Новые подходы к проведению пренатального скрининга хромосомной патологии: ДНК-скрининг по крови матери


Цитировать

Полный текст

Открытый доступ Открытый доступ
Доступ закрыт Доступ предоставлен
Доступ закрыт Доступ платный или только для подписчиков

Аннотация

Цель исследования. Оценка эффективности использования неинвазивного пренатального ДНК-скрининга анеуплоидий плода по крови матери в клинической практике. Материал и методы. Исследования осуществлялись в России на базе лабораторий ФГБУ НЦАГиП им. В.И. Кулакова Минздрава РФ и ФГБОУ МГУ им. М.В. Ломоносова. Производилось высокопроизводительное секвенирование внеклеточной ДНК периферической крови матери с последующим биоинформационным анализом. В исследование включены объединенные данные результатов валидации ДНК-скрининга анеуплоидий плода у 529 беременных женщин в сроке беременности 10-20 недель (медиана составила 14 недель). Первая выборка состояла из 259 женщин группы высокого риска, вторая - из 270 женщин с различным риском хромосомной патологии плода (177 беременных с низким и 93 с высоким риском). Оценку достоверности полученных результатов проводили с помощью данных о кариотипе плода и исходах беременностей. Проведено сравнение полученных результатов с литературными данными. Результаты исследования. Частота выявления анализируемых анеуплоидий в первой выборке составила 23,6%, тогда как во второй - всего 4,1%, что объясняется особенностями формирования групп. Установленные чувствительность, специфичность ДНК-скрининга приближаются к 100%. Наибольшие значения PPVдостигаются для выявления анеуплоидий по хромосомам 21 и 18, для половых хромосом и хромосомы 13 значения ниже. При содержании плодовой ДНК ниже порога чувствительности метода (около 4%) результаты ДНК-скрининга могут быть недостоверными. Полученные в ходе валидации результаты соответствуют литературным данным и свидетельствуют о том, что ДНК-скрининг по крови матери обладает значительно более высокими чувствительностью и специфичностью при выявлении анеуплоидий по 21, 18, 13-й и X-хромосомам по сравнению с применяемым в настоящее время комбинированным скринингом. Заключение. ДНК-скрининг может быть рекомендован для пренатального скрининга анеуплоидий по 21, 18, 13-й и X-хромосомам большинству беременных женщин. При проведении исследования является обязательным определение количества плодовой ДНК. Положительные результаты ДНК-скрининга требуют обязательного подтверждения с помощью инвазивных методов диагностики.

Полный текст

Доступ закрыт

Об авторах

Геннадий Тихонович Сухих

ФГБУ НЦАГиП им. академика В.И. Кулакова Минздрава России

Email: g_sukhikh@oparina4.ru
д.м.н., профессор, директор, академик РАН

Дмитрий Юрьевич Трофимов

ФГБУ НЦАГиП им. академика В.И. Кулакова Минздрава России

Email: d_trofimov@oparina4.ru
д.б.н., зав. лабораторией молекулярно-генетических методов

Илья Юрьевич Барков

ФГБУ НЦАГиП им. академика В.И. Кулакова Минздрава России

Email: i_barkov@oparina4.ru
врач лабораторный генетик лаборатории молекулярно-генетических методов

Андрей Евгеньевич Донников

ФГБУ НЦАГиП им. академика В.И. Кулакова Минздрава России

Email: a_donnikov@oparina4.ru
к.м.н. в.н.с. лаборатории молекулярно-генетических методов

Екатерина Сергеевна Шубина

ФГБУ НЦАГиП им. академика В.И. Кулакова Минздрава России

Email: e_shubina@oparina4.ru
лаборант-исследователь лаборатории молекулярно-генетических методов

Дмитрий Олегович Коростин

ФГБУ НЦАГиП им. академика В.И. Кулакова Минздрава России

Email: d_korostin@oparina4.ru
м.н.с. лаборатории молекулярно-генетических методов

