ПОЛИМОРФИЗМ МИКРОСАТЕЛЛИТНОЙ ДНК ЭНДЕМИЧНОГО РОДА РЫБ ОЗЕРА БАЙКАЛ - ГОЛОМЯНОК (COMEPHORUS LACEPEDE, 1801)



Цитировать

Полный текст

Аннотация

На основе микросателлитного анализа проведена оценка внут- ривидового генетического поли- морфизма одного из эндемичных видов рыб оз. Байкал - боль- шой голомянки (Comephorus baicalensis Pallas, 1776). Проведен сравнительный анализ резуль- татов с полученными ранее для малой голомянки (С. dybowski Korotneff, 1905). Использовали шесть микросателлитных локусов, разработанных для европейского подкаменщика - Cottus gobio. Протестированы выборки большой голомянки из трех котловин Бай- кала (южной, средней, северной). Средние значения индексов FST и RST между выборками не превышали 0,02, что указывает на слабую внутривидовую генетическую подразделенность. В сравнении с малой голомянкой у большой наблюдалось меньшее аллельное разнообразие, больший дефицит гетерозигот и преобладание низкомолекулярных аллелей. Значения генетической дифференциации по всем локусам между совокупными выборками малой и большой голомянок составили FST = 0,138 и RST = 0,244. Анализ полиморфизма микросателлитной ДНК большой и малой голомянок показал, что оба вида представлены едиными популяциями. Фактором, способствующим панмиксии голомянок, возможно, является пассивный перенос молоди и взрослых особей водными течениями.

