Открытый доступ Открытый доступ  Доступ закрыт Доступ предоставлен  Доступ закрыт Доступ платный или только для подписчиков

Том 17, № 4 (2019)

Статьи

Омиксные технологии: роль и значение для развития персонализированной медицины

Пальцев М.А., Чемезов А.С., Линькова Н.С., Дробинцева А.О., Полякова В.О., Белушкина Н.Н., Кветной И.М.

Аннотация

Персонализированная медицина предполагает использование новых методов молекулярной диагностики для увеличения эффективности лечения пациентов и определения предрасположенности к тем или иным заболеваниям. В связи с этим актуальной задачей этой инновационной области знаний являются поиск, развитие и использование современных методов и технологий биомедицины и биофизики. Цель обзора - анализ применения омиксных технологий (геномики, протеомики, метаболомики, фармакогеномики) в персонализированной медицине. Описаны возможности применения геномики для анализа циркулирующей опухолевой ДНК методом жидкой биопсии, исследования микроРНК в качестве биомаркера патологии кардиомиоцитов и эндотелия, фиброза, нарушения ангиогенеза, ишемии миокарда. Приведены данные о применении протеомики для создания панели онкомаркеров и молекул - маркеров сердечно-сосудистой патологии. Описаны достижения современной метаболомики для диагностики и оценки эффективности лечения патологии желудочно-кишечного тракта. Фармакогеномика рассматривается с позиций анализа эффективности и прогнозирования выраженности побочных эффектов лекарственных средств у пациентов с сахарным диабетом, онкологическими заболеваниями и атеросклерозом. Таким образом, омиксные технологии являются фундаментальной и практической базой для развития персонализированной медицины.
Молекулярная медицина. 2019;17(4):3-8
pages 3-8 views

Дендритные клетки в терапии аденокарциномы молочной железы

Чернышева А.А., Чехонин И.В., Гурина О.И., Шепелева И.И., Попова Т.Н.

Аннотация

Будучи профессиональными антигенпрезентирующими клетками, обладающими функциональной пластичностью, дендритные клетки (ДК) широко изучаются в доклинических и клинических исследованиях вакцин против различных видов злокачественных опухолей. В отношении некоторых из них была доказана эффективность. Тем не менее в мире еще не существует ни одной официально одобренной дендритноклеточной вакцины (ДКВ) для лечения аденокарциномы молочной железы (АМЖ). Знание и понимание основных функций ДК, а также разработка способов усиления эффекта подобных вакцин могут способствовать развитию этого направления. В представленном обзоре рассматриваются основные типы ДК с акцентом на их роль в патогенезе опухоли молочной железы, а также рассматриваются основные механизмы захвата, процессинга и презентации антигенов. Кроме того, значительное внимание уделяется существующим исследованиям, касающимся терапии АМЖ ДКВ, применяющимися как в качестве монотерапии, так и в комбинации с другими терапевтическими стратегиями.
Молекулярная медицина. 2019;17(4):9-16
pages 9-16 views

Сравнительный анализ методов митохондриальной заместительной терапии

Глухов А.И., Исагаджиев А.М.

Аннотация

Митохондриальные болезни - группа наследственных заболеваний, характеризующихся наличием у больного дефектов наследственного аппарата митохондрий. Эти болезни отличаются от других заболеваний полной передачей их от матери потомству. Для лечения таких болезней разрабатываются различные методы митохондриальной заместительной терапии - процедуры, используемой для предупреждения передачи митохондриальных болезней от матери потомству. Различают несколько методов данной терапии: перенос пронуклеусов, перенос веретена деления и перенос полярного тельца 1 и 2. В представленном обзоре нами описаны существующие методы митохондриальной заместительной терапии со всеми аспектами и особенностями их проведения, а также возникающими осложнениями и ключевыми моментами, на которые следует обратить внимание. Мы сравнили эффективность методов, сопоставляя эспериментальные данные и результаты, полученные разными исследователями за последние 10 лет, и пришли к выводу, что самым эффективным из рассмотренных методов митохондриальной заместительной терапии является перенос полярного тельца 1. Кроме того, многообещающим методом может стать также перенос веретена деления, несмотря на менее выдающиеся результаты экспериментов
Молекулярная медицина. 2019;17(4):17-21
pages 17-21 views

Анализ метаболитов головного мозга у пациентов с сахарным диабетом типа 2 и когнитивными нарушениями

Матвеева М.В., Самойлова Ю.Г., Жукова Н.Г., Кудлай Д.А.

