ГЕНЕТИЧЕСКАЯ ХАРАКТЕРИСТИКА ВИЧ-1 У ПАЦИЕНТОВ С ОПЫТОМ ВИРУСОЛОГИЧЕСКОЙ НЕУДАЧИ ТЕРАПИИ В КИРГИЗСКОЙ РЕСПУБЛИКЕ В 2017-2018 гг


Цитировать

Полный текст

Открытый доступ Открытый доступ
Доступ закрыт Доступ предоставлен
Доступ закрыт Доступ платный или только для подписчиков

Аннотация

Цель исследования. Молекулярно-генетический анализ вариантов ВИЧ-1, циркулировавших в Киргизии в 2017-2018 гг. среди пациентов с неудачным опытом антиретровирусной терапии. Материалы и методы. Была собрана коллекция образцов плазмы крови (n =100), исследованы нуклеотидные последовательности гена pol ВИЧ-1, определены субтиповая принадлежность вируса в образцах, структура и уровень лекарственной устойчивости ВИЧ-1. Результаты. Установлено доминирование в Киргизии рекомбинантного варианта ВИЧ-1 CRF63 02A1 (в 56% образцов), и суб-субтипа A6 (в 41% образцов). В то же время выявлены случаи инфицирования редкой генетической формой ВИЧ-1, близкой к CRF94_cpx и CRF95 02B, и высокая частота мутаций устойчивости к препаратам, входящим в основные применяемые в стране схемы терапии: к EFVи NVP (в 48 и 50% образцов соответственно) и к FTC и 3TC (в 39% образцов). Заключение. Выявленная высокая частота лекарственной устойчивости к препаратам, составляющим основные схемы АРТ, у пациентов с высокой приверженностью лечению говорит о необходимости дальнейшего мониторинга лекарственной устойчивости в стране, в том числе среди пациентов без опыта терапии и только приступающих к ней.

Полный текст

Доступ закрыт

Об авторах

Илья Андреевич ЛАПОВОК

ФБУН «Центральный НИИ эпидемиологии» Роспотребнадзора

Email: i_lapovok@mail.ru
к.б.н., старший научный сотрудник Москва, Россия

Дарья Владиславовна САЛЕЕВА

ФБУН «Центральный НИИ эпидемиологии» Роспотребнадзора

Email: dasha_saleeva@inbox.ru
лаборант-исследователь Москва, Россия

Алексей Эдуардович ЛОПАТУХИН

ФБУН «Центральный НИИ эпидемиологии» Роспотребнадзора

Email: a.lopatukhin@gmail.com
научный сотрудник Москва, Россия

Алина Алексеевна КИРИЧЕНКО

ФБУН «Центральный НИИ эпидемиологии» Роспотребнадзора

Email: kotova-kirichenko@mail.ru
научный сотрудник Москва, Россия

Анастасия Вениаминовна МУРЗАКОВА

ФБУН «Центральный НИИ эпидемиологии» Роспотребнадзора

Email: murzakova_a.v@mail.ru
научный сотрудник Москва, Россия

Айбек Абдылдаевич БЕКБОЛОТОВ

Республиканский Центр СПИД Министерства здравоохранения Киргизской Республики

Email: aibek_0001@mail.ru
заместитель директора Бишкек, Киргизия

Баариниса Мусуратиллаевна ИСКАНОВА

Республиканский Центр СПИД Министерства здравоохранения Киргизской Республики

Email: i.barnisa@hotmail.com
врач-лаборант Бишкек, Киргизия

Эльмира Балтабаевна НАРМАТОВА

Ошский областной Центр профилактики и борьбы со СПИДом Министерства здравоохранения Киргизской Республики