Об авторах

Вероника Игоревна Тетерина

Лимнологический институт СО РАН, Иркутск, Иркутская Область, РФ

Любовь Васильевна Суханова

Лимнологический институт СО РАН, Иркутск, Иркутская Область, РФ

Сергей Васильевич Кирильчик

Лимнологический институт СО РАН, Иркутск, Иркутская Область, РФ

Список литературы

  1. Аношко П. Н. Морфологическая изменчивость и дифференциация малой голомянки Comephorus dybowskii Korotneff (Cottoidei, Comephoridae) в озере Байкал/П. Н. Аношко//Сиб. экологич. журн. -1998. -№ 5. -С. 453-458.
  2. Аношко П. Н. Изменение признаков внешней морфологии и трофического статуса у голомянок Comephorus dybowski Korotneff и C. baicalensis (Pallas) (Cottoidei, Comephoridae) оз. Байкал в процессе роста/П. Н. Аношко, Е. В. Дзюба, Н. Г. Мельник//Мат-лы рабочего совещ. молодых ученых Иркутск. НЦ СО РАН. «Междисциплинарные исследования в Байкальском регионе». -Иркутск: Ин-т географии СО РАН, 2001. -С. 5-10.
  3. Волерман И. Б. Характер питания и использования кормовой базы голомянками Байкала/И. Б. Волерман//Динамика продуцирования рыб Байкала: коллективн. монография. -Новосибирск: Наука, 1983 -С. 63-66.
  4. Дзюба Е. В. Исследование пищевых стратегий пелагических рыб Байкала: автореф. дис.... канд. биол. наук/Е. В. Дзюба. -Борок: ИБВВ РАН, 2004. -24 с.
  5. Коряков Е. А. Биология, ресурсы и хозяйственное значение голомянок/Е. А. Коряков//Исследования по ихтиофауне Байкала: тр. Лимнол. ин-та СО АН СССР. -М.-Л., 1964. -Т. 2. -С. 3-75.
  6. Коряков Е. А. Пелагические бычковые Байкала/Е. А. Коряков. -М.: Наука. -1972. -155 с.
  7. Мамонтов А. М. Динамика пространственного распределения и размерная структура голомянок (Comephoridae) в прибрежной пелагиали южного Байкала в зимний период/А. М. Мамонтов, П. Н. Аношко, А. В. Сороковиков [и др.]//Тр. каф. зоол. позвочн. Иркутск. гос. ун-та. -Иркутск: Иркутский ун-т, 2004. -Т. 2. -С. 52-64.
  8. Нагорный В. К. Особенности распределения и продукционная структура голомянок/В. К. Нагорный//Динамика продуцирования рыб Байкала: коллективн. монография. -Новосибирск: Наука, 1983. -С. 6-14.
  9. Стариков Г. В. Голомянки Байкала/Г. В. Стариков. -Новосибирск: Наука, 1977. -96 с.
  10. Талиев Д. Н. Бычки-подкаменщики Байкала (Cottoidei)/Д. Н. Талиев. -М.-Л.: АН СССР, 1955. -603 с.
  11. Тетерина В. И. Анализ генетического полиморфизма малой голомянки Comephorus dybowski Korotneff, 1905 (Scorpaeniformes: Cottoidei) по микросателлитным локусам/В. И. Тетерина, Л. В. Суханова, Б. Э. Богданов [и др.]//Генетика. -2005. -№ 7. -С. 919-924.
  12. Guillemette J. G. Detection of subnanogram quantities of DNA and RNA on native and denaturing polyacrylamide and agarose gels by silver staining/J. G. Guillemette, P N. Lewis//Electrophoresis. -1983. -Vol. 4. -P 92-94.
  13. Guo S. Performing the exact test of Hardy-Weinberg proportion for multiple alleles/S. Guo, E. Thomson//Biometrics. -1992. -Vol. 48. -P. 361-372.
  14. Шимараев М. Н. О межкотловинном водообмене в Байкале/М. Н. Шимараев, Н. Г. Гранин, В. М. Домышева [и др.]//Вод. ресурсы. -2003. -№ 6. -С. 678-681.
  15. Amos W. Microsatellites show mutational bias and heterozygote instability/W. Amos, S. J. Sawcer, R. W. Feakes, D. C. Rubinstein//Nat. Genet. -1996. -Vol. 13. -P 390-391.
  16. Brookfield J. F. Y. A simple new method for estimating null allele frequency from heterozygote deficiency/J. F. Y. Brookfield//Molecular Ecology. -1996. -Vol. 5. -P. 453-455.
  17. Cornuet J. M. Description and power analysis of two tests for detecting recent population bottlenecks from allele frequency data/J. M. Cornuet, G. Luikart//Genetics. -1996. -Vol. 144. -P. 2001-2014.
  18. Englbrecht C. C. Isolation and characterization of polymorphic microsatellite loci in the European bullhead Cottus gobio L. (Osteichthyes) and their applicability to related taxa/C. C. Englbrecht, C. R. Largiader, B. Hanfling, D. Tautz//Mol. Ecol. -1999. -Vol. 8. -N 11. -P. 1966-1999.
  19. Estoup A. Microsatellites and minisatellites for molecular ecology: theoretical and empirical considerations/A. Estoup, B. Angers//Advances in molecular ecology. -Amsterdam: IOS Press, 1998. -P. 55-86.
  20. Luikart G. Distortion of allele frequency distributions provides a test for recent population bottlenecks/G. Luikart, F. W. Allendorf, J.-M. Cornuet, W. B. Sherwin//The Journal of Heredity. -1998. -Vol. 89. -N 3. -P. 238-247.
  21. McConnel S. K. Polymorphic microsatellite loci from Atlantic salmon (Salmon salar): Genetic differentiation of North American and European populations/S. K. McConnel, P. Oreilly, L. Hamilton [et al]//Canad. J. Fish. Aquat. Sci. -1995. -Vol. 52. -N 9. -P. 1863-1872.
  22. Olsen J. B. Moderately and highly polymorphic microsatellites provide discordant estimates of population divergence in sockeye salmon, Oncorhynchus nerka //J. B. Olsen, C. Habicht, J. Reynolds, J. E. Seeb // Environmantal Biology of Fishes. - 2004. - Vol. 69. - P. 261-273.
  23. Pereyra R. Variation in habitat preference and population structure among three species of the Lake Malavi cichlid genus Protomelas/R. Pereyra, M. I. Taylor, G. F. Turner, C. Rico//Molecular Ecology. -2004. -Vol. 13. -P. 2691-2697.
  24. Rico C. No evidence for parallel sympatric speciation in cichlid species of the genus Pseudotropheus from northwestern Lake Malawi/C. Rico, P. Bouteillon, M. J. H. Van open [et al.]//J. Evol. Biol. -2003. -Vol. 16. -P. 37-46.
  25. Schneider S. Arlequin: A software for population genetics data analysis. Ver 2.000/S. Schneider, D. Roessli, L. Excoffier//Genetics and Biometry Lab. Dept. of Anthropology, Univ. Geneva. -2000.
  26. Shaw P. W. Genetic population structure indicates sympatric speciation of Lake Malawi pelagic cichlids/P. W. Shaw, G. F. Turner, M. R. Idid [et al.]//Proc. R. Soc. Lond. -2000. -Vol. 267 -P. 2273-2280.
  27. Tautz D. Notes on definition and nomenclature of tandemly repetitive DNA sequences/D. Tautz//DNA Fingerprenting: State of the Science. -Basel: Birkhauser Verlag, 1993. -P. 21-28.
  28. Van Oosterhout C. Micro-checker: software for identifying and correcting genotyping errors in microsatellite data/C. Van Oosterhout, W F. Hutchinson, D. P. M. Wills, P Shipley//Mol. Ecol. Notes. -2004. -Vol. 4. -P. 535-538.
  29. Van Oppen M. J. H. Unusually fine-scale genetic structuring found in rapidly speciating Malavi cichlid fishes/G. F. Turner, C. Rico [et al]//Proc. R. Soc. Lond. B. -1997. -Vol. 264. -P. 1803-1812.
  30. Wright S. Evolution and the genetics of populations. Vol. 4. Variability within and among natural populations/S. Wright. -Chicago, London: Univ. Chicago Press, 1978. -580 p.
  31. Yeh F. C. Population genetic analysis of co-dominant and dominant markers and quantitative traits/F. C. Yeh, T. J. B. Boyle//Belgian Journal of Botany. -1997. -Vol. 129. -P. 157.

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML
Скачать

© Тетерина В.И., Суханова Л.В., Кирильчик С.В., 2007

Creative Commons License
Эта статья доступна по лицензии Creative Commons Attribution 4.0 International License.
СМИ зарегистрировано Федеральной службой по надзору в сфере связи, информационных технологий и массовых коммуникаций (Роскомнадзор).
Регистрационный номер и дата принятия решения о регистрации СМИ: серия ПИ № ФС 77 - 65617 от 04.05.2016.


Данный сайт использует cookie-файлы

Продолжая использовать наш сайт, вы даете согласие на обработку файлов cookie, которые обеспечивают правильную работу сайта.

О куки-файлах