Генетическая характеристика вариантов ВИЧ-1, циркулировавших в Гвинейской Республике в 2015-2017 гг


Цитировать

Полный текст

Открытый доступ Открытый доступ
Доступ закрыт Доступ предоставлен
Доступ закрыт Доступ платный или только для подписчиков

Аннотация

Несмотря на широкое распространение ВИЧ-инфекции в Африке, особенности эпидемии в ряде стран этого континента изучены недостаточно. Цель исследования. Молекулярно-биологический анализ вариантов ВИЧ, циркулировавших на территории Гвинейской Республики в 2015-2017гг. Материалы и методы. Была собрана коллекция образцов плазмы крови (п = 5566) от граждан, проживающих в Гвинейкой Республике, и проанализирована на наличие ВИЧ-инфекции. Исследованы нуклеотидные последовательности (сиквенсы) гена pol ВИЧ-1 в ВИЧ-позитивных образцах, определены структура и уровень лекарственной устойчивости вируса. Результаты. У 200 (3,59%) лиц была выявлена инфекция ВИЧ-1. Случаев инфекции ВИЧ-2 обнаружено не было. Получены сиквенсы для 35 образцов, из них 30 (85,71%) относились к AG-рекомбинантам, 6 (17,14%) содержали мутации устойчивости к НИОТ и ННИОТ.

Полный текст

Доступ закрыт

Об авторах

И. А Лаповок

ФБУН «Центральный НИИ эпидемиологии» Роспотребнадзора

Email: i_lapovok@mail.ru
к.б.н., научный сотрудник Москва, Россия

Д. В Салеева

ФБУН «Центральный НИИ эпидемиологии» Роспотребнадзора

Email: dasha_saleeva@inbox.ru
лаборант-исследователь Москва, Россия

А. А Кириченко

ФБУН «Центральный НИИ эпидемиологии» Роспотребнадзора

Email: kotova-kirichenko@mail.ru
младший научный сотрудник Москва, Россия

А. В Мурзакова

ФБУН «Центральный НИИ эпидемиологии» Роспотребнадзора

Email: murzakova_a.v@mail.ru
младший научный сотрудник Москва, Россия

А. Э Лопатухин

ФБУН «Центральный НИИ эпидемиологии» Роспотребнадзора

Email: a.lopatukhin@gmail.com
научный сотрудник Москва, Россия

Д. Е Киреев

ФБУН «Центральный НИИ эпидемиологии» Роспотребнадзора

Email: dmitkireev@yandex.ru
к.б.н., научный сотрудник Москва, Россия

Ж. А Касьян

ФКУЗ «Российский научно-исследовательский противочумный институт «Микроб» Роспотребнадзора

Email: kas.ja2na@rambler.ru
к.м.н., старший научный сотрудник отдела диагностики инфекционных заболеваний Саратов, Россия

Д. А Агафонов

ФКУЗ «Российский научно-исследовательский противочумный институт «Микроб» Роспотребнадзора

Email: stone_dragon@mail.ru
к.б.н., старший научный сотрудник отдела микробиологии Саратов, Россия

К. А Никифоров

ФКУЗ «Российский научно-исследовательский противочумный институт «Микроб» Роспотребнадзора

Email: nikiforov6666666@mail.ru
к.м.н., старший научный сотрудник отдела микробиологии Саратов, Россия

Н. А Плеханов

ФКУЗ «Российский научно-исследовательский противочумный институт «Микроб» Роспотребнадзора

Email: muscari.sp@yandex.ru
к.б.н., старший научный сотрудник отдела микробиологии Саратов, Россия

Р. Б Баяндин

ФБУН «Государственный научный центр вирусологии и биотехнологии «Вектор» Роспотребнадзора

Email: romb@ngs.ru
к.б.н., научный сотрудник Кольцово, Новосибирская область, Россия

М. Ю Карташов

ФБУН «Государственный научный центр вирусологии и биотехнологии «Вектор» Роспотребнадзора

Email: mikkartash@yandex.ru
к.б.н., старший научный сотрудник Кольцово, Новосибирская область, Россия

А. В Шиповалов

ФБУН «Государственный научный центр вирусологии и биотехнологии «Вектор» Роспотребнадзора

Email: shipovalov_av@vector.nsc.ru
научный сотрудник Кольцово, Новосибирская область, Россия

М. П Гашникова

ФБУН «Государственный научный центр вирусологии и биотехнологии «Вектор» Роспотребнадзора

Email: gashnikova_ mp@vector.nsc.ru
лаборант-исследователь Кольцово, Новосибирская область, Россия

Г. А Шипулин

ФБУН «Центральный НИИ эпидемиологии» Роспотребнадзора

Email: shipgerman@gmail.com
к.м.н., заведующий отделом молекулярной диагностики и эпидемиологии Москва, Россия

S. Boumbaly

Исследовательский институт прикладной биологии Гвинеи

Email: drboumbaly@yahoo.fr
к.б.н., директор докторской школы г. Киндия, Гвинейская Республика

