Связанность эпидемий ВИЧ-инфекции в республике Армения и Российской Федерации
- Авторы: Киреев Д.Е.1, Кириченко А.А.1, Осадчая О.А.1, Салеева Д.В.1, Лаповок И.А.1, Лопатухин А.Э.1, Шлыкова А.В.1, Ладная Н.Н.1, Григорян Т.Р.2, Петросян А.Р.2, Саргатян Т.А.2, Овакимян Э.М.2, Мартоян С.В.2, Казарян О.К.2, Овсепян Т.В.2, Саркисянц Н.К.2, Покровский В.В.1, Акимкин В.Г.1
-
Учреждения:
- Центральный НИИ эпидемиологии Роспотребнадзора
- ЗАО «Национальный центр инфекционных болезней» Министерства здравоохранения Республики Армения
- Выпуск: Том 13, № 3 (2023)
- Страницы: 27-34
- Раздел: Эпидемическая ситуация
- URL: https://journals.eco-vector.com/2226-6976/article/view/625008
- DOI: https://doi.org/10.18565/epidem.2023.13.3.27–34
- ID: 625008
Цитировать
Полный текст
Открытый доступ
Доступ предоставлен
Доступ платный или только для подписчиков
Аннотация
Цель исследования. Генетическая характеристика вариантов ВИЧ, циркулирующих среди граждан Армении, и оценка степени связанности эпидемий ВИЧ-инфекции между Арменией и Российской Федерацией.
Материалы и методы. Исследованы 1009 нуклеотидных последовательностей ВИЧ региона pol и сопутствующая деперсонифицированная информация о пациентах, полученные в рамках распоряжений Правительства РФ, выполненных в 2016–2021 гг. Для оценки связанности эпидемии ВИЧ-инфекции анализировали также последовательности из базы данных Лос-Аламос и коллекции Центрального НИИ эпидемиологии Роспотребнадзора. К полученному пулу последовательностей были применены инструмент BLAST, филогенетический и кластерный анализ.
Результаты. Среди проанализированных последовательностей ВИЧ граждан Армении 87,2% принадлежали к субсубтипу А6, 5,6% – к субтипу В, 2,7% – CRF63_02А6 и 1,9% – CRF02_AG. Другие генетические варианты встречались реже (1%). Наибольшее количество генетически родственных последовательностей ВИЧ имели российское происхождение (44,52%), затем следовали Республика Беларусь (10,59%) и США (8,04%). С помощью кластерного анализа было обнаружено, что достоверно чаще смешанные AM-RU кластеры состояли из мужчин, пациентов с гомосексуальным путем передачи, проживающих в пригороде Еревана, инфицирование которых предположительно произошло в России.
Заключение. Биоинформатический анализ нуклеотидных последовательностей ВИЧ, полученных от граждан Республики Армения, в сочетании с генетическими вариантами ВИЧ, доступными на сегодняшний день, показал высокую генетическую близость последовательностей ВИЧ Армении и Российской Федерации.
Ключевые слова
Полный текст
Об авторах
Дмитрий Евгеньевич Киреев
Центральный НИИ эпидемиологии Роспотребнадзора
Автор, ответственный за переписку.
Email: dmitkireev@yandex.ru
ORCID iD: 0000-0002-7896-2379
к.б.н., заведующий лабораторией диагностики и молекулярной эпидемиологии ВИЧ-инфекции
Россия, МоскваАлина Алексеевна Кириченко
Центральный НИИ эпидемиологии Роспотребнадзора
Email: kotova-kirichenko@mail.ru
ORCID iD: 0000-0002-7116-0138
научный сотрудник лаборатории диагностики и молекулярной эпидемиологии ВИЧ-инфекции
Россия, МоскваОльга Алексеевна Осадчая
Центральный НИИ эпидемиологии Роспотребнадзора
Email: osadchaya96@yandex.ru
ORCID iD: 0000-0003-1543-5579
младший научный сотрудник лаборатории диагностики и молекулярной эпидемиологии ВИЧ-инфекции
Россия, МоскваДарья Владиславовна Салеева
Центральный НИИ эпидемиологии Роспотребнадзора
Email: dasha_saleeva@inbox.ru
ORCID iD: 0000-0002-5870-5594
научный сотрудник лаборатории диагностики и молекулярной эпидемиологии ВИЧ-инфекции
Россия, МоскваИлья Андреевич Лаповок
Центральный НИИ эпидемиологии Роспотребнадзора
