болезни (МОБ) в костном мозге сохранялся химерный транскрипт RUNX1-RUNX1T1, определявшийся методом ПЦР в реальном времени после 3 курсов полихимиотерапии, что свидетельствовало о рефрактерном течении заболевания. Было принято решение о проведении алло-ТГСК. Выбран родственный гаплоидентичный донор (отец ребенка). По результатам проведенного комплексного предтрансплантационного обследования донора и реципиента абсолютных противопоказаний к алло-ТГСК не выявлено.
Проведено кондиционирование (из расчета на курс): треосульфан по 42 г/м2, флударабин по 150 мг/м2, этопозид по 60 мг/кг, ритуксимаб по 375 мг/м2. В качестве источника трансплантата использовали неманипулированные периферические стволовые клетки. Объем материала составил 70 мл, цитоз 232×109/л, CD34+ 6×106/кг, CD3+ 26,5%. Трансплантацию ребенок перенес удовлетворительно. Профилактика реакции трансплантат против хозяина: такролимус и микофенолата мофетил со дня +1, циклофосфан в дозе 100 мг/кг на курс на +3...+4-е сутки от алло-ТГСК.
Течение раннего посттрансплантационного периода протекало со следующими осложнениями: фебрильная нейтропения III степени, дерматологическая токсичность II степени, желудочно-кишечная токсичность II степени, гематологическая токсичность IV степени. Токсичность оценивали в соответствии со шкалой CTCAE 5.0 (Common terminology criteria for adverse events). Методом ПЦР в период фебрильной нейтропении однократно выявлялся ротавирус из стула. Все осложнения купировались комплексной сопроводительной терапией.
Приживление трансплантата достигнуто на +16-е сутки. На +19-е сутки пациентка выписана из стационара без признаков диареи и инфекционного процесса. При обследовании на +30-е сутки сохранялась клинико-гематологическая ремиссия, полный донорский химеризм, достигнут МОБ-негативный статус (отсутствие экспрессии RUNX1-RUNX1T1 в костном мозге).
С +30-х суток у ребенка появились боли в животе, жидкий стул. При исследовании кала выявлен астровирус. В ходе лабораторного исследования образцов стула выявлен положительный клостридиальный токсин А. Проводились инфузионная терапия с коррекцией электролитных нарушений; заместительные трансфузии 20% раствора альбумина; комбинированная противомикробная терапия, включавшая комбинацию антибиотиков широкого спектра действия (меропенем, метронидазол, ванкомицин, колистиметат натрия, рифаксимин), антимикотиков (каспофунгин, амфотерицин В) и противовирусных препаратов (ацикловир); трансфузии 10% внутривенного иммуноглобулина. На этом фоне общее состояние ребенка улучшилось, однако сохранялся жидкий стул до 10 раз/сут общим объемом до 1,5 л/сут. Принято решение о проведении ТФМ.
Для ТФМ использовали жидкий фекальный материал в виде суспензии от здорового донора (женщина, 38 лет), полученный по использованной ранее методике [9]. Донор предварительно прошел лабораторное обследование: базовые гематологические и биохимические исследования крови; анализы на гепатиты В и С, вирус иммунодефицита человека, сифилис; общий анализ мочи; копрограмму; анализ кала на скрытую кровь, простейшие и яйца гельминтов; бактериальный посев кала; анализ кала методом ПЦР на патогенную кишечную флору, наличие токсинов C. difficile A и B, наличие генетических маркеров лекарственной устойчивости. Материал был взят при нормальных значениях исследованных показателей.
Процедуру ТФМ пациентка перенесла удовлетворительно. Введение микробного сообщества проводили с помощью назогастрального зонда. На 3-и сутки после процедуры отмечалось уменьшение частоты и объема дефекаций, однако консистенция стула оставалась разжиженной. При контрольном исследовании через неделю после ТФМ анализ на астровирус в кале положительный. Проведена вторая процедура ТФМ, после чего кишечный синдром нивелировался.
Исходы и прогноз
При повторных исследованиях образцов кала пациентки астровирус и клостридиальные токсины не обнаруживались. Ребенок выписан из стационара. В дальнейшем пациентка наблюдалась амбулаторно в течение 8 месяцев. Эпизодов диареи не отмечалось.
