<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>
<!DOCTYPE root>
<article xmlns:mml="http://www.w3.org/1998/Math/MathML" xmlns:xlink="http://www.w3.org/1999/xlink" xmlns:xsi="http://www.w3.org/2001/XMLSchema-instance" xmlns:ali="http://www.niso.org/schemas/ali/1.0/" article-type="research-article" dtd-version="1.2" xml:lang="en"><front><journal-meta><journal-id journal-id-type="publisher-id">Ecological genetics</journal-id><journal-title-group><journal-title xml:lang="en">Ecological genetics</journal-title><trans-title-group xml:lang="ru"><trans-title>Экологическая генетика</trans-title></trans-title-group></journal-title-group><issn publication-format="print">1811-0932</issn><issn publication-format="electronic">2411-9202</issn><publisher><publisher-name xml:lang="en">Eco-Vector</publisher-name></publisher></journal-meta><article-meta><article-id pub-id-type="publisher-id">2423</article-id><article-id pub-id-type="doi">10.17816/ecogen12332-42</article-id><article-categories><subj-group subj-group-type="toc-heading" xml:lang="en"><subject>Articles</subject></subj-group><subj-group subj-group-type="toc-heading" xml:lang="ru"><subject>Статьи</subject></subj-group><subj-group subj-group-type="article-type"><subject>Research Article</subject></subj-group></article-categories><title-group><article-title xml:lang="en">The History of Manayunkia [Polychaeta: Sedentaria: Sabellidae] propagation in North Eastern Asia</article-title><trans-title-group xml:lang="ru"><trans-title>Родственные связи байкальских полихет рода Manayunkia [Polychaeta: Sedentaria: Sabellidae] по данным анализа СО1 с анализом истории расселения</trans-title></trans-title-group></title-group><contrib-group><contrib contrib-type="author"><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Pudovkina</surname><given-names>Tatyana Anatolyevna</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Пудовкина</surname><given-names>Татьяна Анатольевна</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="en"><p>engineer. Laboratory of Molecular Systematics</p></bio><bio xml:lang="ru"><p>инженер. Лаборатория геносистематики беспозвоночных</p></bio><email>tap77@rambler.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff1"/></contrib><contrib contrib-type="author"><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Sitnikova</surname><given-names>Tatyana Yakovlevna</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Ситникова</surname><given-names>Татьяна Яковлевна</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="en"><p>dr., senior researcher. Laboratory of Biology of aquatic invertebrates</p></bio><bio xml:lang="ru"><p>д. б. н., с. н. с. Лаборатория биологии водных беспозвоночных</p></bio><xref ref-type="aff" rid="aff1"/></contrib><contrib contrib-type="author"><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Matveyev</surname><given-names>Arkadiy Nikolayevich</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Матвеев</surname><given-names>Аркадий Николаевич</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="en"><p>dr., professor. Head of Department of Biology and Soil Sciences</p></bio><bio xml:lang="ru"><p>д. б. н., профессор, декан. Биолого-почвенный факультет</p></bio><xref ref-type="aff" rid="aff2"/></contrib><contrib contrib-type="author"><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Shcherbakov</surname><given-names>Dmitriy Yuryevich</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Щербаков</surname><given-names>Дмитрий Юрьевич</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="en"><p>Head of Laboratory of Molecular Systematics</p></bio><bio xml:lang="ru"><p>д. б. н., заведующий лабораторией. Лаборатория геносистематики беспозвоночных</p></bio><email>sherb@lin.irk.