Лекарственная устойчивость ВИЧ-1 среди АРТ-наивных недавно инфицированных пациентов в Иркутской области

Обложка

Цитировать

Полный текст

Открытый доступ Открытый доступ
Доступ закрыт Доступ предоставлен
Доступ закрыт Доступ платный или только для подписчиков

Аннотация

Цель исследования. Определение распространенности передающейся лекарственной устойчивости (ЛУ) к препаратам антиретровирусной терапии (АРТ) среди недавно инфицированных ВИЧ пациентов, не имевших опыта получения АРТ, на территории Иркутской области.

Материалы и методы. В 2019 и 2023 г. проведены 2 пороговых исследования передающейся ЛУ ВИЧ в выборках пациентов Иркутского областного центра по профилактике и борьбе со СПИД и инфекционными заболеваниями. В обоих исследованиях использовали плазму крови от 50 ВИЧ-инфицированных лиц, не имевших опыта АРТ, с предположительной давностью заражения не более 1 года и уровнем CD4+-лимфоцитов > 500 клеток/мкл на момент исследования.

Результаты. Мутации передающейся ЛУ были выявлены в образцах от 3 пациентов в 2019 г. и от 6 – в 2023 г. (6% (90% ДИ 0,5–11,5%) и 12% (90% ДИ 4,4–19,6%) соответственно). В выборке 2019 г. у 2 (4%) пациентов обнаружены мутации ЛУ к ненуклеозидным ингибиторам обратной транскриптазы (ННИОТ) и у 1 (2%) – к ингибиторам протеазы (ИП). В 2023 г. были обнаружены следующие варианты ЛУ: 2 (4%) пациента с ЛУ к ИП, 2 (4%) – к ННИОТ, 1 (2%) – к НИОТ+ННИОТ и 1 (2%) – к ИП+ННИОТ. По данным филогенетического анализа в выборке 2019 г. 1 (2%) образец кластеризовался с субтипом В, 5 (10%) – с рекомбинантом CRF63 02_A6, остальные 44 (88%) образца типировались как А6. В 2023 г. выявлено следующее распределение: А6 – 90%, CRF63 02_A6 – 8%, В – 2%.

Заключение. Передающаяся ЛУ ВИЧ в Иркутской области на данный момент установилась на значении в 12%, что не превышает порог в 15%, после которого необходимо проводить тестирование каждого пациента перед назначением АРТ. Целесообразно провести повторное исследование на передающуюся ЛУ через 2 года для оценки динамики распространения устойчивых штаммов ВИЧ.

Полный текст

Доступ закрыт

Об авторах

Александр Олегович Ревизор

Иркутский областной центр по профилактике и борьбе со СПИД и инфекционными заболеваниями

Автор, ответственный за переписку.
Email: rao@aids38.ru
ORCID iD: 0000-0002-6876-124X

биолог клинико-диагностическая лаборатория № 3

Россия, Иркутск

Юлия Кимовна Плотникова

Иркутский областной центр по профилактике и борьбе со СПИД и инфекционными заболеваниями; Иркутская государственная медицинская академия последипломного образования – филиал Российской медицинской академии непрерывного профессионального образования Минздрава России

Email: plot18@yandex.ru
ORCID iD: 0000-0003-2912-9118

кандидат медицинских наук, главный врач, доцент

Россия, Иркутск; Иркутск

Ольга Александровна Пономарева

Иркутский областной центр по профилактике и борьбе со СПИД и инфекционными заболеваниями

Email: poa@aids38.ru
ORCID iD: 0000-0001-9154-211X

врач, заведующая клинико-диагностической лабораторией № 3

Россия, Иркутск

Алексей Александрович Шулунов

Иркутский областной центр по профилактике и борьбе со СПИД и инфекционными заболеваниями

Email: Shulunov18@gmail.com
ORCID iD: 0009-0008-5034-3390

врач клинико-диагностической лаборатории № 3

Россия, Иркутск

Николай Николаевич Черкасов

Иркутский областной центр по профилактике и борьбе со СПИД и инфекционными заболеваниями