Email: narmatova@yandex.ru
главный врач Ош, Киргизия

Жылдыз Кыдыргычевна АКМАТОВА

Республиканский Центр СПИД Министерства здравоохранения Киргизской Республики

Email: zhyldyz_akmatova@mail.ru
врач-эпидемиолог Бишкек, Киргизия

Назгуль Асыбалиевна АСЫБАЛИЕВА

Республиканский Центр СПИД Министерства здравоохранения Киргизской Республики

Email: nazgul-asybaliev@mail.ru
врач-эпидемиолог Бишкек, Киргизия

Дмитрий Евгеньевич КИРЕЕВ

ФБУН «Центральный НИИ эпидемиологии» Роспотребнадзора

Email: dmitkireev@yandex.ru
к.б.н., научный сотрудник Москва, Россия

Список литературы

  1. UNAIDS. Country factsheets. Kyrgyzstan. 2018. https://www. unaids.org/ru/regionscountries/countries/kyrgyzstan
  2. Laga V., Lapovok I., Kazennova E., Ismailova A., Beisheeva N., Asybalieva N. et al. The Genetic Variability of HIV-1 in Kyrgyzstan: The Spread of CRF02_AG and Subtype A1 Recombinants. J. HIV AIDS 2015; 1(2): http://dx.doi. org/10.16966/jha.106
  3. Bobkova M. Current status of HIV-1 diversity and drug resistance monitoring in the former USSR. AIDS Rev. 2013; 15(4): 204-12. PMID: 24192601.
  4. Foley B.T., Leitner T., Paraskevis D., Peeters M. Primate immunodeficiency virus classification and nomenclature: Review. Infect. Genet. Evol. 2016; 46: 150-8. DOI: 10.1016/j. meegid.2016.10.018
  5. Baryshev P., Bogachev V., Gashnikova N. HIV-1 genetic diversity in Russia: CRF63_02A1, a new HIV type 1 genetic variant spreading in Siberia. AIDS Res. Hum. Retroviruses 2014; 30(6): 592-7. doi: 10.1089/AID.2013.0196
  6. Лаповок И.А., Лопатухин А.Э., Киреев Д.Е., Казеннова Е.В., Лебедев А.В., Бобкова М.Р., Коломеец А.Н., Турбина Г.И., Шипулин Г.А., Ладная Н.Н., Покровский В.В. Молекулярно-эпидемиологический анализ вариантов ВИЧ-1, циркулировавших в России в 1987-2015 гг. Тер. архив 2017; 89(11): 44-9. doi: 10.17116/terarkh2017891144-49.
  7. Kostaki E.G., Karamitros T., Bobkova M., Oikonomopoulou M., Magiorkinis G., Garcia F. et al. Spatiotemporal Characteristics of the HIV-1 CRF02_AG/CRF63_02A1 Epidemic in Russia and Central Asia. AIDS Res. Hum. Retroviruses 2018; 34(5): 415-20. doi: 10.1089/AID.2017.0233
  8. Орузбаева Б.О., ред. Киргизская Советская Социалистическая Республика. Киргизская Советская Энциклопедия, 1982; 29-30.
  9. Lapovok I., Kazennova E., Laga V., Vasilyev A., Utegenova A., Abishev A. et al. Short Communication: Molecular Epidemiology of HIV Type 1 Infection in Kazakhstan: CRF02_AG Prevalence Is Increasing in the Southeastern Provinces. AIDS Res. Hum. Retroviruses 2014; 30(8): 769-74. doi: 10.1089/AID.2013.0291
  10. Хомколова В.В., Тотменин А.В., Астахова Е.М., Бекболотов А.А., Кадырбеков У.К., Гашникова Н.М. Исследование генетических вариантов ВИЧ-1, распространяющихся среди жителей Джалал-Абадской и Чуйской областей Республики Кыргызстан. Материалы Международной научно-практической конференции «Актуальные вопросы ВИЧ-инфекции». СПБ., 2019; 388-9.
  11. 90-90-90 An ambitious treatment target to help end the AIDS epidemio. UNAIDS/JC2684 (English original, October 2014). https://www.unaids.org/sites/default/files/media_asset/90-90-90_en_0.pdf
  12. HIV drug resistance report 2019. World Health Organization. https://apps.who.int/iris/handle/10665/325891
  13. REGA HIV-1 Subtyping Tool. Version 3.0. http: //dbpartners. stanford.edu:8080/RegaSubtyping/stanford-hiv/typingtool/
  14. COMET HIV-1 v2.2 Subtyping Tool. https://comet.lih.lu.
  15. Tamura K., Stecher G., Peterson D., Filipski A., Kumar S. MEGA6: Molecular Evolutionary Genetics Analysis Version 6.0. Mol. Biol. Evol. 2013; 30(12): 2725-9. doi: 10.1093/molbev/ mst197.
  16. Los Alamos HIV database. https://www.hiv.lanl.gov.
  17. Stanford University HIV Drug Resistance Database. http:// hivdb. stanford. edu
  18. Кулаичев А.П. ред. Методы и средства комплексного статистического анализа данных. Учебное пособие. 5-е изд., перераб. и доп. М.: Инфра-М; 2017: 141-45.
  19. Billings E., Kijak G.H., Sanders-Buell E., Ndembi N., O’Sullivan A.M., Adebajo S. New Subtype B Containing HIV-1 Circulating Recombinant of sub-Saharan Africa Origin in Nigerian Men Who Have Sex with Men. J. Acquir. Immune Defic. Syndr. 2019; 81(5): 578-84. DOI: 10.1097/ QAI.0000000000002076.
  20. Wirden M., De Oliveira F., Bouvier-Alias M., Lambert-Niclot S., Chaix M-L., Raymond S. et al. New HIV-1 Circulating Recombinant Form 94: From Phylogenetic Detection of a Large Transmission Cluster to Prevention in the Age of Geosocial-Networking Apps in France, 2013 to 2017. Euro Surveill. 2019; 24(39): 1800658. doi: 10.2807/1560-7917. ES.2019.24.39.1800658.

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML
Скачать

© ООО «Бионика Медиа», 2020

Данный сайт использует cookie-файлы

Продолжая использовать наш сайт, вы даете согласие на обработку файлов cookie, которые обеспечивают правильную работу сайта.

О куки-файлах