Том 8, № 6 (2020)

Обложка

Весь выпуск

Статьи

Механизмы развития цитокинового шторма при COVID-19 и новые потенциальные мишени фармакотерапии

Петров В.И., Амосов А.А., Герасименко А.С., Шаталова О.В., Пономарева А.В., Акинчиц А.Н., Кулакова И.С., Горбатенко В.С.

Аннотация

Для тяжёлых форм COVID-19 характерно развитие «цитокинового шторма» – состояния неконтролируемого высвобождения большого количества медиаторов воспаления. Присоединение S-гликопротеина SARS-CoV-2 к ангиотензин-превращающему ферменту 2 рассматривается как процесс, запускающий сложные молекулярные взаимодействия, которые приводят к гипервоспалению, которое в свою очередь реализуется через несколько систем: ренин-ангиотензин-альдостероновую, калликреин-кининовую и систему комплемента. Знание данных механизмов позволяет предположить потенциальные точки терапевтического вмешательства, на которые можно воздействовать существующими терапевтическими средствами для противостояния «цитокиновому шторму» и лечения острого респираторного дистресс-синдрома, связанного с COVID-19.

Цель. В обзоре обобщаются известные на сегодняшний день данные по молекулярным процессам, лежащим в основе неконтролируемого «цитокинового шторма» у пациентов с тяжёлой формой COVID-19 и возможные варианты их фармакологической коррекции.

Материалы и методы. В системах Medline, Cochrane Central Register of Controlled Trials, Scopus, Web of Science Core Collection, Cochrane Library, ClinicalTrials.gov, Elibrary, Google-академия был проведен поиск по ключевым словам и комбинации этих слов: COVID-19, ренин-ангиотензин-альдостероновая система, брадикинин, система комплемента, гиалуроновая кислота, фармакотерапия.

Результаты. Развитие «цитокинового шторма» при COVID-19 опосредованно патогенетическими изменениями, происходящими в организме в ответ на проникновения SARS-CoV-2 в клетку. В РААС подавление АПФ2 приводит к снижению его способности расщеплять АТII, что, с одной стороны, ведет к уменьшению количества АТ1-7, а с другой – к воздействию АТII на AT1R с последующим развитием вазоконстрикции и повреждения лёгких. Нарушения в калликреин-кининовой системе связаны, с одной стороны, с повышенной экспрессией калликреина и усилением образования брадикинина и его метаболита des-Arg 9-брадикинина, с другой стороны, с подавлением экспрессии ингибитора C1-эстеразы, который препятствует образованию калликреина, и нарушением инактивации des-Arg 9-брадикинин под действием АПФ 2. Нуклеокапсидный белок SARS-CoV-2 запускает активацию системы комплемента по лектиновому пути, что приводит к продукции анафилатоксинов C3a и C5a, которые стимулируют синтез провоспалительных цитокинов. Провоспалительные цитокины являются сильными индукторами гена HAS 2 в эндотелии, который кодирует мембранные ферменты гиалуронатсинтазы. Вызванное «брадикининовым штормом» пропотевание жидкости в альвеолы в сочетании с гиперпродукцией гиалуроновой кислоты, которая накапливает воду в 1000 раз больше собственной массы, может приводить к образованию плотного желеобразного вещества, препятствующего газообмену.

Заключение. Перспективные направления фармакотерапии «цитокинового шторма» связаны с влиянием на дисфункцию перечисленных систем. Однако эффективность и безопасность применения большинства препаратов для лечения COVID-19 еще предстоит изучить с помощью тщательно спланированных клинических исследованиях.

Фармация и фармакология. 2020;8(6):380-391
pages 380-391 views

Фармакогенетические основы индивидуальной чувствительности и персонализированного назначения антиагрегантной терапии в различных этнических группах

Кантемирова Б.И., Орлова Е.А., Полунина О.С., Чернышева Е.Н., Абдуллаев М.А., Сычев Д.А.