Алексей Николаевич Екимов

ФГБУ НЦАГиП им. академика В.И. Кулакова Минздрава России

Email: aekimov@gmail.com
врач клинической лабораторной диагностики лаборатории молекулярно-генетических методов

Андрей Юрьевич Гольцов

ФГБУ НЦАГиП им. академика В.И. Кулакова Минздрава России

Email: g_goltsov@oparina4.ru
научный сотрудник лаборатории молекулярно-генетических методов

Владимир Анатольевич Бахарев

ФГБУ НЦАГиП им. академика В.И. Кулакова Минздрава России

Email: v_bakharev@oparina4.ru
д.м.н., профессор, зав. лабораторией репродуктивной генетики

Наталья Александровна Каретникова

ФГБУ НЦАГиП им. академика В.И. Кулакова Минздрава России

Email: n_karetnikova@oparina4.ru
д.м.н. в.н.с. лаборатории репродуктивной генетики

Павел Игоревич Боровиков

ФГБУ НЦАГиП им. академика В.И. Кулакова Минздрава России

Email: p_borovikov@oparina4.ru
зав. лабораторией биоинформатики

Нана Картлосовна Тетруашвили

ФГБУ НЦАГиП им. академика В.И. Кулакова Минздрава России

Email: tetrauly@mail.ru
д.м.н., профессор, зав. 2-м отделением акушерским патологии беременности

Людмила Викторовна Ким

ФГБУ НЦАГиП им. академика В.И. Кулакова Минздрава России

Email: kimika@list.ru
аспирант 2-е отделение акушерское патологии беременности

Альбина Сергеевна Гата

ФГБУ НЦАГиП им. академика В.И. Кулакова Минздрава России

Email: a_gata@oparina4.ru
к.м.н., зав. отделом лицензирования и аккредитации

Станислав Владиславович Павлович

ФГБУ НЦАГиП им. академика В.И. Кулакова Минздрава России

Email: s_pavlovich@oparina4.ru
к.м.н., ученый секретарь

Константин Георгиевич Скрябин

ФГБОУ МГУ им. М.В. Ломоносова

Email: skryabin@biengi.ac.ru
д.б.н., профессор, академик РАН, зав. кафедрой биотехнологии биологического факультета

Егор Борисович Прохорчук

ФГБОУ МГУ им. М.В. Ломоносова

Email: prokhortchouk@biengi.ac.ru
д.б.н., профессор кафедры биотехнологии биологического факультета

Александр Михайлович Мазур

ФГБОУ МГУ им. М.В. Ломоносова

Email: mazur.am@gmail.com
к.ф.-м.н., старший преподаватель кафедры биотехнологии биологического факультета

Катерина Сергеевна Пантюх

ФГБОУ МГУ им. М.В. Ломоносова

Email: pantiukh@gmail.com
аспирант кафедры биотехнологии биологического факультета

