<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>
<!DOCTYPE root>
<article xmlns:mml="http://www.w3.org/1998/Math/MathML" xmlns:xlink="http://www.w3.org/1999/xlink" xmlns:xsi="http://www.w3.org/2001/XMLSchema-instance" xmlns:ali="http://www.niso.org/schemas/ali/1.0/" article-type="research-article" dtd-version="1.2" xml:lang="en"><front><journal-meta><journal-id journal-id-type="publisher-id">Ophthalmology Reports</journal-id><journal-title-group><journal-title xml:lang="en">Ophthalmology Reports</journal-title><trans-title-group xml:lang="ru"><trans-title>Офтальмологические ведомости</trans-title></trans-title-group></journal-title-group><issn publication-format="print">1998-7102</issn><issn publication-format="electronic">2412-5423</issn><publisher><publisher-name xml:lang="en">Eco-Vector</publisher-name></publisher></journal-meta><article-meta><article-id pub-id-type="publisher-id">10997</article-id><article-id pub-id-type="doi">10.17816/OV2019113-20</article-id><article-categories><subj-group subj-group-type="toc-heading" xml:lang="en"><subject>Original study articles</subject></subj-group><subj-group subj-group-type="toc-heading" xml:lang="ru"><subject>Оригинальные исследования</subject></subj-group><subj-group subj-group-type="article-type"><subject>Research Article</subject></subj-group></article-categories><title-group><article-title xml:lang="en">Artificial intelligence and machine learning for optical coherence tomography-based diagnosis in central serous chorioretinopathy</article-title><trans-title-group xml:lang="ru"><trans-title>Искусственный интеллект и машинное обучение в диагностике центральной серозной хориоретинопатии на основании оптической когерентной томографии</trans-title></trans-title-group></title-group><contrib-group><contrib contrib-type="author"><contrib-id contrib-id-type="spin">6440-7706</contrib-id><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Kulikov</surname><given-names>Alexey N.</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Куликов</surname><given-names>Алексей Николаевич</given-names></name></name-alternatives><address><country country="RU">Russian Federation</country></address><bio xml:lang="en"><p>MD, PhD, DMedSc, Professor, Head of the Department</p></bio><bio xml:lang="ru"><p>д-р мед. наук, доцент, начальник кафедры офтальмологии</p></bio><email>alexey.kulikov@mail.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff1"/></contrib><contrib contrib-type="author"><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Malahova</surname><given-names>Ekaterina Yu.</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Малахова</surname><given-names>Екатерина Юрьевна</given-names></name></name-alternatives><address><country country="RU">Russian Federation</country></address><bio xml:lang="en"><p>Associate Researcher</p></bio><bio xml:lang="ru"><p>младший научный сотрудник</p></bio><email>katerina.malahova@gmail.com</email><xref ref-type="aff" rid="aff2"/></contrib><contrib contrib-type="author"><contrib-id contrib-id-type="orcid">https://orcid.org/0000-0001-6598-3982</contrib-id><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Maltsev</surname><given-names>Dmitrii S.</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Мальцев</surname><given-names>Дмитрий Сергеевич</given-names></name></name-alternatives><address><country country="RU">Russian Federation</country></address><bio xml:lang="en"><p>MD, PhD, ophthalmologist of the Ophthalmology Department</p></bio><bio xml:lang="ru"><p>канд. мед. наук, врач-офтальмолог клиники офтальмологии</p></bio><email>glaz.med@yandex.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff1"/></contrib></contrib-group><aff-alternatives id="aff1"><aff><institution xml:lang="en">S.M. Kirov Military Medical Academy</institution></aff><aff><institution xml:lang="ru">ФГБВОУ ВО «Военно-медицинская академия им. С.М. Кирова» Минобороны России</institution></aff></aff-alternatives><aff-alternatives id="aff2"><aff><institution xml:lang="en">Pavlov Institute of Physiology Russian Academy of Sciences</institution></aff><aff><institution xml:lang="ru">Институт физиологии им. И.