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff1"/></contrib></contrib-group><aff-alternatives id="aff1"><aff><institution xml:lang="en">Limnological Institute, Siberian Division, Russian Academy of Sciences</institution></aff><aff><institution xml:lang="ru">Лимнологический институт Сибирского отделения Российской академии наук (ЛИН СО РАН)</institution></aff></aff-alternatives><aff-alternatives id="aff2"><aff><institution xml:lang="en">Irkutsk State University</institution></aff><aff><institution xml:lang="ru">Иркутский государственный университет</institution></aff></aff-alternatives><pub-date date-type="pub" iso-8601-date="2014-09-15" publication-format="electronic"><day>15</day><month>09</month><year>2014</year></pub-date><volume>12</volume><issue>3</issue><issue-title xml:lang="en">VOL 12, NO3 (2014)</issue-title><issue-title xml:lang="ru">ТОМ 12, №3 (2014)</issue-title><fpage>32</fpage><lpage>42</lpage><history><date date-type="received" iso-8601-date="2016-03-30"><day>30</day><month>03</month><year>2016</year></date></history><permissions><copyright-statement xml:lang="en">Copyright ©; 2014, Pudovkina T.A., Sitnikova T.Y., Matveyev A.N., Shcherbakov D.Y.</copyright-statement><copyright-statement xml:lang="ru">Copyright ©; 2014, Пудовкина Т.А., Ситникова Т.Я., Матвеев А.Н., Щербаков Д.Ю.</copyright-statement><copyright-year>2014</copyright-year><copyright-holder xml:lang="en">Pudovkina T.A., Sitnikova T.Y., Matveyev A.N., Shcherbakov D.Y.</copyright-holder><copyright-holder xml:lang="ru">Пудовкина Т.А., Ситникова Т.Я., Матвеев А.Н., Щербаков Д.Ю.</copyright-holder><ali:free_to_read xmlns:ali="http://www.niso.org/schemas/ali/1.0/"/><license><ali:license_ref xmlns:ali="http://www.niso.org/schemas/ali/1.0/">http://creativecommons.org/licenses/by/4.0</ali:license_ref></license></permissions><self-uri xlink:href="https://journals.eco-vector.com/ecolgenet/article/view/2423">https://journals.eco-vector.com/ecolgenet/article/view/2423</self-uri><abstract xml:lang="en"><p>This study aimes to elucidate the history of propagation of the freshwater Manayunkia polychaetes in North-Eastern Asia and their speciation in Lake Baikal. Nucleotide polymorphism analysis of of the CO1 Folmer fragment allowed to establish the sequence of migration and speciation events. Phylogenetic analysis and bayesian comparison of possible scenarios supports the hypothesis that the origin of the Manayunkia migration was the Kolyma river basin, from where the polychaetes migrated into Baikal and diverged into at least three species, one of which (M. godlewskii) served as the source of migrants into the Lake Baunt system.</p></abstract><trans-abstract xml:lang="ru"><p>Целью исследования является выяснение истории распространения многощетинковых червей рода Manayunkia (Leidy, 1859) [Sedentaria, Sabellidae] по северо-востоку Азии и их видообразования в Байкале. Сравнительный анализ полиморфизма нуклеотидных последовательностей фолмеровского фрагмента гена СО1 позволил установить последовательность миграционных и видообразовательных событий в истории пресноводных многощетинковых червей рода Manayunkia. Филогенетический анализ и сравнение гипотез о характере миграции Manayunkia с помощью байесовского критерия показали, что стартовым районом был бассейн Колымы, откуда полихеты проникли в Байкал, где разделились на три вида (M. godlewskii, M. baicalensis и M. zenkewitschii), из которых M. godlewskii послужил источником мигрантов в систему Баунтовских озер.</p></trans-abstract><kwd-group xml:lang="en"><kwd>Manayunkia</kwd><kwd>Manayunkia</kwd><kwd>Lake Baikal</kwd><kwd>sympatric speciation</kwd><kwd>migration</kwd></kwd-group><kwd-group xml:lang="ru"><kwd>Байкал</kwd><kwd>симпатрическое видообразование</kwd><kwd>миграция</kwd></kwd-group></article-meta></front><body></body><back><ref-list><ref id="B1"><label>1.