Опыт применения импульсного УФ-излучения сплошного спектра плазменных ксеноновых ламп для деконтаминации продуктов ПЦР

Обложка

Цитировать

Полный текст

Открытый доступ Открытый доступ
Доступ закрыт Доступ предоставлен
Доступ закрыт Доступ платный или только для подписчиков

Аннотация

Цель исследования. Оценка эффективности разрушения коротких ПЦР-ампликонов с помощью импульсного источника излучения широкого спектра.

Материалы и методы. С помощью источника импульсного УФ-излучения проведены эксперименты на ампликонах ДНК длиной 117 п. н. Эффективность деконтаминации оценивали по остаточному количеству ампликонов в смывах с рабочих поверхностей, таких как пластик, стекло и металл.

Результаты. Была показана высокая эффективность импульсного УФ-излучения в борьбе с контаминацией ДНК, определено оптимальное время облучения (10–12 мин), достаточное для полного разрушения ампликонов на различных типах поверхности (пластик, стекло, металл). Полученные данные позволяют сократить время обработки помещений и снизить негативное воздействие от УФ-излучения на лабораторное оборудование и помещения.

Заключение. Продемонстрирована целесообразность использования импульсных установок, генерирующих высокоинтенсивные потоки УФ-излучения сплошного спектра, для разрушения ампликонов на различных поверхностях.

Полный текст

Доступ закрыт

Об авторах

Алексей Викторович Тутельян

Центральный НИИ эпидемиологии Роспотребнадзора

Автор, ответственный за переписку.
Email: bio-tav@yandex.ru
ORCID iD: 0000-0002-2706-6689

чл.-корр. РАН, д.м.н., профессор, заведующий лабораторией инфекций, связанных с оказанием медицинской помощи

Россия, Москва

Евгений Александрович Черкашин

Центральный НИИ эпидемиологии Роспотребнадзора

Email: e.cherkashin@pcr.ms
ORCID iD: 0000-0002-3627-6047

к.х.н. руководитель. Центр разработки, развития продукции и инноваций

Россия, Москва

Татьяна Львовна Замотаева

Центральный НИИ эпидемиологии Роспотребнадзора

Email: zamotaevatat@gmail.com
ORCID iD: 0009-0003-9799-3749

научный сотрудник, Центр разработки, развития продукции и инноваций

Россия, Москва

Ольга Андреевна Абросимова

Центральный НИИ эпидемиологии Роспотребнадзора

Email: kvasova@cmd.su
ORCID iD: 0000-0002-4545-1804

врач-эпидемиолог, руководитель эпидемиологической службы

Россия, Москва

Алексей Олегович Потапенко

ООО «НПП «Мелитта»

Email: alexeu1999pt@gmail.com

научный сотрудник

Россия, Москва

Сергей Геннадьевич Шашковский

ООО «НПП «Мелитта»

Email: melitta916@gmail.com

к.т.н., главный конструктор

Россия, Москва

Яков Абраммерович Гольдштейн

ООО «НПП «Мелитта»

