Common hamster (Cricetus cricetus L., 1758, Cricetidae, Rodentia) in Moscow City: genetic structure, conservation status

封面

如何引用文章

全文:

开放存取 开放存取
受限制的访问 ##reader.subscriptionAccessGranted##
受限制的访问 订阅或者付费存取

详细

The habitat conditions and genetic structure of the native population of the common hamster in Moscow, listed in the 3rd edition of the Red Data Book of Moscow City with the status 3 (vulnerable in the city), are described. Information about the presence of the common hamster in Moscow dates back to the end of the XIX century. Over the past 50 years, the Moscow population is noted to have sharply declined in abundance and has survived only along the Yazvenka River and the banks of the Borisov ponds. These areas are separated by a distance of 6 km. The genetic differences between these subpopulations are 14.6%. The diversity of the Moscow subpopulations is reduced both in mitochondrial DNA (there are only two mtDNA haplotypes in the city (in the cytochrome b gene + control region)) and in microsatellite markers. When analyzing 10 microsatellite loci in the Moscow population, 23 alleles were found. This is two to three times lower than in the populations of the common hamster in Astana, Simferopol and Kislovodsk. Haplotypes of the Moscow population together with those of the hamsters from the Tula and Vladimir regions form a well-supported clade on the phylogenetic tree. Genetic analysis of Moscow subpopulations of the common hamster confirms the adequacy of including this species in the Red Data Book of the Moscow City.

全文:

受限制的访问

作者简介

N. Feoktistova

Severtsov Institute of Ecology and Evolution, Russian Academy of Sciences

编辑信件的主要联系方式.
Email: feoktistovanyu@gmail.com
俄罗斯联邦, Leninsky pr., 33, Moscow, 119071