В настоящее время в ремиссии, трансплантат функционирует, сохраняется донорский химеризм. Планируется длительное, в течение как минимум 1 года, активное наблюдение в трансплантационной клинике с последующим проведением вакцинации при достижении полной иммунной реконституции.
ОБСУЖДЕНИЕ
Микробные и вирусные антигены кишечной микробиоты являются ключевым фактором нормального созревания и функционирования иммунной системы, особенно в детском возрасте [10]. Положительный исход алло-ТГСК зависит от успешного лечения ТГСК-ассоциированной диареи, которая может быть фатальной и, в свою очередь, обусловлена взаимодействием между нарушенной в этот период иммунной системой макроорганизма и кишечной экосистемой, подвергающейся сильной деформации в связи с использованием многокомпонентной противомикробной терапии [10]. В нашем случае ТФМ показала положительный эффект при лечении инфекционного поражения кишечника после алло-ТГСК, вызванного астровирусной инфекцией. Отмечались улучшение общего состояния пациентки, устранение кишечного синдрома, нормализация кишечной микрофлоры по показателям желчных кислот и КЦЖК. По результатам ПЦР-исследования, после первой ТФМ токсин А C. difficile в кале пациентки не обнаружен, что подтверждает эффективность ТФМ при клостридиальной инфекции [11], в том числе у детей [12]. Энтероинвазивные Escherichia coli после ТФМ не выявляются. После ТФМ также наблюдается значительное снижение бактериальной обсемененности Klebsiella pneumoniae.
Важность исследования ТФМ при астровирусной инфекции обусловлена тем, что данный возбудитель является причиной некротизирующего энтероколита и сопровождается высокой летальностью у новорожденных [5]. Астровирусная инфекция является одной из множества причин развития кишечного синдрома у пациентов с иммунодефицитными состояниями, в том числе после алло-ТГСК [5, 13]. В нашем случае выявленная на фоне алло-ТГСК РНК астровируса не обнаруживалась после проведения повторной ТФМ. Ранее эффективность ТФМ при вирусных заболеваниях в виде восстановления микробиоты кишечника была показана для пациентов с ВИЧ [14]. В доклинических исследованиях ТФМ способствовала более быстрому благоприятному исходу при парвовирусной диарее [15]. Учитывая редкую частоту случаев астровирусной инфекции, ассоциированной с алло-ТГСК [13, 16], можно считать представленный клинический случай первым успешным применением ТФМ при данном осложнении после алло-ТГСК.
Дисфункция микробиоты кишечника приводит к снижению трансформации первичных конъюгированных желчных кислот во вторичные, что, вероятно, может объяснять чрезвычайно малое (ниже предела обнаружения методики) содержание индивидуальных желчных кислот у реципиента (см. табл. 2) [17]. После терапии отмечался рост показателей первичной (CA) и особенно вторичной (DCA) желчных кислот, а также повышение концентраций таурин- (TCA, TUDCA) и глицинконъюгированных (GUDCA) желчных кислот (см. табл. 2). DCA является мощным антимикробным агентом, способным уменьшать воспалительные процессы при нарушениях функционала микробиоты [18]. Повышенный уровень DCA у реципиента после ТФМ указывает на улучшение функционирования микробиоты кишечника [17]. Наличие конъюгированных желчных кислот в кале может говорить о сниженной активности/небольшом количестве бактерий Firmicutes и Bacteroidetes, регулирующих деконъюгацию желчных кислот [19].
Результат анализа реципиента на КЦЖК показал значительное увеличение уровня уксусной кислоты, небольшое снижение количества пропионовой кислоты, а также еще менее значительный рост уровней масляной, изомасляной, капроновой кислот и уменьшение количества валериановой и изовалериановой кислот (см. табл. 3). Данные изменения, вероятно, могут означать улучшение функционирования желудочно-кишечного тракта. Бутират играет важную роль в регуляции иммунного ответа и противовоспалительной активности КЦЖК [20, 21]. Однако незначительное изменение уровня бутирата после ТФМ и недостаток экспериментальных точек пока не дает нам возможности сделать вывод о его вкладе в изменение функционирования микробиоты реципиента.
