Visualization of data using the R programming language for repeated measurements in three observation groups

V. B. Grinevich; Гриневич В. Б.; G. F. Bunenkova; Буненкова Г. Ф.; D. Yu. Ivkin; Ивкин Д. Ю.; R. G. Guseinov; Гусейнов Р. Г.; V. V. Perepelitsa; Перепелица В. В.; I. A. Zavyalov; Завьялов И. А.; S. V. Popov; Попов С. В.; A. A. Karpov; Карпов А. А.; N. S. Bunenkov; Буненков Н. С.

doi:10.29296/25877305-2025-02-05

Визуализация данных с помощью языка программирования R при повторных измерениях в трех группах наблюдения

Авторы: Гриневич В.Б.¹, Буненкова Г.Ф.¹, Ивкин Д.Ю.², Гусейнов Р.Г.³^,4^,5, Перепелица В.В.³^,4, Завьялов И.А.⁵, Попов С.В.¹^,3^,4, Карпов А.А.⁶^,7, Буненков Н.С.³^,6^,8
Учреждения:
1. Военно-медицинская академия им. С.М. Кирова Минобороны России
2. Санкт-Петербургский химико-фармацевтический университет Минздрава России
3. Клиническая больница Святителя Луки Минздрава России
4. Санкт-Петербургский медико-социальный институт
5. Санкт-Петербургский государственный университет
6. Национальный медицинский исследовательский центр им. В.А. Алмазова Минздрава России
7. Санкт-Петербургский государственный электротехнический университет «ЛЭТИ» им. В.И. Ульянова (Ленина)
8. Первый Санкт-Петербургский государственный медицинский университет им. И.П. Павлова Минздрава России
Выпуск: Том 36, № 2 (2025)
Страницы: 27-31
Раздел: Из практики
URL: https://journals.eco-vector.com/0236-3054/article/view/678167
DOI: https://doi.org/10.29296/25877305-2025-02-05
ID: 678167

Цитировать

Полный текст

Открытый доступ
Доступ закрыт

Доступ предоставлен
Доступ закрыт

Доступ платный или только для подписчиков

Аннотация
Полный текст
Об авторах
Список литературы
Дополнительные файлы
Статистика

Аннотация

Задача статистической обработки данных и их представления не является сложной для специалистов в области статистики, однако может потребовать достаточно много времени и усилий от начинающих специалистов. В статье представлено преобразование базы данных, включающее транспозицию строк и столбцов с последующей визуализацией данных с использованием языка программирования R.