П. Павлова Российской академии наук</institution></aff></aff-alternatives><pub-date date-type="pub" iso-8601-date="2019-06-06" publication-format="electronic"><day>06</day><month>06</month><year>2019</year></pub-date><volume>12</volume><issue>1</issue><issue-title xml:lang="en"/><issue-title xml:lang="ru"/><fpage>13</fpage><lpage>20</lpage><history><date date-type="received" iso-8601-date="2019-02-06"><day>06</day><month>02</month><year>2019</year></date><date date-type="accepted" iso-8601-date="2019-03-01"><day>01</day><month>03</month><year>2019</year></date></history><permissions><copyright-statement xml:lang="en">Copyright ©; 2019, Kulikov A.N., Malahova E.Y., Maltsev D.S.</copyright-statement><copyright-statement xml:lang="ru">Copyright ©; 2019, Куликов А.Н., Малахова Е.Ю., Мальцев Д.С.</copyright-statement><copyright-year>2019</copyright-year><copyright-holder xml:lang="en">Kulikov A.N., Malahova E.Y., Maltsev D.S.</copyright-holder><copyright-holder xml:lang="ru">Куликов А.Н., Малахова Е.Ю., Мальцев Д.С.</copyright-holder><ali:free_to_read xmlns:ali="http://www.niso.org/schemas/ali/1.0/"/><license><ali:license_ref xmlns:ali="http://www.niso.org/schemas/ali/1.0/">http://creativecommons.org/licenses/by/4.0</ali:license_ref></license></permissions><self-uri xlink:href="https://journals.eco-vector.com/ov/article/view/10997">https://journals.eco-vector.com/ov/article/view/10997</self-uri><abstract xml:lang="en"><p><bold><italic>The aim</italic></bold> of the present study was to examine the potential of machine learning for identification of isolated neurosensory retina detachment and retinal pigment epithelium (RPE) alterations as diagnostic criteria of central serous chorioretinopathy (CSC).</p> <p><bold><italic>Material and methods.</italic></bold> Patients with acute CSC in whom a standard ophthalmic examination and optical coherence tomography (OCT) using RTVue-XR Avanti (Angio Retina HD scan protocol, 6 × 6 mm) was performed were included in the study. 10-μm en face slab above the RPE layer was used to create ground truth masks. Learning aims were defined as identification of 3 classes of structural abnormalities on OCT cross-sectional scans: class 1 – subretinal fluid, class 2 – RPE abnormalities, and class 3 – leakage points. Data for each of the 3 classes included: 4800/1400 training/test images for class 1, 2000/802 training/test images for class 2, and 1504/408 training/test images for class 3. Unet-similar architecture was used for segmentation of abnormalities on OCT cross-sectional scans.</p> <p><bold><italic>Results.</italic></bold> Analysis of test sets revealed sensitivity, specificity, precision, and F1-score for detection of subretinal fluid of 0.61, 0.99, 0.99, and 0.76, respectively. For detection of RPE abnormalities sensitivity, specificity, precision, and F1-score were 0.14, 0.95, 0.94 and 0.24, respectively. For detection of leakage point sensitivity, specificity, precision, and F1-score were 0.06, 1.0, 1.0, and 0.12, respectively.</p> <p><bold><italic>Conclusions.</italic></bold> Thus, machine learning demonstrated high potential in the OCT-based identification of structural abnormalities associated with acute CSC (neurosensory retina detachment and RPE alterations). Topical identification of the leakage point appears to be possible using large learning sets.</p></abstract><trans-abstract xml:lang="ru"><p><bold><italic>Цель</italic></bold> данного исследования состояла в изучении возможности машинного обучения для выявления изолированной отслойки нейроэпителия сетчатки и изменений пигментного эпителия сетчатки как диагностических критериев центральной серозной хориоретинопатии (ЦСХ).</p> <p><bold><italic>Материал и методы.</italic></bold> В это исследование были включены пациенты с острой ЦСХ, прошедшие стандартное офтальмологическое обследование и выполнившие оптическую когерентную томографию с помощью RTVue-XR Avanti (протокол Angio Retina HD, 6 × 6 мм). Для обучающей разметки был использован en face пласт толщиной 10 мкм в плоскости над пигментным эпителием сетчатки. В соответствии с задачами обучения нейронной сети на кросс-секционных сканах были выделены три категории патологических изменений: класс 1 — субретинальная жидкость, класс 2 — аномалии пигментного эпителия сетчатки и класс 3 — точки просачивания. Количество данных для каждой из категорий составило 4800/1400 тренировочных/тестовых изображений для класса 1, 2000/802 для класса 2 и 1504/408 для класса 3. Для решения задачи сегментации патологий на ОКТ-сканах была использована архитектура, аналогичная Unet.</p> <p><bold><italic>Результаты.