Визуализация корреляций с помощью тепловых карт в программной среде R
- Авторы: Гриневич В.Б.1, Буненкова Г.Ф.1, Саликова С.П.1, Егоров Д.В.1, Лазарева Ю.А.1, Петруков С.Н.1, Гусейнов Р.Г.2, Перепелица В.В.2, Буненков Н.С.3, Попов С.В.2
-
Учреждения:
- Военно-медицинская академия им. С.М. Кирова
- Клиническая больница Святителя Луки
- Первый Санкт-Петербургский государственный медицинский университет им. И.П. Павлова
- Выпуск: Том 35, № 10 (2024)
- Страницы: 34-36
- Раздел: Новое в медицине
- URL: https://journals.eco-vector.com/0236-3054/article/view/689501
- DOI: https://doi.org/10.29296/25877305-2024-10-07
- ID: 689501
Цитировать
Полный текст
Открытый доступ
Доступ предоставлен
Доступ платный или только для подписчиков
Аннотация
Последние десятилетия активно изучается роль биото-тканевого комплекса (микробиота) желудочно-кишечного тракта в поддержании гомеостаза и формировании патофизиологических нарушений. С развитием технологии секвенирования генома открываются новые возможности в исследовании этой области. На определенном этапе статистической обработки данных возникает необходимость выполнения корреляционного анализа. Однако при большом количестве показателей наглядное представление данных может вызвать затруднения. Тепловые карты корреляций позволяют графически отобразить большой объем данных. В рукописи представлен опыт обработки и графического представления корреляций в виде тепловых карт.
Ключевые слова
Полный текст
Об авторах
В. Б. Гриневич
Военно-медицинская академия им. С.М. Кирова
Email: gulnara533@gmail.com
доктор медицинских наук, профессор
Россия, Санкт-ПетербургГ. Ф. Буненкова
Военно-медицинская академия им. С.М. Кирова
Автор, ответственный за переписку.
Email: gulnara533@gmail.com
Россия, Санкт-Петербург
С. П. Саликова
Военно-медицинская академия им. С.М. Кирова
Email: gulnara533@gmail.com
доктор медицинских наук
Россия, Санкт-ПетербургД. В. Егоров
Военно-медицинская академия им. С.М. Кирова
Email: gulnara533@gmail.com
кандидат медицинских наук
Россия, Санкт-ПетербургЮ. А. Лазарева
Военно-медицинская академия им. С.М. Кирова
Email: gulnara533@gmail.com
Россия, Санкт-Петербург
С. Н. Петруков
Военно-медицинская академия им. С.М. Кирова
Email: gulnara533@gmail.com
Россия, Санкт-Петербург
Р. Г. Гусейнов
Клиническая больница Святителя Луки
Email: gulnara533@gmail.com
Россия, Санкт-Петербург
В. В. Перепелица
Клиническая больница Святителя Луки
Email: gulnara533@gmail.com
Россия, Санкт-Петербург
Н. С. Буненков
Первый Санкт-Петербургский государственный медицинский университет им. И.П. Павлова
Email: gulnara533@gmail.com
Россия, Санкт-Петербург
С. В. Попов
Клиническая больница Святителя Луки
Email: gulnara533@gmail.com
Россия, Санкт-Петербург
Список литературы
- Esipova O.Y., Bogdanov V.K., Esipov A.S. at al. Development of a new low-volume oxygenator and creation of a hydrodynamic test bench for ex vivo lung perfusion in small animals. Russian Journal of Transplantology and Artificial Organs. 2023; 25 (3): 106–12. doi: 10.15825/1995-1191-2023-3-106-112
- Gautier S.V., Tsirulnikova O.M., Pashkov I.V. at al. Normothermic ex vivo perfusion of isolated lungs in an experiment using a russian-made perfusion system. Russian Journal of Transplantology and Artificial Organs. 2022; 24 (2): 94–101. doi: 10.15825/1995-1191-2022-2-94-101
- Pashkov I.V., Gautier S.V., Bogdanov V.K., at al. Normothermic ex vivo lung perfusion using a developed solution followed by orthotopic left lung transplantation (experimental study). Russian Journal of Transplantology and Artificial Organs. 2023; 25 (2): 158–66. doi: 10.15825/1995-1191-2023-2-158-166
- Егошин В.Л., Иванов С.В., Саввина Н.В. и др. Визуализация исследовательских данных с использованием программной среды R. Экология человека. 2018; 8: 52–64 [Egoshin V.L., Ivanov S.V., Savvina N.V. et al. Visualization of Biomedical Data Using R. Human Ecology. 2018; 8: 52–64 (in Russ.)].
