Кластеризация стандартизованных показателей кумулятивной инцидентности за многолетний период как метод анализа пространственного распределения случаев заболевания

Обложка

Цитировать

Полный текст

Открытый доступ Открытый доступ
Доступ закрыт Доступ предоставлен
Доступ закрыт Доступ платный или только для подписчиков

Аннотация

Цель исследования. Обоснование использования визуализации результатов иерархической кластеризации стандартизованных показателей кумулятивной инцидентности за многолетний период как метода анализа пространственного распределения случаев заболевания.

Материалы и методы. Проанализированы сведения о заболеваемости хроническим гепатитом В (ХГВ) населения 85 субъектов Российской Федерации за период с 2014 по 2022 г. по данным статистической формы № 2 «Сведения об инфекционных и паразитарных болезнях». Все расчеты выполнены при помощи библиотек Python.

Результаты. Описана последовательность действий по получению и интерпретации результатов иерархической кластеризации показателей многолетней кумулятивной инцидентности в субъектах Российской Федерации с целью анализа многолетней заболеваемости населения ХГВ.

Заключение. Предложенный метод значительно повышает информативность и объективность результатов изучения пространственного распределения случаев заболевания ХГВ.

Полный текст

Доступ закрыт

Об авторах

Дмитрий Васильевич Дубоделов

Центральный НИИ эпидемиологии Роспотребнадзора

Автор, ответственный за переписку.
Email: dubodelov@cmd.su
ORCID iD: 0000-0003-3093-5731

к.м.н., старший научный сотрудник лаборатории вирусных гепатитов

Россия, Москва

Светлана Викторовна Углева

Центральный НИИ эпидемиологии Роспотребнадзора

Email: ugleva@cmd.su
ORCID iD: 0000-0002-1322-0155

д.м.н., профессор, научный консультант организационно-методического отдела

Россия, Москва

Гасан Алиевич Гасанов

Центральный НИИ эпидемиологии Роспотребнадзора

Email: gasanov@cmd.su
ORCID iD: 0000-0002-0121-521X

консультант организационно-методического отдела

Россия, Москва

Марина Игоревна Корабельникова

Центральный НИИ эпидемиологии Роспотребнадзора

Email: korabelnikova@cmd.su
ORCID iD: 0000-0002-2575-8569

научный сотрудник лаборатории вирусных гепатитов

Россия, Москва

Наталья Владимировна Сычева

Центральный НИИ эпидемиологии Роспотребнадзора

Email: natsy@bk.ru
ORCID iD: 0000-0001-8557-6540

младший научный сотрудник лаборатории инфекций, связанных с оказанием медицинской помощи

Россия, Москва

Василий Алексеевич Заволожин

Центральный НИИ эпидемиологии Роспотребнадзора

Email: zavolozhin@cmd.su
ORCID iD: 0000-0003-4015-1105

к.м.н., младший научный сотрудник лаборатории вирусных гепатитов

Реюньон, Москва

Анна Сергеевна Есьман

Центральный НИИ эпидемиологии Роспотребнадзора

Email: esman@cmd.su
ORCID iD: 0000-0002-5456-7649

научный сотрудник лаборатории молекулярных методов изучения генетических полиморфизмов

Россия, Москва

Наталья Викторовна Власенко

Центральный НИИ эпидемиологии Роспотребнадзора

Email: vlasenko@cmd.su
ORCID iD: 0000-0002-2388-1483

лаборант-исследователь лаборатории вирусных гепатитов

Россия, Москва

Татьяна Анатольевна Семененко

Национальный исследовательский центр эпидемиологии и микробиологии имени почетного академика Н.Ф. Гамалеи Минздрава России

