Evolution of epidemiology

Cover Page

Cite item

Full Text

Open Access Open Access
Restricted Access Access granted
Restricted Access Subscription or Fee Access

Abstract

The article considers the evolution of epidemiology as a fundamental scientific discipline related to the field of preventive medicine, in terms of changing paradigms of diagnostics and surveillance of infectious diseases. The article presents views on the development of modern epidemiology associated with advances in molecular biological technologies for identifying pathogens, taking into account their genetic diversity and the use of digital platform approaches for analyzing «big» epidemiological data, which made it possible to successfully solve operational problems during the COVID-19 pandemic. The article presents the results of the implementation of the Russian platform for aggregation of information on viral genomes (VGARus), developed at the Central Research Institute of Epidemiology, Russian Federal Service for Supervision of Consumer Rights Protection and Human Well-Being, as a technological, scientific, organizational and infrastructural base for molecular genetic monitoring, acting as an interdepartmental consortium. The developed strategy of genomic epidemiological surveillance is considered as a powerful tool for ensuring readiness for the implementation of response measures and managing the epidemic process by implementing and adjusting preventive and anti-epidemic measures.

Full Text

Restricted Access

About the authors

Vasily G. Аkimkin

Central Research Institute of Epidemiology

Author for correspondence.
Email: vgakimkin@yandex.ru
ORCID iD: 0000-0001-8139-0247

