Дифференциальное распределение 5-формилцитозина и 5-карбоксилцитозина в сперматогенных клетках и сперматозоидах человека
- Авторы: Ефимова О.А.1, Крапивин М.И.1, Парфеньев С.Е.2, Мекина И.Д.1, Комарова Е.М.1, Ищук М.А.1, Тихонов А.В.1, Коган И.Ю.1, Голубева А.В.2, Даев Е.В.2, Гзгзян А.М.1, Беспалова О.Н.1, Пендина А.А.1,2
-
Учреждения:
- Научно-исследовательский институт акушерства, гинекологии и репродуктологии им. Д.О. Отта
- Санкт-Петербургский государственный университет
- Выпуск: Том 21, № 1 (2023)
- Страницы: 61-74
- Раздел: Экологическая генетика человека
- Статья получена: 30.12.2022
- Статья одобрена: 20.03.2023
- Статья опубликована: 12.05.2023
- URL: https://journals.eco-vector.com/ecolgenet/article/view/120080
- DOI: https://doi.org/10.17816/ecogen120080
- ID: 120080
Цитировать
Полный текст
![Открытый доступ](https://journals.eco-vector.com/lib/pkp/templates/images/icons/text_open.png)
![Доступ закрыт](https://journals.eco-vector.com/lib/pkp/templates/images/icons/text_unlock.png)
![Доступ закрыт](https://journals.eco-vector.com/lib/pkp/templates/images/icons/text_lock.png)
Аннотация
Актуальность. Эпигеном половых клеток формируется под влиянием как программы развития, так и средовых факторов. Специфика возникновения и изменения в сперматогенезе человека продуктов окисления цитозина изучена недостаточно.
Цель — оценка распределения 5-формилцитозина (5fC) и 5-карбоксилцитозина (5caC) в сперматогенных клетках и в сперматозоидах человека.
Материалы и методы. Исследование проведено на образцах тестикулярной ткани 10 пациентов с диагнозом «азооспермия» и образцах эякулята 5 доноров спермы и 8 пациентов из бесплодных пар. Из образцов готовили микроскопические препараты. 5fC и 5caC выявляли методом непрямой иммунофлуоресценции. Определение плоидности ядер сперматогенных клеток проводили методом флуоресцентной гибридизации in situ (FISH).
Результаты. 5fC и 5caC отсутствовали в митотически и мейотически делящихся сперматогенных клетках и были характерны только для некоторых интерфазных ядер сперматогониев и сперматид, а также для некоторых эякулированных сперматозоидов. Частота сперматозоидов с высоким уровнем 5fC и 5caC в эякуляте пациентов из бесплодных пар варьировала в широком диапазоне и была выше, чем у доноров спермы (p = 0,007, p = 0,028 соответственно). Увеличение частоты сперматозоидов с высоким уровнем 5fC и 5caC сопровождалось снижением частоты морфологически нормальных и прогрессивно-подвижных сперматозоидов.
Выводы. 5fC и 5caC дифференциально распределены в сперматогенных клетках и сперматозоидах человека. Одним из вероятных объяснений повышенного уровня 5fC и 5caC, выявляемого методом непрямой иммунофлуоресценции в некоторых эякулированных сперматозоидах, является оксидативный стресс, вызванный воздействием внешних и внутренних факторов. Оценку 5fC и 5caC можно потенциально использовать как дополнительный критерий качества эякулята.
Полный текст
![Доступ закрыт](https://journals.eco-vector.com/lib/pkp/templates/images/icons/text_lock.png)
Об авторах
Ольга Алексеевна Ефимова
Научно-исследовательский институт акушерства, гинекологии и репродуктологии им. Д.О. Отта
Email: efimova_o82@mail.ru
ORCID iD: 0000-0003-4495-0983
SPIN-код: 6959-5014
Scopus Author ID: 14013324600
канд. биол. наук, заведующая лабораторией цитогенетики и цитогеномики репродукции
Россия, Санкт-ПетербургМихаил Игоревич Крапивин
Научно-исследовательский институт акушерства, гинекологии и репродуктологии им. Д.О. Отта
Email: krapivin-mihail@mail.ru
ORCID iD: 0000-0002-1693-5973
SPIN-код: 4989-1932
Scopus Author ID: 56507166200
мл. научн. сотр.