</label><mixed-citation>Верещагин Г. Ю. (1940) Происхождение и история Байкала, его фауны и флоры. Труды Байк. лимн. ст. АН СССР. Т. X.</mixed-citation></ref><ref id="B2"><label>2.</label><mixed-citation>Гоманенко Г. В., Камалтынов Р. М., Кузьменкова Ж. В. (2005) Популяционная структура байкальского бокоплава Gmelinoides fasciatus (Stebbing). Генетика. Т. 41: С. 1108-1114.</mixed-citation></ref><ref id="B3"><label>3.</label><mixed-citation>Клишко О. К. (1994) Фенотипические различия полихет Manayunkia baicalensis Nusb. из водоемов бассейнов рек Лены и Амура. Докл. АН СССР. Сер. Общ. биология. Т. 335: С. 116-117.</mixed-citation></ref><ref id="B4"><label>4.</label><mixed-citation>Клишко О. К. (1996) Полихета Manayunkia baicalensis Nussb. в водоемах бассейнов рек Лена и Амур. Известия РАН. № 1: С. 101-105.</mixed-citation></ref><ref id="B5"><label>5.</label><mixed-citation>Кожов М. М. (1962) Биология озера Байкал. М.: Наука. 315 с.</mixed-citation></ref><ref id="B6"><label>6.</label><mixed-citation>Кожов М. М. (1972) Очерки по Байкаловедению. Иркутск: Вост.-Сиб. книжн. изд-во. 254 с.</mixed-citation></ref><ref id="B7"><label>7.</label><mixed-citation>Ламакин В. В. (1952) Ушканьи острова и проблема происхождения Байкала. М.: Географгиз. 199 с.</mixed-citation></ref><ref id="B8"><label>8.</label><mixed-citation>Мац В. Д., Уфимцев Г. Ф., Мандельбаум М. М. и др. (2001) Кайнозой Байкальской рифтовой впадины: Строение и геологическая история. Новосибирск: Изд-во СО РАН., филиал «Гео». 252 с.</mixed-citation></ref><ref id="B9"><label>9.</label><mixed-citation>Мац В. Д., Фуджии, Ш., Машико, К. и др. (2002) К палеогидрологии Байкала в связи с неотектоникой. Геология и геофизика. Т. 43 (2): С. 142-154.</mixed-citation></ref><ref id="B10"><label>10.</label><mixed-citation>Остерман Л. А. (1981) Методы исследования белков и нуклеиновых кислот. Электрофорез и ультрацентрифугирование. М.: Наука. 288 с.</mixed-citation></ref><ref id="B11"><label>11.</label><mixed-citation>Перетолчина Т. Е., Ситникова Т. Я., Щербаков Д. Ю. (2006) Исследование популяционного генетического полиморфизма эндемичного байкальского вида Baicalia carinata (Mollusca, Caenogastropoda). Ruthenica. Т. 16(1-2): С. 105-111.</mixed-citation></ref><ref id="B12"><label>12.</label><mixed-citation>Ситникова Т. Я. (2001) Многощетинковые черви (ANNELIDA: POLYCHAETA). Аннотированный список фауны озера Байкал и его водосборного бассейна. Под ред. О. А. Тимошкина. Т. 1 книга 1: С. 428-431.</mixed-citation></ref><ref id="B13"><label>13.</label><mixed-citation>Ситникова Т. Я., Щербаков Д. Ю., Огарков О. Б., Щербакова Т. А. (1995) О родственных взаимоотношениях байкальских полихет. Вторая Верещагинская. Байк. конференция. Иркутск. С. 177.</mixed-citation></ref><ref id="B14"><label>14.</label><mixed-citation>Ситникова Т. Я., Щербаков Д. Ю., Харченко В. В. (1997) О таксономическом статусе полихет рода Manayunkia (Sabellidae, Fabricinae) из Байкала. Зоол. журнал. Т. 76: С. 16-27.</mixed-citation></ref><ref id="B15"><label>15.</label><mixed-citation>Сластников Г. С. (1940) К нахождению многощетинкового червя Manayunkia в бассейне реки Гыда. Природа. № 7: С. 76-77.</mixed-citation></ref><ref id="B16"><label>16.</label><mixed-citation>Тахтеев В. В., Снимщикова Л. Н., Окунева Г. Л. и др. (1993) Характеристика донного населения глубинной зоны Байкала. Экология. № 6: С. 60-67.</mixed-citation></ref><ref id="B17"><label>17.</label><mixed-citation>Томилов А. А. (1954) Материалы по гидробиологии глубоководных озер Олекмо-Витимской горной страны. Тр. Иркутск. ун-та. Сер. биол. Т. 11: С. 1-86.</mixed-citation></ref><ref id="B18"><label>18.