Academician of the Russian Academy of Sciences, МD, Professor, Director

Russian Federation, Moscow

References

  1. Беляков В.Д., Яфаев Р.Х. Эпидемиология. М.: Медицина, 1989. 416 с. Belyakov V.D., Yafaev R.H. [Epidemiology]. Moscow: Medicine, 1989. 416 p. (In Russ.).
  2. Каргальцев А.В. Чума Киприана: христиане в городской среде в эпоху гонений и эпидемий. Hypothekai 2022; (6): 145–157. doi: 10.32880/2587-7127-2022-6-6-145-157 Kargaltsev A.V. [Рlague of Cyprian: Christians in the urban environment in the era of persecution and epidemics]. Hypothekai 2022; (6): 145–157. (In Russ.). doi: 10.32880/2587-7127-2022-6-6-145-157
  3. Зибаев А.В., Жукова В.Ф. Формы чумы у Прокопия Кесарийского (Procop. de Bellis. IV. 14) и Евагрия Схоластика (Evagrius. hist. ecc. IV.29): о развитии теоретической медицины в Восточной Римской империи VI в. Hypothekai 2022; (6): 158–186. doi: 10.32880/2587-7127-2022-6-6-158-186. Zibaev A.V., Zhukova V.F. [Forms of plague in Procopius of Caesarea (Procop. de Bellis. IV. 14) and Evagrius Scholastica (Evagrius. hist. ecc. IV.29): on the development of theoretical medicine in the Eastern Roman Empire of the sixth century]. Hypothekai 2022; (6): 158–186. (In Russ.). doi: 10.32880/2587-7127-2022-6-6-158-186
  4. Пенской В.В., Липич В.В., Реутов Н.Н., Артюх А.В. «Бысть мор зол...»: «черная смерть» XIV века на Руси. Проблемы социальной гигиены, здравоохранения и истории медицины 2021; 29(4): 1017–1024. doi: 10.32687/0869-866X-2020-29-4-1017-1024 Penskoi V.V., Lipich V.V., Reutov N.N., Artyukh A.V. [«There was a plague of evil...»: «the black death» of the XIV century in Russiа]. Problemy sotsialnoy gigieny, zdravookhraneniya i istorii meditsiny 2021; 29(4): 1017–1024. (In Russ.). doi: 10.32687/0869-866X-2020-29-4-1017-1024
  5. Балахонов С.В., Вержуцкий Д.Б., Корзун В.М., Куликалова Е.С., Холин А.В., Шаракшанов М.Б. Особенности современной эпизоотической ситуации и эпидемиологической обстановки по чуме в Южной Сибири, Монголии и Китае (обзор). Санитарный врач 2021; (8): 34–40. doi: 10.33920/med-08-2108-05. Balakhonov S.V., Verzhutsky D.B. Korzun V.M. Kulikalova E.S., Kholin A.V. Sharakshanov M.B. [Features of the current epizootic situation and the epidemiological situation for plague in southern Siberia, Mongolia and China (review)]. Sanitary Doctor 2021; (8): 34–40. (In Russ.). doi: 10.33920/med-08-2108-05
  6. Сергиев В.П., Каганов Б.С. Variola Vera. Вопросы практической педиатрии 2017; 12(1): 69–82. Sergiev V.P., Kaganov B.S. [Variola Vera]. Problems of Practical Pediatrics 2017; 12(1): 69–82. (In Russ.).
  7. Онищенко Г.Г., Попова А.Ю., Топорков В.П., Смоленский В.Ю., Щербакова С.А., Кутырев В.В. Современные угрозы и вызовы в области биологической безопасности и стратегия противодействия. Проблемы особо опасных инфекций 2015; (3): 5–9. Onishchenko G.G., Popova A.Yu., Toporkov V.P., Smolensky V. Yu., Shcherbakova S.A., Kutyrev V.V. [Present-Day Menaces and Challenges in the Sphere of Biological Safety and Strategy of Countermeasures]. Problems of Particularly Dangerous Infections 2015; (3): 5–9. (In Russ.).
  8. Семиотрочев В.Л. Современное представление о причинах возникновения эпидемий холеры. Современные инновации: научно-практический журнал 2017; 8(22): 51–58. SemiotrochevV.L. [Modern understanding of the causes of cholera epidemics]. Modern innovations 2017; 8(22): 51–58. (In Russ.).
  9. Курлыкина И.А., Кистенева О.А. Эпидемия холеры в СССР 1970 г. Молодежный инновационный вестник 2019; 8(S1): 66–67. Kurlykina I.A., Kisteneva O.A. [The cholera epidemic in the USSR in 1970]. Youth Innovation Bulletin 2019; 8(S1): 66–67. (In Russ.).
  10. Сорокина М.Ю. Между верой и разумом: великий бактериолог Владимир Хавкин. Природа 2020; 4(1256): 61–70. doi: 10.7868/S0032874X20040079. Sorokina M.Yu. [Between Faith and Reason: the Great Bacteriologist Vladimir Khavkin (1860–1930)].Nature 2020; 4(1256): 61–70. (In Russ.). doi: 10.7868/S0032874X20040079
