The role of pathogens of upper respiratory tract viral infections in the formation of an epidemic rise in morbidity in the season 2022–2023 in Moscow

封面

如何引用文章

全文:

开放存取 开放存取
受限制的访问 ##reader.subscriptionAccessGranted##
受限制的访问 订阅或者付费存取

详细

Objective. Assessment of the dynamics of morbidity and the role of pathogens of influenza, acute respiratory viral infections (ARVI) and herpes in the epidemic season 2022–2023 in Moscow.

Materials and methods. A retrospective epidemiological analysis of the dynamics of morbidity rates was carried out using the federal state statistical observation form No 2 Information on infectious and parasitic diseases» for 2010–2023, data from the weekly national bulletin on influenza and ARVI of the Smorodintsev Influenza Research Institute and N.F. Gamaleya National Research Center for Epidemiology and Microbiology for the epidemic season 2022–2023. Molecular genetic methods were used to etiologically decipher cases of diseases and serological methods (ELISA, RTGA) – to assess the level of specific antibodies (IgG) to current pathogens of acute upper respiratory tract viral infections.

Results. Influenza and ARVI incidence rates during the epidemic season2022–2023 corresponded to the characteristics of the pre-pandemic» period with peak values at the 48–49th week in Moscow and at the 50th week in the Russian Federation. The dominant circulation of influenza viruses A(H1N1)pdm09 (A/Victoria/4897/2022) among Moscow residents was noted due to the large number of non-immune individuals. On the contrary, against the background of high seroprevalence to influenza viruses B line B/Victoria-like and A(H3N2) (A/Darwin/9/2021), there were low number of cases of diseases. Among the pathogens of ARVI, rhinoviruses (35.6% of all findings), as well as metapneumo-, boca-, adenoviruses and parainfluenza viruses 1 prevailed; the circulation of rhinoviruses was most intense at the beginning and end of the epidemic season. It was established that the presence of IgG to SARS-CoV-2 in the examined individuals was a prerequisite for detecting markers of reactivation of chronic infections caused by the Epstein–Barr virus and herpes simplex virus, which indicates the trigger role of COVID-19 in maintaining the epidemic process of herpesvirus infections.

Conclusion. The introduction of mandatory molecular genetic monitoring along with seroprevalence assessment can ensure effective prediction and identification of priority pathogens of acute respiratory tract infections for the upcoming epidemic season.

全文:

受限制的访问

作者简介

Tatiana Semenenko

N.F. Gamaleya National Research Center for Epidemiology and Microbiology

编辑信件的主要联系方式.
Email: semenenko@gamaleya.org
ORCID iD: 0000-0002-6686-9011

Professor, MD, Head, Epidemiology Department

俄罗斯联邦, Moscow

Elena Burtseva

N.F. Gamaleya National Research Center for Epidemiology and Microbiology

Email: elena-burtseva@yandex.ru
ORCID iD: 0000-0003-2518-6801

MD, Head, Laboratory of Etiology and Epidemiology of Influenza

俄罗斯联邦, Moscow

Anna Nozdracheva

N.F. Gamaleya National Research Center for Epidemiology and Microbiology

Email: nozdracheva0506@gmail.com
ORCID iD: 0000-0002-8521-1741

Cand. Med. Sci., Head, Laboratory of Nonspecific Prevention of Infectious Diseases

俄罗斯联邦, Moscow

Tatiana Solomay

Central Research Institute of Epidemiology, Russian Federal Service for Supervision of Consumer Rights Protection and Human Well-Being

Email: solomay@rambler.ru
ORCID iD: 0000-0002-7040-7653

Cand. Med. Sci., Senior Researcher, Laboratory of Infections Associated with the Provision of Medical Care

俄罗斯联邦, Moscow

Svetlana Ugleva

Central Research Institute of Epidemiology, Russian Federal Service for Supervision of Consumer Rights Protection and Human Well-Being