Email: mto_cherkasov_nn@mail.ru
ORCID iD: 0009-0006-1343-7051

биолог клинико-диагностической лаборатории №3

Россия, Иркутск

Петр Евгеньевич Вершинин

Иркутский областной центр по профилактике и борьбе со СПИД и инфекционными заболеваниями

Email: petr0trep@gmail.com
ORCID iD: 0009-0008-4605-9450

биолог клинико-диагностической лаборатории № 3

Россия, Иркутск

Елена Степановна Наумова

Иркутский областной центр по профилактике и борьбе со СПИД и инфекционными заболеваниями

Email: Naumova_e_s26@mail.ru
ORCID iD: 0009-0005-2724-6718

врач клинико-диагностической лаборатории № 3

Россия, Иркутск

Екатерина Аркадьевна Кузнецова

Иркутский областной центр по профилактике и борьбе со СПИД и инфекционными заболеваниями

Email: Atomarnaya@mail.ru
ORCID iD: 0009-0006-6967-6342

врач клинико-диагностической лаборатории № 3

Россия, Иркутск

Алена Ивановна Танхаева

Иркутский областной центр по профилактике и борьбе со СПИД и инфекционными заболеваниями

Email: alena.pilueva@mail.ru
ORCID iD: 0009-0009-9753-7042

биолог клинико-диагностической лаборатории № 3

Россия, Иркутск

Полина Алексеевна Полякова

Иркутский областной центр по профилактике и борьбе со СПИД и инфекционными заболеваниями