Аннотация

Сердечно-сосудистые заболевания (ССЗ) являются ведущей причиной инвалидности и смертности населения во всем мире. Повышенное тромбообразование является пусковым моментом развития различных ССЗ и их осложнений, в связи с чем, терапия ингибиторами P2Y12-рецепторов всегда является патогенетически обоснованной и жизненно необходимой. Однако, по разным данным, у 10-25% пациентов, получающих клопидогрел, отмечается «резистентность» к антиагрегантной терапии. Причины формирования резистентности до сих пор не ясны. Общепризнанной, стандартной методики определения резистентности к антиагрегантам не существует. Кроме того, нет методологических подходов по выявлению пациентов с невосприимчивостью к антиагрегационным препаратам и стандартизированных схем коррекции низкой чувствительности к ним.

Цель. Целью написания данного обзора было резюмировать имеющиеся результаты зарубежных и отечественных исследований, посвященных изучению вопросов эффективности и безопасности назначения антитромбоцитарных препаратов с позиции генетической предрасположенности к изменению их метаболизма.

Материалы и методы. Для обзора использовали сведения научной литературы из открытых и доступных источников за период 1996–2020 гг., размещенных в электронных базах данных: pharmgkb.org; PubMed; Scopus; Web of Science Core Collection; Elibrary. Поисковые запросы – «генетические особенности+антиагрегационная терапия+этнические группы», «CYP2C19+клопидогрел+эффективность антитромбоцитарной терапии»; «ретромбоз стента+полиморфизм CYP2C19+ остаточная реактивность тромбоцитов» и «полиморфизм CYP2C19+этнические группы+резистентность к клопидогрелу» как в русском, так и английском эквиваленте.

Результаты. Проблема формирования резистентности к антиагрегационным препаратам в настоящее время изучена недостаточно. Наиболее проработанным вопросом является изучение влияния носительства полиморфных аллелей гена CYP2C19 на остаточную реактивность тромбоцитов, у пациентов получающих двойную антиагрегационную терапию, включающую клопидогрел. Анализ открытых литературных источников, в целом, свидетельствует о наличии статистически значимой ассоциативной связи между носительством медленных аллелей гена CYP2C19 и остаточной реактивностью тромбоцитов, клинически проявляющуюся тромбозом и неблагоприятными сердечно-сосудистыми событиями. Частота встречаемости полиморфного носительства гена CYP2C19 варьирует в разных этнических группах, поэтому не может быть экстраполирована на отдельные субъекты, отличающиеся этническим разнообразием.

Заключение. Для разработки превентивных и предиктивных мер по преодолению резистентности к антиагрегантам, а также методологических подходов к персонализированному назначению препаратов этой группы, требуются дальнейшие исследования, с расширением поиска причин и изучением участия других генов системы цитохрома Р450.

Фармация и фармакология. 2020;8(6):392-404
pages 392-404 views

Флебопротекторы на базе флавоноидов: лекарственные формы, биофармацевтическая характеристика, технологические особенности

Степанова Э.Ф., Ремезова И.П., Шевченко А.М., Морозов А.В., Мальцева В.К.

Аннотация

Микронизированная очищенная флавоноидная фракция (МОФФ) – оригинальный флеботропный препарат, и его выпускаемая на рынок форма (Детралекс®) состоит из 90% диосмина и 10% – другие флавоноиды, в пересчете на гесперидин и является наиболее широко используемым в настоящее время лекарственным препаратом. Диосмин и гесперидин, входящие в состав большинства веноактивных лекарственных средств, являются труднорастворимыми в воде соединениями, что может сказываться на их клинической эффективности. Одним из способов повышения растворимости данных соединений, который приводит к повышению биодоступности, является микронизация действующих веществ.

Цель. Сравнительное определение динамики и результативности растворения лекарственных препаратов, содержащих биофлавоноидные фракции, при проведении теста растворения, а также анализ степени микронизации и ее влияние на технологию и биофармацевтические показатели.

