Экспосом и химики

Обложка

Цитировать

Полный текст

Открытый доступ Открытый доступ
Доступ закрыт Доступ предоставлен
Доступ закрыт Доступ платный или только для подписчиков

Аннотация

Статья представляет собой краткий обзор экспосомики – современной области биомедицинских и химико-аналитических исследований, связанных с изучением суммы различных внешних воздействий на организм человека в течение длительного периода времени. Рассмотрены сложная структура и компоненты экспосома. Выделены внешний и внутренний экспосомы и их химические составляющие, в том числе экзогенные соединения, продукты их биотрасформации и эндогенные метаболиты. Отмечено, что развитие экспосомики в ее химических аспектах неразрывно связано с применением методов нецелевого химического анализа, включающих различные варианты хроматографии и масс-спектрометрии. Охарактеризовано развитие информатики, которое привело к появлению многочисленных баз данных, отражающих связи между различными химическими соединениями и теми или иными заболеваниями. Сформулированы задачи экспосомных исследований, которые проводят или должны проводить химики-аналитики.

Полный текст

Доступ закрыт

Об авторах

Б. Л. Мильман

ФГБУ НКЦТ им. С. Н. Голикова ФМБА России

Email: bormilman@yandex.ru

д. х. н

Россия

И. К. Журкович

ФГБУ НКЦТ им. С. Н. Голикова ФМБА России

Автор, ответственный за переписку.
Email: bormilman@yandex.ru

к. х. н.

Россия

Список литературы

  1. Заикин В. Г., Борисов Р. С. Масс-спектрометрия как важнейшая аналитическая основа ряда омиксных наук. Масс-спектрометрия. 2021; 18(1):4–31.
  2. Wild C. P. The exposome: from concept to utility. Int. J. Epidemiol. 2012; 41(1):24–32.
  3. Exposome and Exposomics. URL: https://www.cdc.gov/niosh/topics/exposome/default.html.
  4. Zhang H., Hu H., Diller M., Hogan W. R., Prosperi M., Guo Y., et al. Semantic standards of external exposome data. Environ. Res. 2021; 197:111185.
  5. Rappaport S. M. Biomarkers intersect with the exposome. Biomarkers. 2012; 17(6):483–489.
  6. Vermeulen R., Schymanski E. L., Barabási A. L., Miller G. W. The exposome and health: Where chemistry meets biology. Science. 2020; 367(6476):392–396.
  7. Milman B. L., Zhurkovich I. K. The chemical space for non-target analysis. Trends Anal. Chem. 2017; 97:179–187.
  8. Zhang P., Carlsten C., Chaleckis R., Hanhineva K., Huang M., Isobe T., et al. Defining the scope of exposome studies and research needs from a multidisciplinary perspective. Environ. Sci. Technol. Lett. 2021; 8(10):839–852.
  9. Bolon B., Haschek W. M. The Exposome in toxicologic pathology. Toxicol. Pathol. 2020; 48(6):718–720.
  10. Barouki R., Audouze K., Becker C., Blaha L., Coumoul X., Karakitsios S., et al. The exposome and toxicology: a win–win collaboration. Toxicol. Sci. 2022; 186(1):1–11.
  11. Wishart D., Arndt D., Pon A., Sajed T., Guo A. C., Djoumbou Y., et al. T3DB: the toxic exposome database. Nucleic Acids Res. 2015; 43(D1): D928-D934.
  12. О химической безопасности в Российской Федерации: проект Федерального закона. URL: https://www.profiz.ru/upl/2021/%D0%9F%D1%80%D0%BE%D0%B5%D0%BA%D1%82%20%D0%9D%D0%9F%D0%90.pdf.
  13. Vitale C. M., Price E. J., Miller G. W., David A., Antignac J. P., Barouki R., et al. Analytical strategies for chemical exposomics: exploring limits and feasibility. Exposome. 2021; 1(1): osab003.
  14. Flasch M., Koellensperger G., Warth B. Comparing the sensitivity of low- and high-resolution mass spectrometry for xenobiotic trace analysis: An exposome-type case study. 2022. URL: https://chemrxiv.org/engage/chemrxiv/article-details/6287303a87d01f083beb903a.
  15. Мильман Б. Л., Журкович И. К. Современная практика нецелевого химического анализа. Ж. аналит. хим. 2022; 77(5):412–426.
  16. Barupal D. K., Fiehn O. Generating the blood exposome database using a comprehensive text mining and database fusion approach. Environ. Health Perspect. 2019; 127(9):097008.
  17. Meijer J., Lamoree M., Hamers T., Antignac J.-P., Hutinet S., Debrauwer L., et al. An annotation database for chemicals of emerging concern in exposome research. Environ. Int. 2021; 152:106511.
  18. Neveu V., Moussy A., Rouaix H., Wedekind R., Pon A., Knox C., et al. Exposome-Explorer: a manually-curated database on biomarkers of exposure to dietary and environmental factors. Nucleic Acids Res. 2017; 45(Database issue): D979–D984.
  19. Barupal D. K., Mahajan P., Fakouri-Baygi S., Wright R. O., Arora M., Teitelbaum S. L. CCDB: A database for exploring inter-chemical correlations in metabolomics and exposomics datasets. Environ. Int. 2022; 164:107240.

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML
2. Рис. 1. К исходному понятию экспосома, введенному в работах Уайлда (Wild) [2]. Постулируется, что экспосом включает каждое воздействие, которому подвергается индивидуум от зачатия до смерти

Скачать (245KB)
3. Рис. 2. Различные компоненты экспосома, рассматриваемые по мере развития концепции экспосомики [4]

Скачать (321KB)
4. Рис. 3. Часть справки о генистеине [18] – органическом соединении растительного происхождения. Показана его структурная формула и статистика соответствующих экспосомных данных. Отмечены связи генистеина как биомаркера с образцами, подвергаемыми анализу, и его влияние на раковые заболевания

Скачать (409KB)

© Мильман Б.Л., Журкович И.К., 2023

Данный сайт использует cookie-файлы

Продолжая использовать наш сайт, вы даете согласие на обработку файлов cookie, которые обеспечивают правильную работу сайта.

О куки-файлах