Email: semenenko@gamaleya.org
ORCID iD: 0000-0002-6686-9011

д.м.н., профессор, руководитель отдела эпидемиологии

Россия, Москва

Станислав Николаевич Кузин

Центральный НИИ эпидемиологии Роспотребнадзора

Email: drkuzin@list.ru
ORCID iD: 0000-0002-0616-9777

д.м.н., профессор, заведующий лабораторией вирусных гепатитов

Россия, Москва

Василий Геннадиевич Акимкин

Центральный НИИ эпидемиологии Роспотребнадзора

Email: vgakimkin@yandex.ru
ORCID iD: 0000-0003-4228-9044

академик РАН, д.м.н., профессор, директор

Россия, Москва

Список литературы

  1. Беляков В.Д., Яфаев Р.Х. Эпидемиология: Учебник. М.: Медицина, 1989. 416 с.
  2. Belyakov V.D., YAfaev R.H. [Epidemiology: Textbook]. Moscow: Medicine, 1989. 416 p. (In Russ.)
  3. Беляков В.Д., Дегтярев А.А., Иванников Ю.Г. Качество и эффективность противоэпидемических мероприятий. Л.: Медицина, 1981. 303 с.
  4. Belyakov V.D., Degtyarev A.A., Ivannikov Yu.G. [The quality and effectiveness of anti-epidemic measures]. Saint-Petersburg: Medicine, 1981. 303 p. (In Russ.)
  5. Зуева Л.П., Еремин С.Р., Асланов Б.И. Эпидемиологическая диагностика. 2-е изд., перераб. и доп. СПб: Фолиант, 2009. 312 с.
  6. Zueva L.P., Eremin S.R., Aslanov B.I. [Epidemiological diagnosis. 2nd edition]. Saint-Petersburg: Foliant. 2009. 312 p. (In Russ.)
  7. Слободенюк А.В., Косова А.А., Ан Р.Н. Эпидемиологический анализ: Учебное пособие. Екатеринбург: изд. ГБОУ ВПО УГМУ Минздрава России, 2015. 36 с.
  8. Slobodenyuk A.V., Kosova A.A., An R.N. [Epidemiological analysis]. Ekaterinburg. Ural State Medical University publishing house, 2015. 36 p. (In Russ.)
  9. Гаврилов Д.В., Абрамов Р.В., Кирилкина А.В., Ившин А.А., Новицкий Р.Э. Модель прогнозирования пандемии COVID-19 на основе машинного обучения в отдельных регионах Российской Федерации. Фармакоэкономика. Современная фармакоэкономика и фармакоэпидемиология 2021; 14(3): 342–56. https://doi.org/10.17749/ 2070-4909/farmakoekonomika.2021.108
  10. Gavrilov D.V., Abramov R.V., Kirilkina А.V., Ivshin А.А., Novitskiy R.E. [COVID-19 pandemic prediction model based on machine learning in selected regions of the Russian Federation]. Farmakoekonomika. Modern Pharmacoeconomics and Pharmacoepidemiology 2021; 14(3): 342–56 (In Russ.). https://doi.org/10.17749/2070-4909/farmakoekonomika.2021.108.
  11. Зайцева Н.В., Май И.В., Кирьянов Д.А., Бабина С.В., Камалтдинов М.Р. Cанитарно-эпидемиологический надзор: новый этап развития в условиях цифровизации и правовых изменений. Анализ риска здоровью 2021; (2): 4–16. doi: 10.21668/health.risk/2021.2.01
  12. Zaitseva N.V., May I.V., Kiryanov D.А., Babina S.V., Kamaltdinov M.R. [Sanitary-epidemiological surveillance: a new stage in development stimulated by digitalization and changes in legislation]. Health Risk Analysis 2021; (2): 4–16. (In Russ.). doi: 10.21668/health.risk/2021.2.01
  13. Гусев А.В., Добриднюк С.Л. Искусственный интеллект в медицине и здравоохранении. Информационное общество 2017; (4–5): 78–93.
  14. Gusev A.V., Dobridnyuk S.L. [Artificial intelligence in medicine and healthcare.] Information Society 2017; (4–5): 78–93. (In Russ.).
  15. Невзорова В.А., Плехова Н.Г., Присеко Л.Г., Черненко И.Н., Богданов Д.Ю., Мокшина М.В. и др. Методы машинного обучения в прогнозировании исходов и рисков сердечно-сосудистых заболеваний у пациентов с артериальной гипертензией (по материалам ЭССЕ-РФ в Приморском крае). Российский кардиологический журнал 2020; 25(3): 10–16. doi: 10.15829/1560-4071-2020-3-3751
  16. Nevzorova V.A., Plekhova N.G., Priseko L.G., Chernenko I.N., Bogdanov D.Yu., Mokshina M.V., Kulakova N.V. [Machine learning for predicting the outcomes and risks of cardiovascular diseases in patients with hypertension: results of ESSE-RF in the Primorsky Region]. Russian Journal of Cardiology 2020; 25(3): 3751 (In Russ.). https://doi.org/10.15829/1560-4071-2020-3-3751