Материалы и методы. Биофармацевтический профиль высвобождения определяли с помощью ВЭЖХ. Распадаемость, характеристика формы и размера частиц таблеток определяли согласно методикам Государственной Фармакопеи ХIV издания.

Результаты. Подробно рассмотрены объекты, созданные с использованием диосмина и гесперидина. Отмечена роль технологических решений в отношении соответствующих лекарственных форм. Установлена подробная биофармацевтическая характеристика с выбором методики для контроля высвобождения на основе ВЭЖХ. Все препараты данной группы обладают небольшой растворимостью в воде, что приводит к максимальной биодоступности для Детралекса®, составляющей около 1,26%; для других анализируемых моделей – не более 0,2%.

Заключение. Среди проанализированных объектов (таблетки) по степени высвобождения доминирует Детралекс®. Что касается общих количественных показателей высвобождения, то фактические числа довольно низкие, что связано с плохой растворимостью в воде действующих веществ.

Фармация и фармакология. 2020;8(6):405-415
pages 405-415 views

Применение секретома мультипотентных мезенхимальных стволовых клеток в лечении адъювантного артрита и контактно-аллергического дерматита на животных моделях

Голубинская П.А., Сарычева М.В., Должиков А.А., Бондарев В.П., Стефанова М.С., Солдатов В.О., Надеждин С.В., Корокин М.В., Покровский М.В., Бурда Ю.Е.

Аннотация

Терапевтическое действие мультипотентных мезенхимальных стволовых клеток доказано на различных моделях заболеваний. Одним из механизмов является паракринное воздействие клеток на окружающие ткани.

Цель. Изучение эффективности секретома мультипотентных мезенхимальных стволовых клеток при лечении адъювантного артрита и контактно-аллергического дерматита у крыс линии Wistar.

Материалы и методы. На 26 самках крыс введением полного адьюванта Фрейнда моделировали адъювантный артрит, лечили введением 100 мкл секретома мультипотентных мезенхимальных стволовых клеток или физиологического раствора. На 30 самках крыс моделировали контактно-аллергический дерматит путём нанесения на кожу 200 мкл масляного раствора динитрофторбензола на 1, 5 и 6-е сутки, затем лечили мазью с флуоцинолоном (положительный контроль), детским кремом (отрицательный контроль), детским кремом с секретомом от нативных мультипотентных мезенхимальных стволовых клеток или от клеток, обработанных дексаметазоном.

Результаты. Секретом не оказал противовоспалительного эффекта при адъювантном артрите, судя по показателям продольных и поперечных размеров лап у крыс и гистологического исследования. Наиболее эффективным на модели контактно-аллергического дерматита оказался крем с секретомом от мультипотентных мезенхимальных стволовых клеток, обработанных дексаметазоном, – клиническое улучшение наступило на 2 сутки. Секретом от нативных мультипотентных мезенхимальных стволовых клеток и флуоцинолон оказали терапевтический эффект на 3 сутки применения, отрицательный контроль – на 4 сутки. Коэффициент лимфоцитарной инфильтрации был достоверно ниже (p<0,05) во всех случаях по сравнению с отрицательным контролем (2,8±0,1), однако самая низкая инфильтрация наблюдалась при использовании крема с секретомами от нативных (1,75±0,1) и стимулированных дексаметазоном (1,76±0,1) мультипотентных мезенхимальных стволовых клеток.

Заключение. Крем с секретомом мультипотентных мезенхимальных стволовых клеток на модели контактно-аллергического дерматита, который является классической местной реакцией гиперчувствительности замедленного типа, сильнее подавляет лимфоцитарную инфильтрацию, чем высокоактивный топический глюкокортикостероид – флуоцинолон. Однако требуется дальнейшее изучение терапевтического действия секретома на моделях системных воспалительных заболеваний после его предварительной очистки от крупномолекулярных белков.

Фармация и фармакология. 2020;8(6):416-425
pages 416-425 views

Коррекция психоневрологических последствий острой интоксикации алкоголем у крыс новой композицией на основе ацетилцистеина

Куркин Д.В., Морковин Е.И., Осадченко Н.А., Бакулин Д.А., Абросимова Е.Е., Дубровина М.А., Ковалев Н.С., Горбунова Ю.В., Тюренков И.Н.