ЗАКЛЮЧЕНИЕ
В данной работе впервые представлена клиническая оценка эффективности ТФМ при терапии астровирусной инфекции желудочно-кишечного тракта после алло-ТГСК, в том числе по показателям КЦЖК и желчных кислот. Показано снижение бактериальной нагрузки K. pneumoniae, а также полная элиминация Candida albicans и энтероинвазивных E. coli. В то же время выявление Streptococcus mitis и Streptococcus oralis после ТФМ может свидетельствовать в пользу постепенной реколонизации желудочно-кишечного тракта нормальной микрофлорой.
На основании имеющихся в литературе данных, а также собственных исследований можно сделать предположение о положительном влиянии ТФМ на ход лечения реципиента алло-ТГСК, в том числе осложненного астровирусной инфекцией желудочно-кишечного тракта. Улучшение профиля уровней КЦЖК и желчных кислот дает основание судить об эффективности ТФМ, что выражается улучшением состояния и функционирования микробиоты кишечника. Однако для подтверждения результатов и достоверности суждений об эффективности терапии необходимо рассмотреть большее количество экспериментальных точек после ТФМ.
ИНФОРМИРОВАННОЕ СОГЛАСИЕ
Исследование одобрено ЛЭК ГБУЗ Морозовская ДГКБ ДЗМ, протокол № 176 от 24.05.2022.
Исследование одобрено ЛЭК ФГБУ ФНКЦ ФХМ им. Ю.М. Лопухина ФМБА России, протокол № 2022/05/31 от 31.05 2022.
Родителями пациентки подписано добровольное информированное согласие на проведение исследования и публикацию его результатов (17.06.2022).
INFORMED CONSENT
Written voluntary informed consent was received from the patient for the publication medical data for scientific purposes in the journal Clinical Practice. Ethic committee vote was granted by Morozov Children’s Hospital № 176 on 24.05.2022 and Lopukhin Federal Research and Clinical Center of Physical-Chemical Medicine № 2022/05/31 on 31.05 2022. The legal representative has signed written voluntary informed consent on publication the clinical case description, medical data (results of diagnosis, treatment and observation in medical journal, electronic version included (signed on 17.06.2022).
ДОПОЛНИТЕЛЬНАЯ ИНФОРМАЦИЯ / ADDITIONAL INFORMATION
Вклад авторов. Ю.А. Беспятых — концепция исследования, анализ клинических данных, финальное редактирование текста рукописи; А.В. Господарик — сбор и подготовка материала; Е.А. Журавель — лечащий врач пациента; Г.З. Серёгин — курирование процедуры трансплантации фекальной микробиоты; А.В. Комарова, С.С. Есиев — проведение исследований; Г.О. Бронин — координация ТФМ-терапии пациента, написание текста рукописи; Я.Д. Шанский — проведение исследований, написание текста рукописи, статистический анализ результатов. Авторы подтверждают соответствие своего авторства международным критериям ICMJE (все авторы внесли существенный вклад в разработку концепции, проведение исследования и подготовку статьи, прочли и одобрили финальную версию перед публикацией).
Author contribution. J.A. Bespyatykh — study concept, clinical data analysis, final manuscript editing; A.V. Gospodarik — collection and pre-treatment of biological samples; E.A. Juravehl — treatment of patients; G.Z. Seregin — FTM coordination and control; A.V. Komarova, S.S. Esiev — laboratory studies; G.O. Bronin — FTM coordination, writing the text of the article; Ya.D. Shansky — laboratory studies, data acquisition and analysis, manuscript writing, data statistical analysis. The authors made a substantial contribution to the conception of the work, acquisition, analysis, interpretation of data for the work, drafting and revising the work, final approval of the version to be published and agree to be accountable for all aspects of the work.
Источник финансирования. Научное исследование проведено при финансовой поддержке АНО «Московский центр инноваций в здравоохранении» (договор № 2412-31/22).
Funding source. This work was funded by the Moscow Center of Innovative Technologies in Medicine autonomic non-commercial organization (grant No. 2412-31/22).
Конфликт интересов. Авторы статьи подтвердили отсутствие конфликта интересов, о котором необходимо сообщить.
Competing interests. The authors declare that they have no competing interests.
About the authors
Julia A. Bespyatykh
Lopukhin Federal Research and Clinical Center of Physical-Chemical Medicine; N.A. Semashko National Research Institute of Public Health; Mendeleev University of Chemical Technology of Russia
Author for correspondence.
