Характеристика штаммов Brucella melitensis, изолированных в разных регионах Российской Федерации
- Авторы: Сердюк Н.С.1, Жилченко Е.Б.1, Кузнецова И.В.1, Жаринова Н.В.1, Ковалев Д.А.1, Шапаков Н.А.1, Хачатурова А.А.1, Белозерова О.Н.1, Карапетян М.Г.1
-
Учреждения:
- Ставропольский противочумный институт Роспотребнадзора
- Выпуск: Том 14, № 4 (2024)
- Страницы: 70-76
- Раздел: Оригинальные исследования
- URL: https://journals.eco-vector.com/2226-6976/article/view/646591
- DOI: https://doi.org/10.18565/epidem.2024.14.4.70-6
- ID: 646591
Цитировать
Полный текст
Открытый доступ
Доступ предоставлен
Доступ платный или только для подписчиков
Аннотация
Цель исследования. Изучение фенотипических и молекулярно-генетических свойств штаммов B. melitensis, выделенных на неблагополучных по бруцеллезу территориях Российской Федерации с 1949 по 2019 г.
Материалы и методы. Использовали 74 штамма возбудителя бруцеллеза из коллекции Ставропольского противочумного института Роспотребнадзора и 3 референсных штамма (63/9, 16М и 706) из базы данных MLVA http://microbesgenotyping.i2bc.paris-saclay.fr/databases.
Результаты. Изученные штаммы B. melitensis отличались значительным разнообразием по 14 VNTR-локусам. Выявлено, что штаммы B. melitensis разделились на два крупных кластера. Один кластер образован штаммами, циркулирующими в азиатской части России, а второй кластер представлен штаммами из Европейской части России – Северо-Кавказского и Южного федеральных округов.
Заключение. Полученные данные используются для постоянного молекулярно-генетического мониторинга возбудителя бруцеллеза на неблагополучных по бруцеллезу территориях России, в том числе в качестве эффективного инструмента ретроспективного эпидемиологического анализа, что позволит качественно улучшить эпидемиологический надзор за этой инфекцией. Использование комплексных данных как фенотипического, так и генетического характера позволяет расширять возможности дифференциации штаммов во время расследования вспышек бруцеллеза в будущем.
Полный текст
Об авторах
Наталия Сергеевна Сердюк
Ставропольский противочумный институт Роспотребнадзора
Автор, ответственный за переписку.
Email: nata.serdyuk.83@mail.ru
ORCID iD: 0000-0001-5350-0111
к.б.н., старший научный сотрудник лаборатории «Коллекция патогенных микроорганизмов»
Россия, СтавропольЕлена Борисовна Жилченко
Ставропольский противочумный институт Роспотребнадзора
Email: stavnipchi@mail.ru
ORCID iD: 0000-0001-7180-1292
к.б.н., заведующая лабораторией «Коллекция патогенных микроорганизмов»
Россия, СтавропольИрина Владимировна Кузнецова
Ставропольский противочумный институт Роспотребнадзора
Email: stavnipchi@mail.ru
ORCID iD: 0000-0001-9513-0761
к.м.н., старший научный сотрудник лаборатории биохимии
Россия, СтавропольНина Вадимовна Жаринова
Ставропольский противочумный институт Роспотребнадзора
Email: stavnipchi@mail.ru
ORCID iD: 0000-0001-6718-4877
к.б.н, старший научный сотрудник лаборатории «Коллекция патогенных микроорганизмов»
Россия, СтавропольДмитрий Анатольевич Ковалев
Ставропольский противочумный институт Роспотребнадзора
Email: stavnipchi@mail.ru
ORCID iD: 0000-0002-9366-5647
к.х.н, заведующий лабораторией. Биохимии
Россия, СтавропольНиколай Андреевич Шапаков
Ставропольский противочумный институт Роспотребнадзора
Email: stavnipchi@mail.ru
ORCID iD: 0000-0001-9152-4026
младший научный сотрудник лаборатории биохимии
Россия, СтавропольАнна Андреевна Хачатурова