M. Y Boiro

Исследовательский институт прикладной биологии Гвинеи

Email: myboiro@yahoo.fr
к.б.н., профессор, генеральный директор г. Киндия, Гвинейская Республика

Список литературы

  1. Delatorre E., Be G. Time-scale of minor HIV-1 complex circulating recombinant forms from Central and West Africa. BMC Evol. Biol. 2016; 16(1): 2490. doi: 10.1186/s12862-016-0824-8
  2. Worobey M., Gemmel M., Teuwen D.E., Haselkorn T., Kunstman K., Bunce M. et al. Direct evidence of extensive diversity of HIV-1 in Kinshasa by 1960. Nature 2008; 455: 661-4. doi: 10.1038/nature07390.
  3. Faria N.R., Rambaut A., Suchard M.A., Baele G., Bedford T., Ward M.J. et al. The early spread and epidemic ignition of HIV-1 in human populations. Science 2014; 56: 56-61. doi: 10.1126/science.1256739.
  4. Mir D., Jung M., Delatorre E., Vidal N., Peeters M., Bello G. Phylodynamics of the major HIV-1 CRF02_AG African lineages and its global dissemination. Infect. Genet. Evol. 2016; 46: 190-9. doi: 10.1016/j.meegid. 2016.05.017.
  5. HIV Databases of Los Alamos National Laboratory. https:// www.hiv.lanl.gov/content/index
  6. USAID HEALTH PROFILE: Guinea HIV/AIDS Report. 2005. https://web. archive.org/web/20081113214710/http:// www.usaid.gov/our_work/global_health/aids/Countries/africa/ guinea_05.pdf
  7. UNAIDS. Giunea country factsheets report 2017. http://www. unaids.org/en/ regionscountries/countries/guinea.
  8. Charpentier C., Bellecave P., Cisse M., Mamadou S., Diakite M., Peytavin G. et al. High prevalence of antiretroviral drug resistance among HIV-1-untreated patients in Guinea-Conakry and in Niger. Antivir. Ther. 2011; 16(3): 429-33. DOI: 10.3851/ IMP1754.
  9. Freimanis G.L., Loua A., Allain J.P. HIV-1 subtypes D and F are prevalent in Guinea Conakry. J. Clin. Virol. 2012; 53(4): 350-3. doi: 10.1016/j.jcv. 2011.12.026.
  10. Diouara A.A., Ndiaye H.D., Guindo I., Bangoura N., Ciss6 M., Edmond T. et al. Antiretroviral treatment outcome in HIV- 1-infected patients routinely followed up in capital cities and remote areas of Senegal, Mali and Guinea-Conakry. J. Int. AIDS Soc. 2014; 17: 19315. doi: 10.7448/IAS.17.1.19315.
  11. Los Alamos HIV database. https://www.hiv.lanl.gov.
  12. Riva C., Romano L., Saladini F., Lai A., Carr J.K., Francisci D. et al. Identification of a possible ancestor of the subtype A1 HIV Type 1 variant circulating in the former Soviet Union. AIDS Res Hum Retroviruses. AIDS Res. Hum. Retroviruses 2008; 24(10): 1319-25. doi: 10.1089/aid.2008. 0119.
  13. Men6ndez-Arias L., Alvarez M. Antiretroviral therapy and drug resistance in human immunodeficiency virus type 2 infection. Antiviral Res. 2014; 102: 70-86. DOI: 10.1016/j. antiviral.2013.12.001.
  14. World Health Organization. Ebola situation report 16 December 2015. http://apps.who.int/iris/bitstream/10665/202501/1/ ebolasitrep_16Dec2015_eng.pdf
  15. Leuenberger D., Hebelamou J., Strahm S., De Rekeneire N., Balestre E., Wandeler G. Dabis F; IeDEA West Africa study group. Impact of the Ebola epidemic on general and HIV care in Macenta, Forest Guinea, 2014. AIDS. 2015; 29(14): 1883-7. doi: 10.1097/QAD.0000000000000784.
  16. Ndawinz J.D., Ciss6 M., Diallo M.S., Sidibd C.T., D’Ortenzio E. Prevention of HIV spread during the Ebola outbreak in Guinea. Lancet 2015; 385(9976): 1393.
  17. REGA HIV-1 Subtyping Tool - Version 3.0. http://dbpartners. stanford.edu: 8080/RegaSubtyping/stanford-hiv/typingtool/.
  18. COMET HIV-1 v2.2 Subtyping Tool. https://comet.lih.lu.
  19. Stanford University HIV Drug Resistance Database. http:// hivdb.stanford.edu.
  20. Major HIV-1 Drug Resistance Mutations. Updated Feb 4, 2019. https://hivdb. stanford.edu/assets/media/resistance-mutation-handout-feb2019.b0204a57. pdf

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML
Скачать

© ООО «Бионика Медиа», 2019

Данный сайт использует cookie-файлы

Продолжая использовать наш сайт, вы даете согласие на обработку файлов cookie, которые обеспечивают правильную работу сайта.

О куки-файлах