Email: yagmed@gmail.com

генеральный директор

Россия, Москва

Василий Геннадьевич Акимкин

Центральный НИИ эпидемиологии Роспотребнадзора

Email: vgakimkin@yandex.ru
ORCID iD: 0000-0003-4228-9044

академик РАН, д.м.н., профессор, директор

Россия, Москва

Список литературы

  1. Kleppe K., Ohtsuka E., Kleppe R., Molineux I., Khorana H.G. Studies on polynucleotides. XCVI. Repair replications of short synthetic DNA’s as catalyzed by DNA polymerases. J. Mol. Biol. 1971; 56: 341–361. doi: 10.1016/0022-2836(71)90469-4
  2. Saiki R., Scharf S., Faloona F., Mullis K., Horn G., Erlich H. Enzymatic amplification of beta-globin genomic sequences and restriction site analysis for diagnosis of sickle cell anemia. Science 1985; 230: 1350–1354. doi: 10.1126/science.2999980
  3. Краснов Я.М., Гусева Н.П., Шарапова Н.А., Черкасов А.В. Современные методы секвенирования ДНК. Проблемы особо опасных инфекций 2014; (2): 73–79. doi: 10.21055/0370-1069-2014-2/Krasnov Ya.M., Guseva N.P., Sharapova N.A., Cherkasov A.V. [Modern methods of DNA sequencing]. Problems of Particularly Dangerous Infections 2014; (2): 73–79. (In Russ.). doi: 10.21055/0370-1069-2014-2
  4. Wong Y., Othman S., Lau Y., Radu S., Chee H. Loop-mediated isothermal amplifcation (LAMP): a versatile technique for detection of micro-organisms. J. Appl. Microbiol. 2018; 124(3): 626–643. doi: 10.1111/jam.13647
  5. Zhou L., Chandrasekaran A.R., Punnoose J.A., Bonenfant G., Charles S., Levchenko O. et al. Programmable low-cost DNA-based platform for viral RNA detection. Sci. Adv. 2020; 6(39): eabc6246. doi: 10.1126/sciadv.abc6246
  6. Волков А.Н., Начева Л.В., Захарова Ю.В. Молекулярно-генетические методы в практике современных медико-биологических исследований. Часть II: использование ПЦР в диагностике инфекционных заболеваний человека. Фундаментальная и клиническая медицина 2021; 6(1): 77–85. doi: 10.23946/2500-0764-2021-6-1-77-85/Volkov A.N., Nacheva L.V., Zakharova Y.V. [Molecular genetic techniques in current biomedical research. Part II: PCR applications in diagnostics of human infectious diseases]. Fundamental and Clinical Medicine 2021; 6(1): 77–85. (In Russ.). doi: 10.23946/2500-0764-2021-6-1-77-85
  7. Кузин В.В., Колупаева Н.В., Щербакова О.А., Дятлов И.А. Деконтаминация поверхностей от нуклеиновых кислот аэрозолями дезинфицирующих средств. Microbiology Independent Research Journal 2023; 10(1): 1–12. doi: 10.18527/2500-2236-2023-10-1-1-12/Kuzin V.V., Kolupaeva N.V., Shcherbakova O.A., Dyatlov I.A. [Decontamination of surfaces from nucleic acids with aerosols of disinfectants]. Microbiology Independent Research Journal 2023; 10(1): 1–12. (In Russ.). doi: 10.18527/2500-2236-2023-10-1-1-12
  8. Jinno Y., Yoshiuraand K., Niikawa N. Use of psoralen as extinguisher of contaminated DNA in PCR. Nucleic Acids Res. 1990; 18(22): 6739 doi: 10.1093/nar/18.22.6739
  9. Алиев А.А., Шапиев Б.И., Алиев Н.А. Коррозионная активность дезинфицирующего средства для обработки помещений и объектов на основе нейтрального анолита. Известия Дагестанского государственного педагогического университета. Серия: Естественные и точные науки 2018; 12(4): 5–10. doi: 10.31161/1995-0675-2018-12-4-5-10/Aliev A.A., Shapiev B.I., Aliev N.A. [Corrosive activity of a disinfectant for treating premises and objects based on neutral anolyte]. News of the Dagestan State Pedagogical University. Series: Natural and Exact Sciences 2018; 12(4): 5–10. (In Russ.). doi: 10.31161/1995-0675-2018-12-4-5-10
  10. Mwangi P., Mogotsi M., Ogunbayo A., Mooko T., Maringa W. A decontamination strategy for resolving SARS-CoV-2 amplicon contamination in a next-generation sequencing laboratory. Arch. Virol. 2022; 167(4): 1175–1179. doi: 10.1007/s00705-022-05411-z
  11. Champlot S., Berthelot C., Pruvost M. An Efficient Multistrategy DNA Decontamination Procedure of PCR Reagents for Hypersensitive PCR Applications. PLoS One 2010; 5(9):e13042. doi: 10.1371/journal.pone.0013042
  12. Волынкина А.С., Рязанова А.Г., Русанова Д.В., Куличенко А.Н. Проблема ДНК (РНК)-контаминации в лаборатории при проведении диагностики COVID-19 методом ПЦР. Здоровье населения и среда обитания 2021; (7): 76–81. doi: 10.35627/2219-5238/2021-29-7-76-81/Volynkina A.S., Ryazanova A.G., Rusanova D.V., Kulichenko A.N. [The problem of DNA (RNA) contamination in the laboratory when diagnosing COVID-19 using the PCR method]. Population Health and Environment 2021; (7): 76–81. (In Russ.). doi: 10.35627/2219-5238/2021-29-7-76-81
  13. Karlen Y., McNair A., Perseguers S., Mazza C., Mermod N. Statistical significance of quantitative PCR. BMC Bioinformatics 2007; 20(8): 131. doi: 10.1186/1471-2105-8-131
  14. Sicairos-Ruelas E.E., Gerba C.P., Bright K.R. Efficacy of copper and silver as residual disinfectants in drinking water. J. Environ. Sci. Health A Tox. Hazard Subst. Environ. Eng. 2019; 54(2): 146–155. doi: 10.1080/10934529.2018.1535160
  15. Farrer A.G., Wright S., Skelly E., Eisenhofer R., Dobney K., Weyrich L. Effectiveness of decontamination protocols when analyzing ancient DNA preserved in dental calculus. Sci. Rep. 2021; 11(1): 7456. doi: 10.1038/s41598-021-86100-w
  16. Soro A., Ekhlas D., Shokri S., Yem M., Li R., Barroug S. The efficiency of UV light-emitting diodes (UV-LED) in decontaminating Campylobacter and Salmonella and natural microbiota in chicken breast, compared to a UV pilot-plant scale device. Food Microbiology 2023; 116: 104365. doi: 10.1016/j.fm.2023.104365

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML
Скачать

© ООО «Бионика Медиа», 2025