Ecological geneticsEcological geneticsЭкологическая генетика1811-09322411-9202Eco-Vector545910.17816/ecogen535-14ArticlesСтатьиResearch ArticleUsing of ITS sequences for the evaluation of taxonomic relations of the representatives of tribe Vicieae (Adans.) Bronn сем. Fabaceae LindlИСПОЛЬЗОВАНИЕ ITS ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЕЙ ДЛЯ ОЦЕНКИ ТАКСОНОМИЧЕСКИХ ОТНОШЕНИЙ У ПРЕДСТАВИТЕЛЕЙ ТРИБЫ VICIEAE (ADANS.) BRONN СЕМ. FABACEAE LINDRyzhovaNatalia NРыжоваНаталья Николаевнаrynatalia@yandex.ruBurlyaevaMarina OБурляеваМарина ОлеговнаKochievaE AКочиеваЕ АVishnyakovaMargarita AВишняковаМаргарита Афанасьевнаm.visnyakova@vir.nw.ruCentre Bioengineering RAS, Moscow, RFЦентр «Биоинженерия» РАН РФ, Москва, РФN. I. Vavilov Institute of Plant Industry, Saint-Petersburg, RFВсероссийский институт растениеводства им.Н.И.Вавилова, Санкт-Петербург, РФ1509200753VOL 5, NO3 (2007)ТОМ 5, №3 (2007)51414112016Copyright ©; 2007, Ryzhova N.N., Burlyaeva M.O., Kochieva E.A., Vishnyakova M.A.Copyright ©; 2007, Рыжова Н.Н., Бурляева М.О., Кочиева Е.А., Вишнякова М.А.2007Ryzhova N.N., Burlyaeva M.O., Kochieva E.A., Vishnyakova M.A.Рыжова Н.Н., Бурляева М.О., Кочиева Е.А., Вишнякова М.А.http://creativecommons.org/licenses/by/4.0https://journals.eco-vector.com/ecolgenet/article/view/5459

ITS1-5.8S-ITS2 nucleotide polymorphism аnalysis of Vicieae species that represent accessions of Russian genebank (VIR) collection have been performed. Nucleotide substitutions in ITS1-5.8S-ITS2-sequences and indels of different length that were species-specific or specific for Lathyrus and Viciaspecies groups have been revealed. New data proving taxonomic status of accessions with uncertain taxonomic position have been obtained.

Проведен анализ нуклеотидного полиморфизма ITS1-5.8S-ITS2 последовательностей представителей трибы Vicieae из коллекции ВИР. Выявлены нуклеотидные замены и индели различной длины в ITS1-5.8S-ITS2 районе, характеризующие как отдельные виды, так и группы видов Lathyrus и Vicia. Получен целый ряд данных, подтверждающий видовой/родовой статус образцов, имеющих спорное таксономическое положение.

