Микробиологический мониторинг пациентов в инфекционном отделении реанимации

Обложка

Цитировать

Полный текст

Открытый доступ Открытый доступ
Доступ закрыт Доступ предоставлен
Доступ закрыт Доступ платный или только для подписчиков

Аннотация

Цель исследования. Анализ данных микробной колонизации пациентов отделения анестезиологии-реанимации (ОАР) с оценкой динамики антибактериальной резистентности.

Материалы и методы. Выполнен анализ данных микробиологического мониторинга 88 пациентов с диагнозом «новая коронавирусная инфекция», поступивших в ОАР. Микробиологические исследования проводили по общепринятой методике.

Результаты. До поступления в ОАР 27,3% пациентов получали антимикробную терапию. Частота микробной колонизации различных биолокусов пациентов при поступлении в ОАР составила: содержимое нижних дыхательных путей – 93,8%, моча – 54,1%, кровь – 35,0%. В содержимом нижних дыхательных путей и моче в основном выделялись нормальные комменсалы ротовой полости и мочевыводящих путей. Отмечено значительное содержание грибов рода Candida – 24,0 и 13,6% соответственно. В крови пациентов при поступлении в ОАР в 71,4% случаев выделялись Staphylococcus spp., а в 19,0% – Аctinomyces spp. В динамике отмечено увеличение частоты выделения грибов из всех локусов пациентов. Уже при поступлении часть пациентов (7,6–38,1%) была контаминирована антибиотикорезистентными микроорганизмами, в динамике отмечалось снижение выделения антибиотикорезистентных микроорганизмов, выделенных из содержимого нижних дыхательных путей и крови.

Заключение. Микробиологический мониторинг необходим в ОАР, поскольку позволяет проводить раннюю диагностику инфекций, связанных с оказанием медицинской помощи, следить за динамикой эпидемического процесса и своевременно назначать рациональную антимикробную терапию.

Полный текст

Доступ закрыт

Об авторах

Оксана Анатольевна Орлова

Национальный медико-хирургический Центр имени Н.И. Пирогова Минздрава России; Национальный исследовательский центр эпидемиологии и микробиологии имени почетного академика Н.Ф. Гамалеи Минздрава России; Центральный НИИ эпидемиологии Роспотребнадзора

Автор, ответственный за переписку.
Email: оksana_orlova@bk.ru
ORCID iD: 0000-0002-6701-1252

д.м.н., врач-эпидемиолог, начальник отдела эпидемиологии; старший научный сотрудник лаборатории оппортунистических инфекций; ведущий научный сотрудник лаборатории инфекций, связанных с оказанием медицинской помощи

Россия, Москва; Москва; Москва

Виталий Геннадьевич Гусаров

Национальный медико-хирургический Центр имени Н.И. Пирогова Минздрава России

Email: gusarovvg@pirogov-center.ru
ORCID iD: 0000-0002-2900-1459

д.м.н., доцент, главный врач стационара, заведующий кафедрой анестезиологии и реаниматологии, Институт усовершенствования врачей

Россия, Москва

Дарья Андреевна Камышова

Национальный медико-хирургический Центр имени Н.И. Пирогова Минздрава России

Email: kamyshovada@pirogov-center.ru
ORCID iD: 0000-0003-3084-9294

врач-клинический фармаколог, заведующая отделением клинической фармакологии, ассистент кафедры внутренних болезней, Институт усовершенствования врачей

Россия, Москва

Людмила Викторовна Петрова

Национальный медико-хирургический Центр имени Н.И. Пирогова Минздрава России

Email: petrovalv@pirogov-center.ru
ORCID iD: 0000-0001-6221-9743

врач-бактериолог, заведующая микробиологической лабораторией

Россия, Москва

Татьяна Анатольевна Семененко

Национальный исследовательский центр эпидемиологии и микробиологии имени почетного академика Н.Ф. Гамалеи Минздрава России