Список литературы

  1. Жученко Л.А., Андреева Е.Н., Воскобоева Е.Ю., Давыдова О.Н., Калашникова Е.А., Кокаровцева С.Н., Лагкуева Ф.К., Одегова Н.О., Серкова ТН.А., Степнова С.В., Судакова Е.В., Цветкова Т.Г. Реализация мероприятий Национального проекта «Пренатальная (дородовая) диагностика нарушений развития ребенка» в Московской области. Российский вестник акушера-гинеколога. 2013; 13(4): 6-12. [Zhuchenko L.A., Andreeva E.N., Voskoboeva E.Yu., Davyidova O.N., Kalashnikova E.A., Kokarovtseva S.N., Lagkueva F.K., Odegova N.O., Serkova N.A., Stepnova S.V., Sudakova E.V., Tsvetkova T.G. Implementation of activities of the National Project „Prenatal (antenatal) diagnosis of child development disorders” in the Moscow region. Rossiyskiy vestnik akushera-ginekologa. 2013; 13(4): 6-12. (in Russian)]
  2. Сухих Г.Т., Каретникова Н.А., Баранова Е.Е., Шубина Е.С., Коростин Д.О., Екимов А.Н., Парсаданян Н.Г., Гус А.И., Бахарев В.А., Трофимов Д.Ю., Воеводин С.М., Тетруашвили Н.К. Неинвазивная пренатальная диагностика анеуплоидий методом высокопроизводительного секвенирования (NGS) в группе женщин высокого риска. Акушерство и гинекология. 2015; 4: 5-10. [Sukhikh G.T., Karetnikova N.A., Baranova E.E., Shubina E.S., Korostin D.O., Ekimov A.N., Parsadanyan N.G., Gus A.I., Bakharev V.A., Trofimov D.Yu., Voevodin S.M., Tetruashvili N.K. Noninvasive prenatal diagnosis of aneuploidies by next-generation sequencing (NGS) in a group of high-risk women. Akusherstvo i ginekologiya/Obstetrics and Gynecology. 2015; (4): 5-10. (in Russian)
  3. Norton M.E., Brar H., Weiss J., Karimi A., Laurent L.C., Caughey A.B. et al. Non-Invasive Chromosomal Evaluation (NICE) Study: results of a multicenter prospective cohort study for detection of fetal trisomy 21 and trisomy 18. Am. J. Obstet. Gynecol. 2012; 207(2): 137. e1-8.
  4. Dar P., Curnow K.J., Gross S.J., Hall M.P., Stosic M., Demko Z. et al. Clinical experience and follow-up with large scale single-nucleotide polymorphism-based noninvasive prenatal aneuploidy testing. Am. J. Obstet. Gynecol. 2014; 211(5): 527. e1-527. e17.
  5. Bhatt S., Parsa S., Snyder H., Taneja P., Halks-Miller M., Seltzer W., DeFeo E. Clinical laboratory experience with noninvasive prenatal testing: update on clinically relevant metrics. ISPD 2014 poster.
  6. Palomaki G.E., Kloza E.M., Lambert-Messerlian G.M., Haddow J.E., Neveux L.M., Ehrich M. et al. DNA sequencing of maternal plasma to detect Down syndrome: An international clinical validation study. Genet. Med. 2011; 13(11): 913-20.
  7. Palomaki G.E., Deciu C., Kloza E.M., Lambert-Messerlian G.M., Haddow J.E., Neveux L.M. et al. DNA sequencing of maternal plasma reliably identifies trisomy 18 and trisomy 13 as well as down syndrome: an international collaborative study. Genet. Med. 2012; 14(3): 296-305.
  8. Nicolaides K.H., Musci T.J., Struble C.A., Syngelaki A., Gil M.M. Assessment of fetal sex chromosome aneuploidy using directed cell-free DNA analysis. Fetal Diagn. Ther. 2014; 35(1): 1-6.
  9. Porreco R.P., Garite T.J., Maurel K., Marusiak B., Ehrich M., van den Boom D. et al. Noninvasive prenatal screening for fetal trisomies 21, 18, 13 and the common sex chromosome aneuploidies from maternal blood using massively parallel genomic sequencing of DNA. Am. J. Obstet. Gynecol. 2014; 211(4): 365. e1-12.
  10. Jiang F., Ren J., Chen F., Zhou Y., Xie J., Dan S. et al. Noninvasive Fetal Trisomy (NIFTY) test: an advanced noninvasive prenatal diagnosis methodology for fetal autosomal and sex chromosomal aneuploidies. BMC Medical Genomics. 2012; 5: 57.
  11. Fleiss J.L. Statistical methods for rates and proportions. 2nd ed. New York: John Wiley & Sons; 1981.
  12. Ижевская В.Л. Старые заботы и новые этические проблемы в пренатальной диагностике. Медицинская генетика. 2015; 14(4): 67. [Izhevskaya V.L. Old concerns and new ethical issues in prenatal diagnostics. Meditsinskaya genetika. 2015; 14(4): 67. (in Russian)]

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML

© ООО «Бионика Медиа», 2016

Данный сайт использует cookie-файлы

Продолжая использовать наш сайт, вы даете согласие на обработку файлов cookie, которые обеспечивают правильную работу сайта.

О куки-файлах