Россия, Санкт-ПетербургСергей Евгеньевич Парфеньев
Санкт-Петербургский государственный университет
Email: gen21eration@gmail.com
SPIN-код: 9703-0273
Scopus Author ID: 57190742512
студент
Россия, Санкт-ПетербургИрина Дмитриевна Мекина
Научно-исследовательский институт акушерства, гинекологии и репродуктологии им. Д.О. Отта
Email: irendf@mail.ru
ORCID iD: 0000-0002-0813-5845
SPIN-код: 4682-8590
Scopus Author ID: 7006299063
канд. биол. наук, ст. научн. сотр.
Россия, Санкт-ПетербургЕвгения Михайловна Комарова
Научно-исследовательский институт акушерства, гинекологии и репродуктологии им. Д.О. Отта
Email: evgmkomarova@gmail.com
ORCID iD: 0000-0002-9988-9879
SPIN-код: 1056-7821
Scopus Author ID: 57191625749
канд. биол. наук, заведующая лабораторией раннего эмбриогенеза
Россия, Санкт-ПетербургМария Алексеевна Ищук
Научно-исследовательский институт акушерства, гинекологии и репродуктологии им. Д.О. Отта
Email: mashamazilina@gmail.com
ORCID iD: 0000-0002-4443-4287
SPIN-код: 1237-6373
Scopus Author ID: 24779589100
мл. научн. сотр.
Россия, Санкт-ПетербургАндрей Владимирович Тихонов
Научно-исследовательский институт акушерства, гинекологии и репродуктологии им. Д.О. Отта
Email: tixonov5790@gmail.com
ORCID iD: 0000-0002-2557-6642
SPIN-код: 3170-2629
Scopus Author ID: 57191821068
канд. биол. наук, научн. сотр.
Россия, Санкт-ПетербургИгорь Юрьевич Коган
Научно-исследовательский институт акушерства, гинекологии и репродуктологии им. Д.О. Отта
Email: ikogan@mail.ru
ORCID iD: 0000-0002-7351-6900
SPIN-код: 6572-6450
Scopus Author ID: 56895765600
д-р мед. наук, чл.-корр. РАН, директор
Россия, Санкт-ПетербургАрина Вячеславовна Голубева
Санкт-Петербургский государственный университет
Email: AlikovaAV1504@yandex.ru
ORCID iD: 0000-0003-1613-222X
студент
Россия, Санкт-ПетербургЕвгений Владиславович Даев
Санкт-Петербургский государственный университет
Email: e.daev@spbu.ru
ORCID iD: 0000-0003-2036-6790
SPIN-код: 8926-6034
Scopus Author ID: 6701779129
д-р биол. наук, профессор кафедры генетики и биотехнологии
Россия, Санкт-ПетербургАлександр Мкртичевич Гзгзян
Научно-исследовательский институт акушерства, гинекологии и репродуктологии им. Д.О. Отта
Email: agzgzyan@gmail.com
SPIN-код: 6412-4801
Scopus Author ID: 56232643300
д-р мед. наук, заведующий отделом репродуктологии
Россия, Санкт-ПетербургОлеся Николаевна Беспалова
Научно-исследовательский институт акушерства, гинекологии и репродуктологии им. Д.О. Отта
Email: shiggerra@mail.ru
SPIN-код: 4732-8089
Scopus Author ID: 57189999252
д-р мед. наук, заместитель директора по научной работе
Россия, Санкт-ПетербургАнна Андреевна Пендина
Научно-исследовательский институт акушерства, гинекологии и репродуктологии им. Д.О. Отта; Санкт-Петербургский государственный университет
Автор, ответственный за переписку.
Email: pendina@mail.ru
ORCID iD: 0000-0001-9182-9188
SPIN-код: 3123-2133
Scopus Author ID: 6506976983
канд. биол. наук, ст. научн. сотр.