Email: poly.poliackova28@yandex.ru
ORCID iD: 0009-0004-4880-6828

биолог клинико-диагностической лаборатории № 3

Россия, Иркутск

Список литературы

  1. Бобкова М.Р. Лекарственная устойчивость ВИЧ. М.: Человек, 2014. 288 с. Bobkova M.R. [HIV drug resistance]. Moscow: Chelovek, 2014. 288 p. (In Russ.).
  2. Кравченко А.В., Кириченко А.А., Киреев Д.Е., Беляева В.В. Резистентность ВИЧ к антиретровирусной терапии. М.: ГЭОТАР-Медиа, 2023. 112 с. doi: 10.33029/9704-7620-8-RAT-2023-1-112. Kravchenko A.V., Kirichenko A.A., Kireev D.E., Belуaeva V.V. [HIV resistance to antiretroviral therapy]. Moscow: GEOTAR-Media, 2023. 112 p. (In Russ.). doi: 10.33029/9704-7620-8-RAT-2023-1-112
  3. HIV-1 Drug Resistance in ARV-naive Populations. Compendium of published virus sequences from 95,024 persons, 442 studies according to region, year and subtype. https://hivdb.stanford.edu/_wrapper/surveillance/map/
  4. Clutter D.S., Jordan M.R., Bertagnolio S., Shafer R.W. HIV-1 drug resistance and resistance testing. Infect. Genet. Evol. 2016; 46: 292–307. doi: 10.1016/j.meegid.2016.08.031
  5. Kirichenko A., Kireev D., Lapovok I., Shlykova A., Lopatukhin A., Pokrovskaya A. et al. HIV-1 Drug Resistance among Treatment-Naïve Patients in Russia: Analysis of the National Database, 2006–2022. Viruses 2023; 15: 991. doi: 10.3390/v15040991
  6. Bennett D.E., Camacho R.J., Otelea D., Kuritzkes D.R., Fleury H., Kiuchi M. et al. Drug resistance mutations for surveillance of transmitted HIV-1 drug-resistance: 2009 update. PLoS One 2009; 4(3): 4724. doi: 10.1371/journal.pone.0004724
  7. May M., Sterne J.A., Sabin C., Costagliola D., Justice A.C., Thiebaut R. et al. Prognosis of HIV-1-infected patients up to 5 years after initiation of HAART: collaborative analysis of prospective studies. AIDS 2007; 21(9): 1185–1197. doi: 10.1097/QAD.0b013e328133f285
  8. Sabin C.A., Smith C.J., Gumley H., Murphy G., Lampe F.C., Phillips A.N. et al. Late presenters in the era of highly active antiretroviral therapy: uptake of and responses to antiretroviral therapy. AIDS 2004; 18(16): 2145–2151. doi: 10.1097/00002030-200411050-00006
  9. Scherrer A.U., Boni J., Yerly S., Klimkait T., Aubert V., Furrer H. et al. Long-lasting protection of activity of nucleoside reverse transcriptase inhibitors and protease inhibitors (PIs) by boosted PI containing regimens. PLoS One 2012; 7(11): 50307. doi: 10.1371/journal.pone.0050307
  10. Lodi S., Günthard H.F., Gill J., Phillips A.N., Dunn D., Vu Q. et al. Effectiveness of Transmitted Drug Resistance Testing Before Initiation of Antiretroviral Therapy in HIV-Positive Individuals. J. Acquir. Immune. Defic. Syndr. 2019; 82(3): 314–320. doi: 10.1097/QAI.0000000000002135
  11. World Health Organization (WHO). Updated recommendations on first-line and second-line antiretroviral regimens and post-exposure prophylaxis and recommendations on early infant diagnosis of HIV Interim guidance. 2018. WHO-update-of-recommendations-on-first-and-second-line-ARV-regimens pdf
  12. Günthard H.F., Calvez V., Paredes R., Pillay D., Shafer R.W., Wensing A.M. et al. Human Immunodeficiency Virus Drug Resistance: 2018 Recommendations of the International Antiviral Society-USA Panel. Clin. Infect. Dis. 2019; 68(2): 177–187. doi: 10.1093/cid/ciy463
  13. Scherrer A.U., Yang W.L., Kouyos R.D., Böni J., Yerly S., Klimkait T. et al. Swiss HIV Cohort Study. Successful Prevention of Transmission of Integrase Resistance in the Swiss HIV Cohort Study. J. Infect. Dis. 2016; 214(3): 399–402. doi: 10.1093/infdis/jiw165
  14. Scherrer A.U., von Wyl V., Yang W.L., Kouyos R.D., Böni J., Yerly S. et al. Emergence of Acquired HIV-1 Drug Resistance Almost Stopped in Switzerland: A 15-Year Prospective Cohort Analysis. Clin. Infect. Dis. 2016; 62(10): 1310–1317. doi: 10.1093/cid/ciw128
  15. Günthard H.F., Saag M.S., Benson C.A., del Rio C., Eron J.J., Gallant J.E. et al. Antiretroviral Drugs for Treatment and Prevention of HIV Infection in Adults: 2016 Recommendations of the International Antiviral Society-USA Panel. JAMA 2016; 316(2): 191–210. doi: 10.1001/jama.2016.8900
  16. HIV drug resistance strategy, 2021 update. World Health Organization, 2021. https://www.who.int/publications/i/item/9789240030565
  17. Guidelines on the public health response to pretreatment HIV drug resistance: July 2017. World Health Organization, 2017. https://www.who.int/publications/i/item/9789241550055
