PCR GENOTYPING OF NON-TOXIGENIC VIBRIO CHOLERAE STRAINS AS ONE OF APPROACHES TO THEIR ACTUALIZATION IN TERMS OF EPIDEMIOLOGICAL SURVEILLANCE OF CHOLERA


如何引用文章

全文:

开放存取 开放存取
受限制的访问 ##reader.subscriptionAccessGranted##
受限制的访问 订阅或者付费存取

详细

Objective. To carry out PCR genotyping (with a high discriminating power) of non-toxigenic Vibrio cholerae strains isolated from environmental objects. Materials and methods. The authors carried out PCR genotyping of a representative sample from 408 non-toxigenic V. cholerae strains isolated from water bodies in the Russian Federation in 1989 to 2016, which was based on the detection of the calculated optimal number (n = 14) of virulence factor genes. A cluster analysis by the unweighted pair group method with arithmetic mean (UPGMA) was used to distribute V. cholerae isolates in 81 genotypes on the basis of different combinations (presence/absence) of these genes. Results. Genotype G10 strains were ascertained to be isolated from the Agur River in the Krasnodar Territory in different years (1993, 1999, 2007), which was suggestive of their persistent potential. In 2015, the likely drift was 89 strains of the other cluster (genotype D4). In addition, 65 V. cholerae ctxA-tcpA+ strains belonging to 26 genotypes were included in both separate clusters and in common ones with ctxA-tcpA-cultures. Conclusion. The proposed approach assists in systematizing the non-toxigenic strains of V. cholerae in terms of establishing (with a high discriminating power) their possible origin, as well as their likely importance in the etiology of acute intestinal infections, which is an important component of epidemiological investigations.

全文:

受限制的访问

作者简介

V. KRUGLIKOV

Rostov-on-Don Anti-Plague Research Institute, Russian Federal Service for Supervision of Consumer Rights Protection and Human WellBeing

D. LEVCHENKO

Rostov-on-Don Anti-Plague Research Institute, Russian Federal Service for Supervision of Consumer Rights Protection and Human WellBeing

A. VODOPYANOV

Rostov-on-Don Anti-Plague Research Institute, Russian Federal Service for Supervision of Consumer Rights Protection and Human WellBeing

N. NEPOMNYASHCHAYA

Rostov-on-Don Anti-Plague Research Institute, Russian Federal Service for Supervision of Consumer Rights Protection and Human WellBeing

