Изучение передачи лекарственной устойчивости ВИЧ-1 в Республике Армения с помощью биоинформатичских методов


Цитировать

Полный текст

Открытый доступ Открытый доступ
Доступ закрыт Доступ предоставлен
Доступ закрыт Доступ платный или только для подписчиков

Аннотация

Цель исследования. Анализ уровня лекарственной устойчивости (ЛУ) и структуры мутаций резистентности во фрагментах гена pol ВИЧ-1 к антиретровирусным препаратам (АРВП) среди ВИЧ-инфицированных наивных пациентов в Республике Армения; изучение особенностей передачи вариантов ВИЧ-1 и степень их генетического родства с вирусами, циркулирующими в РФ. Материалы и методы. Выполнен анализ 546 нуклеотидных последовательностей фрагмента гена pol, выделенных от ВИЧ-инфицированных пациентов без опыта приема АРТ из Республики Армения. Нуклеотидные последовательности анализировали на наличие мутаций резистентности и уровень ЛУ к АРВП с помощью базы данных Стэнфордского университета и инструмента CPR. Оценивали мутации из листа SDRM 2009 г. в соответствии со стандартными протоколами ВОЗ. Субтипы ВИЧ были определены с помощью базы Стэнфордского университета и подтверждены филогенетическим анализом. Результаты. Уровень распространения мутаций, ассоциированных с прогностической ЛУ, составил 16,3%. Уровень передаваемой ЛУ составил 5,5%, что ВОЗ классифицирует как умеренный. Наиболее высокая ЛУ была обнаружена к 2препаратам класса ННИОТ(NVP, EFV) и 2 препаратам класса НИОТ (FTC, 3TC). Анализ генетических вариантов ВИЧ-1 в Республике Армения и РФ показал высокую генетическую схожесть эпидемий, протекающих в этих странах. Заключение. Выявлен рост ЛУ к АРВП с 1,5 до 5,5%. Установлен высокий (3,8%) уровень устойчивости к EFV, который назначали как препарат первой линии терапии. Важно проводить эпидемиологический надзор за распространением ЛУ в регионе в связи с увеличением охвата пациентов АРТ.

Полный текст

Доступ закрыт

Об авторах

Ольга Алексеевна Осадчая

Центральный НИИ эпидемиологии Роспотребнадзора

Email: osadchaya96@yandex.ru
младший научный сотрудник

Павел Васильевич Ерошкин

Центральный НИИ эпидемиологии Роспотребнадзора

Email: eroshkinpvl@gmail.com

Алина Алексеевна Кириченко

Центральный НИИ эпидемиологии Роспотребнадзора

Email: kotova-kirichenko@mail.ru
научный сотрудник

Илья Андреевич Лаповок

Центральный НИИ эпидемиологии Роспотребнадзора

Email: i_lapovok@mail.ru
к.б.н., старший научный сотрудник

Дарья Владиславовна Салеева

Центральный НИИ эпидемиологии Роспотребнадзора

Email: dasha_saleeva@inbox.ru
младший научный сотрудник

Алексей Эдуардович Лопатухин

Центральный НИИ эпидемиологии Роспотребнадзора

Email: a.lopatukhin@gmail.com
научный сотрудник

Анастасия Вениаминовна Шлыкова

Центральный НИИ эпидемиологии Роспотребнадзора

Email: murzakova_a.v@mail.ru
научный сотрудник

Дмитрий Евгеньевич Киреев

Центральный НИИ эпидемиологии Роспотребнадзора

к.б.н., заведующий лабораторией

Трдат Рафаелович Григорян

ГНО «Республиканский центр по профилактике СПИДа», Ереван

Email: gtrdat@yahoo.com
специалист по мониторингу и оценке

Аршак Размикович Петросян

ГНО «Республиканский центр по профилактике СПИДа», Ереван

Email: a_petrosyan@list.ru
врач-лаборант лаборатории ПЦР, микробиологии, вирусологии и генетики

Татевик Амировна Сархатян

ГНО «Республиканский центр по профилактике СПИДа», Ереван

Email: sarhatyantatev@mail.ru
врач-лаборант лаборатории ПЦР, микробиологии, вирусологии и генетики

Вадим Валентинович Покровский

Центральный НИИ эпидемиологии Роспотребнадзора

Email: pokrovsky.vad@yandex.ru
академик РАН, д.м.н., профессор, заведующий специализированным отделом эпидемиологии и профилактики СПИД