Email: uglevas@bk.ru
ORCID iD: 0000-0002-1322-0155

MD, Head, Scientific and Analytical Department

俄罗斯联邦, Moscow

Tatiana Gotvyanskaya

N.F. Gamaleya National Research Center for Epidemiology and Microbiology

Email: gotvin@gamaleya.org
ORCID iD: 0000-0002-0814-2666

Cand. Biol. Sci., Senior Researcher, Laboratory of Nonspecific Prevention of Infectious Diseases

俄罗斯联邦, Moscow

Evgenia Mukasheva

N.F. Gamaleya National Research Center for Epidemiology and Microbiology

Email: mukasheva_evgeniya@mail.ru
ORCID iD: 0000-0002-5688-5309

Researcher, Laboratory of Etiology and Epidemiology of Influenza

俄罗斯联邦, Moscow

Oleg Latyshev

N.F. Gamaleya National Research Center for Epidemiology and Microbiology

Email: oleglat80@mail.ru
ORCID iD: 0000-0002-5757-3809

Cand. Biol. Sci., Head, Laboratory of Immunology

俄罗斯联邦, Moscow

Elizaveta Vetrova

N.F. Gamaleya National Research Center for Epidemiology and Microbiology

Email: immunol.lab@mail.ru
ORCID iD: 0000-0003-1902-5278

Researcher, Laboratory of Immunology

俄罗斯联邦, Moscow

Natalya Nikitenko

N.F. Gamaleya National Research Center for Epidemiology and Microbiology

Email: nan-nikitenko@yandex.ru
ORCID iD: 0000-0001-5829-744X

Cand. Biol. Sci., Head, Medical Department

俄罗斯联邦, Moscow

Egor Burmistrov

N.F. Gamaleya National Research Center for Epidemiology and Microbiology

Email: chetusha2006@gmail.com
ORCID iD: 0000-0002-6592-8331

Researcher, Laboratory of Cellular Microbiology

俄罗斯联邦, Moscow

Aleksey Tutelyan

Central Research Institute of Epidemiology, Russian Federal Service for Supervision of Consumer Rights Protection and Human Well-Being

Email: bio-tav@yandex.ru
ORCID iD: 0000-0002-2706-6689

Professor, Corresponding Member of Russian Academy of Sciences, MD, Head of the Laboratory of Infections Associated with the Provision of Medical Care

俄罗斯联邦, Moscow

Stanislav Kuzin

Central Research Institute of Epidemiology, Russian Federal Service for Supervision of Consumer Rights Protection and Human Well-Being

Email: drkuzin@list.ru
ORCID iD: 0000-0002-0616-9777

Professor, MD, Head, Laboratory of Viral Hepatitis

俄罗斯联邦, Moscow

Vasily Akimkin

Central Research Institute of Epidemiology, Russian Federal Service for Supervision of Consumer Rights Protection and Human Well-Being

