ГЕНЕТИЧЕСКОЕ ТИПИРОВАНИЕ NEISSERIA MENINGITIDIS, ЦИРКУЛИРУЮЩИХ В РЕГИОНАХ РОССИИ

Методом мультилокусного секвенирования-типирования (МЛСТ) в сочетании с определением антигенних свойств (серогруппа, субтип, аллель вариабельного участка VR белка FetA) проведена генетическая характеристика 34 штаммов менингококков и 22 клинических образцов, содержащих ДНК N. meningitidis, выделенних на территории России от больних генерализованними формами менингококковой инфекции. Преобладали менингококки серогрупп B (31 образец) и С (20 образцов). Большая часть (33 образца) менингококков серогрупп В и С била распределена по пяти клональним комплексам, четире из них уже наличествовали в базе данних http://pubmlst.org/neisseria/: «ST-41/44 complex/Lineage» (18 образцов или 35%), «ST-18 complex» (4 образца или 8%), «ST-226 complex» (1 образцец или 2%) и «ST-37 complex» (1 образец или 2%). Клональниый комплекс, образованний сиквенс-типами, генетически близкими к ST-9396 (9 образцов или 18%), бил виделен в данном исследовании. Для 17найденних сиквенс-типов (18 образцов или 35%) не удается установить принадлежность к какому-либо клональному комплексу. Такая картина типична для спорадического характера заболеваемости. В то же время присутствие на наблюдаемой территории сиквенс-типов и клональных комплексов, встречающихся в странах Европы, не позволяет говорить о существенних генетических особенностях российских штаммов N. meningitidis серогрупп В и С.

региони России, мультилокусное секвенирование-типирование