ИСПОЛЬЗОВАНИЕ SS AP-АНАЛИЗА ДЛЯ ПЕРВИЧНОЙ ЛОКАЛИЗАЦИИ МУТАЦИИ CDT (CADMIUM TOLERANCE) В VI ГРУППЕ СЦЕПЛЕНИЯ ГОРОХА



Цитировать

Полный текст

Аннотация

С целью локализации мутации cdt, приводящей к повышенной устойчивости мутанта гороха к кадмию и его увеличенному накоплению в биомассе растений, по сравнению с исходной линией, был проведен сегрегационный анализ F2 и F3 поколений гибридов от скрещивания мутантной линии SGECdt и линии JI281. В эксперименте проанализировано совместное наследование 89 SSAP (от англ. sequence specific amplified polymorphism) маркеров, по которым различались анализируемые линии и мутантного признака устойчивости к кадмию. Было выявлено сцепление 4-х SSAP маркеров (Tps1/146+, Tps1/167+, Tps1/44+ и Tps1/58+), расположенных в VI группе сцепления гороха, с признаком устойчивости к кадмию. Таким образом, продемонстрирована перспективность использования SSAP -анализа для первичной локализации мутации в группе сцепления.

Об авторах

Виктор Евгеньевич Цыганов

Всероссийский научно-исследовательский институт сельскохозяйственной микробиологии, Санкт-Петербург, РФ

Email: viktor_tsyganov@arriam.spb.ru

Ольга Алексеевна Кулаева

Всероссийский научно-исследовательский институт сельскохозяйственной микробиологии, Санкт-Петербург, РФ

Email: koa1983@yandex.ru Podbelskiy chausse, 3, Saint-Petersburg, Pushkin, 196608, Russia

Маги Нокс

Центр Джона Иннеса, Норвич, Великобритания

Email: maggie.knox@bbsrc.ac.uk

Алексей Юрьевич Борисов

Всероссийский научно-исследовательский институт сельскохозяйственной микробиологии, Санкт-Петербург, РФ

Email: ayborisov@yandex.ru

Игорь Анатольевич Тихонович

Всероссийский научно-исследовательский институт сельскохозяйственной микробиологии, Санкт-Петербург, РФ

Email: arriam@arriam.spb.ru. contact@arriam.spb.ru Podbelskiy Ch., 3, Saint-Petersburg, Pushkin-8

Томас Ноел Эллис

Институт биологии и проблем окружающей среды, Аберистуит, Великобритания

Email: noe2@aber.ac.uk

Список литературы

  1. Кулаева О. А., Цыганов В. Е., 2010. Молекулярно-генетические основы устойчивости высших растений к кадмию и его аккумуляции//Экол. генетика. Т. 8. С. 3-15.
  2. Чегамирза К., Ковеза О. В., Коновалов Ф. А., Гостимский С. А., 2004. Идентификация и локализация гена chi115 и сцепленных с ним ДНК-маркеров у гороха посевного (Pisum sativum L.)//Генетика. Т. 40. С. 909-915.
  3. Konovalov F., Toshchakova E., Gostimsky S., 2005. A CAP S marker set for mapping in linkage group III of pea (Pisum sativum L.)//Cell. Mol. Biol. Lett. V. 10. P. 163-171.
  4. Kumar A., Pearce S. R., McLean K., et al., 1997. The Tyl copia group of retrotransposons in plants: genomic organisation, evolution, and use as molecular markers//Genetica. Vol. 100. P. 205-217.
  5. Rozov S. M., Borisov A. Y., Tsyganov V. E., Kosterin O. E., 1999. The history of the pea gene map: last revolutions and the new symbiotic genes//Pisum Genet. Vol. 31. P. 55-57.
  6. Sambrook J., Fritsch E. F., Maniatis T., 1989. Molecular cloning: a laboratory manual (2nd edn.). Cold Spring Harbor N.Y.: Cold Spring Harbor Laboratory Press.
  7. SanMiguel P., Tikhonov A., Jin Y. K. et al., 1996. Nested retrotransposons in the intergenic regions of the maize genome//Science. Vol. 274. P. 765-768.
  8. Schulman A. H., Flavell A. J., Ellis T. H., 2004. The application of LTR retrotransposons as molecular markers in plants//Methods Mol. Biol. Vol. 260. P. 145-173.
  9. Suoniemi A., Anamthawat Jonsson K., Arna T., Schulman A. H., 1996. Retrotransposon BARE-1 is a major, dispersed component of the barley (Hordeum vulgare L.) genome//Plant Mol. Biol. Vol. 30, P. 1321-1329.
  10. Tsyganov V. E., Pavlova Z. B., Kravchenko L. V. et al., 2000. New gene Crt (curly roots) controlling pea (Pisum sativum L.) root development//Ann. Bot. Vol. 86. P. 975 981.
  11. Tsyganov V., Belimov A., Borisov A. et al., 2007. A chemically induced new pea (Pisum sativum) mutant SGECdt with increased tolerance to, and accumulation of, cadmium//Ann. Bot. Vol. 99. P. 227-237.
  12. Vershinin A.V., Allnutt T.R., Knox M.R. et al., 2003. Transposable elements reveal the impact of introgression, rather than transposition, in Pisum diversity, evolution, and domestication//Mol. Biol. Evol. Vol. 20. P. 2067-2075.
  13. Vos P., Hogers R., Bleeker M. et al., 1995. AFLP: a new technique for DNA fingerprinting//Nucl. Acid Res. Vol. 23. P. 4407-4414.
  14. Watanabe A., Ito H., Chiba M. et al., 2010. Isolation of novel types of Arabidopsis mutants with altered reactions to cadmium: cadmium gradient agar plates are an effective screen for the heavy metal related mutants//Planta. Vol. 232. P. 825-836.
  15. Waugh, R., McLean K., Flavell A. J. et al., 1997. Genetic distribution of Bare-1-like retrotransposable elements in the barley genome revealed by sequence specific amplification polymorphisms (SSAP)//Mol. Gen. Genet. Vol. 253. P. 687-694.

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML
Скачать

© Цыганов В.Е., Кулаева О.А., Нокс М., Борисов А.Ю., Тихонович И.А., Эллис Т.Н., 2012

Creative Commons License
Эта статья доступна по лицензии Creative Commons Attribution 4.0 International License.
СМИ зарегистрировано Федеральной службой по надзору в сфере связи, информационных технологий и массовых коммуникаций (Роскомнадзор).
Регистрационный номер и дата принятия решения о регистрации СМИ: серия ПИ № ФС 77 - 65617 от 04.05.2016.


Данный сайт использует cookie-файлы

Продолжая использовать наш сайт, вы даете согласие на обработку файлов cookie, которые обеспечивают правильную работу сайта.

О куки-файлах