Email: crie@pcr.ru
ORCID iD: 0000-0003-4228-9044

Professor, Academician of Russian Academy of Sciences, MD, Director

俄罗斯联邦, Moscow

参考

  1. WHO. Fact sheets. 3.11.2023. Influenza (Seasonal). www.who.int/news-room/fact-sheets/detail/influenza-(seasonal)
  2. О состоянии санитарно-эпидемиологического благополучия населения в Российской Федерации в 2022 году: Государственный доклад. М.: Федеральная служба по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека, 2023. 368 с. [On the state of sanitary and epidemiological well-being of the population in the Russian Federation in 2022: State report]. Moscow, 2023. 368 p. (In Russ.).
  3. Никифоров В.В., Полибин Р.В., Суранова Т.Г., Полежаева Н.А. Грипп вчера, сегодня и завтра. Итоги мониторинга иммунизации и заболеваемости в эпидемические сезоны 2019–2020, 2020–2021, 2021–2022, 2022–2023 годов. Эпидемиол. и инфекц. бол. 2023; 28(6): 373–6. doi: 10.17816/EID607411 Nikiforov V.V., Polibin R.V., Suranova T.G., Polezhaeva N.A. [Flu yesterday, today and tomorrow. The results of monitoring immunization and morbidity in the epidemic seasons 2019–2020, 2020–2021, 2021–2022, 2022–2023]. Epidemiology and Infectious Diseases 2023; 28(6): 373–86. (In Russ.). doi: 10.17816/EID607411
  4. Акимкин В.Г., Кузин С.Н., Колосовская Е.Н., Кудрявцева Е.Н., Семененко Т.А., Плоскирева А.А. и др. Характеристика эпидемиологической ситуации по COVID-19 в Санкт-Петербурге. Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии 2021; 98(5): 497–511. doi: 10.36233/0372-9311-154 Akimkin V.G., Kuzin S.N., Kolosovskaya E.N., Kudryavtseva E.N., Semenenko T.A., Ploskireva A.A. et al. [Characteristics of the epidemiological situation regarding COVID-19 in St. Petersburg]. Journal of Microbiology, Epidemiology and Immunobiology 2021; 98(5): 497–511. (In Russ.). doi: 10.36233/0372-9311-154
  5. Семененко Т.А., Акимкин В.Г., Бурцева Е.И., Ноздрачева А.В., Симонова Е.Г., Тутельян А.В. и др. Особенности эпидемической ситуации по острым респираторным вирусным инфекциям с учетом пандемического распространения COVID-19. Эпидемиология и Вакцинопрофилактика 2022; 21(4): 4–15. doi: 10.31631/2073-3046-2022-21-4-4-15 Semenenko T.A., Akimkin V.G., Burtseva E.I., Nozdracheva A.V., Simonova E.G., Tutelyan A.V. et al. [Features of the epidemic situation for acute respiratory viral infections taking into account the pandemic spread of COVID-19]. Epidemiology and Vaccine Prevention 2022; 21(4): 4–15. (In Russ.). doi: 10.31631/2073-3046-2022-21-4-4-15
  6. Бурцева Е.И., Панова А.Д., Колобухина Л.В., Игнатьева А.В., Кириллова Е.С., Бреслав Н.В. и др. Эпидемический сезон 2021–2022 годов. Частота ко-инфекции респираторными вирусными патогенами. Эпидемиол. и инфекц. бол. 2023; 28(2): 67–77. doi: 10.17816/EID321873 Burtseva E.I., Panova A.D., Kolobukhina L.V., Ignatjeva A.V., Kirillova E.S., Breslav N.V. et al. [Epidemic season 2021–2022: Frequency of co-infection by respiratory viral pathogens]. Epidemiology and Infectious Diseases 2023; 28(2): 67–77. (In Russ.). doi: 10.17816/EID321873
  7. Жукова Э.В., Бурова А.А., Мирская М.А., Никитина Г.Ю., Семененко А.В. Структура и антибиотикорезистентность бактериальных патогенов в отделениях высокого риска ИСМП в условиях пандемии COVID-19. Санитарный врач 2022; (11): 821–32. doi: 10.33920/med-08-2211-03 Zhukova E.V., Burova A.A., Mirskaya M.A., Nikitina G.Yu., Semenenko A.V. [Structure and antibiotic resistance of bacterial pathogens in high-risk departments of HCAI during the COVID-19 pandemic]. Sanitary doctor 2022; (11): 821–32. (In Russ.). doi: 10.33920/med-08-2211-03