ТРИБА VICIEAEТАКСОНОМИЯНУКЛЕОТИДНЫЙ ПОЛИМОРФИЗМITS-ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИКрашенинников И. М. Из истории развития ландшафтов Южного Урала/Крашенинников И. М.//Ред. Сукачев В. Н. -М.: Географические работы. -1954. -С. 103-128.Попов М. Г. Род Cicer и его виды. К проблеме происхождения средиземноморской флоры (Опыт морфологической и географической монографии)/Попов М. Г.//Тр. по прикл. бот., ген. и сел. -1929. -Т. 21, Вып. 1. -239 с.Станкевич А. К. Вика. Культурная флора/Станкевич А. К., Репьев С. И.//Ред. Репьев С. И. -СПб.: ГНЦ-ВИР, 1999. -Т. 4. -491 с.Федченко Б. А. Lathyrus L./Федченко Б. А.//Ред. Комаров В. Л. -М.-Л.: Флора СССР, 1948. -Т. 13. -С. 479-520.Чефранова З.В. Конспект системы рода Lathyrus L./Чефранова З. В.//Новости сист. высш. раст. -1971. -Т. 8. -С. 191-201.Чефранова З. В. Род Lathyrus L./Чефранова З. В.//Ред. Федорова А. А. -Л.: Флора Европейской части СССР, 1987. -Т. 6. -С. 147-172.Яковлев Г. П. Бобовые земного шара/Яковлев Г. П.//Ред. Меницкий Ю. Л. -Л.: Наука, 1991. -141 с.Adanson M. Familles des plantes/Adanson M.//Paris, 1763. -N 2. -P. 331-332.Ainouche A.-K. Phylogenetic relationships in Lupinus (Fabaceae: Papilionoideae) based on internal transcribed spacer sequences (ITS) of nuclear ribosomal DNA/Ainouche A.-K., R. J. Bayer.//American Journal of Botany -1999. -V. 86. -P. 590-607.Alefeld. F. Genus Vicia L./Alefeld. F.//Bonpandia. -1861. -Vol. 9. -P. 66-199.Allan G. J. Tribal delimitation, phylogenetic relationships of Loteae, Coronilleae (Faboideae: Fabaceae) with special reference to Lotus: evidence from nuclear ribosomal ITS sequences/Allan G. J., Porter J. M.//American Journal of Botany -2000. -Vol. 87. -P. 1871 -1881.Alvarez I. A. Ribosomal ITS sequences, plant phylogenetic inference/Alvarez I. A., Wendel J. F.//Molec. Phyl. Evol. -2003. -Vol. 29. N 3. -P. 417-434.Asmussen C. B. Chloroplast DNA characters, phy-logeny and classification of Lathyrus (Fabaceae)/Asmussen C. B., Liston A.//Am. J. Bot. -1998. -Vol. 85. -P. 387-401.Barneby R. C. A new species of Lathyrus (Fabaceae) from the Death Valley region of California, Nevada./Barneby R. C., Reveal J. L.//Aliso. -1971. -Vol. 7. -P. 361-364.Bassler M. Revision der eurasiatischen Arten von Lathyrus L. sect. Orobus (L.) Gren. et Godr/Bassler M.//Feddes Repertorium. -1973. -Bd. 84. -Hf. 5-6. -P. 329-447.Boissier E. Vicia L., Lathyrus L./Boissier E.//Flora Orientalis. Geneve, 1872. -Vol. 2. -P. 565-622.Bronn H. G. De formis plantarum Leguminosarum primitivis et derivatis/Bronn H. G.//Нeidelbergae. -1822. -P. 1-76.Byoung-Hee Choi. Phylogenetic significance of stylar features in genus Vicia (Leguminosae): an analysis with molecular phylogeny/Byoung-Hee Choi, Dong-Im Seok, Yasuhiko Endo, Hiroyoshi Ohashi//Journal of Plant Research. -2006. -Vol. 119, N 5. -P. 513-523.Godron D. A. Lathyrus L./Grenier J. C. M., Godron D. A.//Flore de France. I. -Paris et Besanson, 1848. -P. 478-492.Goel S. Molecular evolution, phylogenetic implications of internal transcribed spacer sequences of nuclear ribosomal DNA in the Phaseolus-Vigna comple/Goel S., Raina S. N., Ogihara Y.//Mol. Phylogenet. Evol. -2002. -Vol. 22, N 1. -P. 1 -19.Gunn C. R. Androecium and pistil characters for the tribe Vicieae (Fabaceae)/Gunn C. R., Kluve J.//Taxon. -1976. -Vol. 25. -P. 563-575.Edwards S. K. A simple and rapid method for the preparation of plant genomic DNA for PCR analyses/Edwards S.K., Johonstone C., Thompson C.//Nucleic Acids Res. -1991. -Vol. 19, N 6. -P. 1349.Engler A. Lathyrus L./Engler A., Prantl K.//Die Natürlichen Pflanzen Familien. Leipzig. -1894. -S. 70-388.Kenicer G. J. Systematics, biogeography of Lathyrus (Leguminosae) based on internal transcribed spacer, cpDNA sequence data/Kenicer G. J., Kajita T., Pennington R. T., Murata J.//American Journal of Botany. -2005. -Vol. 92. -P. 1199-1209.Kumar S. MEGA3: Integrated Software for Molecular Evolutionary Genetics Analysis and Sequence Alignment/Kumar S., Tamura K., Nei M.//Briefings in Bioinformatics. -2004. -Vol. 5. -P. 150-163.Kupicha F. K. The infrageneric structure of Vicia./Kupicha F. K.//Notes from the Royal Botanic Garden. -Edinburg. -1976. -Vol. 34, N 3. -P. 287-326.Kupicha F. K. The infrageneric structure of Lathyrus L./Kupicha F. K.//Notes from the Royal Botanic Garden. -Edinburg. -1983. -Vol. 41, N 2. -P 209-244.Mayer M. S. The phylogeny of Lens (Leguminosae): new insight from ITS sequence analysis/Mayer M. S., Bagga S. K.//Plant Systematics, Evolution. -2002. -Vol. 232. -P. 145-154.Nuclear DNA contents, rDNAs, karyotype evolution in Vicia subgenus Vicia: II. Section Peregrinae/Frediani M., Caputo P., Venora G. [et al.]//Protoplasma. -2005. -Vol. 226, N 3-4. -P. 181 -190.Saitou N. The neighbor-joining method: a new method for reconstructing phylogenetic trees/Saitou N., Nei M.//Mol Biol Evol. -1987. -V. 4. -N 4. -P. 6-25.Simola L. K. Comparative studies on number of leaflets, venation and epidermal structure in the genus Lathyrus/Simola L. K.//Canad. J. Bot. -1968. -Vol. 46. -P. 71-84.Steele K. P. Phylogenetic analyses if tribes Trifoleae, Vicieae based on sequences of the plastid gene matK (Papilionoideae: Leguminosae)/Steele K. P., Wojciechowski M. F. B.; eds. B. Klitgaard, A. Bruneau. -Royal Botanic Gardens, Kew, Richmond, UK: Advances in legume systematics, 2003. -Part 10. -P. 355-370.Thompson J. D. The ClustalX windows interface: flexible strategies for multiple seguence alignment aided by quality tools/Thompson J. D., Gibson T. J., Plewniak F. [et al.]//Nucleic Acids Res. -1997. -Vol. 24. -P. 4876-4882.White T. J. Amplification and direct sequencing of fungal ribosomal RNA genes for phylogenetics/White T. J., Bruns T., Lee S. [et al.]//In: Innis M. A., Gelfand D. H., Shinsky J. J., White T. J. (editors). PCR Protocols: A Guide to Methods and Applications, Academic Press, San Diego. -1990. -P. 315-322.