Лекарственная устойчивость ВИЧ-1 у пациентов с вирусологической неэффективностью АРТ в России (2013- 2021 гг.)


Цитировать

Полный текст

Открытый доступ Открытый доступ
Доступ закрыт Доступ предоставлен
Доступ закрыт Доступ платный или только для подписчиков

Аннотация

Цель исследования. Оценка распространенности и структуры лекарственной устойчивости (ЛУ) ВИЧ-1 среди пациентов с вирусологической неэффективностью АРТ в России в период с 2013 по 2021 г. Материалы и методы. Были использованы образцы плазмы крови от 831 ВИЧ-инфицированного пациента с вирусологической неэффективностью АРТ. Для всех пациентов были получены нуклеотидные последовательности фрагментов генаpol, кодирующих протеазу и часть обратной транскриптазы, для 273 из них дополнительно получены нуклеотидные последовательности фрагмента гена pol, кодирующего интегразу ВИЧ-1. Для субтипирования ВИЧ-1 использовали базу данных Стэнфордского университета HIVdb (v. 9.0) и REGA HIV-1 Subtyping Tool (v. 3.0), для уточнения результатов - HIV Blast международной базы данных института Лос-Аламос, для выявления мутаций резистентности и определения прогностической ЛУ ВИЧ-1 - HIVdb (v. 9.0). Результаты. Выборка включала преимущественно генетические варианты вируса А6 (728; 87,6%), CRF 02 AG (21; 2, 5%), B (59; 7,1%) и CRF63 02A1 (15; 1,8%). У 82,4% пациентов с неуспехом терапии была обнаружена прогностическая ЛУ хотя бы к одному препарату: чаще - к НИОТ(74,2%) и ННИОТ (67,3%), реже - к ИИ (12,1%) и ИП (9,6%). В большинстве случаев была установлена резистентность одновременно к НИОТ + ННИОТ(45,8-57%). Мультирезистентность к ИП + НИОТ + ННИОТ + ИИ была обнаружена только в 1,1% случаев. Заключение. Необходимо централизованное проведение теста на ЛУ ВИЧ-1 пациентам с вирусологической неэффективностью АРТ для подбора эффективных схем терапии, а также минимизации возникновения и дальнейшего распространения резистентных вариантов ВИЧ-1 на территории России.

Полный текст

Доступ закрыт

Об авторах

Алина Алексеевна Кириченко

Центральный НИИ эпидемиологии Роспотребнадзора

Email: kotova-kirichenko@mail.ru
научный сотрудник

Дмитрий Евгеньевич Киреев

Центральный НИИ эпидемиологии Роспотребнадзора

Email: dmitkireev@yandex.ru
к.б.н., заведующий лабораторией диагностики и молекулярной эпидемиологии ВИЧ-инфекции

Анастасия Вениаминовна Шлыкова

Центральный НИИ эпидемиологии Роспотребнадзора

Email: murzakova_a.v@mail.ru
научный сотрудник

Алексей Эдуардович Лопатухин

Центральный НИИ эпидемиологии Роспотребнадзора

Email: a.lopatukhin@gmail.com
научный сотрудник

Илья Андреевич Лаповок

Центральный НИИ эпидемиологии Роспотребнадзора

Email: i_ lapovok@mail.ru
к.б.н., старший научный сотрудник

Дарья Владиславовна Салеева

Центральный НИИ эпидемиологии Роспотребнадзора

Email: dasha_ saleeva@inbox.ru
младший научный сотрудник

Алексей Викторович Кравченко

Центральный НИИ эпидемиологии Роспотребнадзора

Email: alexey-kravtchenko@yandex.ru
д.м.н., профессор, ведущий научный сотрудник

Вадим Валентинович Покровский

Центральный НИИ эпидемиологии Роспотребнадзора

Email: pokrovsky.vad@yandex.ru
академик РАН, д.м.н., профессор, руководитель отдела

