Молекулярногенетические исследования в эпидемиологии вирусных гепатитов: достижения и перспективы


Цитировать

Полный текст

Открытый доступ Открытый доступ
Доступ закрыт Доступ предоставлен
Доступ закрыт Доступ платный или только для подписчиков

Аннотация

Вирусные гепатиты являются широко распространёнными инфекционными болезнями и остаются значимой проблемой здравоохранения во всем мире. Развитие молекулярно-генетических методов исследования позволило значительно расширить представления о биологии возбудителей этих инфекций. В статье описаны современные взгляды на генетическую классификацию вирусов гепатитов А и В, приводятся данные о распространенности их генотипов и субтипов в мире и в России. На примере возбудителей этих инфекций раскрываются возможности и перспективы использования молекулярногенетических подходов для изучения характеристик эпидемического процесса вирусных гепатитов.

Полный текст

Доступ закрыт

Об авторах

Владимир Петрович Чуланов

Центральный НИИ эпидемиологии Роспотребнадзора

Email: vladimir.chulanov@pcr.ru
канд. мед. наук, зав. лаб. вирусных гепатитов отд. молекулярной диагностики и эпидемиологии

Алексей Дмитриевич Неверов

Центральный НИИ эпидемиологии Роспотребнадзора

Email: neva_2000@mail.ru
канд. биол. наук, ст. науч. сотр. лаб. вирусных гепатитов отд. молекулярной диагностики и эпидемиологии

Инга Вадимовна Карандашова

Центральный НИИ эпидемиологии Роспотребнадзора

Email: inga.karadashova@pcr.ru
канд. биол. наук, ст. науч. сотр. лаб. вирусных гепатитов отд. молекулярной диагностики и эпидемиологии

Николай Николаевич Пименов

Центральный НИИ эпидемиологии Роспотребнадзора

Email: n.pimenov@mail.ru
аспирант

Герман Александрович Шипулин

Центральный НИИ эпидемиологии Роспотребнадзора

Email: german.shipulin@pcr.ru
канд. мед. наук, руководитель отд. молекулярной диагностики и эпидемиологии