I. Meschersky

Severtsov Institute of Ecology and Evolution, Russian Academy of Sciences

Email: meschersky@rambler.ru
俄罗斯联邦, Leninsky pr., 33, Moscow, 119071

S. Meschersky

Severtsov Institute of Ecology and Evolution, Russian Academy of Sciences

Email: nervaner6892236@gmail.com
俄罗斯联邦, Leninsky pr., 33, Moscow, 119071

Т. Karmanova

Severtsov Institute of Ecology and Evolution, Russian Academy of Sciences

Email: karmanovs94@mail.ru
俄罗斯联邦, Leninsky pr., 33, Moscow, 119071

P. Bogomolov

Severtsov Institute of Ecology and Evolution, Russian Academy of Sciences

Email: bogomolov.pl@gmail.com
俄罗斯联邦, Leninsky pr., 33, Moscow, 119071

A. Surov

Severtsov Institute of Ecology and Evolution, Russian Academy of Sciences

Email: surov@sevin.ru
俄罗斯联邦, Leninsky pr., 33, Moscow, 119071

参考

  1. Карасева Е. В., Телицына А. Ю., Самойлов Б. Л., 1999. Млекопитающие Москвы в прошлом и настоящем. М.: Наука. 246 с.
  2. Косолапова М. В., Шварц Е. А., Дубинина Н. В., 1978. Обыкновенный хомяк в Москве. Растительность и животное население Москвы и Подмосковья. М.: Изд-во МГУ. С. 32–33.
  3. Красная книга города Москвы, 2001. Отв. ред. Б. Л. Самойлов, Г. В. Морозова. М.
  4. Красная книга города Москвы, 2022. Отв. ред. Н. А. Соболев. М.: Департамент природопользования и охраны окружающей среды. 846 с.
  5. Огнев С. И., 1913. Fauna Mosquensis. Опыт описания фауны Московской губернии. Т. 1. Млекопитающие. Ч. 1. Chiroptera, Insectivora, Rodentia. М.: Изд. Комиссии по исслед. фауны Моск. губерн. 310 с.
  6. Паровщиков В. Я., 1941. Очерк фауны Тимирязевской c/х академии // Всероссийское общество охраны природы. Т. 8. Ч. 2. С. 304–310.
  7. Сатунин К. А., 1895. Позвоночные Московской губернии // Известия Общества любителей естествознания, антропологии и этнографии. Т. 36. Вып. 1. Млекопитающие. С. 3–16.
  8. Судейкин В. А., Ляпунова К. Л., Тихомиров С. И., 1972. Случай размножения обыкновенного хомяка (Cricetus cricetus) на территории города Москвы // Зоологический журнал. Т. 51. № 8. С. 1258–1259.
  9. Суров А. В., Карманова Т. Н., Кацман Е. А., Зайцева Е. А., Феоктистова Н. Ю., 2023. От агрофила к синурбисту: как обыкновенный хомяк (Cricetus cricetus) осваивает городскую среду // Зоологический журнал. Т. 102. № 4. С. 453–465.
  10. Суров А. В., Поплавская Н. C., Богомолов П. Л., Кропоткина М. В., Товпинец Н. Н., Кацман Е. А., Феоктистова Н. Ю., 2015. Синурбанизация обыкновенного хомяка (Cricetus cricetus L., 1758) // Российский журнал биологических инвазий. № 4. С. 105–117.
  11. Суров А. В., Феоктистова Н. Ю., 2023. Обыкновенный хомяк (Cricetus cricetus Linnaeus, 1758). Серия “Виды фауны России и сопредельных стран”. М.: РАН. 312 с.
  12. Телицына А. Ю., Карасева Е. В., Степанова Н. В., Суров А. В., 1994. Обыкновенный хомяк в Москве. Сб. Синантропия грызунов М.: ИЭМЭЖ РАН. С. 60–76.
  13. Феоктистова Н. Ю., Мещерский И. Г., Богомолов П. Л., Мещерский С. И., Кацман Е. А., Пельгунова Л. А., Поташникова Е. В., Суров А. В., 2020. Непреднамеренно поставленный эксперимент – заселение вновь созданного городского парка видом-синурбистом обыкновенным хомяком Cricetus cricetus L., 1758 // Известия Академии наук. Серия биологическая. № 2. С. 224–232.
  14. Феоктистова Н. Ю., Мещерский И. Г., Богомолов П. Л., Мещерский С. И., Поплавская Н. С., Чунков М. М., Юферева В. В., Тельпов В. А., Суров А. В., 2019. Обыкновенный хомяк (Cricetus cricetus) в Предкавказье: генетическая структура городских и пригородных популяций // Генетика. Т. 55. № 3. С. 337–348.
  15. Феоктистова Н. Ю., Мещерский И. Г., Суров А. В., Богомолов П. Л., Товпинец Н. Н., Поплавская Н. С., 2016. Генетическая структура городской популяции обыкновенного хомяка (Cricetus cricetus) // Генетика. Т. 52. № 2. С. 221–230.
  16. Цалкин В. И., Борисоглебская М. Б., 1967. Млекопитающие Москвы и Подмосковья на рубеже нашей эры. “Животное население Москвы и Подмосковья, его изучение, охрана и направленное преобразование” 27–28 апреля 1967 г. М. С. 7–9.
  17. Alberti M., Correa C., Marzluff J. M., Hendry A. P., Palkovacs E. P., Gotanda K. M., Hunt V. M., Apgar T. M., Zhou Y., 2017. Global urban signatures of phenotypic change in animal and plant populations // Proceedings of the National Academy of Sciences. V. 114. № 34. P. 8951–8956.
  18. Alberti M., Palkovacs E. P., Roches S. D., Meester L. D., Brans K. I., Govaert L., Grimm N. B., Harris N. C., Hendry A. P., Schell C. J., 2020. The complexity of urban eco-evolutionary dynamics // BioScience. V. 70. № 9. P. 772–793.
  19. Banaszek A., Bogomolov P., Feoktistova N., La Haye M. J.J., Monecke S., Reiners T. E., Rusin M., Surov A., Weinhold U., Ziomek J., 2020. Cricetus cricetus // The IUCN Red List of Threatened Species. P. 1–15. https://dx.doi.org/10.2305/IUCN.UK.2020-2.RLTS.T5529A111875852.en
  20. Chiappero M., Panzetta-Dutari G.M., Gomez M., Castillo E., Polop J., Gardenal C., 2011. Contrasting genetic structure of urban and rural populations of the wild rodent Calomys musculinus (Cricetidae, Sigmodontinae) // Mammalian Biology – Zeitschrift für Säugetierkunde. V. 76. P. 41–50.
  21. Earl D., von Holdt B., 2012. STRUCTURE HARVESTER: a website and program for visualizing STRUCTURE output and implementing the Evanno method, 2011 // Saatavilla: http://taylor0. biology. ucla. edu/struct_harvest
  22. Evanno G., Regnaut S., Goudet J., 2005. Detecting the number of clusters of individuals using the software STRUCTURE: a simulation study // Molecular Ecology. V. 14. № 8. P. 2611–2620.
  23. Excoffier L., Laval G., Schneider S., 2005. Arlequin (version 3.0): an integrated software package for population genetics data analysis // Evolutionary Bioinformatics. V. 1. 117693430500100003.
  24. Feoktistova N. Y., Meschersky I. G., Shenbrot G. I., Puzachenko A. Y., Meschersky S. I., Bogomolov P. L., Surov A. V., 2023. Phylogeography of the common hamster (Cricetus cricetus): paleoclimatic reconstructions of Late Pleistocene colonization // Integr. Zool. V. 18. № 3. P. 581–599.
  25. Gortat T., Rutkowski R., Gryczyńska-Siemiątkowska A., Kozakiewicz A., Kozakiewicz M., 2013. Genetic structure in urban and rural populations of Apodemus agrarius in Poland // Mamm. Biol. № 78. P. 171–177.
  26. Goudet J., 2001. FSTAT Ver. 2.9.3, a program to estimate and test gene diversities and fixation indices. http://www.unil.ch/izea/ softwares/fstat.html
  27. Kajdacsi B., Costa F., Hyseni C., Porter F., Brown J., Rodrigues G., Farias H., Reis M., Childs J., Ko A., A. C., 2013. Urban population genetics of slum dwelling rats (Rattus norvegicus) in Salvador, Brazil // Molecular Ecology. V. 22. P. 5056–5070.
  28. Katzman E. A., Zaytseva E. A., Feoktistova N. Y., Tovpinetz N. N., Bogomolov P. L., Potashnikova E. V., Surov A. V., 2018. Seasonal changes in burrowing of the Common hamster (Cricetus crictus L., 1978) (Rodentia: Cricetidae) in the city // Поволжский экологический журнал. № 3. С. 251–258.
  29. Li Y-L., Liu J-X., 2018. STRUCTURE SELECTOR: A web-based software to select and visualize the optimal number of clusters using multiple methods // Mol. Ecol. Resour. № 8. P. 76–177. https://doi.org/10.1111/1755-0998
  30. Munshi-South J., 2012. Urban landscape genetics: canopy cover predicts gene flow between white-footed mouse (Peromyscus leucopus) populations in New York City // Molecular Ecology. V. 21. № 6. P. 1360–1378.
  31. Munshi-South J., Nagy C., 2014. Urban park characteristics, genetic variation, and historical demography of white-footed mouse (Peromyscus leucopus) populations in New York City // Peer J. V. 2. P. 310–315.
  32. Neumann K., Jansman H., 2004. Polymorphic microsatellites for the analysis of endangered common hamster populations (Cricetus cricetus L.) // Conservation Genetics. V. 5. № 1. P. 127–130.
  33. Pritchard J. K., Stephens M., Donnelly P., 2000. Inference of population structure using multilocus genotype data // Genetics. V. 155. P. 945–959.
  34. Schilthuizen M., 2018. Darwin comes to towns. How the Urban Jungle Drives Evolution. London Quercus Edition Ltd. 344 p.
  35. Surov A., Banaszek A., Bogomolov P., Feoktistova N., Monecke S., 2016. Dramatic global decrease in the range and reproduction rate of the European hamster Cricetus cricetus // Endangered Species Research. V. 31. P. 119–145.