</label><mixed-citation>Bukin Ju. S., Pudovkina T. A., Sherbakov D. Ju., Sitnikova T. Ya. (2007) Genetic Flows in a Structured One-Dimensional Population: Simulation and Real Data on Baikalian Polychaetes M. Godlewskii. In Silico Biology. V. 7: P. 277-284.</mixed-citation></ref><ref id="B19"><label>19.</label><mixed-citation>Canales-Aguirre C. B., Rozbaczylo N., Hernández C. E. (2011) Genetic identification of benthic polychaetes in a biodiversity hotspot in the southeast Pacific. Revista de Biologia Marina y Oceanografia. V. 46: P. 89-94.</mixed-citation></ref><ref id="B20"><label>20.</label><mixed-citation>Doyle J. J., Dickson E. E. (1987) Preservation of plant samples for DNA restriction endonuclease analysis. Taxon. V. 36: P. 715-722.</mixed-citation></ref><ref id="B21"><label>21.</label><mixed-citation>Folmer O., Black M., Hoeh W. et al. (1994) DNA primers for amplification of mitochondrial cytochrome C subunit I from diverse metazoan invertebrates. Mol. Mar. Biol. Biotech. V. 3: P. 294-299.</mixed-citation></ref><ref id="B22"><label>22.</label><mixed-citation>Kaygorodova I. A., Sherbakov D. Yu., Martin P. (2007) Molecular phylogeny of Baikalian Lumbriculidae (Oligochaeta): evidence for recent explosive speciation. Comparative Cytogenetics. V. 1: P. 71-84.</mixed-citation></ref><ref id="B23"><label>23.</label><mixed-citation>Maniatis T., Fritsch E. F., Sambrook J. (1982) Molecular cloning: A laboratory manual. Gold Spring Harbor Laboratory Press. New York. 545 p.</mixed-citation></ref><ref id="B24"><label>24.</label><mixed-citation>Nusbaum J. (1901) Dybowcella baicalensis nov. gen. Ein in Sueswasser lebendes Polychaet. Biol. Ctrbl., V. 21: P. 6-19.</mixed-citation></ref><ref id="B25"><label>25.</label><mixed-citation>Posada D. (2008) jModelTest: phylogenetic model averaging. Mol. Biol. Evol. V. 25: P. 1253-1256.</mixed-citation></ref><ref id="B26"><label>26.</label><mixed-citation>Rambaut A. (2006-2012) Tree figure drawing tool. Version 1.4.0. Institute of evolutionary biology. University of Edinburgh. http://tree.bio.ed.ac.uk.</mixed-citation></ref><ref id="B27"><label>27.</label><mixed-citation>R Core Team (2013) R: A language and environment for statistical computing. R Foundation for Statistical Computing. Vienna, Austria. http://www.R-project.org.</mixed-citation></ref><ref id="B28"><label>28.</label><mixed-citation>Ronquist F., Teslenko M., van der Mark P., et al. (2012) MrBayes 3.2: Efficient Bayesian phylogenetic inference and model choice across a large model space. Syst. Biol. V. 61: P. 539-542.</mixed-citation></ref><ref id="B29"><label>29.</label><mixed-citation>Tajima F. (1989) Statistical method for testing the neutral mutation hypothesis by DNA polymorphism. Genetics. V. 123: P. 585-595.</mixed-citation></ref><ref id="B30"><label>30.</label><mixed-citation>Tamura K., Peterson D., Peterson N. et al. (2011) MEGA5: Molecular Evolutionary Genetics Analysis using Maximum Likelihood, Evolutionary Distance, and Maximum Parsimony Methods. Mol. Biol. Evol. V. 28: P. 2731-2739.</mixed-citation></ref><ref id="B31"><label>31.</label><mixed-citation>Wilke T., Schultheib R., Albrecht C. (2009) As time goes by: A simple fool's guide to molecular clock approaches in invertebrates. Amer. Malac. Bull. V. 27: P. 25-45.</mixed-citation></ref><ref id="B32"><label>32.</label><mixed-citation>Xie W., Lewis P. O., Fan Y. et al. (2011) Improving marginal likelihood estimation for Bayesian phylogenetic model selection. Syst. Biol. V. 60: P. 150-160.</mixed-citation></ref><ref id="B33"><label>33.</label><mixed-citation>Zenkewitsch L. (1935) Über d. Manayunkia (M. polaris) an dem Murman - Küsten. Zool. Anz. B., 199, 718.</mixed-citation></ref></ref-list></back></article>
