Метагеномный анализ проб при цистите
- Авторы: Тец Г.В1, Тец В.В1, Ворошилова Т.М2
-
Учреждения:
- ГБОУ ВПО «Первый Санкт-Петербургский государственный медицинский университет им. академика И. П. Павлова» Минздрава России
- ФГБУ ВЦЭРМ им. А.М. Никифорова МЧС России
- Выпуск: № 1 (2016)
- Страницы: 29-31
- Раздел: Статьи
- URL: https://journals.eco-vector.com/1728-2985/article/view/282346
- ID: 282346
Цитировать
Полный текст
Открытый доступ
Доступ предоставлен
Доступ платный или только для подписчиков
Аннотация
Выявление бактерий в патологическом материале и оценка их чувствительности к антибиотикам - важнейшие факторы, определяющие стратегию лечения и выбор антимикробной терапии. Результаты проведенного исследования показали, что метагеномный анализ позволяет выявлять в патологическом материале больше бактерий, чем при использовании стандартных лабораторных методов диагностики. Обнаружены различные бактерии, описанные как возбудители заболеваний мочевой системы, но плохо поддающиеся культивированию стандартными методами. Полученные данные указывают, что при заболеваниях мочевой системы смешанные инфекции могут быть распространены значительно шире, чем принято считать. При этом в патологическом процессе участвуют бактерии, роль факторов патогенности и чувствительность к антибиотикам которых остаются практически не изученными.
Ключевые слова
Полный текст
Об авторах
Г. В Тец
ГБОУ ВПО «Первый Санкт-Петербургский государственный медицинский университет им. академика И. П. Павлова» Минздрава России
Email: georgetets@gmail.com
к.м.н., ст. научный сотрудник лаборатории иммунологии НИЦа
В. В Тец
ГБОУ ВПО «Первый Санкт-Петербургский государственный медицинский университет им. академика И. П. Павлова» Минздрава России
Email: vtetzv@yahoo.com
д.м.н., профессор, заведующий кафедрой микробиологии и вирусологии
Т. М Ворошилова
ФГБУ ВЦЭРМ им. А.М. Никифорова МЧС Россиизав. лабораторией микробиологических исследований отдела лабораторной диагностики
Список литературы
- Grice E.A., Segre J.A. The Human Microbiome: Our Second Genome. Annu. Rev. Genomics Hum. Genet. 2012; 13: 151-170.
- Oliver J.D. Recent findings on the viable but nonculturable state in pathogenic bacteria. FEMS Microbiol. Rev. 2010; 34: 415-425.
- Lipkin W.I. Lipkin W.I. The changing face of pathogen discovery and surveillance. Nat. Rev. Microbiol. 2013; 11: 133-141.
- Petrosino J.F., Highlander S., Luna R.A., Gibbs R.A., Versalovic J. Metagenomic pyrosequencing and microbial identification. Clin. Chem. 2009;55(5):856-866.
- Schloss P.D., Westcott S.L., Ryabin T., Hall J.R., Hartmann M., Hollister E.B., Lesniewski R.A., Oakley B.B., Parks D.H., Robinson C.J., Sahl J.W., Stres B., Thallinger G.G., Van Horn D.J., Weber C.F. Introducing mothur: open-source, platform-independent, community-supported software for describing and comparing microbial communities. Appl. Environ. Microbiol. 2009;75(23):7537-7541.
- Cruz A.T., Cazacu A.C., Allen C.H. Pantoea agglomerans, a plant pathogen causing human Disease. J. Clin. Microbiol. 2007; 45(6): 1989-1992.
- Mezzatesta M.L., Gona F., Stefani S. Enterobacter cloacae complex: clinical impact and emerging antibiotic resistance. Future Microbiol. 2012;7(7):887-902. doi: 10.2217/fmb.12.61.
- Fraser S.L., Sinave S. P., Mileno M.D. Enterobacter Infections: Practice Essentials, Background, Pathophysiology. Updated Mar 13, 2014 http://www.emedicine.medscape.com/article/216845-overview
- Фельдблюм И.В., Захарова Ю.А., Деменко С.Г. Сравнительная оценка различных подходов к изучению заболеваемости гнойно-септическими инфекциями среди родильниц в акушерских стационарах. Медицинский альманах. 2011;5:209-212
- O'Hara C.M., Steigerwalt A.G., Hill B.C., Farmer J.J. 3rd, Fanning G.R., Brenner D.J. Enterobacter hormaechei, a new species of the family Enterobacteriaceae formerly known as enteric group 75. J. Clin. Microbiol. 1989;27(9):2046-2049.
- Garazzino S., Aprato A., Maiello A., Masse A., Biasibetti A., De Rosa F.G., Di Perri G. Osteomyelitis caused by Enterobacter cancerogenus infection following a traumatic Injury: case report and review of the literature. J. Clin. Microbiol. 2005;43(3):1459-1461.
- Papasian S.J., Enna-Kifer S., Garrison B. Symptomatic Shigella sonnei urinary tract infection. J. Clin. Microbiol. 1995; 33(8): 2222-2223.
- John G.J. Jr., Sharbaugh R.G., Bannister E.R. Enterobacter cloacae: bacteremia, epidemiology, and antibiotic Resistance. Rev. Infect. Dis. 1982;4(1):13-28.
- DeLappe N., O'Halloran F., Fanning S., Corbett-Feeney G., Cheasty T., Cormican M. Antimicrobial resistance and genetic diversity of Shigella sonnei isolates from Western Ireland, an area of low incidence of infection. J. Clin. Microbiol. 2003;41:1919-1924.
- Тец В.В., Тец Г.В., Викина Д.С., Вечерковская М.Ф., Харламова В.В. Неизвестные возбудители заболеваний в микрофлоре ротовой полости человека, актуальные для оториноларингологии. Вестник оториноларингологии. 2014; 1: 33-36
- Вечерковская М.Ф., Тец Г.В., Тец В.В. Неизвестные бактерии в микрофлоре ротовой полости детей с онкогематологическими заболеваниями. Клиническая онкогематология. 2014;7(2): 229-232
Дополнительные файлы