  11. Спасенников Б.А. «Испанка» в России (1918–1921). Бюллетень Национального научно-исследовательского института общественного здоровья имени Н.А. Семашко 2021; (3): 22–31. doi: 10.25742/NRIPH.2021.03.004. Spasennikov B.A. [“Spanish Woman” in Russia (1918–1921)]. Bulletin of the N.A. Semashko National Research Institute of Public Health 2021; (3): 22–31. (In Russ.). doi: 10.25742/NRIPH.2021.03.004
  12. Подунова Л.Г., Панин В.Ф. Этапы становления и развития санитарно-эпидемиологических станций в России (к юбилею государственной санитарно-эпидемиологической службы России). Санитарный врач 2022; (4): 295–309. doi: 10.33920/med-08-2204-06. Podunova L.G., Panin V.F. [Stages of formation and development of sanitary and epidemiological stations in Russia (on the anniversary of the State Sanitary and Epidemiological Service of Russia)]. Sanitary doctor 2022; (4): 295–309. (In Russ.). doi: 10.33920/med-08-2204-06
  13. Кириллов Ю.А. Даниил Кириллович Заболотный: вчера и сегодня. Часть 2. Пространство и Время 2018; (1–2): 151–168. doi: 10.24411/2226-7271-2018-11062. Kirillov Yu.A. [Daniil Zabolotny: in past and present. Part 2]. Space and Time 2018; (1–2): 151–168. (In Russ.). doi: 10.24411/2226-7271-2018-11062
  14. Сточик А.А. Академик Лев Васильевич Громашевский (к 135-летию выдающегося советского эпидемиолога). Эпидемиол. инфекц. болезни. Актуал. вопр. 2022; 12(4): 77–80. doi: 10.18565/epidem.2022.12.4.77-80. Stochik A.A. [Academician Lev Vasilyevich Gromashevsky (on the occasion of the 135th birth anniversary of the outstanding Soviet epidemiologist)]. Epidemiоlоgy and infectious diseases. Сurrent items 2022; 12(4): 77–80. (In Russ.). doi: 10.18565/epidem.2022.12.4.77-80
  15. Павловский Е.Н. Как зародилось и развивалось учение о природной очаговости болезней человека, животных и растений. В кн.: Е.Н. Павловский. Общие проблемы паразитологии и зоологии. М.–Л.: Изд-во АН СССР, 1961: 159–162. Pavlovsky E.N. [How the doctrine of the natural foci of human, animal and plant diseases originated and developed. In: E.N. Pavlovsky. General problems of parasitology and zoologyv]. Moscow: Publishing House of the USSR Academy of Sciences, 1961: 159–162. (In Russ.).
  16. Павловский Е.Н. Основы учения о природной очаговости трансмиссивных болезней человека. Журнал общей биологии 1946; 7(1): 3–33. Pavlovsky E.N. [Fundamentals of the doctrine of the natural foci of human transmissible diseases]. Journal of General Biology 1946; 7(1): 3–33
  17. Акимкин В.Г., Семененко Т.А., Дубоделов Д.В., Хафизов К.Ф., Углева С.В. Теория саморегуляции паразитарных систем и COVID-19. Вестник РАМН 2024; 79(1): 33–41. doi: 10.15690/vramn11607. Akimkin V.G., Semenenko T.A., Dubodelov D.V., Khafizov K.F., Ugleva S.V. [The theory of self-regulation of parasitary systems and COVID-19]. Annals of the Russian Academy of Medical Sciences 2024; 79(1): 33–41. (In Russ.). doi: 10.15690/vramn11607
  18. Акимкин В.Г., Семененко Т.А., Углева С.В., Дубоделов Д.В., Кузин С.Н., Яцышна С.Б. и др. COVID- 19 в России: эпидемиология и молекулярно-генетический мониторинг. Вестник РАМН 2022; 77(4): 254–260. doi: 10.15690/vramn2121. Akimkin V.G., Semenenko T.A., Ugleva S.V., Dubodelov D.V., Kuzin S.N,, Yacyshina S.B. et al. [COVID-19 in Russia: Epidemiology and Molecular Genetic Monitoring]. Annals of the Russian Academy of Medical Sciences 2022; 77(4): 254–260. (In Russ.). doi: 10.15690/vramn2121
  19. Беляков В.Д. Общие закономерности функционирования паразитарных систем (механизмы саморегуляции). Паразитология 1986; XX(4): 249–255. Belyakov V.D. [General patterns of functioning of parasitic systems (mechanisms of self-regulation)]. Parasitology 1986; XX(4): 249–255. (In Russ.).
  20. Черкасский Б.Л., Симонова Е.Г. Современные представления о системе управления эпидемическим процессом. Эпидемиология и инфекционные болезни 2006; (5): 4–7. Cherkassky B.L., Simonova E.G. [Modern concepts of the epidemic process management system]. Epidemiology and Infectious Diseases 2006; (5): 4–7. (In Russ.).
