ПЦР-ГЕНОТИПИРОВАНИЕ НЕТОКСИГЕННЫХ ШТАММОВ ХОАЕРНЫХ ВИБРИОНОВ КАК ОДИН ИЗ ПОДХОДОВ ИХ АКТУАЛИЗАЦИИ В ПААНЕ ЭПИДНАЗОРА ЗА ХОАЕРОЙ


Цитировать

Полный текст

Открытый доступ Открытый доступ
Доступ закрыт Доступ предоставлен
Доступ закрыт Доступ платный или только для подписчиков

Аннотация

Цель исследования. ПЦР-генотипирование (с высокой дискриминирующей силой) нетоксигенных изолятов холерных вибрионов, выделенных из объектов окружающей среды. Материалы и методы. Проведено ПЦР-генотипирование репрезентативной выборки из 408 нетоксигенных штаммов холерных вибрионов, выделенных из водных объектов в Российской Федерации с 1989 по 2016 г., основанное на детекции рассчитанного оптимального количества (14) генов факторов патогенности. С помощью кластерного анализа по методу UPGMA (unweighted pair group method with arithmetic mean) изоляты V. cholerae были распределены в 81 генотип на основе различных сочетаний (наличие/отсутствие) данных генов. Результаты. Установлено, что на территории Краснодарского края из р. Агура в разные годы (1993, 1999, 2007) были выделены штаммы с генотипом G10, что свидетельствовало об их персистентном потенциале. В 2015 г. - 89 штаммов другого кластера (генотип D4) - вероятный занос. Кроме того, 65 штаммов V. cholerae ctxA-tcpA+, принадлежащие к 26 генотипам, входили как в отдельные кластеры, так и в общие с культурами ctxA-tcpA-. Заключение. Предлагаемый подход помогает систематизировать нетоксигенные штаммы холерных вибрионов в плане установления (с высокой дискриминирующей силой) возможного происхождения, а также вероятного их значения в этиологии острых кишечных инфекций, что является важной составляющей эпидемиологических расследований.