Email: i_lapovok@mail.ru
ORCID iD: 0000-0002-6328-1415
к.б.н., старший научный сотрудник лаборатории диагностики и молекулярной эпидемиологии ВИЧ-инфекции
Россия, МоскваАлексей Эдуардович Лопатухин
Центральный НИИ эпидемиологии Роспотребнадзора
Email: a.lopatukhin@gmail.com
ORCID iD: 0000-0002-2826-699X
научный сотрудник лаборатории диагностики и молекулярной эпидемиологии ВИЧ-инфекции
Россия, МоскваАнастасия Вениаминовна Шлыкова
Центральный НИИ эпидемиологии Роспотребнадзора
Email: murzakova_a.v@mail.ru
ORCID iD: 0000-0002-1390-8021
научный сотрудник лаборатории диагностики и молекулярной эпидемиологии ВИЧ-инфекции
Россия, МоскваНаталья Николаевна Ладная
Центральный НИИ эпидемиологии Роспотребнадзора
Email: nladnaia@hotmail.com
ORCID iD: 0000-0003-2994-151X
к.б.н., старший научный сотрудник
Россия, МоскваТрдат Рафаелович Григорян
ЗАО «Национальный центр инфекционных болезней» Министерства здравоохранения Республики Армения
Email: gtrdat@yahoo.com
ORCID iD: 0000-0002-7319-7444
специалист по мониторингу и оценке
Армения, ЕреванАршак Размикович Петросян
ЗАО «Национальный центр инфекционных болезней» Министерства здравоохранения Республики Армения
Email: a_petrosyan@list.ru
врач-лаборант лаборатории ПЦР, микробиологии, вирусологии и генетики
Армения, ЕреванТатевик Амировна Саргатян
ЗАО «Национальный центр инфекционных болезней» Министерства здравоохранения Республики Армения
Email: sarhatyantatev@mail.ru
врач-лаборант лаборатории ПЦР, микробиологии, вирусологии и генетики
Армения, ЕреванЭрмис Мисаковна Овакимян
ЗАО «Национальный центр инфекционных болезней» Министерства здравоохранения Республики Армения
Email: hovakimyan80@mail.ru
заведующая клиническим отделением
Армения, ЕреванСирануш Вачиковна Мартоян
ЗАО «Национальный центр инфекционных болезней» Министерства здравоохранения Республики Армения
Email: smartoyan@gmail.com
ORCID iD: 0000-0002-2067-9503
врач-эпидемиолог
Армения, ЕреванОвсеп Карапетович Казарян
ЗАО «Национальный центр инфекционных болезней» Министерства здравоохранения Республики Армения
Email: hovser.ghazaryan@gmail.com
ORCID iD: 0000-0001-5612-8933
к.б.н., научный сотрудник
Армения, ЕреванТамара Врежовна Овсепян
ЗАО «Национальный центр инфекционных болезней» Министерства здравоохранения Республики Армения
Email: thovsep@gmail.com
заведующая лабораторией
Армения, ЕреванНарина Константиновна Саркисянц
ЗАО «Национальный центр инфекционных болезней» Министерства здравоохранения Республики Армения
Email: sknarina70@mail.ru
к.м.н., заместитель директора
Армения, ЕреванВадим Валентинович Покровский
Центральный НИИ эпидемиологии Роспотребнадзора
Email: pokrovsky.vad@yandex.ru
ORCID iD: 0000-0002-9514-7288
академик РАН, д.м.н., профессор, заведующий специализированным отделом эпидемиологии и профилактики СПИДа
Россия, МоскваВасилий Геннадьевич Акимкин
Центральный НИИ эпидемиологии Роспотребнадзора
Email: vgakimkin@yandex.ru
ORCID iD: 0000-0003-4228-9044
академик РАН, д.м.н., профессор, директор
Россия, МоскваСписок литературы
- Покровский В.В., Улумбекова Г.Э., Петрачков И.В. Организация медицинской помощи при инфекции, вызываемой вирусом иммунодефицита человека. ОРГЗДРАВ: новости, мнения, обучение. Вестник ВШОУЗ 2022; 8(2): 108–30. DOI: https://doi.org/10.33029/2411-8621-2022-8-2-108-130. Pokrovsky V.V., Ulumbekova G.E., Petrachkov I.V. [Organization of medical care in case of infection caused by the human immunodeficiency virus]. ORGZDRAV: news, opinions, training. Vestnik VSHOUZ. 2022; 8(2): 108–30. (In Russ.). DOI: https://doi.org/10.33029/2411-8621-2022-8-2-108-130.