Список литературы

  1. WНO. Hepatitits A vaccines. WHO position paper. Weekly Epidemiol. Rec. 2000; 75: 38-44.
  2. Jacobsen K.H., Wiersma S.T. Hepatitis A virus seroprevalence by age and world region, 1990 and 2005. Vaccine 2010; 28(41): 6653-6657.
  3. WHO. Factsheet № 204: Hepatitis B. http://www.who.int/mediacentre/factsheets/fs204/en/index.html. Дата просмотра 26.06.2013.
  4. Robertson B.H., Jansen R.W., Khanna B., Totsuka A., Nainan O.V., Siegl G. et al. Genetic relatedness of hepatitis A virus strains recovered from different geographical regions. J. Gen. Virology. 1992; 73(Pt 6): 1365-1377.
  5. Nainan O.V., Xia G., Vaughan G., Margolis H.S. Diagnosis of hepatitis a virus infection: a molecular approach. Clin. Microbiol. Rev. 2006; 19(1): 63-79.
  6. Чуланов В.П., Пименов Н.Н., Карандашова И.В., Комарова С.В. Современные особенности эпидемического процесса гепатита А в России и странах Европы, определяющие стратегии его профилактики. Эпидемиол. и инфекц. бол. 2012; 3: 28-34.
  7. Wattanasri N., Ruchusatsawat K., Wattanasri S. Phylogenetic analysis of hepatitis A virus in Thailand. J. Med. Virol. 2005; 75(1): 1-7.
  8. Gharbi-Khelifi H., Ferre V., Sdiri K., Berthome M., Fki L., Harrath R. et al. Hepatitis A in Tunisia: phylogenetic analysis of hepatitis A virus from 2001 to 2004. J. Virol. Meth. 2006; 138(1-2): 109-116.
  9. Costa-Mattioli M., Ferre V., Monpoeho S., Garcia L., Colina R., Billaudel S. et al. Genetic variability of hepatitis A virus in South America reveals heterogeneity and co-circulation during epidemic outbreaks. J. Gen. Virol. 2001; 82(Pt 11): 2647-2652.
  10. Munné M.S., Vladimirsky S., Otegui L., Soto S., Brajterman L., Castro R. et al. Molecular characterization of hepatitis A virus isolates from Argentina. J. Med. Virol. 2007; 79(7): 887-894.
  11. De Paula V.S., Niel C., Teves S.C., Villar L.M., Virgolino H., Gaspar A.M. Molecular epidemiology of hepatitis A virus in Brazilian Amazon. J. Gastroenterol. Hepatol. 2006; 21(9): 1435-1438.
  12. Costa-Mattioli M., Domingo E., Cristina J. Analysis of sequential hepatitis A virus strains reveals coexistence of distinct viral subpopulations. J. Gen. Virol. 2006; 87(Pt 1): 115-118.
  13. Toyoda H., Kumada T., Kiriyama S., Sone Y., Tanikawa M., Hisanaga Y. et al. Clinical and molecular characteristics of hepatitis A virus infections during the years 1992-2003 in Ogaki, a centrally located city of Japan. J. Clin. Virol. 2009; 44(2): 145-148.
  14. Wheeler C., Vogt T.M., Armstrong G.L., Vaughan G., Weltman A., Nainan O.V. et al. An outbreak of hepatitis A associated with green onions. N. Engl. J. Med. 2005; 353(9): 890-897.
  15. Чуланов В.П. Эпидемиологическое и клиническое значение генетической гетерогенности вирусов гепатита А и В. Автореф. дис.. д-ра мед. наук. М., 2013.
  16. Moratorio G., Costa-Mattioli M., Piovani R., Romero H., Musto H., Cristina J. Bayesian coalescent inference of hepatitis A virus populations: evolutionary rates and patterns. J. Gen. Virol. 2007; 88(Pt 11): 3039-3042.
  17. Hanada K., Suzuki Y., Gojobori T. A large variation in the rates of synonymous substitution for RNA viruses and its relationship to a diversity of viral infection and transmission modes. Mol. Biol. Evol. 2004; 21(6): 1074-1080.
  18. Hutin Y.J., Pool V., Cramer E.H., Nainan O.V., Weth J., Williams I.T. et al. A multistate, foodborne outbreak of hepatitis A. National Hepatitis A Investigation Team. N. Engl. J. Med. 1999; 340(8): 595-602.
  19. Robesyn E., De Schrijver K., Wollants E., Top G., Verbeeck J., Van Ranst M. An outbreak of hepatitis A associated with the consumption of raw beef. J. Clin. Virol. 2009; 44(3): 207-210.