Аннотация

Цель. Экспериментальное обоснование применения новой комбинации биологически активных веществ с тонизирующим и антиоксидантным действием, содержащей в составе ацетилцистеин для снижения выраженности психоневрологических последствий интоксикации алкоголем.

Материалы и методы. Исследование проведено на крысах-самцах линии Вистар. Постинтоксикационное состояние моделировали однократным введением этанола (3 г/кг, внутрибрюшинно). Через полчаса после пробуждения крыс разделяли на группы, которым вводили: физиологический раствор, ацетилцистеин (1 г/кг), таурин (20 мг/кг), кофеин (20 мг/кг), янтарную (100 мг/кг), липоевую кислоту (100 мг/кг), пиридоксин (400 мг/кг), или комбинацию ацетилцистеина со всеми данными веществами, взятыми в меньшей (в 2 раза) дозе (кроме таурина). До лечения и спустя 3 часа фиксировали степень неврологических нарушений по шкале «Combs и D’Alecy», в тесте «Открытое поле» и «Адгезивный тест». Далее животных подвергали эвтаназии для оценки уровня глутатиона, триглицеридов и малонового диальдегида в гомогенатах печени, определения активности ферментативных антиоксидантных систем и сывороточных аминотрансфераз.

Результаты. У животных, которым вводили алкоголь, отмечались выраженные признаки психоневрологических нарушений, проявляющихся в низкой двигательной активности и снижением мелкой моторики. Данное состояние не изменялось после перорального введения физиологического раствора. После введения ацетилцистеина, таурина, кофеина, янтарной кислоты, липоевой кислоты, пиридоксина и, в большей степени, их композиции, отмечали компенсацию психоневрологических нарушений, улучшение мелкой моторики. Уровни глутатиона, малонового диальдегида, триглицеридов и активность ферментов антиоксидантной защиты в печени этих животных соответствовали физиологической норме.

Заключение. Введение комбинации ацетилцистеина с таурином, кофеином, пиридоксином, липоевой и янтарной кислотами после острой алкогольной интоксикации, в большей степени способствует сохранению функций антиоксидантной системы гепатоцитов, снижает уровень дистрофических изменений в них и приводит к снижению тяжести психоневрологических нарушений у экспериментальных животных.

Фармация и фармакология. 2020;8(6):426-435
pages 426-435 views

Фармакоэкономическое обоснование проведения антипневмококковой вакцинации в группах риска для профилактики внебольничных пневмоний среди взрослого населения Астраханской области

Орлова Е.А., Дорфман И.П., Орлов М.А., Абдуллаев М.А.

Аннотация

Цель. Обосновать экономическую эффективность и выбор стратегии вакцинопрофилактики в контингентах повышенного риска развития респираторной пневмококковой инфекции среди взрослого населения Астраханской области.

Материалы и методы. За период с 2015 по 2018 гг. проанализированы данные о числе зарегистрированных заболеваний у пациентов, проживающих в районе обслуживания медицинских организаций (форма № 12, Приказы Росстата № 591 от 27.11.2015; № 679 от 22.11.2019). Изучена основная документация по диспансеризации, представленная медицинскими учреждениями (форма № 030/у «Контрольная карта диспансерного наблюдения», списки лиц, подлежащих диспансерному наблюдению в отчетном году, Приказы МЗ РФ № 1344 от 21.12.2012; № 173н от 29.03.2019). Проанализированы отчетно-статистические материалы территориального фонда обязательного медицинского страхования Астраханской области (ТФОМС АО) по оплате медицинской помощи 12970 пациентам, перенесшим пневмонию в 2015–2018 гг. Для финансового обеспечения вакцинопрофилактики учитывались результаты конкурсных торгов по закупкам пневмококковых вакцин, организованных региональным министерством здравоохранения. Расчеты выполнялись в соответствии с методическими указаниями «Экономическая эффективность вакцинопрофилактики». МУ 3.3.1878-04 от 04.03.2004.