  21. Брико Н.И., Покровский В.И. Эпидемиологические исследования, клиническая эпидемиология и доказательная медицина. Сеченовский вестник 2010; (2): 106–111. Briko N.I., Pokrovsky V.I. [Epidemiological studies, clinical epidemiology and evidence-based medicine]. Sechenovsky Bulletin 2010; (2): 106–111. (In Russ.).
  22. Блохин А. Новые и возвращающиеся трансграничные инфекции в жизни человека. Пути к миру и безопасности 2020: 2(59): 9–26. doi: 10.20542/2307-1494-2020-2-9-26. Blokhin A. [New and recurring cross-border infections in human life]. Paths to Peace and Security 2020: 2(59): 9–26. (In Russ.). doi: 10.20542/2307-1494-2020-2-9-26
  23. Акимкин В.Г., Семененко Т.А., Хафизов К.Ф., Углева С.В., Дубоделов Д.В., Колосовская Е.Н. Стратегия геномного эпидемиологического надзора. Проблемы и перспективы. Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии 2024; 101(2): 163–172. doi: 10.36233/0372-9311-507. Akimkin V.G., Semenenko T.A., Khafizov K.F., Ugleva S.V., Dubodelov D.V., Kolosovskaya E.N. [Genomic epidemic surveillance strategy. Problems and perspectives]. Journal of microbiology, epidemiology and immunobiology 2024; 101(2): 163–172. (In Russ.). doi: 10.36233/0372-9311-507
  24. Семененко Т.А. Роль банка сывороток крови в системе биологической безопасности страны. Вестник Росздравнадзора 2010; (3): 55–58. Semenenko T.A. [The role of the blood serum bank in the biological safety system of the country]. Vestnik Roszdravnadzora 2010; (3): 55–58. (In Russ.).
  25. Prioritizing diseases for research and development in emergency contexts. https://www.who.int/activities/prioritizing-diseases-for-research-and-development-in-emergency-contexts
  26. What Is Disease X? The Pandemic Threat Discussed At Davos 2024. https://www.forbes.com/sites/brucelee/2024/01/27/what-is-disease-x-the-pandemicthreat-discussed-at-davos-2024/
  27. WHO global framework to define and guide studies into the origins of emerging and re-emerging pathogens with epidemic and pandemic potential. https://www.who.int/publications/i/item/9789240101470
  28. Сизикова Т.Е., Лебедев В.Н., Борисевич С.В. Оценка опасности возбудителей зоонозных вирусных инфекций как потенциальных агентов пандемий. Вестник войск РХБ защиты 2023; 7(4): 350–365. doi: 10.35825/2587-5728-2023-7-4-350-365. Sizikova T.E., Lebedev V.N., Borisevich S.V. [The Assessment of the Danger of Pathogens of Zoonotic Viral Infections as Potential Agents of Pandemics]. Journal of NBC Protection Corps 2023; 7(4): 350–365. (In Russ.). doi: 10.35825/2587-5728-2023-7-4-350-365
  29. Акимкин В.Г., Семененко Т.А., Хафизов К.Ф., Углева С.В., Дубоделов Д.В., Колосовмская Е.Т. Биобезопасность и геномный эпидемиологический надзор. Эпидемиология и Вакцинопрофилактика 2024; 23(5): 4–12. doi: 10.31631/2073-3046-2024-23-5-4-12. Akimkin V.G., Semenenko T.A., Khafizov K.F., Ugleva S.V., Dubodelov D.V., Kolosovskaya E.N. [Biosafety and Genomic Epidemiological Surveillance]. Epidemiology and Vaccinal Prevention 2024; 23(5): 4–12. (In Russ.). DOI: 110.31631/2073-3046-2024-23-5-4-12
  30. Carter L.L., Yu M.A., Sacks J.A., Barnadas C., Pereyaslo D., Cognat S. et al. Global genomic surveillance strategy for pathogens with pandemic and epidemic potential, 2022–2032. Bull. World Health Organ. 2022; 100(4): 239–239A. doi: 10.2471/blt.22.288220
  31. Jolany Vangah S., Katalani C., Booneh H.A., Hajizade A., Sijercic A., Ahmadian G. CRISPR-Based Diagnosis of Infectious and Noninfectious Diseases. Biol. Proced. Online 2020; 22: 22. doi: 10.1186/s12575-020-00135-3
  32. Soroka M., Wasowicz B., Rymaszewska A. Loop-mediated isothermal amplification (LAMP): the better sibling of PCR? Cells 2021; 10(8): 1931. doi: 10.3390/cells10081931