- Егошин В.Л., Иванов С.В., Саввина Н.В. и др. Расчет показателей описательной статистики с использованием программной среды R. Экология человека. 2018; 9: 55–64 [Egoshin V.L., Ivanov S.V., Savvina N.V. et al. Descriptive Statistics Using R. Human Ecology. 2018; 9: 55–64 (in Russ.)].
- Gautier S.V., Tsirulnikova O.M., Pashkov I.V. at al. Evaluation of the efficacy of a novel perfusion solution for normothermic ex vivo lung perfusion compared with Steen solution™ (animal experimental study). Russian Journal of Transplantology and Artificial Organs. 2021; 23 (3): 82–9. doi: 10.15825/1995-1191-2021-3-82-89
- Буненков Н.С., Буненкова Г.Ф., Комок В.В. и др. SAS Enterprise Guide 6.1 для врачей: сравнение групп. Медицинский академический журнал. 2019; 19 (4): 33–40 [Bunenkov N.S., Bunenkova G.F., Komok V.V. et al. SAS Enterprise Guide 6.1 for physicians: multiple comparisons. Medical academic journal. doi: 10.17816/MAJ17736 (in Russ.)].
- Буненков Н.С., Буненкова Г.Ф., Комок В.В., и др. SAS Enterprise Guide 6.1 для врачей: корреляционный анализ. Медицинский академический журнал. 2020; 20 (1): 51–6 [Bunenkov N.S., Bunenkova G.F., Komok V.V. et al. SAS Enterprise Guide 6.1 for physicians: correlation analysis. Medical academic journal. 2020; 20 (1): 51–6 (in Russ.)]. doi: 10.17816/MAJ17737
- Гржибовский А.М. Типы данных, проверка распределения и описательная статистика. Экология человека. 2008; 1: 52–8 [Grzybowski A.M. Data types, control of distribution and descriptive statistics. Human Ecology. 2008; 1: 52-8 (in Russ.)].
- Ким А.Д., Лепехова С.А., Чашкова Е.Ю. и др. Результаты оценки микробиоты в условиях экспериментального язвенного поражения толстой кишки анализ. Бюллетень сибирской медицины. 2021; 20 (1): 59–66 [Kim A.D., Lepekhova S.A., Chashkova E.Y. et al. Results of the microbiota assessment in experimental ulcerative colitis. Bulletin of Siberian Medicine. 2021; 20 (1): 59–66 (in Russ.)]. doi: 10.20538/1682-0363-2021-1-59-66
- Sung J., Rajendraprasad S.S., Philbrick K.L. et al. The human gut microbiome in critical illness: disruptions, consequences, and therapeutic frontiers. J Crit Care. 2024; 79: 154436. doi: 10.1016/j.jcrc.2023.154436
- Гржибовский А.М., Иванов С.В., Горбатова М.А. Корреляционный анализ данных с использованием программного обеспечения Statistica и SPSS. Наука и здравоохранение. 2017; 1: 7–36 [Grzhibovsky A.M., Ivanov S.V., Gorbatova M.A. Correlation analysis of data using Statistica and SPSS software. Science & Healthcare. 2017; 1: 7–36 (in Russ.)].
- Унгуряну Т.Н., Гржибовский А.М. Краткие рекомендации по описанию, статистическому анализу и представлению данных в научных публикациях. Экология человека. 2011; 5: 55–60 [Unguryanu T.N., Grjibovski A.M. Brief recommendations on description, analysis and presentation of data in scientific papers. Human Ecology. 2011; 5: 55–60 (in Russ.)].
- Егошин В.Л., Иванов С.В., Саввина Н.В. и др. Корреляционный и простой линейный регрессионный анализ с использованием программной среды R. Экология человека. 2018; 12: 55–64 [Egoshin V.L., Ivanov S.V., Savvina N.V. et al. Correlation and simple regression analysis using R. Human Ecology. 2018; 12: 55–64 (in Russ.)].
- Ушаков В.Г., Ушаков Н.Г. Критерии нормальности вероятностного распределения при округленных данных. Информатика и ее применение. 2023; 17 (1): 18–27 [Ushakov V.G., Ushakov N.G. Tests for normality of the probabilistic distribution when data are rounded. Informatics and Applications. 2023; 17 (1): 18–27 (in Russ.)]. doi: 10.14357/19922264230103
Дополнительные файлы