Список литературы

  1. Справка по ВИЧ-инфекции в Российской Федерации на 31.12.2020. М., 2018. http://www.hivrussia.info/wp-content/ uploads/2021/03/VICH-infektsiya-v-Rossijskoj-Federatsii-na-31.12.2020-pdf
  2. Cohen M.S., Chen Y.Q., McCauley M., Gamble T., Hosseinipour M.C., Kumarasamy N. et al.; HPTN 052 Study Team. Antiretroviral Therapy for the Prevention of HIV-1 Transmission. N. Engl. J. Med. 2016; 375(9): 830-839. doi: 10.1056/NEJMoa1600693
  3. Cohen M.S., Chen Y.Q., McCauley M., Gamble T., Hosseinipour M.C., Kumarasamy N. et al.; HPTN 052 Study Team. Prevention of HIV-1 infection with early antiretroviral therapy. N. Engl. J. Med. 2011; 365(6): 493-505. doi: 10.1056/ NEJMoa1105243
  4. Rodger A.J., Cambiano V., Bruun T., Vernazza P., Collins S., van Lunzen J. et al.; PARTNER Study Group. Sexual Activity Without Condoms and Risk of HIV Transmission in Serodifferent Couples When the HIV-Positive Partner Is Using Suppressive Antiretroviral Therapy. JAMA 2016; 316(2): 171-181. doi: 10.1001/ jama.2016.5148.
  5. Rodger A.J., Cambiano V., Bruun T., Vernazza P., Collins S., Degen O et al.; PARTNER Study Group. Risk of HIV transmission through condomless sex in serodifferent gay couples with the HIV-positive partner taking suppressive antiretroviral therapy (PARTNER): final results of a multicentre, prospective, observational study. Lancet 2019; 393(10189): 2428-2428. doi: 10.1016/S0140-6736(19)30418-0
  6. Ладная Н.Н., Покровский В.В., Дементьева Л.А., Соколова Е.В. Эпидемическая ситуация по ВИЧ-инфекции в Российской Федерации в 2019 г. Эпидемиол. инфекц. болезни. Актуал. вопр. 2020; 10(3): 17-26. DOI: https://dx.doi.org/10.18565/epidem.2020.10.3.17-26
  7. Pokrovskaya A.V., Popova A.A., Suvorova Z.K., Dementieva L.A., Pokrovsky V.V. Progress in HIV Cascade in Russia from 2011 to 2019. Journal of the International AIDS Society 2020: 23(S7): e25616
  8. Clutter D.S., Jordan M.R., Bertagnolio S., Shafer R.W. HIV-1 drug resistance and resistance testing. Infect. Genet. Evol. 2016; 46: 292-307. doi: 10.1016/j.meegid.2016.08.031
  9. Surveillance of HIV drug resistance in adults receiving ART (acquired HIV drug resistance): concept note. WHO, 2014. 46 p. https://apps.who.int/iris/handle/10665/112801
  10. Guidelines on the public health response to pretreatment HIV drug resistance. Geneva: WHO, 2017. 84 p. https://apps.who.int/iris/bitstream/handle/10665/255880/9789241550055-eng.pdf
  11. WHO HIVResNet HIV drug resistance laboratory operational framework. Geneva: WHO, 2020. 82 p. https://www.who.int/publications/i/item/978-92-4-000987-5
  12. Yang W.L., Kouyos R., Scherrer A.U., Bon J., Shah C., Yerly S. et al. Swiss HIV Cohort Study. Assessing the Paradox Between Transmitted and Acquired HIV Type 1 Drug Resistance Mutations in the Swiss HIV Cohort Study From 1998 to 2012. J. Infect. Dis. 2015; 212(1): 28-38. doi: 10.1093/infdis/jiv012.
  13. Rocheleau G., Brumme C.J., Shoveller J., LimaV.D., Harrigan P.R. Longitudinal trends of HIV drug resistance in a large Canadian cohort, 1996-2016. Clin. Microbiol. Infect. 2018; 24(2): 185-191. doi: 10.1016/j.cmi.2017.06.014
  14. Егорова Н., Михайлов А., Лисенков Д., Бабихина К., Головин С. Результаты исследования рынка диагностических тест-систем для выявления и мониторинга лечения ВИЧ-инфекции в России в 2018-2019 г. СПб.: Коалиция по готовности к лечению, 2020; 76 с.
  15. Кириченко А.А., Мурзакова А.В., Киреев Д.Е. Структура и уровень мутаций лекарственной устойчивости ВИЧ-1 у пациентов с вирусологической неудачей лечения. Материалы IX Всероссийской научно-практической конференции с международным участием «Молекулярная диагностика 2017». М.: ООО «Юлис», 2017; 462-463
  16. Коломеец А.Н., Довгополюк Е.С., Сергеева И.В., Ястребов В.К., Тюменцев А.Т. Показатели лекарственной устойчивости вируса иммунодефицита человека к антиретровирусным препаратам у ВИЧ-инфицированных лиц в Сибирском федеральном округе в 2010-2012 гг. Вопросы вирусологии 2015; 60(1): 20-23
  17. Плотникова Ю.К., Ревизор А.О., Пономарева О.А., Круглова Е.А. Генетическое разнообразие ВИЧ-1 на территории Иркутской области. Материалы IX Всероссийской научно-практической конференции с международным участием «Молекулярная диагностика 2017». М.: ООО «Юлис», 2017; 479-480