  33. Берман А.М. Влияние биологических вызовов на общественно-политические отношения: проблемы и перспективы. Территория новых возможностей. Вестник Владивостокского государственного университета экономики и сервиса 2020; 12(4): 79–87. doi: 10.24866/VVSU/2073-3984/2020-4/079-087. Berman A.M. [Impact of biological challenges on social and political relations: issues and prospects. The territory of new opportunities].The Herald of Vladivostok State University of Economics and Service. 2020; 12(4): 79–87. (In Russ.). doi: 10.24866/VVSU/2073-3984/2020-4/079-087
  34. Попова А.Ю., Смоленский В.Ю., Кутырев В.В., Щербакова С.А., Иванова А.В. Вклад России в формирование глобальной архитектуры здравоохранения. Проблемы особо опасных инфекций 2024; (4): 6–14. doi: 10.21055/0370-1069-2024-4-6-14. Popova A.Yu., Smolensky V.Yu., Kutyrev V.V., Shcherbakova S.A., Ivanova A.V. [Russia’s Contribution to the Formation of the Global Healthcare Architecture]. Problems of Particularly Dangerous Infections 2024; (4): 6–14. (In Russ.). doi: 10.21055/0370-1069-2024-4-6-14
  35. Рудаков Н.В., Пеньевская Н.А. Федеральный проект «Санитарный щит страны – безопасность для здоровья (предупреждение, выявление, реагирование)» – важнейший этап реализации стратегии национальной безопасности Российской Федерации. Национальные приоритеты России 2024; 2(53): 47–59. Rudakov N.V., Penevskaya N.A. [Federal project «Sanitary Shield of the country – safety for health (prevention, detection, response)» is the most important stage in the implementation of the national security strategy of the Russian Federation]. Russia’s National Priorities 2024; 2(53): 47–59. (In Russ.).
  36. Хорошун Д.К., Момыналиев К.Т., Воронин Е.М., Акимкин В.Г. Анализ поисковых запросов в «Яндексе», связанных с COVID-19 в Российской Федерации. Медицинский алфавит 2022; 14: 14–22. doi: 10.33667/2078-5631-2022-18-14-22. Khoroshun D.K., MomynalievK.Т., Voronin E.M., Akimkin V.G. [Analysis of Yandex search queries related to COVID-19 in Russian Federation]. Medical alphabet 2022; 14: 14–22. (In Russ.). doi: 10.33667/2078-5631-2022-18-14-22
  37. Momynaliev K.G., Khoroshun D.K., Akimkin V.G. Online queries as a criterion for evaluating epidemiological status and effectiveness of COVID-19 control measures in Russia: results from Yandex. Wordstat analysis. BMJ Open 2022; 12: e056716. DOI: 10.1136/ bmjopen-2021-056716
  38. Момыналиев К.Т., Хорошун Д.К., Акимкин В.Г. Интернет-запросы, связанные с обонянием, как маркер оценки эпидемической ситуации в связи с коронавирусом SARS-CоV-2. Эпидемиол. инфекц. болезни. Актуал. вопр. 2021; 11(2): 42–48. doi: 10.18565/epidem.2021.11.2.42-8. Momynaliev K.T., Khoroshun D.K., Akimkin V.G. [Study of olfaction-related Internet queries to evaluate the effectiveness of anti-epidemic measures against COVID-19]. Epidemiоlоgy and infectious diseases. Сurrent items 2021; 11(2): 42–48. (In Russ.). doi: 10.18565/epidem.2021. 11.2.42-8
  39. Akimkin V.G., Semenenko T.A., Ugleva S.V., Dubodelov D.V., Khafizov K. COVID-19 epidemic process and evolution of SARS-CoV-2 genetic variants in the Russian Federation. Microbiol. Res. 2024; 15(1): 213–224. doi: 10.3390/microbiolres15010015
  40. Акимкин В.Г., Попова А.Ю., Плоскирева А.А., Углева С.В., Семененко Т.А., Пшеничная Н.Ю и др. COVID-19: эволюция пандемии в России. Сообщение I: проявления эпидемического процесса COVID-19. Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии 2022; 99(3): 269–286. doi: 10.36233/0372-9311-276. Akimkin V.G., Popova A.Yu., Ploskireva A.A., Ugleva S.V., Semenenko T.A., Pshenichnaya N.Yu. et al. [COVID-19: the evolution of the pandemic in Russia. Report I: manifestations of the COVID-19 epidemic process]. Journal of microbiology, epidemiology and immunobiology 2022; 99(3): 269–286. (In Russ.). doi: 10.36233/0372-9311-276
  41. Kotov I., Saenko V., Borisova N., Kotov I., Saenko V., Borisova N. et al. Effective approaches to study the genetic variability of SARS-CoV-2. Viruses 2022; 14(9): 1855. doi: 10.3390/v14091855

Supplementary files

Supplementary Files
Action
1. JATS XML
Download

Copyright (c) 2025 Bionika Media