  8. Острые респираторные вирусные инфекции (ОРВИ) у взрослых – 2021-2022-2023: Клинические рекомендации Минздрава РФ. https://cr.minzdrav.gov.ru/recomend/724_1 [Acute respiratory viral infections (ARVI) in adults – 2021-2022-2023: . Clinical recommendations of the Ministry of Health of Russian Federation]. (In Russ.). https://cr.minzdrav.gov.ru/recomend/724_1
  9. Артебякин С.В., Кузин А.А., Пищугин Д.Ю., Кучеров А.С., Волынков И.О. Этиологическая структура респираторных вирусных инфекций в организованном воинском коллективе центрального военного округа в периоды эпидемических сезонов 2016–2020 гг. Известия Российской военно-медицинской академии 2020; 39(S4): 45–8. Artebyakin S.V., Kuzin A.A., Pishchugin D.Yu., Kucherov A.S., Volynkov I.O. [Etiological structure of respiratory viral infections in an organized military collective of the central military district during the epidemic seasons of 2016–2020]. News of the Russian Military Medical Academy 2020; 39(S4): 45–8. (In Russ.).
  10. Готвянская Т.П., Мукашева Е.А., Ноздрачева А.В., Сипачева Н.Б., Семененко А.В., Игнатьева А.В. и др. Заболеваемость и популяционный иммунитет к гриппу и ОРВИ в условиях пандемии COVID–19. Санитарный врач 2023; (3): 153–63. doi: 10.33920/med-08-2303-03 Gotvyanskaya T.P., Mukasheva E.A., Nozdracheva A.V., Sipacheva N.B., Semenenko A.V., Ignatieva A.V. et al. [Incidence and population immunity to influenza and ARVI during the COVID-19 pandemic]. Sanitary doctor 2023; (3): 153–63. (In Russ.). doi: 10.33920/med-08-2303-03
  11. Акимкин В.Г., Семененко Т.А., Углева С.В., Дубоделов Д.В., Кузин С.Н., Яцышина С.Б. и др. COVID- 19 в России: эпидемиология и молекулярно-генетический мониторинг. Вестник РАМН 2022; 77(4): 254–60. doi: 10.15690/vramn2121 Akimkin V.G., Semenenko T.A., Ugleva S.V., Dubodelov D.V., Kuzin S.N., Yatsyshina S.B. et al. [COVID-19 in Russia: epidemiology and molecular genetic monitoring]. Bulletin of the Russian Academy of Sciences 2022; 77(4): 254–60. (In Russ.). doi: 10.15690/vramn2121
  12. Тимченко В.Н., Суховецкая В.Ф., Чернова Т.М., Баракина Е.В., Починяева Л.М., Семененко Т.А. и др. Роль ранней этиологической расшифровки острых респираторных вирусных инфекций в выборе противовирусной терапии у детей в условиях стационара. Педиатрия. Журнал им. Г.Н. Сперанского 2020; 99(1): 100–6. doi: 10.24110/0031-403X-2020-99-1-100-106 Timchenko V.N., Sukhovetskaya V.F., Chernova T.M., Barakina E.V., Pochinyaeva L.M., Semenenko T.A. et al. [The role of early etiological decoding of acute respiratory viral infections in the choice of antiviral therapy in children in a hospital setting]. Pediatrics. Journal named after G.N. Speransky 2020; 99(1): 100–6. (In Russ.). doi: 10.24110/0031-403X-2020-99-1-100-106
  13. Соломай Т.В., Семененко Т.А., Филатов Н.Н., Ведунова С.Л., Лавров В.Ф., Смирнова Д.И. и др. Реактивация инфекции, вызванной вирусом Эпштейна–Барр (Herpesviridae: Lymphocryptovirus, HHV-4), на фоне COVID-19: эпидемиологические особенности. Вопросы вирусологии 2021; 66(2): 152–61. doi: 10.36233/0507-4088-40 Solomai T.V., Semenenko T.A., Filatov N.N., Vedunova S.L., Lavrov V.F., Smirnova D.I. et al. [Reactivation of infection caused by the Epstein–Barr virus (Herpesviridae: Lymphocryptovirus, HHV-4) against the background of COVID-19: epidemiological features. Problems of Virology 2021; 66(2): 152–61. (In Russ.). doi: 10.36233/0507-4088-40