Ставропольский противочумный институт Роспотребнадзора
Email: stavnipchi@mail.ru
ORCID iD: 0000-0002-7459-7204
научный сотрудник лаборатории бруцеллеза
Россия, СтавропольОльга Николаевна Белозерова
Ставропольский противочумный институт Роспотребнадзора
Email: stavnipchi@mail.ru
ORCID iD: 0009-0002-5570-557X
младший научный сотрудник лаборатории «Коллекция патогенных микроорганизмов»
Россия, СтавропольМаня Григоревна Карапетян
Ставропольский противочумный институт Роспотребнадзора
Email: stavnipchi@mail.ru
ORCID iD: 0009-0005-3006-5504
младший научный сотрудник лаборатории «Коллекция патогенных микроорганизмов»
Россия, СтавропольСписок литературы
- Пономаренко Д.Г., Скударева О.Н., Хачатурова А.А., Германова А.Н., Лукашевич Д.Е., Логвиненко О.В. и др. Об эпизоотолого-эпидемилогической ситуации по бруцеллезу в мире в 2011–2020 гг. и прогноз на 2021 г. в Российской Федерации. Проблемы особо опасных инфекций 2021; (2): 41–51. doi: 10.21055/0370-1069-2021-2-41-51 / Ponomarenko D.G., Skudareva O.N., Khachaturova A.A., Germanova A.N., Lukashevich D.E., Logvinenko O.V. et al. [Epizootiological and Epidemiological Situation on Brucellosis around the World in 2011–2020 and Forecast for the Russian Federation for 2021]. Problems of Particularly Dangerous Infections 2021; (2): 41–51. (In Russ.). doi: 10.21055/0370-1069-2021-2-41-51
- Щипилева И.А., Марковская Е.И., Кретенчук О.Ф. Антибиотикотерапия бруцеллеза. Современное состояние и перспективы совершенствования. Антибиотики и химиотерапия 2022; 67(3–4): 77–84. doi: 10.37489/0235-2990-2022-67-3-4-77-84 / Shchipileva I.A., Markovskaya E.I., Kretenchuk O.F. [Antibiotic Therapy of Brucellosis. Current State and Prospects for Improvement]. Antibiotics and Сhemotherapy 2022; 67(3–4): 77–84. (In Russ.). doi: 10.37489/0235-2990-2022-67-3-4-77-84
- Пономаренко Д.Г., Русанова Д.В., Бердникова Т.В., Хачатурова А.А., Манин Е.А., Куличенко А.Н. Обзор эпизоотологической и эпидемиологической ситуации по бруцеллезу в Российской Федерации в 2017 г. и прогноз на 2018 г. Проблемы особо опасных инфекций 2018; (2): 23–9. doi: 10.21055/0370-1069-2018-2-23-29 / Ponomarenko D.G., Rusanova D.V., Berdnikova T.V., Khachaturova A.A., Manin E.A., Kulichenko A.N. [Review of the Epizootological and Epidemiological Situation of Brucellosis in the Russian Federation in 2017 and Forecast for 2018]. Problems of Especially Dangerous Infections 2018; (2): 23–9. (In Russ.). doi: 10.21055/0370-1069-2018-2-23-29
- Johansen T.B., Lonneke S., Jensen V.K. Whole-genome sequencing and antimicrobial resistance in Brucella melitensis from a Norwegion perspective. Sci. Rep. 2018; (8): 8538. doi: 10.1038/s41598-018-26906-3
- Пономаренко Д.Г., Русанова Д.В., Хачатурова А.А., Скударева О.Н., Логвиненко О.В., Ракитина Е.Л. и др. Анализ эпидемической и эпизоотической ситуации по бруцеллезу в мире в 2019 г. и прогноз на 2020 г. в Российской Федерации. Проблемы особо опасных инфекций 2020; (2): 48–56. doi: 10.21055/0370-1069-2020-2-48-56 / Ponomarenko D.G., Rusanova D.V., Khachaturova A.A., Skudareva O.N., Logvinenko O.V., Rakitina E.L. et al. [Analysis of the Epidemic and Epizootic Situation of Brucellosis in the World in 2019 and Forecast for 2020 in the Russian Federation]. Problems of Especially Dangerous Infections 2020; (2): 48–56. (In Russ.). doi: 10.21055/0370-1069-2020-2-48-56
