Molecular genetics for the diagnostics of socially significant diseases

Cover Page

Cite item

Full Text

Open Access Open Access
Restricted Access Access granted
Restricted Access Subscription or Fee Access

Abstract

Present work summarizes experiences in our collaboration with various clinics of the Medical University, concerning, mainly, gene diagnostics of infectious pathogens (viruses and poorly cultivable bacteria). Special attention is paid to development and applications of DNA diagnostics of periodontal anaerobic microflora (B. Forsythi, P. Gingivalis, A. Actinomycetemcomitans) that have been tested in a study involving 2000 persons. Percentage of the samples positive for these microbes did sufficiently increase with age, beginning from 6-7 years, and, especially, between 15 and 35 лет, reaching it’s maximum by the age of 65 years.

Studies of common gene variants predisposing for malignant diseases represent an important issue. When studying the frequencies of MMP-1 and MMP-3 promoter variants in the patients with uterine leiomyoma, we have found significant correlations between the 1G allele of MMP-1, rates of myoma growth and presence of adenomyosis. Hence, it was shown that MMP-1 genotype should be taken into account as a prognostic factor for the clinical course of this disease.

Moreover, we have studied some interactions between unfavorable genotype of hepatitis C virus and mRNA expression for chemokines IL-8, MIP-1β и RANTES in the patients with chronic hepatitis. Sufficiently increased amounts of RANTES mRNA were found in plasma of the patients with unfavorable HCV 1b genotype. The article deals with perspectives for studies of gene polymorphisms of cytokines, chemokines and their receptors as prognostic markers of immune response in sepsis, hepatitis C, papillomavirus infections Further validation and development of standardized test systems are necessary for multiple genotyping.

About the authors

A. Totolian Areg

I. Pavlov St. Petersburg State Medical University

Author for correspondence.
Email: shabanov@mail.rcom.ru
Russian Federation, St. Petersburg