  14. Соломай Т.В., Семененко Т.А., Исаева Е.И., Ветрова Е.Н., Чернышова А.И., Роменская Э.В. и др. COVID-19 и риск реактивации герпесвирусной инфекции. Эпидемиол. инфекц. болезни. Актуал. вопр. 2021; 11(2): 55–62. doi: 10.18565/epidem.2021.11.2.55–62 Solomai T.V., Semenenko T.A., Isaeva E.I., Vetrova E.N., Chernyshova A.I., Romenskaya E.V. et al. [COVID-19 and the risk of reactivation of herpesvirus infection]. Epidemiology and infectious diseases. Current issues 2021; 11(2): 55–62. (In Russ.). doi: 10.18565/epidem.2021.11.2.55–62
  15. Matsubara H., Konishi T., Saito K., Naito A., Sugisawa J., Nakayama S. et al. Herpes zoster duplex in a patient with influenza A and bacterial superinfection. J. Dermatol. 2020; 47(1): e32–3. doi: 10.1111/1346-8138.15099
  16. Pereiro T., Lourido T., Ricoy J., Valdés .L Influenza Virus, Herpes Simplex Virus and Methicillin-Resistant Staphylococcus aureus in an Immunocompetent Patient. Arch. Bronconeumol. 2018; 54(3): 159–60. doi: 10.1016/j.arbres.2017.07.005
  17. Семененко Т.А., Селькова Е.П., Готвянская Т.П., Гайдаренко А.Д., Полежаева Н.А. и др. Показатели иммунного статуса при специфической и неспецифической профилактике гриппа лиц пожилого возраста. Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии 2005; (6): 24–8. Semenenko T.A., Selkova E.P., Gotvyanskaya T.P., Gaidarenko A.D., Polezhaeva N.A. et al. [Indicators of immune status during specific and nonspecific prevention of influenza in the elderly]. Journal of Microbiology, Epidemiology and Immunobiology 2005; (6): 24–8. (In Russ.).
  18. Sel’kova E.P., Yakovlev V.N., Semenenko T.A., Filatov N.N., Gotvianskaya T.P., Danilina G.A. et al. Evaluation of amyxin effect in prophylaxis of acute respiratory viral infections. Journal of Microbiology Epidemiology Immunobiology 2001; (3): 42–6.
  19. Викулов Г.Х. ОРВИ, грипп и герпес: что общего и в чем разница при диагностике и терапии. Взгляд клинического иммунолога и инфекциониста. Русский медицинский журнал 2015; 17: 1032–7. Vikulov G.Kh. [ARVI, influenza and herpes: what is common and what is the difference in diagnosis and therapy. View of a clinical immunologist and infectious disease specialist]. Russian Medical Journal 2015; 17: 1032–7. (In Russ.).
  20. Dimech W., Curley S., Subissi L., Ströher U., Perkins M.D., Cunningham J. Comprehensive, Comparative Evaluation of 35 Manual SARS-CoV-2 Serological Assays. Microbiol. Spectr. 2023; 11(3): e0510122. doi: 10.1128/spectrum.05101-22
  21. Соломай Т.В., Семененко Т.А., Каражас Н.В., Рыбалкина Т.Н., Веселовский П.А., Пульнова Н.Л. и др. Особенности изменения показателей иммунного статуса лиц с активными и латентными формами герпесвирусных инфекций. Пермский медицинский журнал 2021; 38(1): 46–63. doi: 10.17816/pmj38146-63 Solomai T.V., Semenenko T.A., Karazhas N.V., Rybalkina T.N., Veselovsky P.A., Pulnova N.L. et al. [Features of changes in indicators of the immune status of persons with active and latent forms of herpesvirus infections]. Perm Medical Journal 2021; 38(1): 46–63. (In Russ.). doi: 10.17816/pmj38146-63
  22. Соломай Т.В., Семененко А.В., Никитина Г.Ю., Шувалов А.Н. Прогнозные сценарии развития эпидемического процесса инфекции, вызванной вирусом Эпштейна–Барр. Эпидемиол. инфекц. болезни. Актуал. вопр.. 2023; 13(1): 60–9. doi: 10.18565/epidem.2023.13.1.60-9 Solomai T.V., Semenenko A.V., Nikitina G.Yu., Shuvalov A.N. [Forecast scenarios for the development of the epidemic process of infection caused by the Epstein–Barr virus]. Epidemiology and infectious diseases. Current issues. 2023; 13(1): 60–9. (In Russ.). doi: 10.18565/epidem.2023.13.1.60-9