Email: info@gamaleya.org
ORCID iD: 0000-0002-6686-9011

академик РАЕН, д.м.н., профессор, руководитель отдела эпидемиологии

Россия, Москва

Список литературы

  1. Дворак C.И., Гусев Д.А., Суборова Т.Н., Захарова Н.Г., Сизова Н.В., Буланьков Ю.И. Оптимизация стартовой эмпирической антибактериальной терапии у больных ВИЧ-инфекцией – пациентов специализированного стационара. Журнал инфектологии 2019; 11(2): 97–106. doi: 10.22625/2072-6732-2019-11-2-97-1061/Dvorak S.I., Gusev D.A., Suborova T.N., Zakharova N.G., Sizova N.V., Bulankov Yu.I. [Optimization of starting empirical antibacterial therapy in patients with HIV infection – specialized hospital patients]. Journal Infectology 2019; 11(2): 97–106. (In Russ.). doi: 10.22625/2072-6732-2019-11-2-97-106
  2. Бурмистров Е.М., Краснослободцев К.Г., Аветисян Л.Р., Сиянова Е.А., Медведева О.С., Целикина Е.Г. и др. Смешанные бактериально-вирусные инфекции легких у пациентов с муковисцидозом. Пульмонология 2023; 33(4): 488–496. doi: 10.18093/0869-0189-2023-33-4-488-496/Burmistrov E.M., Krasnoslobodtsev K.G., Avetisyan L.R., Siyanova E.A., Medvedeva O.S., Tselikina E.G. et al. [Mixed bacterial-viral lung infections in patients with cystic fibrosis]. Pulmonologiya 2023; 33(4): 488–496. (In Russ.). doi: 10.18093/0869-0189-2023-33-4-488-496
  3. Тлюстангелова Р.К., Пшеничная Н.Ю., Лизинфельд И.А., Журавлев А.С. Выбор тактики лечения у больных с острыми кишечными инфекциями бактериальной этиологии, имеющих высокий риск развития синдрома раздраженного кишечника. Эпидемиол. инфекц. болезни. Актуал. вопр. 2024; 14(2): 79–86. doi: 10.18565/epidem.2024.14.2.79-86/Tlyustangelova R.K., Pshenichnaya N.Yu., Lizinfeld I.A., Zhuravlev A.S. [Choice of treatment tactics in patients with acute bacterial intestinal infections who have a high risk of developing irritable bowel syndrome]. Epidemiology and infectious diseases. Current items 2024; 14(2): 79–86. (In Russ.). doi: 10.18565/epidem.2024.14.2.79-86
  4. Николаева И.В., Гайнатуллина Л.Р., Гусева С.Е., Юмагулова Е.Ф., Белова М.Н. Этиологическая структура и антибиотикорезистентность возбудителей сепсиса у больных COVID-19. Практическая медицина 2024; 22(2): 90–95. doi: 10.32000/2072-1757-2024-2-90-95/Nikolaeva I.V., Gainatullina L.R., Guseva S.E., Yumagulova E.F., Belova M.N. [Etiological structure and antibiotic resistance of sepsis pathogens in patients with COVID-19]. Practical medicine 2024; 22(2): 90–95. (In Russ.). doi: 10.32000/2072-1757-2024-2-90-95
  5. Жукова Э.В., Никитина Г.Ю., Ноздрачева А.В., Орлова О.А., Готвянская Т.П., Бурова А.А. и др. Мультидисциплинарный подход к оценке рисков возникновения инфекций, связанных с оказанием медицинской помощи, в контексте пандемии COVID-19. Эпидемиол. инфекц. болезни. Актуал. вопр. 2022; 12(1): 25–34. doi: 10.18565/epidem.2022.12.1.25-34/Zhukova E.V., Nikitina G.Yu., Nozdracheva A.V., Orlova O.A., Gotvyanskaya T.P., Burova A.A., Maziy S.A. [Multidisciplinary approach to assessing the risks of healthcare-associated infections in the context of the COVID-19 pandemic]. Epidemiology and infectious diseases. Current items 2022; 12(1): 25–34. (In Russ.). doi: 10.18565/epidem.2022.12.1.25-34
  6. Стрелкова Д.А., Рачина С.А., Кулешов В.Г., Бурмистрова Е.Н., Сычев И.Н., Ананичева Н.А. и др. Микробиологический мониторинг пациентов с COVID- 19 в ОРИТ: проспективное наблюдательное исследование. Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия 2022; 24(3): 274–282. doi: 10.36488/cmac.2022.3.274282/Strelkova D.A., Rachina S.A., Kuleshov V.G., Burmistrova E.N., Sychev I.N., Ananicheva N.A. et al. [Microbiological monitoring of COVID-19 patients in the ICU: a prospective observational study]. Clinical Microbiology and Antimicrobial Chemotherapy 2022; 24(3): 274–282. (In Russ.). doi: 10.36488/cmac.2022.3.274282