- Зульпукарова Н.М., Мамаев И.А., Магомедалиева С.Г., Адилова М.А., Исаева Р.Х, Джаватханова М.И. Эпидемические и клинические особенности некоторых природно-очаговых инфекционных заболеваний в Республике Дагестан. Вестник новых медицинских технологий 2018; (4): 77–82. doi: 10.24411/2075-4094-2018-16095 / Zulpukarova N.M., Mamaev I.A., Magomedalieva S.G., Adilova M.A., Isaeva R.Kh., Dzhavatkhanova M.I. [Epidemic and Clinical Features of Some Natural Focal Infectious Diseases in the Republic of Dagestan]. Bulletin of New Medical Technologies 2018; (4): 77–82. (In Russ.). doi: 10.24411/2075-4094-2018-16095
- Намруева Л.В., Иванов Н.П. Тренды, проблемы и перспективы развития животноводства на юге России. Вестник ВолгГУ. Региональная экономика. 2018; (1): 55–63. doi: 10.15688/jvolsu3.2018.1.6 / Namrueva L.V., Ivanov N.P. [Trends, problems and prospects for the development of animal husbandry in the south of Russia]. Journal of Volgograd State University. Economics 2018; (1): 55–63. (In Russ.). doi: 10.15688/jvolsu3.2018.1.6
- Хачатурова А.А., Пономаренко Д.Г., Ковалев Д.А., Германова А.Н., Лукашевич Д.Е., Русанова Д.В. и др. Анализ заболеваемости людей бруцеллезом и молекулярно-биологическая характеристика изолятов Brucella melitensis на длительно неблагополучных по бруцеллезу территориях юга европейской части России. Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунологии 2022; 99(1): 63–74. doi: 10.36233/0372-9311-185 / Khachaturova A.A., Ponomarenko D.G., Kovalev D.A., Germanova A.N., Lukashevich D.E., Rusanova D.V. et al. [Analysis of human brucellosis incidence and molecular biological characteristics of Brucella melitensis isolates in long-term brucellosis-unfavorable territories of the southern European part of Russia]. Journal of Microbiology, Epidemiology and Immunology 2022; 99(1): 63–74. (In Russ.). doi: 10.36233/0372-9311-185
- Suarez-Esquivel M., Chaves-Olarte E., Moreno E., Guzman-Verri C. Brucella Genomics: Macro and Micro Evolution. Int. J. Mol. Sci. 2020; 21(20): 7749–57. doi: 10.3390/ijms21207749
- Prakash J., Jacob J., Rachel T., Vasudevan K. Genomic analysis of Brucella melitensis reveals new insights into phylogeny and evolutionary divergence. Indian J Med Microbiol. 2023; 44: 100360. doi: 10.1016/j.ijmmb.2023.02.003
- Кузнецова И.В., Ковалев Д.А., Евченко Ю.М., Шакирова Л.И., Швецова Н.М., Пономаренко Д.Г. и др. Изучение генетического разнообразия штаммов бруцелл, выделенных в Северо-Кавказском Федеральном округе. Проблемы особо опасных инфекций 2017; (3): 58–62. doi: 10.21055/0370-1069-2017-3-58-62 / Kuznetsova I.V., Kovalev D.A., Evchenko Yu.M., Shakirova L.I., Shvetsova N.M., Ponomarenko D.G. et al. [Study of genetic diversity of Brucella strains isolated in the North Caucasian Federal District. Problems of Especially Dangerous Infections 2017; (3): 58–62. (In Russ.). doi: 10.21055/0370-1069-2017-3-58-62
- Le Flèche P., Jacques I., Grayon M., Al Dahouk S., Bouchon P., Denoeud F. et al. Evaluation and selection of tandem repeat loci for a Brucella MLVA typing assay. BMC Microbiol. 2006; 6: 9. doi: 10.1186/1471-2180-6-9
- Ma J.Y., Wang H., Zhang X.F., Xu L.Q., Hu G.Y., Jiang H. et al. MLVA and MLST typing of Brucella from Qinghai, China. Infect. Dis. Poverty 2016; (5): 26–37. doi: 10.1186/s40249-016-0123-z
- Pisarenko S.V., Kovalev D.A., Volynkina A.S., Ponomarenko D.G., Rusanova D.V., Zharinova N.V. et al. Global evolution and phylogeography of Brucella melitensis strains. BMC Genomics 2018; (19): 353–62. doi: 10.1186/s12864-018-4762-2
Дополнительные файлы