  23. Бурцева Е.И., Колобухина Л.В., Панова А.Д., Мукашева Е.А., Краснослободцев К.Г., Кириллова Е.С. и др. Свойства вирусов гриппа, вызвавших эпидемические подъемы заболеваемости в России и странах мира в 2022–2023 гг. Эффективность вакцинопрофилактики. Вопросы вирусологии 2024; 69(1): 42–55. doi: 10.36233/0507-4088-211 Burtseva E.I., Kolobukhina L.V., Panova A.D., Mukasheva E.A., Krasnoslobodtsev K.G., Kirillova E.S. et al. [Properties of influenza viruses that caused epidemic increases in morbidity in Russia and countries of the world during 2022–2023. The effectiveness of vaccine prophylaxis]. Problems of Virology 2024; 69(1): 42–55. (In Russ.). doi: 10.36233/0507-4088-211
  24. Еженедельный национальный бюллетень по гриппу и ОРВИ НИИ гриппа им. А.А. Смородинцева. https://www.influenza.spb.ru/system/epidemic_situation/laboratory_diagnostics/ [Weekly national bulletin on influenza and ARVI of the Research Institute of Influenza]. (In Russ.). https://www.influenza.spb.ru/system/epidemic_situation/laboratory_diagnostics/
  25. Карпова Л.С., Соминина А.А., Даниленко Д.М., Волик К.М., Леоненко В.Н. Оценка эффективности базовых линий и порогов интенсивности эпидемий по результатам традиционного надзора за гриппом. Эпидемиология и Вакцинопрофилактика 2019; 18(4): 4–13. doi: 10.31631/2073-3046-2019-18-4-4-13 Karpova L.S., Sominina A.A., Danilenko D.M., Volik K.M., Leonenko V.N. [Assessing the effectiveness of baselines and epidemic intensity thresholds based on traditional influenza surveillance]. Epidemiology and Vaccinal Prevention 2019; 18(4): 4–13. (In Russ.). doi: 10.31631/2073-3046-2019-18-4-4-13
  26. Семененко Т.А. Эпидемиологические аспекты неспецифической профилактики инфекционных заболеваний. Вестник Российской академии медицинских наук 2001; (11): 25–9. Semenenko T.A. [Epidemiological aspects of nonspecific prevention of infectious diseases]. Bulletin of the Russian Academy of Medical Sciences 2001; (11): 25–9. (In Russ.).
  27. Соломай Т.В., Семененко Т.А., Филатов Н.Н., Колбутова К.Б., Олейникова Д.Ю., Каражас Н.В. Роль детей и взрослых как резервуара возбудителей в период сезонного подъема заболеваемости инфекциями верхних дыхательных путей. Детские инфекции 2020; 19(3): 5–11. doi: 10.22627/2072-8107-2020-19-3-5-11 Solomai T.V., Semenenko T.A., Filatov N.N., Kolbutova K.B., Oleynikova D.Yu., Karazhas N.V. [The role of children and adults as a reservoir of pathogens during the seasonal rise in the incidence of upper respiratory tract infections]. Children infections 2020; 19(3): 5–11. (In Russ.). doi: 10.22627/2072-8107-2020-19-3-5-11
  28. Ноздрачева А.В., Асатрян М.Н., Рыбак Л.А., Волошкин А.А., Семененко А.В. Совершенствование эпидемиологической диагностики в системе надзора за корью при помощи новых методов информационного обеспечения. Эпидемиол. инфекц. бол. Актуал. вопр. 2022; 12(2): 12–9. doi: 10.18565/epidem.2022.12.2.12-9 Nozdracheva A.V., Asatryan M.N., Rybak L.A., Voloshkin A.A., Semenenko A.V. [Improvement of epidemiological diagnostics in the measles surveillance system using new information support methods]. Epidemiology and infectious diseases. Current issues 2022; 12(2): 12–9. (In Russ.). doi: 10.18565/epidem.2022.12.2.12-9

补充文件

附件文件
动作
1. JATS XML
下载
2. Fig. 1. Incidence of influenza and ARVI in the Russian Federation and Moscow for the period from 1999 to 2023

下载 (48KB)
索引源数据
3. Fig. 2. Incidence of influenza and ARVI in the Russian Federation and Moscow during the epidemic season 2022-2023 compared to calculated baseline

下载 (62KB)
索引源数据
4. Fig. 3. Proportion of simultaneously detected IgG to different respiratory viruses

下载 (27KB)
索引源数据

版权所有 © Bionika Media, 2024
##common.cookie##