Россия, Санкт-Петербург; Санкт-ПетербургСписок литературы
- Reik W., Surani M.A. Germline and Pluripotent Stem Cells // Cold Spring Harb Perspect Biol. 2015. Vol. 7, No. 11. P. a019422. doi: 10.1101/cshperspect.a019422
- Efimova O.A., Pendina A.A., Tikhonov A.V., Baranov V.S. The evolution of ideas on the biological role of 5-methylcytosine oxidative derivatives in the mammalian genome // Russ J Genet Appl Res. 2018. Vol. 8, No. 1. P. 11–21. doi: 10.1134/S2079059718010069
- Efimova O.A., Koltsova A.S., Krapivin M.I., et al. Environmental Epigenetics and Genome Flexibility: Focus on 5-Hydroxymethylcytosine // Int J Mol Sci. 2020. Vol. 21, No. 9. P. 3223. doi: 10.3390/ijms21093223
- Aitken R.J., Gibb Z., Baker M.A., et al. Causes and consequences of oxidative stress in spermatozoa // Reprod Fertil Dev. 2016. Vol. 28, No. 1–2. P. 1–10. doi: 10.1071/RD15325
- Gunes S., Arslan M.A., Hekim G.N.T., Asci R. The role of epigenetics in idiopathic male infertility // J Assist Reprod Genet. 2016. Vol. 33, No. 5. P. 553–569. doi: 10.1007/s10815-016-0682-8
- Jenkins T.G., Aston K.I., Meyer T.D., et al. Decreased fecundity and sperm DNA methylation patterns // Fertil Steril. 2016. Vol. 105, No. 1. P. 51–7.e1–3. doi: 10.1016/j.fertnstert.2015.09.013
- Aston K.I., Uren P.J., Jenkins T.G., et al. Aberrant sperm DNA methylation predicts male fertility status and embryo quality // Fertil Steril. 2015 Vol. 104, No. 6. P. 1388–97.e1–5. doi: 10.1016/j.fertnstert.2015.08.019
- Urdinguio R.G., Bayon G.F., Dmitrijeva M., et al. Aberrant DNA methylation patterns of spermatozoa in men with unexplained infertility // Hum Reprod. 2015. Vol. 30, No. 5. P. 1014–1028. doi: 10.1093/humrep/dev053
- Du Y., Li M., Chen J., et al. Promoter targeted bisulfite sequencing reveals DNA methylation profiles associated with low sperm motility in asthenozoospermia // Hum Reprod. 2016 Vol. 31, No. 1. P. 24–33. doi: 10.1093/humrep/dev283
- Laqqan M.M., Yassin M.M. Cigarette heavy smoking alters DNA methylation patterns and gene transcription levels in humans spermatozoa // Environ Sci Pollut Res Int. 2022. Vol. 29, No. 18. P. 26835–26849. doi: 10.1007/s11356-021-17786-8
- Li J., Xu J., Yang T., et al. Genome-wide methylation analyses of human sperm unravel novel differentially methylated regions in asthenozoospermia // Epigenomics. 2022. Vol. 14, No. 16. P. 951–964. doi: 10.2217/epi-2022-0122
- Zhang Z., Wang J., Shi F., et al. Genome-wide alternation and effect of DNA methylation in the impairments of steroidogenesis and spermatogenesis after PM2.5 exposure // Environ Int. 2022. Vol. 169. P. 107544. doi: 10.1016/j.envint.2022.107544
- Tahiliani M., Koh K.P., Shen Y., et al. Conversion of 5-methylcytosine to 5-hydroxymethylcytosine in mammalian DNA by MLL partner TET1 // Science. 2009. Vol. 324, No. 5929. P. 930–935. doi: 10.1126/science.1170116
- Ito S., Shen L., Dai Q., et al. Tet proteins can convert 5-methylcytosine to 5-formylcytosine and 5-carboxylcytosine // Science. 2011. Vol. 333, No. 6047. P. 1300–1303. doi: 10.1126/science.1210597
- Branco M.R., Ficz G., Reik W. Uncovering the role of 5-hydroxymethylcytosine in the epigenome // Nat Rev Genet. 2011. Vol. 13, No. 1. P. 7–13. doi: 10.1038/nrg3080
- Pfeifer G.P., Kadam S., Jin S.G. 5-hydroxymethylcytosine and its potential roles in development and cancer // Epigenetics Chromatin. 2013. Vol. 6, No. 1. P. 10. doi: 10.1186/1756-8935-6-10
- Efimova O.A., Pendina A.A., Tikhonov A.V., et al. Oxidized form of 5-methylcytosine-5-hydroxymethylcytosine: a new insight into the biological significance in the mammalian genome // Russ J Genet Appl Res. 2015. Vol. 5. P. 75–81. doi: 10.1134/S2079059715020033
- Efimova O.A., Pendina A.A., Tikhonov A.V., et al. Genome-wide 5-hydroxymethylcytosine patterns in human spermatogenesis are associated with semen quality // Oncotarget. 2017. Vol. 8, No. 51. P. 88294–88307. doi: 10.18632/oncotarget.18331