- Ладная Н.Н., Покровский В.В., Соколова Е.В., Чекрыжова Д.Г., Киржанова В.В. Распространение инфекции, вызываемой вирусом иммунного дефицита человека, на территориях Российской Федерации в 2021 г. Эпидемиол. инфекц. болезни. Актуал. вопр. 2022; 12(3): 12–8. DOI: https://dx.doi.org/10.18565/epidem.2022.12.3.12-8 Ladnaia N.N., Pokrovsky V.V., Sokolova E.V., Chekryzhova D.G., Kirzhanova V.V. [Prevalence of human immune deficiency virus infection in the territories of the Russian Federation in 2021]. Epidemiоlоgy and infectious diseases. Сurrent items 2022; 12(3): 12–8. (In Russ.). DOI: https: //dx.doi.org/10.18565/epidem.2022.12.3.12-8
- HIV Epidemiological surveillance in the Republic of Armenia 2018 Annual Report. https://ecom.ngo/wp-content/uploads/2018/12/IBBS_ARMENIA_ 2018_eng_FINAL.pdf
- International Organization for Migration. (2013). Report on Household Survey on Migration in Armenia. http://publications.iom.int/ bookstore/index. php?main_p.oduct_info&cPath=41_7&products_id=1400
- Ministry of Health, National Center for AIDS Prevention. (2017) Biological and Behavioral Surveillance Survey on Armenian, Male, Seasonal Labor Migrants in Rural Communities in Armenia, 2016. http://www.armaids. am/images/pdf/Rural_migrant_survey_report_arm_eng.pdf
- Nduva G.M., Otieno F., Kimani J., McKinnon L.R., Cholette F., Sandstrom P. et al. Phylogeographic Assessment Reveals Geographic Sources of HIV-1 Dissemination Among Men Who Have Sex With Men in Kenya. Frontiers in Microbiology, 2022; (13): 843330. https://doi.org/10.3389/fmicb.2022. 843330
- Pimentel V., Pingarilho M., Alves D., Diogo I., Fernandes S., Miranda M. et al. Molecular Epidemiology of HIV-1 Infected Migrants Followed up in Portugal: Trends between 2001–2017. Viruses 2020; 12(3), 268. https://doi.org/10.3390/v12030268
- Ratmann O., Kagaayi J., Hall M., Golubchick T., Kigozi G., Xi X. et al. Rakai Health Sciences Progra пm and the Pangea HIV Consortium. Quantifying HIV transmission flow between high-prevalence hotspots and surrounding communities: a population-based study in Rakai, Uganda. The Lancet HIV The Lancet HIV 2020; 7(3): e173–e183. https://doi.org/ 10.1016/S2352-3018(19)30378-9.
- Kirichenko A., Kireev D., Lopatukhin A., Murzakova A., Lapovok I., Saleeva D. et al. Prevalence of HIV-1 drug resistance in Eastern European and Central Asian countries. PLoS ONE 2022; 17(1): e0257731. https://doi.org/ 10.1371/journal.pone.0257731
- Kirichenko A., Kireev D., Lapovok I., Shlykova A., Lopatukhin A., Pokrovskaya A. et al. Prevalence of Pretreatment HIV-1 Drug Resistance in Armenia in 2017–2018 and 2020–2021 following a WHO Survey. Viruses 2022; 14(11): 2320. https://doi.org/10.3390/v14112320
- HIV/AIDS surveillance in Europe: 2022– 2021 data. WHO Regional Office for Europe, European Centre for Disease Prevention and Control. Copenhagen: WHO Regional Office for Europe, 2022.
- Migration Survey on the Relationship between Skills, Migration and Development in Armenia. European Training Foundation, 2011. http://www. crrc.am/hosting/file/_static_content/projects/Migration_and_skills_2011/Migration_and_skills_Armenia.pdf
- Migration and Development. Armenian Country Study. International Labour Organization. Yerevan, 2010. http://www.smsmta.am/upload/Migration%20and%20Development_Study_in_English.pdf
- Осадчая О.А., Ерошкин П.В., Кириченко А.А., Лаповок И.А., Салеева Д.В., Лопатухин А.Э. и др. Изучение передачи лекарственной устойчивости ВИЧ-1 в Республике Армения с помощью биоинформатических методов. Эпидемиол. инфекц. болезни. Актуал. вопр. 2021; 11(4): 53–60. doi: 10.18565/epidem.2021.11.4.53–60. Osadchaya O.A., Eroshkin P.V., Kirichenko A.A., Lapovok I.A., Saleeva D.V., Lopatukhin A.E. et al. [Studying the transmission of HIV-1 drug resistance in the Republic of Armenia using bioinformatics methods]. Epidemiоlоgy and infectious diseases. Сurrent items 2021; 11(4): 53–60. (In Russ.). doi: 10.18565/epidem.2021.11.4.53–60
- Лаповок И.А., Лопатухин А.Э., Киреев Д.Е., Казеннова Е.В., Лебедев А.В., Бобкова М.Р. и др. Молекулярно-эпидемиологический анализ вариантов ВИЧ-1, циркулировавших в России в 1987–2015 гг. Терапевтический архив 2017; 89(11): 44–9. doi: 10.17116/terarkh2017891144-49 Lapovok I.A., Lopatukhin A.E., Kireev D.E., Kazennova E.V., Lebedev A.V., Bobkova M.R. et al. [Molecular epidemiological analysis of HIV-1 variants circulating in Russia in 1987–2015]. Therapeutic archive 2017; 89(11): 44–9. doi: 10.17116/terarkh2017891144-49
- Еремин В.Ф., Гасич Е.Л., СосиноВИЧ С.В., Суетнов О.Н., Грушко П.Н., Грушко Т.П. и др. Молекулярная эпидемиология ВИЧ/СПИД в Беларуси (2008–2011). Здравоохранение (Минск) 2012; (1): 25–34. Eremin V.F., Gasich E.L., Sosinovich S.V., Suetnov O.N., Grushko P.N., Grushko T.P. et al. [Molecular epidemiology of HIV/AIDS in Belarus (2008–2011)]. Healthcare (Minsk). 2012; (1): 25–34. (In Russ.).
Дополнительные файлы