Аннотация

Введение. Сахарный диабет (СД) типа 2 является метаболическим заболеванием, характеризующимся длительной гипергликемией, которая может вызывать различные осложнения. Некоторые исследования сообщают о взаимосвязи между изменениями церебрального метаболизма и уровнем глюкозы. Цель исследования. Оценка содержания метаболитов головного мозга у пациентов с СД типа 2. Методы. Проведено обсервационное одноцентровое одномоментное выборочное исследование c участием пациентов с СД типа 2 (n=48) в возрасте 45-65 лет. У всех обследуемых в крови определяли уровень глюкозы плазмы натощак, гликированного гемоглобина (HbA1с) и тау протеина; вариабельность гликемии оценивали с помощью непрерывного мониторирования в течение 14 сут. Нейропсихологическое тестирование проводили с использованием Монреальской шкалы когнитивной дисфункции (MoCA тест). Исследовали нейрохимические изменения головного мозга с помощью протонной спектроскопии (1HMRS) и анализа следующих метаболитов: N-ацетиласпартат (NAA), холин (Cho), креатин (Cr), креатинфосфат (Cr2). Результаты. Уровень тау протеина в сыворотке был повышен при наличии когнитивных расстройств и составил 44,6 пг/мл, его увеличение связано с возрастом и высоким уровнем HbA1c (r=0,211, p=0,034; r=0,342, p=0,006). Отмечено повышение коэффициентов вариабельности гликемии. У пациентов с СД типа 2 обнаружены когнитивные нарушения (КН), MoCA тест в среднем составил 20 баллов. Выявлено повышение уровня NAA и Cho области гиппокампа. Высокий показатель NAA установлен у пациентов с повышенным содержанием τ-протеина, а HbA1c, индекс лабильности гликемии и среднее значение глюкозы - при пониженном уровне Cr в области гиппокампа. Заключение. СД типа 2 протекает с КН, изменением метаболизма головного мозга и повышением содержания тау протеина. Модель прогнозирования КН, по данным 1HMRS, у пациентов с СД типа 2 составляет 79%
Молекулярная медицина. 2019;17(4):22-27
pages 22-27 views

Особенности формирования скелета в зависимости от полиморфизма гена андрогенового рецептора у лиц с транссексуализмом

Соловьева Н.В., Макарова Е.В., Вильянов В.Б., Кременицкая С.А., Чаусова С.В., Кичук И.В., Шибалев Д.В., Васильев В.А.

Аннотация

Введение. Ген андрогенового рецептора (АР) предположительно ассоциирован с транссексуализмом. Костная ткань (один из органов-мишеней для андрогенов) и трохантерный индекс (ТИ) - соотношение роста и длины ноги) могут свидетельствовать об активности андрогенизации организма в пубертатный период. Представляется интересным выявить особенности этого процесса в популяции транссексуалов. Цель исследования. Выявить связь CAG-полиморфизма гена АР с типом формирования скелета у транссексуалов. Методы. В исследование были включены 262 пациента старше 18 лет с установленным диагнозом транссексуализма (121 обследованный из группы MtF и 141 - из группы FtM). Оценивали психический и сексологический статус; проводили расчет ТИ; генетический анализ (полиморфизм гена АР). Результаты. Средний показатель ТИ для группы MtF составил 1,93±0,03, что соответствует гипоэволютивному типу развития скелета, для FtM - 2,01±0,04, что соответствует пограничному значению между нормоэволютивным и гиперэволютивным типами. Различия в показателях ТИ в группах MtF и FtM были значимыми (p=0,000). В группах MtF и FtM выявлено статистически значимые отличия числа CAG-повторов (p=0,0). Была выявлена четкая отрицательная зависимость между значением ТИ и количеством CAG-повторов в общей группе (R=-0,24; p=0,000). Заключение. ТИ ассоциирован с CAG-полиморфизмом АР. Для популяции FtM характерны меньшее число CAG-повторов в гене АР по сравнению с группой MtF, более высокий ТИ и склонность к гиперэволютивному типу развития скелета. Популяция MtF, напротив, характеризуется гипоэвоютивным типом развития скелета.
Молекулярная медицина. 2019;17(4):28-33
pages 28-33 views

Роль и взаимодействие полиморфных вариантов неаллельных генов KCNJ11, ADIPOQ, ITLN1, LEP, TCF7L2 и PPARGB в увеличении риска развития сахарного диабета типа 2 в Кыргызской Республике

Исакова Ж.Т., Кипень В.Н., Талайбекова Э.Т., Алдашев А.А., Алдашева Н.М., Бектурсунов Т.М., Миррахимов Э.М.