Email: JuliaBes@rcpcm.org
ORCID iD: 0000-0002-4408-503X
SPIN-code: 6003-9246
PhD, Associate Professor
Russian Federation, 1a Malaya Pirogovskaya street, 119435 Moscow; Moscow; MoscowAlina V. Gospodarik
Lopukhin Federal Research and Clinical Center of Physical-Chemical Medicine
Email: alina.gospodaryk@rcpcm.org
PhD, Research Associate
Russian Federation, 1a Malaya Pirogovskaya street, 119435 MoscowEvgeny A. Zhuravel
Morozov Children's Municipal Clinical Hospital
Email: zhuravel_evgeniy93@yandex.ru
врач
Russian Federation, MoscowGeorge Z. Seregin
Morozov Children's Municipal Clinical Hospital
Email: jorggg@mail.ru
врач-детский онколог отд. трансплантации костного мозга и гемопоэтических стволовых клеток
Russian Federation, MoscowAnastacia V. Komarova
Lopukhin Federal Research and Clinical Center of Physical-Chemical Medicine; Mendeleev University of Chemical Technology of Russia
Email: komaanasta@yandex.ru
Junior Research Associate
Russian Federation, 1a Malaya Pirogovskaya street, 119435 Moscow; MoscowSulejman S. Esiev
Lopukhin Federal Research and Clinical Center of Physical-Chemical Medicine
Email: kap20081@gmail.com
SPIN-code: 9593-2893
Russian Federation, 1a Malaya Pirogovskaya street, 119435 Moscow
Gleb O. Bronin
Morozov Children's Municipal Clinical Hospital
Email: gbronin@morozdgkb.ru
ORCID iD: 0000-0002-0694-3996
SPIN-code: 6485-2648
MD, PhD
Russian Federation, MoscowYaroslab D. Shansky
Lopukhin Federal Research and Clinical Center of Physical-Chemical Medicine
Email: yar.shansky@rcpcm.org
ORCID iD: 0000-0003-4672-2474
SPIN-code: 7640-5940
PhD, Research Associate
Russian Federation, 1a Malaya Pirogovskaya street, 119435 MoscowReferences
- Abdel‐Rahman ME, Mathew S, Al Thani AA, et al. Clinical manifestations associated with acute viral gastroenteritis pathogens among pediatric patients in Qatar. J Med Virol. 2021;93(8):4794–4804. doi: 10.1002/jmv.26859
- Dong N, Li ZR, Qin P, et al. Risk factors for Clostridioides difficile infection in children: A systematic review and meta-analysis. J Hosp Inf. 2022;(130):112–121. doi: 10.1016/j.jhin.2022.09.004
- Granado‐Villar D, Sautu CD, Granados A. Acute gastroenteritis. Pediatr Rev. 2012;33(11):487–495. doi: 10.1542/pir.33.11.487
- Голощапов О.В., Чухловин А.Б., Бакини Е.А., и др. Трансплантация фекальной микробиоты при реакции “трансплантат против хозяина” у детей и взрослых: методы, клинические эффекты, безопасность // Терапевтический архив. 2020. Т. 92, № 7. С. 43–54. [Goloshchapov OV, Chukhlovin AB, Bakina EA, et al. Fecal microbiota transplantation in the graft-versus-host reaction in children and adults: Methods, clinical effects, safety. Ther Arch. 2020;92(7):43–54. (In Russ).] doi: 10.26442/00403660.2020.07.000773
- Razizadeh MH, Pourrostami K, Kachooei A, et al. An annoying enteric virus: A systematic review and meta‐analysis of human astroviruses and gastrointestinal complications in children. Rev Med Virol. 2022;32(6):e2389. doi: 10.1002/rmv.2389
- Spindelboeck W, Schulz E, Uhl B, et al. Repeated fecal microbiota transplantations attenuate diarrhea and lead to sustained changes in the fecal microbiota in acute, refractory gastrointestinal graft-versus-host-disease. Haematologica. 2017;102(5):e210-e213. doi: 10.3324/haematol.2016.154351
- Mylonakis E, Ryan E, Calderwood S. Clostridium difficileassociated diarrhea. Arch Intern Med. 2001;161(4):525–533. doi: 10.1001/archinte.161.4.525
- Шанский Я.Д., Комарова А.В., Беспятых Ю.А. Применение метода высокоэффективной жидкостной хроматографии в сочетании с тандемной масс-спектрометрией для мониторинга содержания желчных кислот и их конъюгатов в организме человека // Материалы научно-практических конференций в рамках VIII Российского конгресса лабораторной медицины (РКЛМ 2022), сентябрь 5–9. Москва, 2022. [Shansky YaD, Komarova AV, Bespyatykh JA. Application of the method of high-performance liquid chromatography in combination with tandem mass spectrometry for monitoring the content of bile acids and their conjugates in the human body. In: Materials of scientific and practical conferences within the framework of the VIII Russian Congress of Laboratory Medicine (RKLM 2022), Sep, 5–9. Moscow; 2022. (In Russ).]