A. B. Chukhlovin

I. Pavlov St. Petersburg State Medical University

Email: shabanov@mail.rcom.ru
Russian Federation, St. Petersburg

N. A. laitsky

I. Pavlov St. Petersburg State Medical University

Email: shabanov@mail.rcom.ru

академик РАМН

Russian Federation, St. Petersburg

References

  1. Баранов В. С., Баранова Е. В., Иващенко Т. Э., Асеев М. В. Геном человека и гены предрасположенности // Введение в предиктивную медицину. СПб., 2000. 270 с.
  2. Баранов В. С. Геномика и молекулярная медицина // Мол. биол. 2004. Т. 38. № 1. С. 110-116.
  3. Баранов В. С. Научные и практические аспекты пренатальной диагностики // Вест. РАМН. 2003. № 10. С. 8-13.
  4. Бобкова М. Р. Лекарственная устойчивость ВИЧ и лабораторные методы ее определения // Клин. лабор. диагн. 2002. № 1. С. 25–32.
  5. Вавилова Т. В. Антитромботическая терапия и методы ее лабораторного контроля // Клин. лабор. диагн. 2004. № 12. С. 21-32.
  6. Дмитриев А. В., Кантикова М., Микула И., Тотолян А. А. Факторы и генетика патогенности стрептококков группы В // Журн. микробиол. эпидемиол. и иммунол. 2000. № 5. С. 92-97.
  7. Имянитов Е. Н., Хансон К. П. Роль ДНК-диагностики в современной онкологии // Вестн. РАМН. 2003. № 10. С. 3–8.
  8. Колчинский А. М., Грядунов Д. А., Лысов Ю. П. и др. Микрочипы на основе трехмерных ячеек геля: история и перспективы // Мол. биол. 2004. Т. 38. № 7. С. 5–16.
  9. Мисюрина О. Ю., Шипицина Е. В., Финашутина Ю. П. и др. Анализ точечных мутаций в генах ygeD, gyrA, parC клинических изолятов Chlamidia trachomatis, устойчивых к фторхинолонам // Мол. генет., микробиол., виру сол. 2004. № 3. С. 3-7.
  10. Морозова Е. Б., Чухловин А. Б., Тотолян А. А., Кулагина Н. В. Значимость генного полиморфизма в прогнозе развития и тактике ведения больных миомой матки и аденомиозом // Журн. акушерства и жен. болезней. 2005. № 3 (в печати).
  11. Радченко В. Г., Стельмах В. В., Козлов В. К. Оптимизация этиопатогенетической терапии хронического гепатита С / МАПО. СПб., 2004. 168 с.
  12. Савицкий Г. А., Савицкий А. Г. Миома матки - проблемы патогенеза и патогенетической терапии. СПб.: Элби, 2000. 236 с.
  13. Сафронникова Н. Р., Зарайский М. И., Чухловин А. Б. Факторы онкологического риска при папилломатозной инфекции // Вопр. онкол. 2003. T. 49. № 4. С. 450-454.
  14. Соловьева А. М., Матело С. К., Тотолян А. А. и соавт. Эпидемиологические исследования распространенности периодонтопатогенной микрофлоры полости рта у населения России // Стоматол. 2005. Т. 84. № 5. С. 14-20.
  15. Сысоев К. А., Морозова Е. Б., Чухловин А. Б. и др. Экспрессия РНК хемокинов у пациентов с различными генотипами вируса гепатита С // Мед. иммунол. 2004. Т. 6. № 3-5. C. 339-340.
  16. Чухловин А. Б., Забелина Т. С., Зубаровская Л. С. и соавт. Связь промоторного полиморфизма гена коллагеназы-1 с развитием острой реакции «трансплантат против хозяина» при аллогенной трансплантации гемопоэтических стволовых клеток // Мед. иммунол. 2003. Т. 5. No 1-2. С. 101-106.
  17. Чухловин А. Б., Тотолян Арег А. Генодиагностика возбудителей инфекционных заболеваний и поиск специфических «генов риска» // Клин. лабор. диагн. 2005. (принято к печати).
  18. Alexandrov J. N., Lyschov A. A., Safronnikova N. R., Jmyanitov E. N., Hanson K. P. Features of HPV infection among healthy attendants of gynecological practice in St. Petersburg, Russia // Cancer Lett. 1999. Vol. 145. P. 43-48.
  19. Bodner-Adler B., Bodner K., Kimberger O. et al. Expression of matrix metalloproteinases in patients with uterine smooth muscle tumors: an immunohistochemical analysis of MMP-1 and MMP-2 protein expression in leiomyoma, uterine smooth muscle tumor of uncertain malignant potential, and leiomyosarcoma // Soc. Gynecol. Investig. 2004. Vol. 11. № 3. P. 182-186.
  20. Curry T. E. Jr., Kevin G. Osteen. The Matrix Metalloproteinase System: Changes, Regulation, and Impact throughout the Ovarian and Uterine Reproductive Cycle // Endocr. Rev. 2003. Vol. 24. № 4. P. 428-465.
  21. Dubina M. V., Iaitckii N. A., Popov D. E., Vasili'ev S. V., Krutovskikh V. A. Connexin 43, but not connexin 32, is mutated at advanced stages of human sporadic colon cancer // Oncogene. 2002. Vol. 21. P. 4992-4996.
  22. Inagaki N., Ung L., Otani T. et al. Uterine cavity matrix metalloproteinases and cytokines in patients with leiomyoma, adenomyosis or endometrial polyp // Eur. J. Obstet. Gynecol. Reprod. Biol. 2003. Vol. 111. № 2. P. 197–203.
  23. Kumar P. S., Griffen A. L., Barton J. A. et al. New bacterial species associated with chronic periodontitis // J. Dental. Res. 2003. Vol. 82. P. 338-344.
  24. Lamell C. W., Griffen A. L., McClellan D. L., Leys E. J. Acquisition and colonization stability of Actinobacillus actinomycetemcomitans and Porphyromonas gingivalis in children // J. Clin. Microbiol. 2000. Vol. 38. № 3. P. 1196–1199.
  25. McCabe D. C., Caudill M. A. DNA methylation, genomic silencing, and links to nutrition and cancer // Nutrition Rev. 2005. Vol. 63. № 6. P. 183-195.
  26. Tran S. D., Rudney J. D. Improved Multiplex PCR Using Conserved and Species-Specific 16S rRNA Gene Primers for Simultaneous Detection of Actinobacillus actinomycetemcomitans, Bac-teroides forsythus, and Porphyromonas gin- givalis // J. Clin. Microbiol. 1999. Vol. 37. P. 3504-3505.
  27. Ye S., Dhillon S., Turner S. J. et al. Invasiveness of cutaneous melanoma is influenced by matrix metalloproteinase 1 gene polymorphism // Cancer Res. 2001. Vol. 61. P. 1296-1298.

Supplementary files

Supplementary Files
Action
1. JATS XML
Download

Copyright (c) 2025 Eco-Vector


СМИ зарегистрировано Федеральной службой по надзору в сфере связи, информационных технологий и массовых коммуникаций (Роскомнадзор).
Регистрационный номер и дата принятия решения о регистрации СМИ: серия ПИ № ФС 77 - 74760 от 29.12.2018 г.