Полный текст

Доступ закрыт

Об авторах

В. Д КРУГЛИКОВ

ФКУЗ «Ростовский-на-Дону противочумный институт» Роспотребнадзора

Д. А ЛЕВЧЕНКО

ФКУЗ «Ростовский-на-Дону противочумный институт» Роспотребнадзора

А. С ВОДОПЬЯНОВ

ФКУЗ «Ростовский-на-Дону противочумный институт» Роспотребнадзора

Н. Б НЕПОМНЯЩАЯ

ФКУЗ «Ростовский-на-Дону противочумный институт» Роспотребнадзора

Список литературы

  1. Горяев A.A., Заднова С.П., Шубина A.B., Краснов Я.М., Смирнова Н.И. Измененные варианты возбудителя холеры, выделенные на территории Российской Федерации. Проблемы особо опасных инфекций 2011; (1): 49-52.
  2. Гриднева Л.Г., Мусатов Ю.С., Громова Т.В., Пуховская Н.М., Белозерова Н.Б., Уткина О.М., Иванов Л.И., Ковальский А.Г., Миронова Л.В., Куликалова Е.С., Хунхеева Ж.Ю., Балахонов С.В. Результаты мониторинга и биологические свойства холерных вибрионов, изолированных из объектов окружающей среды на территории Хабаровского края. Проблемы особо опасных инфекций 2014; (1): 121-4.
  3. Куликалова Е.С., Урбанович Л.Я., Миронова Л.В., Балахонов С.В. К вопросу о положении холеры в систематике инфекционных болезней. Холера и патогенные для человека вибрионы. Материалы проблемной комиссии. Ростов-на-Дону, 2015; 28: 56-60. http: Cholera-28-2015.pdf
  4. Писанов Р.В., Ежова М.П., Монахова Е.В., Черкасов A.B., Краснов Я.М., Водопьянов A.C., Кулыпань Т.А., Ливанова Л.Ф., Портенко С.А., Абдрашитова A.C., Кругликов В.Д., Титова С.В. Особенности структуры генома токсигенного штамма Vibrio cholerae El Тоr Инаба, выделенного в 2014 г. из открытого водоема в Ростове-на-Дону. Проблемы особо опасных инфекций 2015; (2): 63-7.
  5. Онищенко Е.Е., Попова А.Ю., Кутырев В.В., Смирнова Н.И., Щербакова С.А., Москвитина Э.А., Титова С.В. Актуальные проблемы эпидемиологического надзора, лабораторной диагностики и профилактики холеры в Российской Федерации. Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии 2016; (1): 89-101.
  6. Титова С.В., Москвитина Э.А., Кругликов В.Д.,Самородова A.B., Тюленева Е.Е, Монахова Е.В., Писанов P.B., Водопьянов A.C., Архангельская И.В., Иванова С.М., Ковалева Т.В., Водопьянов С.О. Холера: оценка эпидемиологичской обстановки в мире и России в 2006-2015 гг. Прогноз на 2016 год. Проблемы особо опасных инфекций 2016; (1): 20-7.
  7. Зубкова Д.А., Кругликов В.Д., Архангельская И.В., Водопьянов A.C., Непомнящая Н.Б., Водопьянов С.О. Генетические особенности штаммов холерных вибрионов 01 серогруппы ctxA-tcpA+, выделенных из водных объектов РФ, охарактеризованные с помощью новой геоинформационной системы. Здоровье население и среда обитания 2014; (9): 32-5.
  8. Kumar Р., Thulaseedharan A., Chowdhury G., Ramamurthy T., Thomas S. Characterization of novel alleles of toxin coregulated pilus A gene (tcpA) from environmental isolates of Vibrio cholera. Curr. Microbiol. 2011; 62(3): 758-63.
  9. Онищенко E.E., Ломов Ю.М., Москвитина Э.А., Подосинникова Л.С., Водяницкая С.Ю., Прометной B.И., Монахова E., Водопьянов С.О., Телесманич Н.Р., Дудина H.A. Эпидемические проявления холеры, обусловленные Vibrio cholerae Ol ctxAB-tcpA+. Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии 2007; (1): 23-9.
  10. Монахова Е.В. Факторы патогенности нехолерогенных штаммов Vibrio cholerae. Автореф. дис.. д-ра биол. наук. Ростов-на-Дону, 2012. http://www.dissercat.com/content/faktory-patogennosti-nekholerogennykshtammov-vibrio-cholerae
  11. Смирнова Н.И. Агафонов Д.А., Щелканова Е.Ю., Заднова С.П., Черкасов A.B., Кутырев В.В. Геноварианты возбудителя холеры Эль-Тор: получение, молекулярно-генетический и протеомный анализ. Молекулярная генетика, микробиология и вирусология 2014; (1): 21-30.
  12. Monakhova E.V. Phenotypic and molecular characteristics of epidemic and non-epidemic Vibrio cholerae strains isolated in Russia and certain countries of Commonwealth of Independent States (CIS). Epidemiological and Molecular Aspects on Cholera. Springer Science+Business Media, 2010; (4): 51-78.
  13. Куликалова E.C., Урбанович Л.Я., Саппо C.E., Миронова Л.В., Марков Е.Ю., Мальник В.В., Корзун В.М., Миткеева C.К., Балахонов С.В. Биопленка холерного вибриона: получение, характеристика и роль в резервации возбудителя в водной окружающей среде. Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии 2015; (1): 3-11.
  14. Титова С.В., Монахова Е.В., Архангельская И.В., Писанов Р.В., Непомнящая Н.Б. Природные популяции холерных вибрионов как резервуар генов факторов патогенности. Здоровье населения и среда обитания 2016; (5): 45-7.
  15. Ali М., Lopez A.L., You Y.A., Kim Y.E., Sah В., Maskery В., Clemens J. The global burden of cholera. Bulletin WHO 2012; 90(3): 209-18
  16. Левченко Д.А., Кругликов В.Д., Водопьянов A.C., Титова С.В., Архангельская И.В., Непомнящая Н.Б., Ежова М.И. ЕИС: возможности анализа данных фено- и генотипирования холерных вибрионов 01 Эль-Тор, изолированных из водных объектов окружающей среды на территории Российской Федерации. Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии 2016; (6): 9-25.
  17. Struelens M.J., Bauemfeind A., Van Belkum A. Consensus guidelines for appropriate use and evaluation of microbial epidemiological typing system 11. Clin. Microbiol. Infect. 1996; 2(1): 2-11.
  18. Титова C.B., Монахова E.В. О потенциальной опасности нетоксигенных штаммов холерных вибрионов, содержащих гены токсин-корегулируемых пилей адгезии. Эпидемиол. инфекц. болезни. Актуал. вопр. 2016; (5): 65-72.
  19. Осина H.A., Каляева Т.Б., Бугоркова Т.В., Касьян H.A., Оброткина Н.Ф. Результаты мониторинга холерных вибрионов в водных экосистемах на территории Республики Калмыкия. Здоровье населения и среда обитания 2013; 2(239): 28-30.
  20. Кругликов В.Д., Левченко Д.А., Водопьянов A.C., Архангельская И.В., Ежова М.И. Сравнительный анализ прикладного использования ПЦР и VNTR-генотипирования штаммов холерных вибрионов 01 cixA-icpA+. Молекулярная диагностика 2017; (1): 341-2.

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML
Скачать

© ООО «Бионика Медиа», 2018