  17. Бетелин В.Б., Галкин В.А., Ряховский А.В. Tочечные и распределенные модели распространения коронавирусной инфекции. Успехи кибернетики 2021; 2(2): 12–20. doi: 10.51790/2712-9942-2021-2-2-1
  18. Betelin V. B., Galkin V. A., Ryakhovskiy A. V. [Local and Distributed Models of the Coronavirus Spread]. Russian Journal of Cybernetics 2021; 2(2): 12–20. (In Russ.). doi: 10.51790/2712-9942-2021-2-2-1
  19. Наумов И.В., Отмахова Ю.С., Красных С.С. Методологический подход к моделированию и прогнозированию воздействия пространственной неоднородности процессов распространения COVID-19 на экономическое развитие регионов России. Компьютерные исследования и моделирование 2021; 13(3): 629–48. doi: 10.20537/2076-7633-2021-13-3-629-648
  20. Naumov I.V., Otmakhova Y.S., Krasnykh S.S. [Methodological approach to modeling and forecasting the impact of the spatial heterogeneity of the COVID-19 spread on the economic development of Russian Regions] Computer Research and Modelin. 2021; 13(3): 629–48. (In Russ.). doi: 10.20537/2076-7633-2021-13-3-629-648
  21. Сенько О.В., Кузнецова А.В., Воронин Е.М., Кравцова О.А., Борисова Л.Р., Кирилюк И.Л. и др. Методы интеллектуального анализа данных в исследованиях эпидемии COVID-19. Журнал Белорусского государственного университета. Математика. Информатика 2022; (1): 83–96. https://doi.org/10.33581/2520-6508-2022-1-83-96
  22. Senko O.V., Kuznetsova A.V., Voronin E.M., Kravtsova O.A., Borisova L.R., Kirilyuk I.L., Akimkin V.G. [Methods of intellectual data analysis in COVID-19 research.] Journal of the Belarusian State University. Mathematics and Informatics. 2022; (1): 83–96. (In Russ.). https://doi.org/10.33581/2520-6508-2022-1-83-96
  23. Головерова Ю.А., Абросимова О.А., Кузнецова А.В., Воронин Е.М. Машинное обучение для оценки взаимосвязи кадровых ресурсов и основных показателей здравоохранения с заболеваемостью инфекциями, связанными с оказанием медицинской помощи, среди пациентов стационаров в субъектах Российской Федерации. Вестник науки 2022; 3(11): 304–20.
  24. Goloverova Yu.A., Abrosimova O.A., Kuznetsova A.V., Voronin E.M. [Machine learning to assess the relationship of human resources and key health indicators with the incidence of infections associated with the provision of medical care among hospital patients in the subjects of the Russian Federation]. Bulletin of Science 2022; 3(11): 304–20. (In Russ.).
  25. Панин А.Н., Рыльский И.А., Тикунов В.С. Пространственные закономерности распространения пандемии COVID-19 в России и мире: картографический анализ. Вестник Московского университета. Серия 5. География 2021; (1): 62–77.
  26. Panin A.N., Rilskiy I.A., Tikunov V.S. [Spatial patterns of COVID-19 distribution in Russia and the world: cartographic analysis]. Lomonosov Geography Journal. Series 5, Geography 2021; (1): 62–77. (In Russ.).
  27. Завальский Л.Ю., Доброхотский О.Н., Зиновьев Г.А., Воронина М.А., Еремченко Е.Н., Клименко С.В. Пространственно-временной анализ инфекционной заболеваемости с использованием методов неогеографии на примере городского поселения Оболенск Московской области. Биозащита и биобезопасность 2011; 3(2): 22–9.
  28. Zavalsky L.Y., Dobrokhotskiy O.N., Zinoviev G.A., Voronina M.A., Eremchenko E.N., Klimenko S.V. [The existential analysis of infectious desease with use of methods neogeography by the example of city settlement Obolensk of the Moscow area]. Biosecurity and biosafety 2011; 3(2): 22–9. (In Russ.).

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML
Скачать
2. Рис. 1. Результат иерархической кластеризации субъектов РФ на основе многолетних интенсивных показателей заболеваемости ХГВ

Скачать (1MB)
Метаданные
3. Рис. 2. Масштабированные интенсивные показатели заболеваемости ХГВ

Скачать (3MB)
Метаданные

© ООО «Бионика Медиа», 2024