- Zhgun ES, Kislun YV, Kalachniuk TN, et al. [Evaluation of the levels of metabolites in feces of patients with inflammatory bowel diseases. (In Russ).] Biomed Khim. 2020;66(3):233–240. doi: 10.18097/PBMC20206603233
- Shi N, Li N, Duan X, Niu H. Interaction between the gut microbiome and mucosal immune system. Mil Med Res. 2017; 4:14. doi: 10.1186/s40779-017-0122-9
- Kelly CR, Ihunnah C, Fischer M, et al. Fecal microbiota transplant for treatment of clostridium difficile infection in immunocompromised patients. Am J Gastroenterol. 2014; 109:1065–1071. doi: 10.1038/AJG.2014.133
- Green JE, Davis JA, Berk M, et al. Efficacy and safety of fecal microbiota transplantation for the treatment of diseases other than Clostridium difficile infection: A systematic review and meta-analysis. Gut Microbes. 2020;12(1):1854640. doi: 10.1080/19490976.2020.1854640
- Sebire NJ, Malone M, Shah N, et al. Pathology of astrovirus associated diarrhoea in a paediatric bone marrow transplant recipient. J Clin Pathology. 2004;57(9):1001–1003. doi: 10.1136/jcp.2004.017178
- Serrano-Villar S, Talavera-Rodríguez A, Gosalbes MJ, et al. Fecal microbiota transplantation in HIV: A pilot placebo-controlled study. Nat Commun 2021;12:1139. doi: 10.1038/s41467-021-21472-1
- Pereira G, Gomes L, Santos I. Fecal microbiota transplantation in puppies with canine parvovirus infection. J Veterinary Int Med. 2018;32(2):707–711. doi: 10.1111/JVIM.15072
- Wunderli W, Meerbach A, Guengoer T, et al. Astrovirus infection in hospitalized infants with severe combined immunodeficiency after allogeneic hematopoietic stem cell transplantation. PLoS One. 2011;6(11):e27483. doi: 10.1371/journal.pone.0027483
- Kamp KJ, Cain KC, Utleget A, et al. Bile acids and microbiome among individuals with irritable bowel syndrome and healthy volunteers. Biol Res Nurs. 2021;23(1):65–74. doi: 10.1177/1099800420941255
- Perino A, Demagny H, Velazquez-Villegas L, Schoonjans K. Molecular physiology of bile acid signaling in health, disease, and aging. Physiol Rev. 2021;101(2):683–731. doi: 10.1152/physrev.00049.2019
- Foley MH, O’Flaherty S, Barrangou R, Theriot CM. Bile salt hydrolases: Gatekeepers of bile acid metabolism and host-microbiome crosstalk in the gastrointestinal tract. PLoS Pathog. 2019;15(3):e1007581. doi: 10.1371/journal.ppat.1007581
- Mirzaei R, Afaghi A, Babakhani S, et al. Role of microbiota-derived short-chain fatty acids in cancer development and prevention. Biomed Pharmacother. 2021;139:111619. doi: 10.1016/j.biopha.2021.111619
- Parada Venegas D, de la Fuente MK, Landskron G, et al. Short-chain fatty acids (SCFAs)-mediated gut epithelial and immune regulation and its relevance for inflammatory bowel diseases. Front Immunol. 2019;10:277. doi: 10.3389/fimmu.2019.00277
Supplementary files
СМИ зарегистрировано Федеральной службой по надзору в сфере связи, информационных технологий и массовых коммуникаций (Роскомнадзор).