  20. Tallon L.A., Love D.C., Moore Z.S., Sobsey M.D. Recovery and sequence analysis of hepatitis a virus from springwater implicated in an outbreak of acute viral hepatitis. Appl. Environ. Microbiol. 2008; 74(19): 6158-6160.
  21. Yoon Y.K., Chun B.C., Lee H.K., Seo Y.S., Shin J.H., Hong Y.S. et al. Epidemiological and genetic analysis of a sustained community-wide outbreak of hepatitis A in the Republic of Korea, 2008: a hospital-based case-control study. J. Clin. Virol. 2009; 46(2): 184-188.
  22. Robertson B.H., Averhoff F., Cromeans T.L., Han Xh., Khoprasert B., Nainan O.V. et al. Genetic relatedness of hepatitis A virus isolates during a community-wide outbreak. J. Med. Virol. 2000. 62(2)144-150.
  23. Ngui S.L., Granerod J., Jewes L.A., Crowcroft N.S., Teo C.G. Outbreaks of hepatitis A in England and Wales associated with two co-circulating hepatitis A virus strains. J. Med. Virol. 2008. 80(7): 1181-1188.
  24. Sanchez G., Pinto R., Vanaclocha H., Bosch A. Molecular characterization of hepatitis a virus isolates from a transcontinental shellfish-borne outbreak. J. Clin. Microbiol. 2002; 40(11): 4148-4155.
  25. Карандашова И.В., Пименов Н.Н., Неверов А.Д., Михайловская Г.В., Долгин В.А., Браславская С.И. и др. Молекулярно-эпидемиологические особенности вспышки гепатита А в Москве. Эпидемиол. и инфекц. бол. 2012; (3): 9-14.
  26. Courouce A.M., Drouet J., Muller J.Y. Australia antigen subtypes identification. Results. Bibl. Haematol. 1976; (42): 89-127.
  27. Moriya T., Kuramoto I.K., Yoshizawa H., Holland P.V. Distribution of hepatitis B virus genotypes among American blood donors determined with a PreS2 epitope enzyme-linked immunosorbent assay kit. J. Clin. Microbiol. 2002; 40(3): 877-880.
  28. Okamoto H., Tsuda F., Sakugawa H., Sastrosoewignjo R.I., Imai M., Miyakawa Y. et al. Typing hepatitis B virus by homology in nucleotide sequence: comparison of surface antigen subtypes. J. Gen. Virol. 1988; 69(Pt 10): 2575-2583.
  29. Norder H., Hammas B., Löfdahl S., Couroucé A.M., Magnius L.O. Comparison of the amino acid sequences of nine different serotypes of hepatitis B surface antigen and genomic classification of the corresponding hepatitis B virus strains. J. Gen. Virol. 1992; 73(Pt 5): 1201-1208.
  30. Kidd-Ljunggren K., Miyakawa Y., Kidd A.H. Genetic variability in hepatitis B viruses. J. Gen. Virol. 2002; 83(Pt 6): 1267-1280.
  31. Tatematsu K., Tanaka Y., Kurbanov F., Sugauchi F., Mano S., Maeshiro T. et al. A genetic variant of hepatitis B virus divergent from known human and ape genotypes isolated from a Japanese patient and provisionally assigned to new genotype J. J. Virol. 2009; 83(20): 10538-10547.
  32. Huy T.T., Ngoc T.T., Abe K. New complex recombinant genotype of hepatitis B virus identified in Vietnam. J. Virol. 2008; 82(11): 5657-5663.
  33. Norder H., Couroucé A.M., Coursaget P., Echevarria J.M., Lee S.D., Mushahwar I.K. et al. Genetic diversity of hepatitis B virus strains derived worldwide: genotypes, subgenotypes, and HBsAg subtypes. Intervirology 2004; 47(6): 289-309.
  34. Devesa M., Loureiro C.L., Rivas Y., Monsalve F., Cardona N., Duarte M.C. et al. Subgenotype diversity of hepatitis B virus American genotype F in Amerindians from Venezuela and the general population of Colombia. J. Med.Virol. 2008; 80(1): 20-26.
  35. Arankalle V.A., Murhekar K.M., Gandhe S.S., Murhekar M.V., Ramdasi A.Y., Padbidri V.S. et al. Hepatitis B virus: predominance of genotype D in primitive tribes of the Andaman and Nicobar islands, India (1989-1999). J. Gen. Virol. 2003; 84(Pt 7): 1915-1920.
  36. Stuyver L., De Gendt S., Van Geyt C., Zoulim F., Fried M., Schinazi R.F. et al. A new genotype of hepatitis B virus: complete genome and phylogenetic relatedness. J. Gen. Virol. 2000; 81(Pt 1): 67-74.
