РАЗРАБОТКА ДИАГНОСТИЧЕСКОЙ СИСТЕМЫ В ФОРМАТЕ ОТ-ПЦР В РЕАЛЬНОМ ВРЕМЕНИ ДЛЯ ВЫЯВЛЕНИЯ РНК ВИРУСА ЭБОЛА ЗАИР


Цитировать

Полный текст

Открытый доступ Открытый доступ
Доступ закрыт Доступ предоставлен
Доступ закрыт Доступ платный или только для подписчиков

Аннотация

В феврале 2014 г. на территории Республики Гвинея возникла вспышка лихорадки Эбола, распространившаяся затем на ряд соседних стран с общим количеством населения около 25 млн человек. Для предотвращения распространения этого опасного заболевания на территорию Российской Федерации разработана диагностическая система в формате ОТ-ПЦР в реальном времени для выявления РНК вируса Эбола Заир в биологических образцах. Аналитическая чувствительность системы составила 1-2 x 10 3 ГЭ/мл. Высокая специфичность системы показана на репрезентативной выборке генетического материала вирусного и бактериального происхождения, а также на образцах от клинически здоровых людей.

Полный текст

Доступ закрыт

Об авторах

Владимир Георгиевич Дедков

Центральный НИИ эпидемиологии Роспотребнадзора; НИИ медицины труда РАН

Email: vgdedkov@mail.ru
мл. науч. сотр. 111123, Москва, ул. Новогиреевская, д. 3а

Марина Викторовна Сафонова

Центральный НИИ эпидемиологии Роспотребнадзора

Email: marina-iris@mail.ru
мл. науч. сотр. Москва

Андрей Андреевич Девяткин

Центральный НИИ эпидемиологии Роспотребнадзора; НИИ медицины труда РАН

Email: andreideviatkin@gmail.com
мл. науч. сотр. Москва

Анна Сергеевна Долгова

Центральный НИИ эпидемиологии Роспотребнадзора

Email: annadolgova@inbox.ru
мл. науч. сотр. Москва

Олег Викторович Пьянков

Государственный научный центр вирусологии и биотехнологии «Вектор»

Email: pyankov@vector.nsc.ru
канд. биол. наук, зав. лаб. коллекции вирусов 1-й группы патогенности Новосибирск

Артемий Александрович Сергеев

Государственный научный центр вирусологии и биотехнологии «Вектор»

Email: artsergeev@mail.ru
канд. мед. наук, зав. лаб. оспы Новосибирск

Александр Петрович Агафонов

Государственный научный центр вирусологии и биотехнологии «Вектор»

Email: gafonov@vector.nsc.ru
д-р биол. наук, зам. генерального дир. по научной работе Новосибирск

Виктор Васильевич Малеев

Центральный НИИ эпидемиологии Роспотребнадзора

Email: maleyev@pcr.ru
акад. РАН, д-р мед. наук, проф., зам. дир. по научной работе Москва

Герман Александрович Шипулин

Центральный НИИ эпидемиологии Роспотребнадзора

Email: german@pcr.ru
канд. мед. наук, руководитель отд. молекулярной диагностики и эпидемиологии Москва