Аннотация

Цель. Изучить межгенные взаимодействия и оценить вклад полиморфных локусов p.K23E (rs5219, KCNJ11), g.15661G>T (rs1501299, ADIPOQ), p.V109D (rs2274907, ITLN1), g.2453G>A (rs7799039, LEP), g.53341C>T (rs7903146, TCF7L2) и p.P12A (rs1801282, PPARG) в увеличение риска развития СД2 среди лиц кыргызской национальности с использованием биоинформатиче-ского метода многофакторного сокращения размерности (MDR). Материал и методы. Исследование проведено по типу «случай-контроль»; оно включало 114 пациентов с СД2: 61 (53,5%) мужчина и 53 (46,5%) женщины, а также 109 обследованных без СД2: 61 (56%) мужчина и 48 (44%) женщин кыргызской национальности. Генотип определяли методом ПЦР-ПДРФ. Анализ межгенных взаимодействий проводился биоинформатическим методом многофакторного сокращения размерности (Multifactor Dimensionality Reduction - MDR). Результаты. Среди изученных полиморфных вариантов наибольший вклад в увеличение риска развития СД2 для лиц кыргызской национальности вносят: g.15661G>T (ADIPOQ) и p.K23E (KCNJ11). К генетическим маркерам повышенного риска развития СД2 относятся: аллель T (ОШ - 1,68; 95% ДИ - [1,09-2,60]; p=0,025) и генотип GT (ОШ - 1,79; 95% ДИ - [1,05- 3,05]; p=0,037) полиморфизма g.15661G>T (ADIPOQ), а также аллель А полиморфизма p.K23E (KCNJ11) - ОШ - 1,62; 95% ДИ - [1,10-2,38]; p=0,019. Полиморфные локусы p.V109D гена ITLN1, g.2453G>A гена LEP, g.53341C>T гена TCF7L2 и p.P12A гена PPARG на развитие СД2 в отдельности не оказывают существенного влияния, однако в фенотипической реализации СД2 они могут принимать участие за счет эффекта межгенных взаимодействий. Так, при наличии генетического профиля «CC (g.53341C>T, TCF7L2)/AG (g.2453G>A, LEP)/AA (p.K23E, KCNJ11)» и «CT(g.5341C>T, TCF7L2)/AA (g.2453G>A, LEP)/AG (p.K23E, KCNJ11)» риск развития СД2 возрастал в 5-8раз. Заключение. Полиморфные локусы p.K23E (KCNJ11) и g.15661G>T (ADIPOQ) ассоциированы с повышенным риском развития СД2 для лиц кыргызской национальности. Локусы g.2453G>A (LEP), p.V109D (ITLN1), g.53341C>T (TCF7L2) и p.P12A (PPARG), способны влиять на фенотипическую реализацию СД2 в комбинации с патогенетически значимыми генотипами генов KCNJ11 и ADIPOQ.
Молекулярная медицина. 2019;17(4):34-44
pages 34-44 views

Полиморфизм и синергизм генов системы гемостаза в патогенезе инфекционного эндокардита

Мальцева Н.В., Лапутенко Т.А., Смирнова А.Ш., Кан С.Л.

Аннотация

Введение. Генетически детерминированная склонность пациентов к тромбообразованию может быть одним из этиологических и патофизиологических факторов инфекционного эндокардита (ИЭ). Цель исследования. Поиск вариантов генов и их сочетаний в системе гемостаза, носительство которых влияет на патогенез (риски развития и исход) ИЭ. Материал и методы. Проведено генотипирование 66 пациентов (20 женщин и 46 мужчин) с ИЭ, из них 45 обследованных (33 мужчины и 12 женщин) были с острым, 21 пациент (13 мужчин и 8 женщин) - с подострым течением заболевания; 63 пациента (30 женщин и 33 мужчины) - с сепсисом по полиморфным локусам rs1801133 гена метилентетрагидрофолатредуктазы MTHFR (MTHFRAla222Val(C677T)), rs1800790 гена β-фибриногена FGB (FGB-455G-A), rs5918 гена β-3-интегрина, тромбоцитарного рецептора фибриногена ITGB3 (ITGB3Leu33Pro(T1565C)) методом аллель-специфической полимеразной цепной реакции. Результаты. Моногенное и сочетанное носительство аллелей MTHFR222Val(677T), FGB-455-A, ITGB3Leu33(T1565) связано с повышением риска развития и летального исхода при ИЭ. Заключение. Мультиплексный анализ вариантов полиморфных локусов генов системы гемостаза должен быть включен в алгоритм генотипирования при диагностике и лечении ИЭ.
Молекулярная медицина. 2019;17(4):45-51
pages 45-51 views

Гигантоклеточная опухоль крестца: радиологические и морфологические характеристики

Степанова Ю.А., Грицкевич А.А., Харазов А.Ф., Морозова М.В., Калинин Д.В., Карельская Н.А., Варава А.Б.