Результаты. При проспективном расчете затрат на реализацию вакцинопрофилактики установлено, что окупаемость вакцинации с применением ПКВ 13(«Превенар 13») и ППВ 23 («Пневмовакс 23») в условиях 95% охвата прививками регистрируется через 2 года. Экономическая выгода вакцинопрофилактики за счет снижения возможного числа пневмоний (ПН) по окончании 2028 года будет составлять 968,2 млн руб.

Заключение. Установлена экономическая целесообразность проведения вакцинопрофилактики взрослого контингента с повышенным риском развития пневмококковой инфекции. Наибольшей эффективностью для ограничения распространения пневмококковой инфекции характеризуется стратегия последовательного применения ПКВ13 и ППВ23. Результаты исследования подлежат широкому внедрению в перспективные планы вакцинопрофилактики и практику здравоохранения Астраханской области.

Фармация и фармакология. 2020;8(6):436-445
pages 436-445 views

Использование квантово-химических параметров для прогнозирования антирадикальной (НО·) активности родственных структур, содержащих циннамоильный фрагмент. III. Халконы, флаваноны и флавоны с флороглюциновым типом кольца «А»

Оганесян Э.Т., Шатохин С.С.

Аннотация

Изучено 42 производных халкона, флаванона и флавона, имеющих флороглюциновый тип кольца «А» и содержащих одинаковые электронодонорные заместители в кольце «В». Флавоноиды с флороглюциновым типом кольца «А» наиболее распространены в природе, что обусловлено особенностями биогенетического формирования при участии малонильных и ацетильных фрагментов.

Цель. Выявление влияния гидроксигруппы в положении 6’ у халконов и в положении 5 у флаванонов и флавонов на связевые числа (Nµ); индексы свободной валентности (Fµ); Малликеновские заряды (а.е); электронную плотность; индексы ненасыщенности (IUA) атомов углерода С-1→С-6→С-7→С-8.

Материалы и методы. Перечисленные выше квантово-химические параметры анализируемых соединений рассчитаны полуэмпирическим методом PM7 (программа WinMopac 2016) на рабочей станции с процессором Intel Xeon E5-1620 3,5 ГГц, 20 Гб оперативной памяти.

Результаты. Квантово-химические характеристики рассматриваемых производных, имеющих флороглюциновый тип кольца «А», свидетельствуют о том, что OH-группа в положении 6’ у халконов, (у соответствующих флаванонов и флавонов в положении 5) влияет по-разному: у халконов имеет место незначительное повышение отрицательного заряда (а.е) и электронной плотности, связевые числа принимают разные значения, что зависит от положения и числа заместителей в кольце «B». У флаванонов Nµ практически остается на одном уровне 3,822–3,829. У флавонов значения связевых чисел Nµ у С-8 находятся в интервале 3,700–3,706, а Малликеновские заряды находятся в пределах от –0,4120 до –0,4356. У замещенных по положению С-3 (6-флаванон и 7-флаванон) заряд равен –0,4436 и –0,4479 соответственно. У халконов заряд на С-7 имеет отрицательное значение у соединений 4х, 5х, 10х и 13х от –0,0204 до –0,0470. Остальные производные халкона, а также соответствующие флаваноны и флавоны, характеризуются положительным значением а.е на С-7. Исходя из связевых чисел (Nµ), найдены индексы свободной валентности (Fµ) для атомов углерода циннамоильного фрагмента С-1→С-6→С-7→С-8. При сопоставлении полученных данных установлено, что у халконов на атомах С-1→С-8 значения индексов свободной валентности находятся в пределах 0,900–0,980 у соединений 12х, 13х, где Fµ>1. У флаванонов на атомах С-1, С-3 и С-5 (соединения 12анон и 13анон) индексы свободной валентности находятся в интервале 0,984–1,024, а у остальных атомов величина Fµ примерно такая же, как у халконов. На атомах С-8 всех производных, а также С-1, С-3 и С-5 (соединения 12он, 13он) Fµ≥1,0. Можно предположить, что при значениях Fµ=0,850–0,955 для всех анализируемых соединений возможны реакции присоединения по двойной связи, а если Fµ≥1, то присоединение будет проходить по свободнорадикальному механизму. Полученные данные свидетельствуют о том, что ОН-группа в положении 6’ у халкона и 5 у флаванонов – не оказывает существенного влияния на Малликеновский заряд (а.е) и электронную плотность на атомах С-8.