Ключевые слова

язык программирования R, визуализация данных, повторные измерения

Полный текст

Об авторах

В. Б. Гриневич

Военно-медицинская академия им. С.М. Кирова Минобороны России

Email: gulnara533@gmail.com
SPIN-код: 1178-0242

доктор медицинских наук, профессор

Россия, Санкт-Петербург

Список литературы

Есипова О.Ю., Богданов В.К., Есипов А.С. и др. Разработка нового малообъемного оксигенатора и создание гидродинамического стенда для ex vivo перфузии легких на мелких животных. Вестник трансплантологии и искусственных органов. 2023; 25 (3): 106–12 [Esipova O.Y., Bogdanov V.K., Esipov A.S. et al. Development of a new low-volume oxygenator and creation of a hydrodynamic test bench for ex vivo lung perfusion in small animals. Russian Journal of Transplantology and Artificial Organs. 2023; 25 (3): 106–12 (in Russ.)]. doi: 10.15825/1995-1191-2022-2-94-101
Готье С.В., Цирульникова О.М., Пашков И.В. и др. Нормотермическая ex vivo перфузия изолированных легких в эксперименте с использованием отечественного перфузионного аппаратного комплекса. Вестник трансплантологии и искусственных органов. 2022; 24 (2): 94–101 [Gautier S.V., Tsirulnikova O.M., Pashkov I.V. et al. Normothermic ex vivo perfusion of isolated lungs in an experiment using a russian-made perfusion system. Russian Journal of Transplantology and Artificial Organs. 2022; 24 (2): 94–101 (in Russ.)]. doi: 10.15825/1995-1191-2022-2-94-101
Готье С.В., Пашков И.В., Богданов В.К. и др. Ex vivo перфузия донорских легких с использованием разработанного раствора с последующей ортотопичеcкой левосторонней трансплантацией легкого (экспериментальное исследование). Вестник трансплантологии и искусственных органов. 2023; 25 (2): 158–66 [Gautier S.V., Pashkov I.V., Bogdanov V.K. et al. Normothermic ex vivo lung perfusion using a developed solution followed by orthotopic left lung transplantation (experimental study). Russian Journal of Transplantology and Artificial Organs. 2023; 25 (2): 158–66 (in Russ.)]. doi: 10.15825/1995-1191-2023-2-158-166
Комок В.В., Буненков Н.С., Белый С.А. и др. Оценка эффективности комбинированного лечения ишемической болезни сердца – аортокоронарное шунтирование, трансплантация аутологичных мононуклеаров костного мозга: Результаты рандомизированного, слепого, плацебо контролируемого исследования. Вестник трансплантологии и искусственных органов. 2019; 21 (4): 54–66 [Komok V.V., Bunenkov N.S., Beliy S.A. et al. Evaluation of the effectiveness of combined treatment of coronary heart disease – coronary artery bypass grafting, transplantation of autologous bone marrow mononuclear cells: a randomized, double-blind, placebo-controlled study. Russian Journal of Transplantology and Artificial Organs. 2019; 21 (4): 54–66 (in Russ.)]. doi: 10.15825/1995-1191-2019-4-54-66
Комок В.В., Буненков Н.С., Белый С.А. и др. Оценка безопасности трансплантации аутологичных мононуклеаров костного мозга в комбинированном лечении ишемической болезни сердца результаты рандомизированного, слепого, плацебо контролируемого исследования (TAMIS). Вестник трансплантологии и искусственных органов. 2019; 21 (2): 112–20 [Komok V.V., Bunenkov N.S., Beliy S.A. et al. Assessment of safety of additional transplantation of autologous bone marrow mononuclear cells in the combined treatment of coronary heart disease. Results from a randomized, blind, placebo-controlled trial (TAMIS). Russian Journal of Transplantology and Artificial Organs. 2019; 21 (2): 112–20 (in Russ.)]. doi: 10.15825/1995-1191-2019-2-112-120
Готье С.В., Цирульникова О.М., Пашков И.В. и др. Оценка эффективности разработанного перфузионного раствора для нормотермической ex vivo перфузии легких по сравнению со Steen Solution™ (экспериментальное исследование). Вестник трансплантологии и искусственных органов. 2021; 23 (3): 82–9 [Gautier S.V., Tsirulnikova O.M., Pashkov I.V. et al. Evaluation of the efficacy of a novel perfusion solution for normothermic ex vivo lung perfusion compared with Steen solution™ (animal experimental study). Russian Journal of Transplantology and Artificial Organs. 2021; 23 (3): 82–9 (in Russ.)]. doi: 10.15825/1995-1191-2021-3-82-89
Буненков Н.С., Буненкова Г.Ф., Комок В.В. и др. SAS Enterprise Guide 6.1 для врачей: сравнение групп. Медицинский академический журнал. 2019; 19 (4): 33–40 [Bunenkov N.S., Bunenkova G.F., Komok V.V. et al. SAS Enterprise Guide 6.1 for physicians: multiple comparisons. Medical academic journal. 2019; 19 (4): 33–40 (in Russ.)]. doi: 10.17816/MAJ17736