  18. Останкова Ю.В., Щемелев А.Н., Зуева Е.Б., Чурина М.А., Валутите Д.Э., Семенов А.В. Молекулярная эпидемиология и фармакорезистентность ВИЧупациентов с вирусологической неэффективностью антиретровирусной терапии в Архангельской области. ВИЧ-инфекция и иммуносупрессии 2019; 11(4): 79-90. https://doi.org/10.22328/2077-9828-2019-11-4-79-90
  19. PhillipsA.N., StoverJ., CambianoV., Nakagawa F., Jordan M.R., Pillay D. et al. Impact of HIV Drug Resistance on HIV/ AIDS-Associated Mortality, New Infections, and Antiretroviral Therapy Program Costs in Sub-Saharan Africa. J. Infect. Dis. 2017; 215(9): 1362-1365. doi: 10.1093/infdis/jix089.
  20. Кириченко А.А., Киреев Д.Е., Кравченко А.В., Покровская А.В., Куимова У.А., Сизова Н.В. и др. Оценка лекарственной устойчивости ВИЧ-1 к элсульфавирину и эффективность его применения среди российских пациентов, ранее не получавших антиретровирусные препараты. Журнал инфектологии 2020; 12(5): 29-39. https://doi.org/10.22625/2072-6732-2020-12-5-29-39
  21. Лаповок И.А., ЛопатухинА.Э., КиреевД.Е., Казеннова Е.В., Лебедев А.В., Бобкова М.Р. и др. Молекулярноэпидемиологический анализ вариантов ВИЧ-1, циркулировавших в России в 1987-2015 гг. Тер. архив 2017; 89(11): 44- 49. doi: 10.17116/terarkh2017891144-49
  22. Кириченко А.А., Киреев Д.Е., Лопатухин А.Э., Мурзакова А.В., Лаповок И.А., Ладная Н.Н., Покровский В.В. Уровень и структура лекарственной устойчивости ВИЧ-1 среди пациентов без опыта приема антиретровирусных препаратов с момента начала применения антиретровирусной терапии в Российской Федерации. ВИЧ-инфекция и иммуносупрессии 2019; 11(2): 75-83. DOI: http://dx.doi.org/10.22328/2077-9828-2019-11-2-75-83
  23. Казеннова Е.В., Лаповок И.А., Лага В.Ю., Васильев А.В., Бобкова М.Р. Естественные полиморфизмы гена pol варианта ВИЧ-1 IDU-A. ВИЧ-инфекция и иммуносупрессии 2012; 4(4): 44-51
  24. Устойчивость, репликативные свойства и фитнес ВИЧ. В кн: Лекарственная устойчивость ВИЧ. М.: Человек, 2014. 288 с
  25. Kolomeets A.N., Varghese V., Lemey P., Bobkova M.R., Shafer R.W. A uniquely prevalent nonnucleoside reverse transcriptase inhibitor resistance mutation in Russian subtype A HIV-1 viruses. AIDS 2014; 28(17): F1-8. doi: 10.1097/QAD.0000000000000485
  26. Chimukangara B., Lessells R.J., Rhee S.Y., Giandhari J., Kharsany A.B.M., Naidoo K. et al. Trends in Pretreatment HIV-1 Drug Resistance in Antiretroviral Therapynaive Adults in South Africa, 2000-2016: A Pooled Sequence Analysis. EClinicalMedicine 2019; (9): 26-34. doi: 10.1016/j.eclinm.2019.03.006
  27. Matias-Florentino M., Chaillon A., Avila-Rios S., Mehta S.R., Paz-Juirez H.E., Becerril-Rodriguez M.A. et al. Pretreatment HIV drug resistance spread within transmission clusters in Mexico City. J. Antimicrob. Chemother. 2020; 75(3): 656-667. doi: 10.1093/jac/dkz502
  28. Little S.J., Frost S.D.W., Wong J.K., Smith D.M., Pond S.L., Ignacio C.C. et al. Persistence of transmitted drug resistance among subjects with primary human immunodeficiency virus infection. J. Virol. 2008; 82(11): 5510-5518. D0I:10.1128/JVI.02579-07
  29. Покровский В.В., Юрин О.Г., Кравченко А.В., Беляева В.В., Буравцова В.В., Деулина М.О. и др. Рекомендации по лечению ВИЧ-инфекции и связанных с ней заболеваний, химиопрофилактике заражения ВИЧ. Эпидемиол. инфекц. болезни. Актуал. вопр. 2019; (4, приложение). 88 с. https://epidemiology-journal.ru/ru/archive/edition/10017
  30. Castagna A., Maggiolo F., Penco G., Wright D., Mills A., Grossberg R. et al.; VIKING-3 Study Group. Dolutegravir in antiretroviral-experienced patients with raltegravir- and/ or elvitegravir-resistant HIV-1: 24-week results of the phase III VIKING-3 study. J. Infect. Dis. 2014; 210(3): 354-362. doi: 10.1093/infdis/jiu051

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML
Скачать

© ООО «Бионика Медиа», 2021

Данный сайт использует cookie-файлы

Продолжая использовать наш сайт, вы даете согласие на обработку файлов cookie, которые обеспечивают правильную работу сайта.

О куки-файлах