Заключение. На основании полученных данных установлено, что ОН-группа в положении 6′ кольца «А» халконов (в положении 5 у флавонов и флаванонов) разнонаправлено влияет на величину связевых чисел: при переходе от халкона к флаванону Nµ возрастает, а затем у флавона резко уменьшается. Для атомов С-8 всех производных флавона Fµ≥1. Это вновь доказывает высказанный ранее нами вывод, что на начальном этапе электрофильный гидроксильный радикал присоединяется по положению С-8 циннамоильного фрагмента.

Фармация и фармакология. 2020;8(6):446-455
pages 446-455 views

Изучение информированности фармацевтических работников по вопросам злоупотребления лекарственными препаратами

Порсева Н.Ю., Солонинина А.В., Дворская О.Н.

Аннотация

Профилактика немедицинского использования лекарственных препаратов является важнейшей задачей государственной антинаркотической политики Российской Федерации, эффективность которой в значительной степени может быть обусловлена профессиональной информированностью фармацевтических работников, соблюдением ими установленных регламентов отпуска лекарственных препаратов и надлежащего фармацевтического консультирования.

Цель. Изучение информированность фармацевтических специалистов по вопросам злоупотребления лекарственными препаратами.

Материал и методы. Исследование базировалось на анализе нормативных правовых актов Российской Федерации, регламентирующих порядок назначения и отпуска лекарственных препаратов, инструкций по медицинскому применению лекарственных препаратов, используемых с целью злоупотребления. В процессе исследования использовался системный подход, включающий в себя методы структурно-логического, кластерного и контент-анализов, методы обобщения и группировки. Изучение информированности фармацевтических работников по вопросам злоупотребления лекарственными препаратами проводилось методом случайного выборочного опроса по специально разработанной анкете: 396 работников аптечных организаций различных форм собственности из Пермского края, Челябинской и Кировской областей, Удмуртской и Чувашской Республик, Республики Коми в период с 2017 по 2019 годы. В анкету были включены 35 вопросов, структурированных в 4 блока. В первом блоке были включены вопросы по образованию, должности, стажу работы респондентов, во втором – вопросы по выявлению знаний по ассортименту лекарственных препаратов, используемых с целью злоупотребления и категориям потребителей таких лекарственных препаратов. В третьем блоке содержались вопросы по регламентации и соблюдению порядка отпуска препаратов. Четвертый блок анкеты предназначался для установления способов и источников получения информации по вопросам злоупотребления препаратов, используемых специалистами аптечных организаций.

Результаты. На основе проведенного анализа установлен недостаточный уровень знаний специалистами нормативных правовых актов, регламентирующих обращение лекарственных препаратов, ассортимента лекарственных препаратов, используемых с целью злоупотребления и категорий их потребителей. Выявлено нарушение правил отпуска лекарственных препаратов, отсутствие систематизированных источников информации по вопросам злоупотребления лекарственными препаратами.

Заключение. Установлена необходимость разработки программы повышения квалификации фармацевтических работников по вопросам профилактики и предотвращения злоупотребления лекарственными препаратами. С целью формирования дополнительных компетенций по профилактике немедицинского употребления лекарственных препаратов и повышения качества фармацевтического консультировании необходимо проводить соответствующие образовательные мероприятий.

Фармация и фармакология. 2020;8(6):456-464
pages 456-464 views

Оценка качества жизни пациентов со стабильной ишемической болезнью сердца после реваскуляризации миокарда

Наркевич И.А., Немятых О.Д., Ковалева К.А., Ратова Л.Г., Трушникова И.О., Парижская Е.Н., Конради А.О.

