Диагностика COVID-19. Способы и проблемы обнаружения вируса SARS-CoV-2 в условиях пандемии


Цитировать

Полный текст

Открытый доступ Открытый доступ
Доступ закрыт Доступ предоставлен
Доступ закрыт Доступ платный или только для подписчиков

Аннотация

По мере того, как продолжается пандемия COVID-19 и тестирование на SARS-CoV-2 становится все более доступным, появляются новые вопросы и проблемы в отношении нового вируса. Когда проводить тестирование? Кого тестировать? Как часто? И что делать с полученными результатами? Какие виды тестов имеются сейчас в наличии, и при каких обстоятельствах они могут оказаться полезными? Понимание вопросов организации тестирования на местном, региональном, государственном и национальном уровнях позволит оптимизировать проведение тестирования. В статье проведен обзор имеющихся тестов и то, как они могут быть полезны в условиях быстро меняющейся и никогда ранее не существовавшей ситуации.

Полный текст

Доступ закрыт

Об авторах

Д. А Кудлай

Первый МГМУ им. И.М. Сеченова Минздрава России (Сеченовский Университет); Государственный научный центр «Институт иммунологии» ФМБА России

доктор медицинских наук, профессор Москва

Я. Е Широбоков

Самарский государственный медицинский университет

Е. П Гладунова

Самарский государственный медицинский университет

доктор фармацевтических наук, профессор

Е. А Бородулина

Самарский государственный медицинский университет

Email: borodulinbe@yandex.ru
доктор медицинских наук, профессор

Список литературы

  1. Самородская И.В., Ларина В.Н., Назимкин К.Е. и др. Организационные и клинические проблемы диагностики COVID-19 на амбулаторном этапе. Врач. 2020; 31 (5): 23-30 https://doi.org/10.29296/25877305-2020-05-05
  2. Cascella M., Rajnik M., Cuomo A. et al. Features, Evaluation and Treatment Coronavirus (COVID-19). StatPearls: StatPearls Publishing, 2020. URL: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK554776/
  3. Sullivan P.S., Sailey C., Guest J.L. et al. Detection of SARS-CoV-2 RNA and Antibodies in Diverse Samples: Protocol to Validate the Sufficiency of Provider-Observed, Home-Collected Blood, Saliva, and Oropharyngeal Samples. JMIR Public Health Surveill. 2020; 6 (2): e19054. doi: 10.2196/19054
  4. Sanduzzi A., Zamparelli S.S. Nasopharyngeal and oropharyngeal swabs, and/or serology for SARS COVID-19: What are we looking for? Int J Environ Res Public Health. 2020; 17 (9): 3289. doi: 10.3390/ijerph17093289
  5. Testing for COVID-19 I CDC [Electronic resource]. URL: https://www.cdc.gov/coronavirus/2019-ncov/symptoms-testing/testing.html (accessed: 19.07.2020).
  6. Interim Guidelines for Clinical Specimens for COVID-19 I CDC [Electronic resource]. URL: https://www.cdc.gov/coronavirus/2019-nCoV/lab/guidelines-clinical-specimens.html (accessed: 16.06.2020).
  7. Udugama B. et al. Diagnosing COVID-19: The Disease and Tools for Detection. ACS Nano. 2020; 14 (4): 3822-35. doi: 10.1021/acsnano.0c02624
  8. Patel R. et al. Report from the American Society for Microbiology COVID-19 International Summit, 23 march 2020: Value of diagnostic testing for SARS-CoV-2/ COVID-19. mBio. 2020; 11 (2): e00722-20. doi: 10.1128/mBio.00722-20
  9. Winichakoon P. et al. Negative nasopharyngeal and oropharyngeal swabs do not rule out COVID-19. J Clin Microbiol. 2020; 58 (5): e00297-20. doi: 10.1128/JCM.00297-20
  10. CDC. Updated Interim Guidelines for Collecting, Handling, and Testing Clinical Specimens from Persons Under Investigation (PUIs) for Coronavirus Disease 2019 (COVID-19). URL: https://www.cdc.gov/csels/dls/locs/2020/updated_interim_pui_guidelines_for_covid-19.html
  11. Wang X. et al. Comparison of nasopharyngeal and oropharyngeal swabs for SARS-CoV-2 detection in 353 patients received tests with both specimens simultaneously. Int J Infect Dis. 2020; 94: 107-9. doi: 10.1016/j.ijid.2020.04.023
  12. Lin C. et al. Comparison of throat swabs and sputum specimens for viral nucleic acid detection in 52 cases of novel coronavirus (SARS-Cov-2)-infected pneumonia (COVID-19). Clin Chem Lab Med. 2020; 58 (7): 1089-94. doi: 10.1515/cclm-2020-0187
  13. Pan Y. et al. Viral load of SARS-CoV-2 in clinical samples. Lancet. Infect Dis. 2020; 20 (4): 411-2. doi: 10.1016/S1473-3099(20)30113-4
