Микобиота как часть микробиоты: особенности методов изучения на современном этапе

Цель работы - обратить внимание исследователей, работающих в области изучения микробиоты/микробиома, на особенности планирования исследования. Важно применять наиболее современные методы получения биоматериала и методы их дальнейшего исследования. Стандартизация подобных исследований необходима для получения результатов, которые должны быть сопоставимы с прочими исследованиями в этой области. Корректное формирование дизайна будущего исследования определяет реперзентативность полученных результатов. Сегодня большинство исследований в основном сконцентрировано на изучении бактериального компонента кишечной микробиоты человека, при этом не учитывается ее грибковый компонент. Исследование кишечной микобиоты, которая относится к разнообразному множеству грибных видов, является относительно новой и быстро прогрессирующей областью изучения. Несмотря на вездесущность и численность грибов, населяющих кишечник человека, их совокупность на несколько порядков меньше, чем бактерий. Недавние исследования показали, что микобиота может быть тесно связана со здоровьем и болезнями. Грибковые сообщества не только изменяются при заболевании, но также играют роль в поддержании гомеостаза того или иного локуса тела человека, во влиянии на системный иммунитет. Кроме того, широко распространено мнение, что ассоциации грибов разных видов в организме хозяина, ассоциации бактерий и грибов имеют решающее значение для здоровья хозяина. Однако менее 0,4% литературы посвящены изучению микобиоты и микобиома. Механизмы, с помощью которых грибы взаимодействуют с другими компонентами микробиома и хозяина, остаются плохо охарактеризованными. Результаты научных исследований, которые проводятся с этой целью, нередко противоречивы, и возникают сложности при попытке сопоставить данные. Исследователи применяют разные методы получения материала, разные методы изучения его состава, обследуют разнородные группы больных (различные географические регионы, без первичного лечения, с лечением, разные стадии болезни и проч.), часто малой выборки. В настоящее время полноценное изучение микобиома возможно только при многогранном и междисциплинарном подходе. Чрезвычайно интересной областью изучения является функциональность различных видов грибов, включая то, как они взаимодействуют с другими эукариотами и прокариотами, присутствующими в различных локусах тела человека. Предстоит выяснить, что более важно, как эти взаимодействия влияют на нас.

микобиом, микробиом, микобиота, микробиота, бактериом