Аннотация

Цель. Оценка качества жизни пациентов со стабильной ишемической болезнью сердца после ангиопластики со стентированием коронарных артерий на постгоспитальном этапе.

Материалы и методы. На разных этапах проспективного обсервационного исследования использовались методы социологического анализа (анкетирование) и методы математической статистики (описательная статистика, метод динамических рядов, факторный и дисперсионный анализ). Материалами исследования служили: 165 электронных историй болезней пациентов со стабильной ишемической болезнью сердца после ангиопластики со стентированием коронарных артерий, а также 620 анкет, заполненных больными до операции, через 1, 6 и 12 месяцев после выписки. Статистическая обработка данных проводилась с использованием программного обеспечения IBM SPSS Statistics.

Результаты. Результаты комплексного опросника позволяют утверждать о сохранении стабильно хорошего самочувствия кардиохирургических пациентов после ангиопластики со стентированием коронарных артерий на протяжении исследуемого промежутка времени. В рамках опросника EQ-5D-5L выявлено, что более 50% пациентов не имеют физиологических проблем. Результаты анализа SAQ демонстрируют, что 58% пациентов отмечают улучшение самочувствия, а также более 34% больных не имеют одышки через 1 год после операции. Установлено статистически достоверное улучшение состояния здоровья по визуально-аналоговой шкале годовой отметки наблюдения (62,82±20,95), что соответствует высокой оценке результатов применения медицинской технологии. При этом 53% больных отмечают, что результаты лечения соответствуют личным ожиданиям.

Заключение. Предложенный расчет интегрированного индекса эффективности лечения пациента на примере больных со стабильной ишемической болезнью сердца после ангиопластики со стентированием коронарных артерий, базирующийся на результатах факторного анализа, может быть использован для оценки эффективности фармакотерапии в рамках ценностно-ориентированного подхода к лечению ряда других патологий.

Фармация и фармакология. 2020;8(6):465-475
pages 465-475 views

Изучение влияния количества запусков Autodock 4 на среднеквадратическое отклонение результатов докинга

Пратама М.Ф., Сисвандоно С.

Аннотация

Цель. Известно, что количество запусков докинга с AutoDock 4 играет важную роль в достоверности получаемых результатов. Чем больше количество запусков, тем больше достоверных результатов докинга. Однако точно не известно, как наиболее оптимально работает докинг с AutoDock 4. Это исследование направлено на определение влияния количества запусков процесса докинга в AutoDock 4 на достоверность результатов.

Материалы и методы. В качестве метода исследования использовали процесс редокинга с AutoDock 4.2.6. Используемый рецептор представляет собой рецептор эстрогена с эталонным лигандом эстрадиола (PDB ID 1GWR). Варьировали количество прогонов от 10 до 100, кратные 10. Наблюдаемыми параметрами были RMSD, свободная энергия связывания, константы ингибирования, аминокислотные остатки и количество водородных связей.

Результаты. Все эксперименты вырабатывают идентичную свободную энергию связи, где максимальная разница в константе ингибирования составляет всего 0,06 нМ. Наименьшее среднеквадратичное отклонение (RMSD) определяется количеством прогонов, равным 60, при значении среднеквадратичного отклонения, равного 0,942. Установлено, что между количеством прогонов и пространственным выравниванием (RMSD) нет линейной зависимости, так как коэффициент корреляции (R) равен 0,4607.

Заключение. В целом, количество запусков не оказывает значительного вклада в достоверность результатов процесса докинга с AutoDock 4. Однако эти результаты справедливы только с рецепторами, использованными в данном исследовании.

Фармация и фармакология. 2020;8(6):476-480
pages 476-480 views

Данный сайт использует cookie-файлы

Продолжая использовать наш сайт, вы даете согласие на обработку файлов cookie, которые обеспечивают правильную работу сайта.

О куки-файлах