  18. ВИЧ-инфекция у взрослых. Клинические рекомендации КР 79. М.: Национальная ассоциация специалистов по профилактике, диагностике и лечению ВИЧ-инфекции. Национальная вирусологическая ассоциация, 2020. 87 с. https://arvt.ru/sites/default/files/rf-2017-protokol-vich-vzroslie.pdf. [HIV infection in adults. Clinical guidelines KR 79]. Moscow, 2020. 87 p. (In Russ). https://arvt.ru/sites/default/files/rf-2017-protokol-vich-vzroslie.pdf
  19. Покровский В.В., Юрин О.Г., Кравченко А.В., Беляева В.В., Буравцова Е.В., Деулина М.О. и др. Рекомендации по лечению ВИЧ-инфекции и связанных с ней заболеваний, химиопрофилактике заражения ВИЧ. Эпидемиол. инфекц. болезни. Актуал. вопр. 2021; 11(4, приложение): 92 с.Pokrovskу V.V., Yurin O.G., Kravchenko A.V., Belyayeva V.V.. Buravtsova E.V., Deulina M.O. et al. [Recommendations for the treatment of HIV infection and related diseases, chemoprophylaxis of HIV infection]. Epidemiоlоgy and infectious diseases. Сurrent items 2021; 11(4, appendix): 92 р. (In Russ.).
  20. Guidelines for the Clinical Management and Treatment of HIV Infected Adults in Europe (Version 11.0; November 2021). Eur. AIDS Clin. Soc. http://www.eacsociety.org
  21. Надзор за распространением штаммов ВИЧ, резистентных к антиретровирусным препаратам: Методические рекомендации МР 3.1.5.0075/1-13. М.: Федеральный центр гигиены и эпидемиологии Роспотребнадзора, 2014. 58 с.[Surveillance of the spread of HIV strains resistant to antiretroviral drugs: Methodological recommendations MR 3.1.5.0075/1-13]. Moscow, 2014. 58 p. (In Russ.).
  22. Tamura K., Nei M. Estimation of the number of nucleotide substitutions in the control region of mitochondrial DNA in humans and chimpanzees. Molecular Biology and Evolution. 1993; (10): 512 –526.
  23. Tamura K., Stecher G., Kumar S. MEGA 11: Molecular Evolutionary Genetics Analysis Version 11. Molecular Biology and Evolution 2021. doi: 10.1093/molbev/msab120
  24. Paredes R., Tzou P.L., van Zyl G., Barrow G., Camacho R., Carmona S. et al. Collaborative update of a rule-based expert system for HIV-1 genotypic resistance test interpretation. PLoS One 2017; 12(7): 0181357. doi: 10.1371/journal.pone.0181357
  25. Rhee S.Y., Taylor J., Fessel W.J., Kaufman D., Towner W., Troia P. et al. HIV-1 protease mutations and protease inhibitor cross-resistance. Antimicrob Agents Chemother. 2010; 54(10): 4253–4261. doi: 10.1128/AAC.00574-10
  26. Lanier E.R., Ait-Khaled M., Scott J., Stone C., Melby T., Sturge G. et al. Antiviral efficacy of abacavir in antiretroviral therapy-experienced adults harbouring HIV-1 with specific patterns of resistance to nucleoside reverse transcriptase inhibitors. Antivir. Ther. 2004; 9(1): 37–45. doi: 10.1177/135965350400900102
  27. Azijn H., Tirry I., Vingerhoets J., de Béthune M.P., Kraus G., Boven K. et al. TMC278, a next-generation nonnucleoside reverse transcriptase inhibitor (NNRTI), active against wild-type and NNRTI-resistant HIV-1. Antimicrob. Agents. Chemother. 2010; 54(2): 718–727. doi: 10.1128/AAC.00986-09
  28. Rhee S.Y., Liu T., Ravela J., Gonzales M.J., Shafer R.W. Distribution of human immunodeficiency virus type 1 protease and reverse transcriptase mutation patterns in 4,183 persons undergoing genotypic resistance testing. Antimicrob. Agents Chemother. 2004; 48(8): 3122–3126. doi: 10.1128/AAC.48.8.3122-3126.2004
  29. Reuman E.C., Rhee S.Y., Holmes S.P., Shafer R.W. Constrained patterns of covariation and clustering of HIV-1 non-nucleoside reverse transcriptase inhibitor resistance mutations. J. Antimicrob. Chemother. 2010; 65(7): 1477– 1485. doi: 10.1093/jac/dkq140
  30. Maldonado J.O., Mansky L.M. The HIV-1 Reverse Transcriptase A62V Mutation Influences Replication Fidelity and Viral Fitness in the Context of Multi-Drug-Resistant Mutations. Viruses 2018; 10(7): 376. doi: 10.3390/v10070376

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML
Скачать
2. Рис. 1. Распространенность передающейся ЛУ ВИЧ по группам препаратов APT в выборках 2019 и 2023 г.

Скачать (38KB)
Метаданные
3. Рис. 2. Филогенетический анализ области гена ро/ВИЧ-1, кодирующей протеазу и 1 -273 аминокислоту обратной транскриптазы, проведенный по принципу максимального правдоподобия с помощью программы MEGA 11 ◆ — выборка 2019 г.,  ● — выборка 2023 г.

Скачать (761KB)
Метаданные

© ООО «Бионика Медиа», 2025