参考

  1. Горяев A.A., Заднова С.П., Шубина A.B., Краснов Я.М., Смирнова Н.И. Измененные варианты возбудителя холеры, выделенные на территории Российской Федерации. Проблемы особо опасных инфекций 2011; (1): 49-52.
  2. Гриднева Л.Г., Мусатов Ю.С., Громова Т.В., Пуховская Н.М., Белозерова Н.Б., Уткина О.М., Иванов Л.И., Ковальский А.Г., Миронова Л.В., Куликалова Е.С., Хунхеева Ж.Ю., Балахонов С.В. Результаты мониторинга и биологические свойства холерных вибрионов, изолированных из объектов окружающей среды на территории Хабаровского края. Проблемы особо опасных инфекций 2014; (1): 121-4.
  3. Куликалова Е.С., Урбанович Л.Я., Миронова Л.В., Балахонов С.В. К вопросу о положении холеры в систематике инфекционных болезней. Холера и патогенные для человека вибрионы. Материалы проблемной комиссии. Ростов-на-Дону, 2015; 28: 56-60. http: Cholera-28-2015.pdf
  4. Писанов Р.В., Ежова М.П., Монахова Е.В., Черкасов A.B., Краснов Я.М., Водопьянов A.C., Кулыпань Т.А., Ливанова Л.Ф., Портенко С.А., Абдрашитова A.C., Кругликов В.Д., Титова С.В. Особенности структуры генома токсигенного штамма Vibrio cholerae El Тоr Инаба, выделенного в 2014 г. из открытого водоема в Ростове-на-Дону. Проблемы особо опасных инфекций 2015; (2): 63-7.
  5. Онищенко Е.Е., Попова А.Ю., Кутырев В.В., Смирнова Н.И., Щербакова С.А., Москвитина Э.А., Титова С.В. Актуальные проблемы эпидемиологического надзора, лабораторной диагностики и профилактики холеры в Российской Федерации. Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии 2016; (1): 89-101.
  6. Титова С.В., Москвитина Э.А., Кругликов В.Д.,Самородова A.B., Тюленева Е.Е, Монахова Е.В., Писанов P.B., Водопьянов A.C., Архангельская И.В., Иванова С.М., Ковалева Т.В., Водопьянов С.О. Холера: оценка эпидемиологичской обстановки в мире и России в 2006-2015 гг. Прогноз на 2016 год. Проблемы особо опасных инфекций 2016; (1): 20-7.
  7. Зубкова Д.А., Кругликов В.Д., Архангельская И.В., Водопьянов A.C., Непомнящая Н.Б., Водопьянов С.О. Генетические особенности штаммов холерных вибрионов 01 серогруппы ctxA-tcpA+, выделенных из водных объектов РФ, охарактеризованные с помощью новой геоинформационной системы. Здоровье население и среда обитания 2014; (9): 32-5.
  8. Kumar Р., Thulaseedharan A., Chowdhury G., Ramamurthy T., Thomas S. Characterization of novel alleles of toxin coregulated pilus A gene (tcpA) from environmental isolates of Vibrio cholera. Curr. Microbiol. 2011; 62(3): 758-63.
  9. Онищенко E.E., Ломов Ю.М., Москвитина Э.А., Подосинникова Л.С., Водяницкая С.Ю., Прометной B.И., Монахова E., Водопьянов С.О., Телесманич Н.Р., Дудина H.A. Эпидемические проявления холеры, обусловленные Vibrio cholerae Ol ctxAB-tcpA+. Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии 2007; (1): 23-9.
  10. Монахова Е.В. Факторы патогенности нехолерогенных штаммов Vibrio cholerae. Автореф. дис.. д-ра биол. наук. Ростов-на-Дону, 2012. http://www.dissercat.com/content/faktory-patogennosti-nekholerogennykshtammov-vibrio-cholerae
  11. Смирнова Н.И. Агафонов Д.А., Щелканова Е.Ю., Заднова С.П., Черкасов A.B., Кутырев В.В. Геноварианты возбудителя холеры Эль-Тор: получение, молекулярно-генетический и протеомный анализ. Молекулярная генетика, микробиология и вирусология 2014; (1): 21-30.
  12. Monakhova E.V. Phenotypic and molecular characteristics of epidemic and non-epidemic Vibrio cholerae strains isolated in Russia and certain countries of Commonwealth of Independent States (CIS). Epidemiological and Molecular Aspects on Cholera. Springer Science+Business Media, 2010; (4): 51-78.
  13. Куликалова E.C., Урбанович Л.Я., Саппо C.E., Миронова Л.В., Марков Е.Ю., Мальник В.В., Корзун В.М., Миткеева C.К., Балахонов С.В. Биопленка холерного вибриона: получение, характеристика и роль в резервации возбудителя в водной окружающей среде. Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии 2015; (1): 3-11.
  14. Титова С.В., Монахова Е.В., Архангельская И.В., Писанов Р.В., Непомнящая Н.Б. Природные популяции холерных вибрионов как резервуар генов факторов патогенности. Здоровье населения и среда обитания 2016; (5): 45-7.
  15. Ali М., Lopez A.L., You Y.A., Kim Y.E., Sah В., Maskery В., Clemens J. The global burden of cholera. Bulletin WHO 2012; 90(3): 209-18
  16. Левченко Д.А., Кругликов В.Д., Водопьянов A.C., Титова С.В., Архангельская И.В., Непомнящая Н.Б., Ежова М.И. ЕИС: возможности анализа данных фено- и генотипирования холерных вибрионов 01 Эль-Тор, изолированных из водных объектов окружающей среды на территории Российской Федерации. Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии 2016; (6): 9-25.
  17. Struelens M.J., Bauemfeind A., Van Belkum A. Consensus guidelines for appropriate use and evaluation of microbial epidemiological typing system 11. Clin. Microbiol. Infect. 1996; 2(1): 2-11.
  18. Титова C.B., Монахова E.В. О потенциальной опасности нетоксигенных штаммов холерных вибрионов, содержащих гены токсин-корегулируемых пилей адгезии. Эпидемиол. инфекц. болезни. Актуал. вопр. 2016; (5): 65-72.
  19. Осина H.A., Каляева Т.Б., Бугоркова Т.В., Касьян H.A., Оброткина Н.Ф. Результаты мониторинга холерных вибрионов в водных экосистемах на территории Республики Калмыкия. Здоровье населения и среда обитания 2013; 2(239): 28-30.
  20. Кругликов В.Д., Левченко Д.А., Водопьянов A.C., Архангельская И.В., Ежова М.И. Сравнительный анализ прикладного использования ПЦР и VNTR-генотипирования штаммов холерных вибрионов 01 cixA-icpA+. Молекулярная диагностика 2017; (1): 341-2.

补充文件

附件文件
动作
1. JATS XML
下载
##common.cookie##