</italic></bold> Анализ тестовых сетов показал, что чувствительность, специфичность, точность и F1-мера в детекции субретинальной жидкости составили 0,61; 0,99; 0,99 и 0,76 соответственно; для детекции аномалий пигментного эпителия сетчатки чувствительность, специфичность, точность и F1-мера равнялись 0,14; 0,95; 0,94 и 0,24 соответственно; для детекции точки просачивания чувствительность, специфичность, точность и F1-мера составили 0,06; 1,0; 1,0 и 0,12 соответственно.</p> <p><bold><italic>Заключение.</italic></bold> Таким образом, машинное обучение демонстрирует высокий потенциал в идентификации патологических изменений, характерных для острой формы ЦСХ (отслойки нейроэпителия сетчатки и альтерации пигментного эпителия сетчатки), по данным ОКТ. Топическая индикация точки просачивания представляется возможной на больших обучающих сетах.</p></trans-abstract><kwd-group xml:lang="en"><kwd>central serous chorioretinopathy</kwd><kwd>optical coherence tomography</kwd><kwd>artificial intelligence</kwd><kwd>machine learning</kwd><kwd>neural network</kwd></kwd-group><kwd-group xml:lang="ru"><kwd>центральная серозная хориоретинопатия</kwd><kwd>оптическая когерентная томография</kwd><kwd>искусственный интеллект</kwd><kwd>машинное обучение</kwd><kwd>нейронная сеть</kwd></kwd-group><funding-group/></article-meta></front><body></body><back><ref-list><ref id="B1"><label>1.</label><mixed-citation>Gargeya R, Leng T. Automated identification of diabetic retinopathy using deep learning. Ophthalmology. 2017;124(7):962-969. https://doi.org/10.1016/j.ophtha.2017.02.008.</mixed-citation></ref><ref id="B2"><label>2.</label><mixed-citation>Daruich A, Matet A, Dirani A, et al. Central serous chorioretinopathy: Recent findings and new physiopathology hypothesis. Prog Retin Eye Res. 2015;48:82-118. https://doi.org/10.1016/j.preteyeres.2015.05.003.</mixed-citation></ref><ref id="B3"><label>3.</label><mixed-citation>Maltsev DS, Kulikov AN, Chhablani J. Topography-guided identification of leakage point in central serous chorioretinopathy: a base for fluorescein angiography-free focal laser photocoagulation. Br J Ophthalmol. 2018;102(9):1218-1225. https://doi.org/10.1136/bjophthalmol-2017-311338.</mixed-citation></ref><ref id="B4"><label>4.</label><mixed-citation>Бойко Э.В., Мальцев Д.С. Фокальная навигационная лазерная коагуляция сетчатки с помощью ОКТ-картирования // Вестник офтальмологии. – 2016. – Т. 132. – № 3. – С. 56–60. [Boyko EV, Mal’tsev DS. En face’ optical coherence tomography guided focal navigated laser photocoagulation. Annals of ophthalmology. 2016;132(3):56-60. (In Russ.)]. https://doi.org/10.17116/oftalma2016132356- 60.</mixed-citation></ref><ref id="B5"><label>5.</label><mixed-citation>Maltsev DS, Kulikov AN, Chhablani J. Clinical application of fluorescein angiography-free navigated focal laser photocoagulation in central serous chorioretinopathy. Ophthalmic Surg Lasers Imaging Retina. [In Press]</mixed-citation></ref><ref id="B6"><label>6.</label><mixed-citation>Xiang D, Tian H, Yang X, et al. Automatic segmentation of retinal layer in OCT images with choroidal neovascularization. IEEE Trans Image Process. 2018;27(12):5880-5891. https://doi.org/10.1109/TIP.2018.2860255.</mixed-citation></ref><ref id="B7"><label>7.</label><mixed-citation>Khalid S, Akram MU, Hassan T, et al. Fully automated robust system to detect retinal edema, central serous chorioretinopathy, and age related macular degeneration from optical coherence tomography images. Biomed Res Int. 2017;2017:7148245. https://doi.org/10.1155/2017/7148245.</mixed-citation></ref><ref id="B8"><label>8.</label><mixed-citation>Wu M, Fan W, Chen Q, et al. Three-dimensional continuous max flow optimization-based serous retinal detachment segmentation in SD-OCT for central serous chorioretinopathy. Biomed Opt Express. 2017;8(9):4257-4274. https://doi.org/10.1364/BOE.8.004257.</mixed-citation></ref><ref id="B9"><label>9.</label><mixed-citation>Ronneberger O, Fischer P, Brox T. U-Net: Convolutional networks for biomedical image segmentation. In: Medical image computing and computer-assisted intervention – MICCAI 2015. MICCAI 2015. Lecture notes in computer science. Vol. 9351. Ed. by N. Navab, J. Hornegger, W. Wells, A. Frangi. Cham: Springer; 2015. https://doi.org/10.1007/978-3-319-24574-4_28.</mixed-citation></ref></ref-list></back></article>