Список литературы

  1. King M.Q., A.J. Michael, Carstens B.E., Lefkowitz J.E. Virus Taxonomy, Classification and Nomenclature of Viruses. Ninth Report of the International Committee on Taxonomy of Viruses, 2012.
  2. Lefebvre A., Fiet C., Belpois-Duchamp C., Tiv M., Astruc K., Aho Glélé L.S. Case fatality rates of Ebola virus diseases: A meta-analysis of World Health Organization data. Med. Mal. Infect. 2014.
  3. Платонов А.Е., Платонова О.В., Малеев В.В. Эбола, 2014 г. Эпидемиологические и социальные аспекты. Эпидемиол. инфекц. болезни. Актуал. вопр. 2014; 5: 34-49.
  4. Kuhn H.J., Dodd E.L., Wahl-Jensen V., Radoshitzky R.S., Bavari S., Jahrling B.P. Evaluation of Perceived Threat Differences Posed by Filovirus Variants. Biosec. Bioterr. 2011, 9(4): 361-371.
  5. Ebola hemorrhagic fever in Zaire, 1976. Bull. World Health Organ. 1978; 56: 271-293.
  6. Baron R.C., McCormick J.B., Zubeir O.A. Ebola virus disease in southern Sudan: hospital dissemination and intrafamilial spread. Bull. World Health Organ. 1983; 61(6): 997-1003.
  7. Okware S.I., Omaswa F.G., Zaramba S., Opio A., Lutwama J.J., Kamugisha J., Rwaguma E.B., Kagwa P., Lamunu M. An outbreak of Ebola in Uganda. Trop. Med. Int. Health 2002; 7(12): 1068-1075.
  8. http://www.cdc.gov/vhf/ebola/outbreaks/2014-west-africa/index.html
  9. http://www.who.int/csr/disease/ebola/situation-reports
  10. Maganga D.G., Kapetshi J., Berthet N., Kebela Ilunga B., Kabange F., Mbala Kingebeni P., Mondonge V., Muyembe J.J., Bertherat E., Briand S., Cabore J., Epelboin A., Formenty P., Kobinger G., Gonzâlez-Angulo L., Labouba I., Manuguerra J.C., Okwo-Bele J.M., Dye C., Leroy E.M. Ebola Virus Disease in the Democratic Republic of Congo. N. Engl. J. Med. 2014; 371(22): 2083-2091.
  11. Gire K. S., Goba A., Andersen G.K., Sealfon R.S., Park D.J., Kanneh L., Jalloh S., Momoh M., Fullah M., Dudas G., Wohl S., Moses L.M., Yozwiak N.L., Winnicki S., Matranga C.B., Malboeuf C.M., Qu J., Gladden A.D., Schaffner S.F., Yang X., Jiang P.P., Nekoui M., Colubri A., Coomber M.R., Fonnie M., Moigboi A., Gbakie M., Kamara F.K., Tucker V., Konuwa E., Saffa S., Sellu J., Jalloh A.A., Kovoma A., Koninga J., Mustapha I., Kargbo K., Foday M., Yillah M., Kanneh F., Robert W., Massally J.L., Chapman S.B., Bochicchio J., Murphy C., Nusbaum C., Young S., Birren B.W., Grant D.S., Scheiffelin J.S., Lander E.S., Happi C., Gevao S.M., Gnirke A, Rambaut A., Garry R.F., Khan S.H., Sabeti P.C. Genomic surveillance elucidates Ebola virus origin and transmission during the 2014 outbreak. Science 2014; 345(6202): 1369-1372.
  12. Tyagi S., Kramer F.R. Molecular beacons: probes that fluoresce upon hybridization. Nat. Biotechnol. 1996; 14(3): 303-308.
  13. Van Pelt-Verkuil E., van Belkum A., Hays J.P. Principles and Technical Aspects of PCR Amplification. New York: Springer, 2008.
  14. Yuryev A., ed. PCR Primer Design. New Jersey, Totowa: Humana Press Inc., 2007.
  15. http://www.basic.northwestern.edu/biotools/OligoCalc. html
  16. http://mfold.rna.albany.edu
  17. Maniatis T., Fritsch E. E., Sambrook J. Molecular Cloning, A laboratory Manual. Cold Spring Harbor Laboratory, 2003.
  18. Cheng Y., Niu J., Zhang Y., Huang J., Li Q. Preparation of His-Tagged Armored RNA Phage Particles as a Control of Serve Acute Respiratory Syndrome Coronavirus. J. Clin. Microb. 2006; 44(10): 3557-3561.

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML

© ООО «Бионика Медиа», 2015

Данный сайт использует cookie-файлы

Продолжая использовать наш сайт, вы даете согласие на обработку файлов cookie, которые обеспечивают правильную работу сайта.

О куки-файлах