Аннотация

Введение. Гигантоклеточная опухоль (ГКО) кости - доброкачественная опухоль с потенциалом агрессивного течения и способностью к метастазированию. ГКО составляют приблизительно 5% всех первичных опухолей костей. Несмотря на то, что ГКО посвящено много работ отечественных и зарубежных авторов, и в большинстве из них освещаются вопросы клиники, диагностики и лечения при локализации патологии в костях конечностей и тазового пояса, позвоночнике многие вопросы, касающиеся гистогенеза, клинико-рентгенологической и гистологической диагностики ГКО, остаются спорными. Материал и методы. Представлено клиническое наблюдение пациентки Л., 35лет, с ГКО крестца. При предоперационном обследовании по данным УЗИ, мультиспиральной компьютерной томографии (МСКТ) и магнитно-резонансной томографии (МРТ), у больной выявлено разрушение кортикального слоя крестца по внутреннему контуру; из данной зоны исходило большое экстраорганное образование округлой формы с четкими, неровными контурами и кистозно-солидной структурой. Образование гиперваскулярное, с наличием крупных лакун, заполненных кровью. Показаны сложности в диагностике данного образования и возможности хирургического лечения. Постановка диагноза оказалась возможной только по данным гистологического и иммуногистохимического исследования. Результаты и обсуждение. Гистогенез ГКО до настоящего времени неизвестен; в Международной гистологической классификации опухолей кости (ВОЗ) она отнесена в самостоятельную рубрику - опухоли неясного генеза. Ткань ГКО представлена 3 линиями клеток: стромальными фибробластоподобными, мононуклеарами-макрофагами, гигантскими многоядерными клетками. Истинно опухолевыми из них являются лишь стромальные фибробластоподобные клетки, клетки же других линий играют важную роль в характерных проявлениях ГКО. Таким образом, гистологическое исследование обнаруживает в ГКО комплекс характерных патологических изменений, которые, однако, могут по-разному сочетаться и быть различной выраженности даже в пределах одного большого очага, что часто затрудняет дифференциальную гистологическую диагностику, особенно при мелком малорепрезентативном гисто- или цитобиоптате. Поэтому необходимо провести иммуногистохимическое исследование. Заключение. Локализация ГКО в тазу и крестце крайне редка. Однако хотя в крестце встречается только 6% ГКО, эти опухоли являются вторым по распространенности типом первичной опухоли крестца. Вследствие крайне редкой встречаемости данной опухоли, несмотря на довольно четко описанные в литературе критерии выявления таких образований по данным МСКТ и МРТ, возможна ошибочная предоперационная дифференциация данной опухоли из-за отсутствия у общих хирургов, гинекологов и урологов, настороженности в выявлении ГКО крестца (а именно в эти отделения, с большей долей вероятности, попадут такие больных).
Молекулярная медицина. 2019;17(4):52-61
pages 52-61 views

Полиморфизм гена DBH у пациентов с псориазом

Сакания Л.Р., Третьяков А.В., Шевцова А.А., Кокаева З.Г., Рудько О.И., Соболева А.Г., Корсунская И.М., Климов Е.А., Соболев В.В.

Аннотация

Введение. Псориаз - хроническое воспалительное аутоиммунное заболевание кожи со сложной этиологией, включающей наследственные факторы. Некоторые исследователи предполагают, что псориаз является системным заболеванием и затрагивает не только кожу. Так, на стыке психиатрии и дерматологии образовалось научное направление - психодерматология, изучающее природу связи между кожными и психическими болезнями. Цель исследования. Оценить роль в развитии псориаза 3 полиморфных локусов (rs141116007, rs2097629 и rs1611115) в гене, кодирующим дофамин-β-гидроксилазу (DBH). Методы. Генотипы исследованных замен определяли с использованием метода полимеразной цепной реакции (ПЦР) с анализом полиморфизма длин рестрикционных фрагментов (ПДРФ). Продукты реакций разделяли в 2% агарозном геле. Статистическая обработка проводилась с использованием программ WinPepi и APSampler. Результаты. Выявлена ассоциация аллеля T замены rs1611115 в гене DBH с псориазом. Аллель T данной замены имеет рецессивную модель наследования - наличие аллеля C снижает вероятность развития псориаза в 4 раза. Поиск связанных с псориазом комплексных генотипов исследуемых замен также выявил ассоциацию генотипа TT замены rs1611115: критерий Фишера p<0,001, отношение шансов - 3,88. Замены rs141116007 и rs2097629 в гене DBH не связаны с псориазом. Заключение. Ассоциированный с псориазом генотип TT замены rs1611115 связан со снижением активности фермента DBH, увеличением количества дофамина и снижением - норадреналина. Можно предположить, что изменение концентрации данных нейромедиаторов играет роль в развитии псориаза.
Молекулярная медицина. 2019;17(4):62-65
pages 62-65 views