Estimation of genetic diversity of Karelian birch populations in Kareliausing microsatellite markers
- Authors: Vetchinnikova L.V1, Titov A.F2, Topchieva L.V2, Rendakov N.L2
-
Affiliations:
- Forest Research Institute KarSR RAS, Petrozavodsk, Republic of Karelia, RF
- Institute of Biology KarSR RAS, Petrozavodsk, Republic of Karelia, RF
- Issue: Vol 10, No 1 (2012)
- Pages: 34-37
- Section: Articles
- Submitted: 18.11.2016
- Published: 15.03.2012
- URL: https://journals.eco-vector.com/ecolgenet/article/view/5752
- DOI: https://doi.org/10.17816/ecogen10134-37
- ID: 5752
Cite item
Full Text
Abstract
We studied genetic structure of populations of Karelian birch Betula pendula var. carelica (Mercklin) Hämet-Ahti, whichlacks second growth. Based on the values of expected and observed heterozygosity, the predominantselection of homozygotes on the background of decrease of the heterozygotes fraction was revealed. Interpopulation differentiation rate (Fst = 0,145) indicates a high inbreeding frequency. Observed genetic characteristics of the populationssuggest that genetic mechanisms play a role in the current decrease of thepopulation size of Karelian birch and its genetic degradation.
About the authors
Lidia V Vetchinnikova
Forest Research Institute KarSR RAS, Petrozavodsk, Republic of Karelia, RF
Email: vetchin@krc.karelia.ru; lvv_krc@mail.ru
Alexander F Titov
Institute of Biology KarSR RAS, Petrozavodsk, Republic of Karelia, RF
Email: titov@krc.karelia.ru
Ludmila V Topchieva
Institute of Biology KarSR RAS, Petrozavodsk, Republic of Karelia, RF
Email: topchiev@krc.karelia.ru 185910, Petrozavodsk, Pushkinskaya st., 11
Nikolay L Rendakov
Institute of Biology KarSR RAS, Petrozavodsk, Republic of Karelia, RF
Email: nlrend@mail.ru 185910, Petrozavodsk, Pushkinskaya st., 11
References
- Артемьев А. В., Ветчинникова Л. В., Гнатюк Е. П. и др., 2007. Красная книга Республики Карелия/под ред. Э. В. Ивантера, О. Л. Кузнецова. Петрозаводск: Карелия. 368 с.
- Алтухов Ю. П., 2003. Генетические процессы в популяциях М.: Академкнига, 431 с.
- Алтухов Ю. П., Салменкова Е. А., Курбатова О. Л. и др., 2004. Динамика популяционных генофондов при антропогенных воздействиях. М.: Наука, 619 с.
- Баранов О. Ю., Марковская Ю. А., 2003. Особенности генетической структуры березы карельской по гену Gpi-2//Проблемы лесоведения и лесоводства: Сб. науч. трудов Ин-та леса НАН Белоруси. Вып. 50. Гомель: ИЛ НАН Беларуси. С. 181-185.
- Ветчинникова Л. В., 2006. Обследование популяции карельской березы на территории Музея-заповедника Кижи -охраняемого природного объекта и национального достояния Республики Карелия//Бюллетень экологических исследований на территории Государственного музея-заповедника «Кижи». 2005 год. Петрозаводск: ФГУК «Государственный музей-заповедник «Кижи». С. 19-23.
- Ветчинникова Л. В., 2005. Карельская береза и другие редкие представители рода Betula L. М.: Наука. 269 с.
- Ермаков В. И., 1986. Механизмы адаптации березы к условиям Севера. Л.: Наука, Ленинградское отделение. 144 с.
- Никитина Т. В., Назаренко С. А., 2004. Микросателлитные последовательности ДНК человека: мутационный процесс и эволюция//Генетика. Т. 40. № 10. С. 1301-1318.
- Николаевская Т. С., Ветчинникова Л. В., Лебедева О. Н., Кузнецова Т. Ю., 2008. Морфофизиологическая характеристика пыльцы различных видов березы в условиях Восточной Фенноскандии//Труды Карельского научного центра РАН. Серия Биогеография. Выпуск 14. Петрозаводск. С. 84-91.
- Топчиева Л. В., Ветчинникова Л. В., Малышева И. Е. и др., 2008. Оценка генетического разнообразия попу-ляции карельской березы с использованием РАПД-маркеров//Актуальные проблемы сохранения биоразно-образия в экстремальных условиях северного климата. Апатиты: «К&М». С. 91-92.
- Щурова М. Л., 2006. Будущее карельской березы в Карелии//Лесной вестник. МГУЛ, № 5, С. 64.
- Kulju K. K. M., Pekkinen M., Varvio S., 2004. Twenty-three microsatellite primer pairs for Betula pendula (Betulaceae)//Molecular Ecology Notes. Vol. 4. P. 471-473.
- Zeng J., Zou Y., Bai J., Zheng H., 2003. RAP D analysis of genetic variation in natural populations of Betula alnoides from Guangxi, China//Euphytica. Vol. 134. N 1. P. 33-41.