Буненков Н.С., Буненкова Г.Ф., Комок В.В. и др. SAS Enterprise Guide 6.1 для врачей: корреляционный анализ. Медицинский академический журнал. 2020; 20 (1): 51–6 [Bunenkov N.S., Bunenkova G.F., Komok V.V. et al. SAS Enterprise Guide 6.1 for physicians: correlation analysis. Medical academic journal. 2020; 20 (1): 51–6 (in Russ.)]. doi: 10.17816/MAJ17737
Буненков Н.С., Буненкова Г.Ф., Белый С.А. и др. SAS Enterprise Guide 6.1 для врачей: начало работы. Медицинский академический журнал. 2019; 19 (3): 27–36 [Bunenkov N.S., Bunenkova G.F., Beliy S.A. et al. SAS Enterprise Guide 6.1 for physicians: getting started. Medical academic journal. 2019; 19 (3): 27–36 (in Russ.)]. doi: 10.17816/MAJ19327-36
Буненков Н.С., Буненкова Г.Ф., Комок В.В. и др. SAS Enterprise guide 6.1: cравнение независимых групп по качественным признакам. Медицинский академический журнал. 2020; 20 (1): 89–98 [Bunenkov N.S., Bunenkova G.F., Komok V.V. et al. Sas enterprise guide 6.1: independent groups comparison for nominal data. Medical academic journal. 2020; 20 (3): 89–98 (in Russ.)]. doi: 10.17816/MAJ34127
Буненков Н.С., Буненкова Г.Ф., Комок В.В. и др. Оценка прогностического значения биомаркера и определение его верхней границы нормы. Медицинский академический журнал. 2020; 20 (2): 79–86 [Bunenkov N.S., Bunenkova G.F., Komok V.V. et al. Evaluating of prognostic value of biomarker and upper reference limit calculating. Medical academic journal. 2020; 20 (2): 79–86 (in Russ.)]. doi: 10.17816/MAJ26271
Егошин В.Л., Иванов С.В., Саввина Н.В. и др. Визуализация исследовательских данных с использованием программной среды R. Экология человека. 2018; 25 (8): 52–64 [Egoshin V.L., Ivanov S.V., Savvina N.V. et al. Visualization of biomedical data using R. Human Ecology. 2018; 25 (8); 52–64 (in Russ.)]. doi: 10.33396/1728-0869-2018-8-52-64
Гржибовский А.М., Иванов С.В., Горбатова М.А. Однофакторный линейный регрессионный анализ с использованием программного обеспечения STATISTICA и SPSS. Наука и Здравоохранение. 2017; 2: 5–33 [Grjibovski A.M., Ivanov S.V., Gorbatova M.A. Univariate regression analysis using Statistica and SPSS software. Science and Healthcare. 2017; 2: 5–33 (in Russ.)].
Егошин В.Л., Саввина Н.В., Гржибовский А.М. Порядковая регрессия в программной среде R - краткие рекомендации для магистрантов и докторантов по специальности «Медицина» и «Общественное здравоохранение». West Kazakhstan medical journal. 2019; 3 (61): 145–53 [Egoshin V.L., Savvina N.V., Grzybowski A.M. Ordinal regression in the R software environment - brief recommendations for undergraduates and doctoral students in the specialty "Medicine" and "Public Health". West Kazakhstan medical journal. 2019; 3 (61): 145–53 (in Russ.)].
Кригер Е.А., Драчев С.Н., Митькин Н.А. и др. Расчет необходимого объема выборки с использованием программы G*POWER. Морская медицина. 2023; 8 (2): 111–25 [Krieger E.A., Drachev S.N., Mitkin N.A. et al. Sample size calculation using G*POWER software. Marine Medicine. 2023; 8 (2): 111–25 (in Russ.)]. doi: 10.22328/2413-5747-2023-9-2-111-125
Гржибовский А.М., Горбатова М.А., Наркевич А.Н. и др. Необходимый объем выборки для сравнения долей в двух независимых группах. Морская медицина. 2020; 6 (3): 76–83 [Grjibovski A.M., Gorbatova M.A., Narkevich A. N. et al. Required sample size for comparing proportions in two independent samples. Marine Medicine. 2020; 6 (3): 76–83 (in Russ.)]. doi: 10.22328/2413-5747-2020-6-3-76-83
Егошин В.Л., Саввина Н.В., Гржибовский А.М. Квантильная регрессия в программной среде R: краткие рекомендации для докторантов по специальности «Медицина» и «Общественное здоровье». West Kazakhstan medical journal. 2019; 4 (61): 194–202 [Egoshin V.L., Savvina N.V., Grzybowski A.M. Quantile regression in the r software environment: brief recommendations for doctoral students in the specialty "Medicine" and "Public Health". West Kazakhstan medical journal. 2019; 4 (61): 194–202 (in Russ.)].
Егошин В.Л., Саввина Н.В., Гржибовский А.М. Множественная логистическая регрессия для бинарной переменной отклика в программной среде R-краткие специальности «Медицина» и «Общественное здравоохранение». West Kazakhstan medical journal. 2019; 2 (61): 83–90 [Egoshin V.L., Savvina N.V., Grzybowski A.M. Multiple logistic regression for a binary response variable in the R software environment-short specialties "Medicine" and "Public Health". West Kazakhstan medical journal. 2019; 2 (61): 83–90 (in Russ.)].
