Влияние пандемии COVID-19 на структуру микробиоценоза кишечника
- Авторы: Битюмина Л.А.1, Куликова Н.Г.1, Плоскирева А.А.1, Горелов А.В.1
-
Учреждения:
- Центральный НИИ эпидемиологии Роспотребнадзора
- Выпуск: Том 13, № 2 (2023)
- Страницы: 70-75
- Раздел: Статьи
- URL: https://journals.eco-vector.com/2226-6976/article/view/553924
- DOI: https://doi.org/10.18565/epidem.2023.13.2.70–5
- ID: 553924
Цитировать
Полный текст
Открытый доступ
Доступ предоставлен
Доступ платный или только для подписчиков
Аннотация
Цель исследования. Сравнение эпидемиологических закономерностей распространения нарушений микробиоценоза кишечника среди населения Российской Федерации до и во время пандемии новой коронавирусной инфекции SARS-CoV-2.
Материалы и методы. Проведен ретроспективный анализ результатов обследований на выявление нарушений микробиоценоза кишечника среди 72 798 пациентов в возрасте от 1 до 60 лет в периоды 01.2018–03.2020 и 04.2020–12.2022. Посев клинического материала на питательные среды и учет результатов проводили традиционными микробиологическими методами. Статистический анализ данных проводили с использованием стандартных методов описательной статистики с помощью программы Microsoft Office Excel 2010. Средние значения оценивали с учетом 95% доверительного интервала (95% ДИ) по методу Клоппера–Пирсона.
Результаты. В возрастной группе от 1 года до 60 лет выявлен рост нарушений микробиоценоза кишечника во время пандемии COVID-19 по сравнению с годами до пандемии. В 2018 – начале 2020 г. показатель не превышал 2,4 ± 0,02%, с 04.2020 он вырос до 77,9 ± 0,08%. Пандемия существенно изменила микробиоценоз кишечника в сторону преобладания условно-патогенной (Klebsiella spp., Enterobacter spp., Proteus spp.) и патогенной (Salmonella spp., Shigella spp.) флоры.
Заключение. Показатели микробиоценоза кишечника у пациентов в возрасте от 1 года до 60 лет до пандемии новой коронавирусной инфекции COVID-19 и во время пандемии значительно отличаются: происходит сдвиг в сторону увеличения дисбиоза, вызванного ростом условно-патогенной и патогенной флоры на фоне снижения облигатных симбионтов бифидобактерий, лактобактерий, энтерококков и типичной E. coli. Выявлено деструктивное влияние различных геновариантов вируса SARS-CoV-2 на кишечный микробиоценоз, выражающееся в повреждении филометаболического ядра, что может быть связано как с обширным применением антибиотиков, так и с повреждающим воздействием вируса на кишечник.
Ключевые слова
Полный текст
Об авторах
Люция Айткалиевна Битюмина
Центральный НИИ эпидемиологии Роспотребнадзора
Автор, ответственный за переписку.
Email: bitumina@cmd.su
ORCID iD: 0000-0002-5378-0827
врач-бактериолог направления клинической микробиологии лаборатории клинической микробиологии и микробной экологии человека
Россия, МоскваНина Георгиевна Куликова
Центральный НИИ эпидемиологии Роспотребнадзора
Email: kulikova_ng@cmd.su
ORCID iD: 0000-0002-1716-6969
к.б.н., старший научный сотрудник направления клинической микробиологии лаборатории клинической микробиологии и микробной экологии человека
Россия, МоскваАнтонина Александровна Плоскирева
Центральный НИИ эпидемиологии Роспотребнадзора
Email: antoninna@mail.ru
ORCID iD: 0000-0002-3612-1889
д.м.н., профессор, заместитель директора по клинической работе
Россия, МоскваАлександр Васильевич Горелов
Центральный НИИ эпидемиологии Роспотребнадзора
Email: gorelov@cmd.su
ORCID iD: 0000-0001-9257-0171
д.м.н., академик РАН, профессор, заместитель директора по научной работе
Россия, МоскваСписок литературы
- Yeoh Y.K., Zuo T., Lui G.C., Zhang F., Liu Q., Li A.Y. et al. Gut microbiota composition reflects disease severity and dysfunctional immune responses in patients with COVID-19. Gut 2021; 70(4): 698–706. doi: 10.1136/gutjnl-2020-323020
- Mohapatra R.K., Pintilie L., Kandi V., Sarangi A.K., Das D., Sahu R. et al. The recent challenges of highly contagious COVID-19, causing respiratory infections: Symptoms, diagnosis, transmission, possible vaccines, animal models, and immunotherapy. Chem. Biol. Drug. Des. 2020; 96(5): 1187–208. doi: 10.1111/cbdd.13761