Список литературы

  1. ЮНЭЙДС. Информационный бюллетень 2021 г. https://www.unaids.org/sites/default/files/media_asset/UNAIDS_FactSheet_ru.pdf
  2. Aibekova L., Foley B., Hortelano G. et al. Molecular epidemiology of HIV-1 subtype A in former Soviet Union countries. PLoS One 2018; 13(2): e0191891. doi:10.1371/ journal.pone. 0191891
  3. ЮНЭЙДС. Армения, информационный бюллетень по стране. https://www.unaids.org/en/regionscountries/countries/armenia
  4. ВИЧ-инфекция 2019. Информационный бюллетень № 45. М.: Федеральный научно-методический центр по профилактике и борьбе со СПИДом, 2020. http://www.hivrussia.info/wp-content/uploads/2020/12/Byulleten-45-VICH-infektsiya-2019-g..pdf
  5. Levi J., Raymond A., Pozniak A., Vernazza H., Kohler P., Hill A. Can the UNAIDS 90-90-90 target be achieved? A systematic analysis of national HIV treatment cascades. BMJ Global Health. 2016; 1(2): e000010. doi: 10.1136/bmjgh-2015 000010
  6. Мониторинг закупок препаратов для лечения ВИЧ-инфекции и ВГС; выработка решений по оптимизации ситуации с целью способствования бесперебойному доступу к препаратам в Республике Армения, 2018-2019. Отчет международной коалиции по готовности к лечению. https://itpcru.org/2019/11/12/rezultaty-monitoringa-zakupok-preparatov-dlya-lecheniya-vich-infekczii-i-gepatita-s-v-armenii-v-2018-godu/
  7. Laga V., Vasilyev A., Lapovok I., Grigoryan S., Papoyan A., Glushchenko N. et al. HIV Type 1 Subtype A1 Dominates in Armenia. Curr. HIV Res. 2015; 13(3): 219-25. PMID: 25845390
  8. WHO/HIVResNet HIV Drug resistance laboratory operational framework. Geneva: World Health Organizations, 2017. https://www.who.int/publications/i/item/978-92-4-000987-5
  9. Bennett D.E., Camacho R.J., Otelea D., Otelea D., Kuritzkes D. R., Fleury H. et. al. Drug Resistance Mutations for Surveillance of Transmitted HIV-1 Drug-resistance: 2009 Updata. PLos ONE 2009; 4(3): 1-8.
  10. Foley B.T, Leitner T., Paraskevis D., Petter M. Primate immunodeficiency virus classification and nomenclature. Review. Infect. Genet. Evol. 2016; 46: 150-58.
  11. Taylor B.S., Sobieszczyk M.E., McCutchan F.E., Hammer S.M. The challenge of HIV-1 subtype diversity. N. Engl. J. Med. 2008; 358(15): 1590-1602.
  12. Кириченко А.А., Киреев Д.Е., Лопатухин А.Э., Лаповок И.А., Ладная Н.Н., Покровский В.В. Уровень и структура лекарственной устойчивости ВИЧ-1 среди пациентов без опыта приема антиретровирусных препаратов с момента начала применения антиретровирусной терапии в Российской Федерации. ВИЧ-инфекция и иммуносупрессии 2019; 11(2): 75-83. http://dx.doi.org/10.22328/2077-9828-2019-11-2-75-83
  13. Lapovok I., Murzakova A., Lopatukhin A. Prevalence of HIV-1 drug resistance mutations among ART-naive patients in Russia from 2005 to 2015. Proceedings of 14 European Meeting on HIV & Hepatitis. Rev. Antivir. Ther. Infect. Dis. 2016; (4): 83-4
  14. Guidelines on the public health response to pretreatment HIV drug resistance. Geneva: World Health Organizations, July 2017. https://apps.who.int/iris/bitstream/handle/10665/255880/9789241550055-eng.pdf;jsessionid=A0D04673B7BD675E51A4774A72435012?sequence=1
  15. Bennett D.E., Myatt M., Bertagolio S., Suthertand D., Gilks C.P. Recommendations for surveillance of transmitted HIV drug resistance countries scaling up antiretroviral treatment. Antivir. Ther. 2008; 13(Suppl. 2): 25-36

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML
Скачать

© ООО «Бионика Медиа», 2021

Данный сайт использует cookie-файлы

Продолжая использовать наш сайт, вы даете согласие на обработку файлов cookie, которые обеспечивают правильную работу сайта.

О куки-файлах