Егошин В.Л., Саввина Н.В., Гржибовский А.М. Анализ главных компонент и факторный анализ в программной среде R. West Kazakhstan medical journal. 2020; 1 (62): 6–14 [Egoshin V.L., Savvina N.V., Grzybowski A.M. Analysis of the main components and factor analysis in the software environment R. West Kazakhstan medical journal. 2020; 1 (62): 6–14 (in Russ.)].
Егошин В.Л., Саввина Н.В., Гржибовский А.М. Анализ пропорциональных рисков в программной среде R: практические рекомендации для докторантов по специальности «Медицина» и «Общественное здоровье». West Kazakhstan medical journal. 2020; 2 (62): 95–103 [Egoshin V.L., Savvina N.V., Grzybowski A.M. Analysis of proportional risks in the R software environment: practical recommendations for doctoral students in the specialty "Medicine" and "Public Health". West Kazakhstan medical journal. 2020; 2 (62): 95–103 (in Russ.)].
Егошин В.Л., Иванов С.В., Саввина Н.В. и др. Корреляционный и простой линейный регрессионный анализ с использованием программной среды R. Экология человека. 2018; 25 (12): 55–64 [Egoshin V.L., Ivanov S.V., Savvina N.V. et al. Correlation and simple regression analysis using R. Human Ecology. 2018; 25 (12): 55–64 (in Russ.)]. doi: 10.33396/1728-0869-2018-12-55-64
Егошин В.Л., Иванов С.В., Саввина Н.В. и др. Основы работы в программной среде R при анализе исследовательских данных. Экология человека. 2018; 25 (7): 55–64 [Egoshin V.L., Ivanov S.V., Savvina N.V. et al. Basic principles of biomedical data analysis in R. Human Ecology. 2018; 25 (7): 55–64 (in Russ.)]. doi: 10.33396/1728-0869-2018-7-55-64
Егошин В.Л., Иванов С.В., Саввина Н.В. и др. Расчет показателей описательной статистики с использованием программной среды R. Экология человека. 2018; 25 (9): 55–64 [Egoshin V.L., Ivanov S.V., Savvina N.V. et al. Descriptive statistics using R. Human Ecology. 2018; 25 (9): 55–64 (in Russ.)]. doi: 10.33396/1728-0869-2018-9-55-64
Егошин В.Л., Иванов С.В., Саввина Н.В. и др. Анализ непрерывных данных с использованием программной среды R. Экология человека. 2018; 25 (11): 51–64 [Egoshin V.L., Ivanov S.V., Savvina N.V. et al. Analysis of continuous data using R. Human Ecology. 2018; 25 (11): 51–64 (in Russ.)]. doi: 10.33396/1728-0869-2018-11-51-64
Гржибовский А.М. Анализ номинальных данных (независимые наблюдения). Экология человека. 2008; 6 (10): 58–68 [Grjibovski A.M. Nominal data analysis (independent observations). Human Ecology. 2008; 6 (10): 58–68 (in Russ.)].
Гржибовский А.М. Типы данных, проверка распределения и описательная статистика. Экология человека. 2008; 1: 52–8 [Grjibovski A. M. Data types, control of distribution and descriptive statistics. Human Ecology. 2008; 1: 58–68 (in Russ.)].
Унгуряну Т.Н., Гржибовский А.М. Краткие рекомендации по описанию, статистическому анализу и представлению данных в научных публикациях. Экология человека. 2011; 5: 55–60 [Unguryanu T.N., Grjibovski A.M. Brief recommendations on description, analysis and presentation of data in scientific papers. Human Ecology. 2011; 5: 55–60 (in Russ.)].
Гржибовский А.М., Гвоздецкий А.Н. Интерпретация величины р и альтернативы ее использованию в биомедицинских исследованиях. Экология человека. 2022; 29 (3): 209–18 [Grjibovski A.M., Gvozdeckii A.N. Interpretation of and alternatives to p-values in biomedical sciences. Human Ecology. 2022; 29 (3): 67–76 (in Russ.)]. doi: 10.17816/humeco97249
Наркевич А.Н., Виноградов К.А., Гржибовский А.М. Множественные сравнения в биомедицинских исследованиях: проблема и способы решения. Экология человека. 2020; 27 (10): 55–64 [Narkevich A.N., Vinogradov K.A., Grjibovski A.M. Multiple comparisons in biomedical research: the problem and its solutions. Human Ecology. 2020; 27 (10): 55–64 (in Russ.)]. doi: 10.33396/1728-0869-2020-10-55-64
Гржибовский А.М., Горбатова М.А., Наркевич А.Н., и др. Объем выборки для корреляционного анализа. Морская медицина. 2020; 6 (3): 101–6 [Grjibovski A.M., Gorbatova M.A., Narkevich A.N. et al. Required sample size for correlation analysis. Marine Medicine. 2020; 6 (1): 101–6 (in Russ.)]. doi: 10.22328/2413-5747-2020-6-1-101-106
Егошин В.Л., Саввина Н.В., Гржибовский А.М. Множественная линейная регрессия в программной среде R-краткие рекомендации для магистрантов и докторантов по специальности «Медицина» и «Общественное здравоохранение». West Kazakhstan medical journal. 2019; 1 (61): 4–15 [Egoshin V.L., Savvina N.V., Grzybowski A.M. Multiple linear regression in the R software environment-brief recommendations for undergraduates and doctoral students in the specialty "Medicine" and "Public Health". West Kazakhstan medical journal. 2019; 1 (61): 4–15 (in Russ.)].