  37. Suzuki S., Sugauchi F., Orito E., Kato H., Usuda S., Siransy L. et al. Distribution of hepatitis B virus (HBV) genotypes among HBV carriers in the Cote d’Ivoire: complete genome sequence and phylogenetic relatedness of HBV genotype E. J. Med. Virol. 2003; 69(4): 459-465.
  38. Pineiro Y., Mbayed V., Campos R. Evolutionary history of Hepatitis B virus genotype F: an in-depth analysis of Argentine isolates. Virus genes 2003; 27(1): 103-110.
  39. Vieth S., Manegold C., Drosten C., Nippraschk T., Günther S. Sequence and phylogenetic analysis of hepatitis B virus genotype G isolated in Germany. Virus genes 2002; 24(2): 153-156.
  40. Arauz-Ruiz P., Norder H., Robertson B., Magnius L. Genotype H: a new Amerindian genotype of hepatitis B virus revealed in Central America. J. Gen. Virol. 2002; 83(Pt 8): 2059-2073.
  41. Olinger C.M., Jutavijittum P., Hübschen J.M., Yousukh A., Samountry B., Thammavong T. et al. Possible new hepatitis B virus genotype, southeast Asia. Emerg. Inf. Dis. 2008; 14(11): 1777-1780.
  42. Chu C.J., Keeffe E.B., Han S.H., Perrillo R.P., Min A.D., Soldevila-Pico C. et al. Hepatitis B virus genotypes in the United States: results of a nationwide study. Gastroenterol. 2003; 125(2): 444-451.
  43. Chulanov V., Neverov A., Karandashova I., Dolgin V., Mikhailovskaya G., Lebedeva E. et al. Molecular epidemiology of HBV in Russia. Abstracts Book of 14th International Symposium on Viral Hepatitis and Liver Disease. Shanghai, 2012; 222.
  44. Pontisso P., Petit M.A., Bankowski M.J., Peeples M.E. Human liver plasma membranes contain receptors for the hepatitis B virus pre-S1 region and, via polymerized human serum albumin, for the pre-S2 region. J. Virol. 1989; 63(5): 1981-1988.
  45. Shokrgozar M.A., Shokri F. Subtype specificity of anti-HBs antibodies produced by human B-cell lines isolated from normal individuals vaccinated with recombinant hepatitis B vaccine. Vaccine 2002; 20(17-18): 2215-2220.
  46. Guirgis B.S., Abbas R.O., Azzazy H.M. Hepatitis B virus genotyping: current methods and clinical implications. Int. J. Inf. Dis. 2010; 14(11): е941-е953.
  47. Cowie B. Is there an optimal genetic target for molecular analysis of hepatitis B virus transmission? J. Clin. Microbiol. 2006; 44(8): 3051.
  48. Bracho M.A., Gosalbes M.J., González F., Moya A., González-Candelas F. Molecular epidemiology and evolution in an outbreak of fulminant hepatitis B virus. J. Clin. Microbiol. 2006; 44(4): 1288-1294.
  49. Datta S., Banerjee A., Chandra P.K., Chowdhury A., Chakravarty R. Genotype, phylogenetic analysis, and transmission pattern of occult hepatitis B virus (HBV) infection in families of asymptomatic HBsAg carriers. J. Med. Virol. 2006; 78(1): 53-59.
  50. Desmond C.P., Gaudieri S., James I.R., Pfafferott K., Chopra A., Lau G.K. Viral adaptation to host immune responses occurs in chronic hepatitis B virus (HBV) infection, and adaptation is greatest in HBV e antigen-negative disease. J. Virol. 2012; 86(2): 1181-1192.
  51. Maini M.K., Boni C., Lee C.K., Larrubia J.R., Reignat S., Ogg G.S. The role of virus-specific CD8(+) cells in liver damage and viral control during persistent hepatitis B virus infection. J. Exp. Med. 2000; 191(8): 1269-1280.
  52. Zoulim F. Mechanism of viral persistence and resistance to nucleoside and nucleotide analogs in chronic hepatitis B virus infection. Antiviral. Research. 2004; 64(1): 1-15.

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML
Скачать

Данный сайт использует cookie-файлы

Продолжая использовать наш сайт, вы даете согласие на обработку файлов cookie, которые обеспечивают правильную работу сайта.

О куки-файлах