补充文件

附件文件
动作
1. JATS XML
下载
2. Fig. 1. Map of the city of Moscow: 1 - Vorobyovy Gory, 2 - Kuskovsky forest park (Perovo station), 3 - Forest dacha of the Timiryazev Agricultural Academy, 4 - Floodplain of the Setun River between the Davydkovo and Matveyevskoye microdistricts, 5 - Lyublinskie filtration fields, 6 - Kuryanovskaya aeration station, 7 - Golosov ravine (Kolomenskoye), 8 - Yazvenka river (Tsaritsyno), 9 - Borisovskie ponds, 10 - Bykovo workers' settlement.

下载 (334KB)
索引源数据
3. Fig. 2. Median network of haplotypes of common hamsters living in Moscow, Tula, Pavlovsk (Vladimir region) and Ryazan.

下载 (65KB)
索引源数据
4. Fig. 3. Variants of assessing the probability of assigning individuals of four urban populations to different genetic clusters based on the results of analysis in the Structure program using the No Admixture model. A – for the assumption of the existence of 8 (K = 8), B – for the assumption of the existence of 11 (K = 11) genetic clusters in the combined sample. Each column corresponds to one animal. Urban populations: 1 – Moscow, 2 – Simferopol, 3 – Kislovodsk, 4 – Astana. The ordinate axis shows the probability of assignment to a cluster.

下载 (190KB)
索引源数据

版权所有 © Russian Academy of Sciences, 2025