- Umakanthan S., Sahu P., Ranade A.V., Bukelo M.M., Rao J.S., Abrahao-Machado L.F. et al. Origin, transmission, diagnosis and management of coronavirus disease 2019 (COVID-19). Postgrad. Med. J. 2020; 96(1142): 753–8. doi: 10.1136/postgradmedj-2020-138234
- Davis H.E., McCorkell L., Vogel J.M., Topol E.J. Long COVID: major findings, mechanisms and recommendations. Nat. Rev. Microbiol. 2023; 21(3): 133–46. doi: 10.1038/s41579-022-00846-2
- Farsi Y., Tahvildari A., Arbabi M., Vazife F., Sechi L.A., Shahidi Bonjar A.H. et al. Diagnostic, Prognostic, and Therapeutic Roles of Gut Microbiota in COVID-19: A Comprehensive Systematic Review. Front Cell Infect. Microbiol. 2022; (12) : 804644. doi: 10.3389/fcimb.2022.804644
- Куликова Н.Г., Плоскирева А.А., Тронза Т.В., Усенко Д.В., Горелов А.В., Акимкин В.Г. Характеристика микробиоценоза кишечника населения в различных возрастных группах во время эпидемии COVID-19. Инфекционные болезни 2022; (4): 78–83. Kulikova N.G., Ploskireva A.A., Tronza T.W., Usenko D.V., Gorelov A.V., Akimkin V.G. [Characteristics of intestinal microbiocenosis of the population in different age groups in the COVID-19 pandemic]. Infectious Diseases 2022; (4): 78–83. (In Russ.).
- Yamamoto S., Saito M., Tamura A., Prawisuda D., Mizutani T., Yotsuyanagi H. The human microbiome and COVID-19: A systematic review. PLoS One 2021; 16(6): e0253293. doi: 10.1371/journal.pone. 0253293
- Бочков И.А., Юрко Л.П., Шуралева С.А., Юдицкая Н.М., Лавренова Э.С., Плахтий И.В. и др. Особенности микробной экологии толстой кишки у детей до 2 лет. Эпидемиология и инфекционные болезни 2012; (5): 29–33. Bochkov I.A., Yurko L.P., Shuraleva S.A., Yuditskaya N.M., Lavrenova E.S., Plakhtiy I.V. et al. [Features of the microbial ecology of the colon in children under 2 years]. Epidemiology and infectious diseases 2012; (5): 29–33. (In Russ.).
- Zhang F., Lau R.I., Liu Q., Su Q., Chan F.K.L., Ng S.C. Gut microbiota in COVID-19: key microbial changes, potential mechanisms and clinical applications. Nat. Rev. Gastroenterol. Hepatol. 2022: 1–15. doi: 10.1038/s41575-022-00698-4
- Kim S., Covington A., Pamer E.G. The intestinal microbiota: Antibiotics, colonization resistance, and enteric pathogens. Immunol. Rev. 2017; 279(1): 90–105. doi: 10.1111/imr.12563
- Borriello S.P., Honour P. Simplified procedure for the routine isolation of Clostridium difficile from faeces. J. Clin. Pathol. 1981; 34(10): 1124–7. doi: 10.1136/jcp.34.10.1124
- Rachina S., Kozlov R., Kurkova A., Portnyagina U., Palyutin S., Khokhlov A. et al. On Behalf Of Russian Working Group Of The Project. Antimicrobial Dispensing Practice in Community Pharmacies in Russia during the COVID-19 Pandemic. Antibiotics (Basel). 2022; 11(5): 586. doi: 10.3390/antibiotics11050586
- Акимкин В.Г., Попова А.Ю., Хафизов К.Ф., Дубоделов Д.В., Углева С.В., Семененко Т.А. и др. COVID-19: эволюция пандемии в России. Сообщение II: динамика циркуляции геновариантов вируса SARS-CoV-2. Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии 2022; 99(4): 381–96. doi: 10.36233/0372-9311-295. Akimkin V.G., Popova A.Y., Khafizov K.F., Dubodelov D.V., Ugleva S.V., Semenenko T.A. et al. [COVID-19: evolution of the pandemic in Russia. Report II: dynamics of the circulation of SARS-CoV-2 genetic variants]. Journal of microbiology, epidemiology and immunobiology 2022; 99(4): 381–96. (In Russ.). doi: 10.36233/0372-9311-295
- Gang J., Wang H., Xue X., Zhang S. Microbiota and COVID- 19: Long-term and complex influencing factors. Front. Microbiol. 2022;13: 963488. doi: 10.3389/fmicb.2022.963488
- Giannos P., Prokopidis K. Gut dysbiosis and long COVID- 19: Feeling gutted. J. Med. Virol. 2022; 94(7): 2917–8. doi: 10.1002/jmv.2768435233795; PMCID: PMC9088471.
Дополнительные файлы