  7. Малкова О.Г., Машаева О.Г., Собетова Г.В., Орлов А.В., Рахимов Р.Т., Втюрина Г.В. и др. Оценка изменений структуры возбудителей инфекций, связанных с оказанием медицинской помощи, в отделениях реанимации и интенсивной терапии в период пандемии новой коронавирусной инфекции (COVID-19). Уральский медицинский журнал 2023; 22(6): 31–42. doi: 10.52420/2071-5943-2023-22-6-31-42/Malkova O.G., Mashaeva O.G., Sobetova G.V., Orlov A.V., Rakhimov R.T., Vtyurina G.V. et al. [Assessing changes in the pattern of healthcare-associated infectious agents in intensive care units during a novel coronavirus infection pandemic (COVID-19)]. Ural Medical Journal 2023; 22(6): 31–42. (In Russ.). doi: 10.52420/2071-5943-2023-22-6-31-42
  8. Langford B.J., So M., Raybardhan S., Leung V., Soucy J.-P. R., Westwood D. et al. Antibiotic prescribing in patients with COVID-19: rapid review and meta-analysis. Clin. Microbiol. Infect. 2021; 24(4): 520–531. doi: 10.1016/j.cmi.2020.12.018
  9. Du Y., Tu L., Zhu P., Mi M., Wang R., Yang P. et al. Clinical features of 85 fatal cases of COVID-19 from Wuhan: a retrospective observational study. Am. J. Respir. Crit. Care Med. 2020; 201(11): 1372–1379. doi: 10.1164/rccm.202003-0543OC
  10. Rothe K., Feihl S., Schneider J., Wallnöfer F., Wurst M., Lukas M. et al. Rates of bacterial co-infections and antimicrobial use in COVID-19 patients: a retrospective cohort study in light of antibiotic stewardship. Eur. J. Clin. Microbiol. Infect. Dis. 2021; 40(4): 859–869. doi: 10.1007/s10096-020-04063-8
  11. WHO. Clinical Management of COVID-19. 2021. https:// www.who.int/publications/i/item/WHO-2019-nCoV-clinical-2021-1
  12. Calderón-Parra J., Muiño-Miguez A., Bendala-Estrada A.D. Inappropriate antibiotic use in the COVID-19 era: Factors associated with inappropriate prescribing and secondary complications. Analysis of the registry SEMI-COVID. PLoS One 2021; 16(5): e0251340. doi: 10.1371/journal.pone.0251340
  13. Lansbury L., Lim B., Baskaran V., Lim W.S. Co-infections in people with COVID-19: a systematic review and meta-analysis. J. Infect. 2020; 81(2): 266–275. doi: 10.1016/j.jinf.2020.05.046
  14. Langford B.J., So M., Raybardhan S., Leung V., Westwood D., MacFadden D.R. et al. Bacterial co-infection and secondary infection in patients with COVID-19: a living rapid review and meta-analysis. Clin. Microbiol. Infect. 2020; 26(12): 1622–1629. doi: 10.1016/j.cmi.2020.07.016
  15. Garcia-Vidal С., Sanjuan G., Moreno-García E., Puerta-Alcalde P., Garcia-Pouton N., Chumbitaet M. et al. Incidence of co-infections and superinfections in hospitalized patients with COVID-19: a retrospective cohort study. Clin. Microbiol. Infect. 2021; 27(1): 83–88. doi: 10.1016/j.cmi.2020.07.041
  16. WHO. Global action plan on antimicrobial resistance. 2015. https://iris.who.int/bitstream/handle/10665/193736/9789241509763_eng.pdf?sequence=1
  17. Dudoignon E., Caméléna F., Deniau B., Habay A., Coutrot M., Ressaire Q. et al. Bacterial pneumonia in COVID-19 critically ill patients: a case series. Clin. Infect. Dis. 2020; 72(5): 905–906. doi: 10.1093/cid/ciaa762
  18. Manohar P., Loh B., Nachimuthu R., Hua X., Welburn S.C., Leptihn S. Secondary bacterial infections in patients with viral pneumonia. Front. Med. (Lausanne). 2020; (7): 420. doi: 10.3389/fmed.2020.00420
  19. Hughes S., Troise O., Donaldson H., Mughal N., Moore L.S.P. Bacterial and fungal coinfection among hospitalized patients with COVID-19: a retrospective cohort study in a UK secondary-care setting. Clin. Microbiol. Infect. 2020; 26(10): 1395–1399. doi: 10.1016/j.cmi.2020.06.025
  20. Søvik S., BarrattDue A., Kåsine T., Olasveengen T., Strand M.W., Tveita A.A. et al. Corticosteroids and superinfections in COVID-19 patients on invasive mechanical ventilation. J. Infect. 2022; 85(1): 57–63. doi: 10.1016/j.jinf.2022.05.015