- Zheng H., Zhou X., Li D.K., et al. Genome-wide alteration in DNA hydroxymethylation in the sperm from bisphenol A-exposed men // PLoS One. 2017. Vol. 12, No. 6. P. e0178535. doi: 10.1371/journal.pone.0178535
- Nettersheim D., Heukamp L.C., Fronhoffs F., et al. Analysis of TET expression/activity and 5mC oxidation during normal and malignant germ cell development // PLoS One. 2013. Vol. 8, No. 12. P. e82881. doi: 10.1371/journal.pone.0082881
- Kruger T.F., Menkveld R., Stander F.S., et al. Sperm morphologic features as a prognostic factor in in vitro fertilization // Fertil Steril. 1986. Vol. 46, No. 6. P. 1118–1123. doi: 10.1016/s0015-0282(16)49891-2
- Pendina A.A., Efimova O.A., Chiryaeva O.G., et al. A comparative cytogenetic study of miscarriages after IVF and natural conception in women aged under and over 35 years // J Assist Reprod Genet. 2014. Vol. 31, No. 2. P. 149–155. doi: 10.1007/s10815-013-0148-1
- Efimova O.A., Pendina A.A., Tikhonov A.V., et al. Chromosome hydroxymethylation patterns in human zygotes and cleavage-stage embryos // Reproduction. 2015. Vol. 149, No. 3. P. 223–233. doi: 10.1530/REP-14-0343
- Pendina A.A., Efimova O.A., Tikhonov A.V., et al. Immunofluorescence Staining for Cytosine Modifications Like 5-Methylcytosine and Its Oxidative Derivatives and FISH. In: Fluorescence in situ hybridization (FISH). Ed. by T. Liehr. Berlin: Heidelberg: Springer, 2017. P. 337–346. doi: 10.1007/978-3-662-52959-1_35
- Efimova O.A., Pendina A.A., Krapivin M.I., et al. Inter-Cell and Inter-Chromosome Variability of 5-Hydroxymethylcytosine Patterns in Noncultured Human Embryonic and Extraembryonic Cells // Cytogenet Genome Res. 2018. Vol. 156, No. 3. P. 150–157. doi: 10.1159/000493906
- Negoescu A., Lorimier P., Labat-Moleur F., et al. In situ apoptotic cell labeling by the TUNEL method: improvement and evaluation on cell preparations // J Histochem Cytochem. 1996. Vol. 44, No. 9. P. 959–968. doi: 10.1177/44.9.8773561
- World Health Organization. Laboratory manual for the examination and processing of human semen, sixth edition. Geneva: World Health Organization, 2021. 276 p.
- Seisenberger S., Peat J.R., Hore T.A., et al. Reprogramming DNA methylation in the mammalian life cycle: building and breaking epigenetic barriers // Philos Trans R Soc Lond B Biol Sci. 2013. Vol. 368, No. 1609. P. 20110330. doi: 10.1098/rstb.2011.0330
- Marcho C., Cui W., Mager J. Epigenetic dynamics during preimplantation development // Reproduction. 2015. Vol. 150, No. 3. P. R109–R120. doi: 10.1530/REP-15-0180
- Fulka H., Mrazek M., Tepla O., Fulka J.Jr. DNA methylation pattern in human zygotes and developing embryos // Reproduction. 2004. Vol. 128, No. 6. P. 703–708. doi: 10.1530/rep.1.00217
- Pendina A.A., Efimova O.A., Fedorova I.D., et al. DNA methylation patterns of metaphase chromosomes in human preimplantation embryos // Cytogenet Genome Res. 2011. Vol. 132, No. 1–2. P. 1–7. doi: 10.1159/000318673
- Madugundu G.S., Cadet J., Wagner J.R. Hydroxyl-radical-induced oxidation of 5-methylcytosine in isolated and cellular DNA // Nucleic Acids Res. 2014. Vol. 42, No. 11. P. 7450–7460. doi: 10.1093/nar/gku334
- Cadet J., Wagner J.R. Radiation-induced damage to cellular DNA: Chemical nature and mechanisms of lesion formation // Radiation Physics and Chemistry. 2016. Vol. 128. P. 54–59. doi: 10.1016/j.radphyschem.2016.04.018
- Alahmar A.T. Role of Oxidative Stress in Male Infertility: An Updated Review // J Hum Reprod Sci. 2019. Vol. 12, No. 1. P. 4–18. doi: 10.4103/jhrs.JHRS_150_18
- Ni K., Dansranjavin T., Rogenhofer N., et al. TET enzymes are successively expressed during human spermatogenesis and their expression level is pivotal for male fertility // Hum Reprod. 2016. Vol. 31, No. 7. P. 1411–1424. doi: 10.1093/humrep/dew096
- Sakkas D., Alvarez J.G. Sperm DNA fragmentation: mechanisms of origin, impact on reproductive outcome, and analysis // Fertil Steril. 2010. Vol. 93, No. 4. P. 1027–1036. doi: 10.1016/j.fertnstert.2009.10.046
Дополнительные файлы
![](/img/style/loading.gif)