  14. Yang Y. et al. Evaluating the accuracy of different respiratory specimens in the laboratory diagnosis and monitoring the viral shedding of 2019-nCoV infections. medRxiv. 2020. https://doi.org/10.1101/2020.02.11.20021493
  15. Kashir J., Yaqinuddin A. Loop mediated isothermal amplification (LAMP) assays as a rapid diagnostic for COVID-19. Med Hypotheses. 2020; 141: 109786. doi: 10.1016/j.mehy.2020.109786
  16. Старшинова А.А., Кушнарева Е.А., Малкова А.М. и др. Новая коронавирусная инфекция: особенности клинического течения, возможности диагностики, лечения и профилактики инфекции у взрослых и детей. Вопросы современной педиатрии. 2020; 19 (2): 123-31 https://doi.org/10.15690/vsp.v19i2.2105
  17. Zhong L. et al. Detection of serum IgM and IgG for COVID-19 diagnosis. Sci China Life Sci. 2020: 1-4. doi: 10.1007/s11427-020-1688-9
  18. Notomi T., Okayama H., Masubuchi H. et al. Loop-Mediated Isothermal Amplification Of DNA. Nucleic Acids Res. 2000; 28 (12): E63. DOI: 10.1093/ nar/28.12.e63
  19. Treibel T.A. et al. COVID-19: PCR screening of asymptomatic health-care workers at London hospital. Lancet. 2020; 395 (10237): 1608-10. doi: 10.1016/S0140-6736(20)31100-4
  20. Corman V.M. et al. Detection of 2019 novel coronavirus (2019-nCoV) by real-time RT-PCR. Euro Surveill. 2020; 25 (3): 2000045. doi: 10.2807/1560-7917. ES.2020.25.3.2000045
  21. Chu D.K.W. et al. Molecular Diagnosis of a Novel Coronavirus (2019-nCoV) Causing an Outbreak of Pneumonia. Clin Chem. 2020; 66 (4): 549-55. doi: 10.1093/clinchem/hvaa029
  22. Lu R. et al. Genomic characterisation and epidemiology of 2019 novel coronavirus: implications for virus origins and receptor binding. Lancet. 2020; 395 (10224): 565-74. doi: 10.1016/S0140-6736(20)30251-8
  23. Castro R. et al. COVID-19: a meta-analysis of diagnostic test accuracy of commercial assays registered in Brazil. Brazilian J Infect Dis. 2020; 24 (2): 180. doi: 10.1016/j.bjid.2020.04.003
  24. Bao L. et al. Lack of Reinfection in Rhesus Macaques Infected with SARS-CoV-2 Beijing Key Laboratory for Animal Models of Emerging and Remerging Infectious. bioRxiv. 2020. https://doi.org/10.1101/2020.03.13.990226
  25. Guan W. et al. Clinical characteristics of coronavirus disease 2019 in China. N Engl J Med. 2020; 382 (18): 1708-20. doi: 10.1056/NEJMoa2002032
  26. Zhang W. et al. Molecular and serological investigation of 2019-nCoV infected patients: implication of multiple shedding routes. Emerg Microbes Infect. 2020; 9 (1): 386-9. doi: 10.1080/22221751.2020.1729071
  27. Xiang J. et al. Evaluation of Enzyme-Linked Immunoassay and Colloidal Gold- Immunochromatographic Assay Kit for Detection of Novel Coronavirus (SARS-Cov-2) Causing an Outbreak of Pneumonia (COVID-19). medRxiv. 2020. https://doi.org/10.1101/2020.02.27.20028787
  28. Yu H-qiong, Sun B-qing, Fang Z-fu et al. Distinct features of SARS-CoV-2-specific IgA response in COVID-19 patients. Eur Respir J. 2020; In press. https://doi.org/10.1183/13993003.01526-2020
  29. Marimuthu Y., Nagappa B., Sharma N. et al. COVID-19 and tuberculosis: A mathematical model based forecasting in Delhi, India. Indian J Tuberc. 2020; 67 (2): 177-81. doi: 10.1016/j.ijtb.2020.05.006
  30. Mohsen Rokni, Vida Ghasemi, Zahra Tavakoli. Immune responses and pathogenesis of SARS-CoV-2 during an outbreak in Iran: Comparison with SARS and MERS. Rev Med Virol. 2020; 30 (3): е2107. doi: 10.1002/rmv.2107
  31. Временные методические рекомендации по оказанию противотуберкулезной помощи в условиях пандемии новой коронавирусной инфекции (COVID-19) от 28.04.2020 утвержденные президиумом Российского общества фтизиатров и президиумом Ассоциации фтизиатров. Режим доступа: [Электронный ресурс]. URL: http://phtiziatr.iopd.ru/images/Clinic_Recomend/Pril_597_290420.pdf
  32. Слогоцкая Л.В., Синицын М.В., Кудлай Д.А. Возможности иммунологических тестов в диагностике латентной туберкулезной инфекции и туберкулеза. Туберкулез и болезни легких. 2019; 97 (11): 46-58 doi: 10.21292/2075-1230-2019-97-11-46-58
  33. Foudeh A.M. et al. Microfluidic designs and techniques using lab-on-a-chip devices for pathogen detection for point-of-care diagnostics. Lab on a Chip. Royal Society of Chemistry. 2012; 12 (18): 3249-66. doi: 10.1039/c2lc40630f

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML
Скачать

© ИД "Русский врач", 2020