  21. Blonz G., Kouatchet A., Chudeau N., Pontis E., Lorber J., Lemeur A. Epidemiology and microbiology of ventilatorassociated pneumonia in COVID-19 patients: a multicenter retrospective study in 188 patients in an un inundated French region. Crit. Care 2021; 25(1): 72. doi: 10.1186/S1305402103493-W
  22. Shappell C.N., Klompas M., Kanjilal S., Chan Ch., Rhee Ch. Prevalence, clinical characteristics, and outcomes of sepsis caused by severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 versus other pathogens in hospitalized patients with COVID- 19. Crit. Care Explor. 2022; 4(5): e0703. doi: 10.1097/CCE.0000000000000703
  23. Полищук И.С., Алешукина А.В., Донцов Д.В., Маркова К.Г., Березинская И.С., Твердохлебова Т.И. Анализ микробного профиля мокроты и содержания в ней цитокинов ИЛ-4, ИЛ-6, ИЛ-10, ИФН-γ у больных внебольничной пневмонией в период пандемии COVID-19. Эпидемиол. инфекц. болезни. Актуал. вопр. 2024; 14(1): 43–48. doi: 10.18565/epidem.2024.14.1.43-8/Polishchuk I.S., Aleshukina A.V., Dontsov D.V., Markova K.G., Berezinskaya I.S., Tverdokhlebova T.I. [Analysis of the microbial profile of sputum and the IL-4, IL-6, IL-10, IFN-γ cytokine levels in patients with community-acquired pneumonia during the COVID-19]. Epidemiology and infectious diseases. Current items 2024; 14(1): 43–48. (In Russ.). doi: 10.18565/epidem.2024.14.1.43-8
  24. Gangneux J.P., Dannaoui E., Fekkar A., Luyt C.E., Botterel F., De Prost N. et al. Fungal infections in mechanically ventilated patients with COVID19 during the first wave: the French multicentre MYCOVID study. Lancet Respir. Med. 2022; 10(2): 180–190. doi: 10.1016/S22132600(21)00442-2
  25. Катаева Л.В., Вакарина А.А., Степанова Т.Ф., Степанова К.Б. Микробиота нижних дыхательных путей при внебольничных пневмониях, в том числе ассоциированных c SARS-CoV-2. Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии 2021; 98(5): 528–537. doi: 10.36233/0372-9311-10739/Kataeva L.V., Vakarina A.A., Stepanova T.F., Stepanova K.B. [Microbiota of the lower respiratory tract in community-acquired pneumonia, including cases associated with SARS-CoV-2]. Journal of Microbiology, Epidemiology and Immunobiology 2021; 98(5): 528–537. (In Russ.). doi: 10.36233/0372-9311-10739
  26. Матиевская Н.В., Волосач О.С., Кузьмич И.А. Синегнойная инфекция у пациентов стационаров различного профиля: клинические и микробиологические аспекты. Эпидемиол. инфекц. болезни. Актуал. вопр. 2022; 12(1): 87–92. doi: 10.18565/epidem.2022.12.1.87-92/Matievskaya N.V., Volosach O.S., Kuzmich I.A. [Pseudomonas aeruginosa infection in inpatients of different profiles: clinical and microbiological aspects]. Еpidemiology and infectious diseases. Current items 2022; 12(1): 87–92. (In Russ.). doi: 10.18565/epidem.2022.12.1.87-92
  27. Попова А.Ю., Ежлова Е.Б., Демина Ю.В., Носков А.К., Ковалев Е.В., Чемисова О.С. и др. Особенности этиологии внебольничных пневмоний, ассоциированных с COVID-19. Проблемы особо опасных инфекций 2020; (4): 99–105. doi: 10.21055/0370-1069-2020-4-99-10541/Popova A.Yu., Ezhlova E.B., Demina Yu.V., Noskov A.K., Kovalev E.V., Chemisova O.S. et al. [Features of Etiology of Community-Acquired Pneumonia Associated with COVID-19]. Problems of Particularly Dangerous Infections 2020; (4): 99–105. (In Russ.). doi: 10.21055/0370-1069-2020-4-99-10541
  28. Moreno-García E., Puerta-Alcalde P., Letona L., Meira F., Dueñas G., Chumbita M. et al. COVID-19-researcher group. Bacterial co-infection at hospital admission in patients with COVID-19. Int. J. Infect. Dis. 2022; 118: 197–202. doi: 10.1016/j.ijid.2022.03.003

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML
Скачать
2. Рис. 1. Динамика выделения основных микроорганизмов из нижних дыхательных путей Здесь и на рис. 2 через дробь указаны число положительных результатов исследования и число проведенных исследований.

Скачать (22KB)
Метаданные
3. Рис. 2. Динамика выделения основных микроорганизмов из мочи

Скачать (21KB)
Метаданные

© ООО «Бионика Медиа», 2025